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Significant genomic introgression from grey junglefowl(Gallus sonneratii)to domestic chickens(Gallus gallus domesticus)

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2024年第4期15卷 1482-1493页

作者： Xiurong Zhao Junhui Wen Xinye Zhang Jinxin Zhang Tao Zhu huie wang Weifang Yang Guomin Cao Wenjie Xiong Yong Liu Changqing Qu Zhonghua Ning Lujiang Qu National Engineering Laboratory for Animal Breeding College of Animal Science and TechnologyChina Agricultural UniversityBeijing 100193China Key Laboratory of Protection and Utilization of Biological Resources in Tarim Basin Xinjiang Production and Construction CorpsTarim UniversityAlar 843300China Beijing Municipal General Station of Animal Science Beijing 100107China Animal husbandry station of Fangchenggang FangchenggangGuangxi Province 538001China Animal Disease Prevention and Control Center of Fangchenggang FangchenggangGuangxi Province 538001China Beijing Agricultural Effect Poultry Industry Co. Ltd.Beijing 101100China Engineering Technology Research Center of Anti‑aging Chinese Herbal Medicine of Anhui Province Fuyang Normal UniversityFuyangAnhui 236037China

Background Chicken is one of the most numerous and widely distributed species around the world,and many studies support the multiple ancestral origins of domestic *** research regarding the yellow skin phenotype in domestic chickens(regulated by BCO2)likely originating from the grey junglefowl serves as crucial evidence for demonstrating the multiple origins of ***,beyond the BCO2 gene region,much remains unknown about the introgression from the grey junglefowl into domestic ***,in this study,based on wholegenome data of 149 samples including 4 species of wild junglefowls and 13 local domestic chicken breeds,we explored the introgression events from the grey junglefowl to domestic *** We successfully detected introgression regions besides BCO2,including two associated with growth trait(IGFBP2 and TKT),one associated with angiogenesis(TIMP3)and two members of the heat shock protein family(HSPB2 and CRYAB).Our findings suggest that the introgression from the grey junglefowl may impact the growth performance of ***,we revealed introgression events from grey junglefowl at the BCO2 region in multiple domestic chicken breeds,indicating a phenomenon where the yellow skin phenotype likely underwent strong selection and was ***,our haplotype analysis shed light on BCO2 introgression event from different sources of grey junglefowl into domestic chickens,possibly suggesting multiple genetic flows between the grey junglefowl and domestic *** In summary,our findings provide evidences of the grey junglefowl contributing to the genetic diversity of domestic chickens,laying the foundation for a deeper understanding of the genetic composition within domestic chickens,and offering new perspectives on the impact of introgression on domestic chickens.

关键词： BCO2 Domestic chickens Grey junglefowl Introgression

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FSH对多浪羊子宫和卵巢组织及血清生殖激素的影响

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黑龙江畜牧兽医 2024年第7期 68-73,80页

作者：郝文王成倩晏航王惠娥塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

为了探讨外源激素卵泡刺激素(FSH)在诱导绵羊超数排卵过程中子宫和卵巢形态、卵泡数量及8种生殖激素浓度变化情况,试验选取30只健康经产多浪羊,随机均分为超数排卵(DC)组和同期发情(DT)组,同时埋植孕酮缓释硅胶栓(CIDR),记为第0天;DC组... 详细信息

为了探讨外源激素卵泡刺激素(FSH)在诱导绵羊超数排卵过程中子宫和卵巢形态、卵泡数量及8种生殖激素浓度变化情况,试验选取30只健康经产多浪羊,随机均分为超数排卵(DC)组和同期发情(DT)组,同时埋植孕酮缓释硅胶栓(CIDR),记为第0天;DC组在埋栓后第11,12,13天依次递减注射FSH,DT组不做处理;在埋栓后第13天两组均撤栓并注射前列腺素(PG)。从埋栓第11天开始每组屠宰3只多浪羊,至第15天结束,摘取子宫和卵巢,观察子宫和卵巢形态,记录卵巢优势卵泡数量,采用ELISA试剂盒检测外源FSH处理后多浪羊血清中8种生殖激素FSH、促黄体生成素(LH)、雌激素(E2)、孕酮(P4)、促性腺激素释放激素(GnRH)、PG、抑制素(INH)和瘦素(LEP)浓度的变化。结果表明:多浪羊经过埋栓处理后卵巢中优势卵泡数量随着时间推移先增加后减少,DC组的平均优势卵泡数量高于DT组。第15天DC组个别卵巢表面可观察到“红体”出现,而DT组未发现。在注射FSH后,DC组中FSH和LH激素浓度持续增加,第13,14天时显著高于第10~12天(P<0.05);E2浓度先增加,而在第14天时显著低于第10~13天(P<0.05);LEP和PG浓度第14天时显著高于第10~13天(P<0.05);GnRH浓度第12天时显著高于第10,11,13天(P<0.05);P4浓度第13,14天时显著高于第10,12天(P<0.05);DC组母羊在第12~13天由发情中期向后期转变,DT组母羊在第12~13天还处于发情中期,第14天DC组母羊的发情期结束。说明采用CIDR+FSH+PG法能获得较好的超排效果。

关键词：多浪羊超数排卵同期发情生殖激素卵巢

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Association of H-FABP gene polymorphisms with intramuscular fat content in Threeyellow chickens and Hetian-black chickens

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2016年第3期7卷 366-373页

作者： Yong wang Xiaohong Hui huie wang Tursunjan Kurban Chao Hang Ying Chen Jinming Xing Jiufeng wang College of Veterinary Medicine China Agricultural University Key Laboratory of Tarim Animal Husbandry Science & Technology of Xinjiang Production and Construction Groups/College of Animal Science Tarim University

Background： To explore the relationship between the heart-type fatty acid binding protein（H-FABP） gene and intramuscular fat（IMF）, a polymorphism of the second exon of the H-FABP gene was investigated in 60 Three-yellow chickens（TYCs） and 60 Hetian-black chickens（HTBCs）.Results： The IMF contents of the cardiac, chest and leg muscles in HTBC were increased compared with TYC. Both TYC and HTBC populations exhibited Hardy-Weinberg Equilibrium（HWE） according to the χ2test. Three variations of the two birds were detected, namely, G939 A, G982 A and C1014 T. HTBCs with the TT genotypes exhibit increased IMF content in the chest muscles compared with the TC genotype. Thus, the G982 A site could be considered a genetic marker for selecting increased IMF content in the chest muscles of HTBC. The correlation coefficients revealed that H-FABP m RNA expression was negatively correlated with the IMF content in the cardiac, chest and leg muscles of HTBC and in the cardiac and chest muscles of TYC. The relative m RNA expression of H-FABP was reduced in the cardiac and leg muscles of HTBC compared with TYC, but this difference was not observed at the protein level, as assessed by Western blot ***： These findings offer essential data that can be useful in the breeding program of HTBC and future research exploring the role of H-FABP in IMF deposition and regulation in chickens.

关键词： Hetian-black Chicken H-FABP m RNA Expression Polymorphism Three-yel ow Chicken

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Origins,timing and introgression of domestic geese revealed by whole genome data

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2023年第3期14卷 936-949页

作者： Junhui Wen Haiying Li huie wang Jincheng Yu Tao Zhu Jinxin Zhang Xinghua Li Zhihua Jiang Zhonghua Ning Lujiang Qu Department of Animal Genetics and Breeding National Engineering Laboratory for Animal BreedingCollege of Animal Science and TechnologyChina Agricultural UniversityBeijingChina College of Animal Science Xinjiang Agricultural UniversityUrumqiChina Xinjiang Production&Construction Corps Key Laboratory of Protection and Utilization of Biological Resources in Tarim Basin AlarXinjiangChina College of Animal Science Tarim UniversityAlarXinjiangChina Liaoning Academy of Agricultural Sciences ShenyangChina Department of Animal Sciences Washington State UniversityPulmanUSA

Background Geese are among the most important poultry species in the *** current generally accepted hypothesis is that the European domestic geese originated from greylag geese(Anser anser),and Chinese domestic geese have two origins,most of which originated from swan geese(Anser cygnoides),and the Yili goose originated from greylag *** explain the origin and demographic history of geese,we selected 14 goose breeds from Europe and China and wild populations of swan and greylag geese,and whole genome sequencing data were obtained for 74 *** Population structure analysis and phylogenetic trees showed that the wild ancestor of Chinese domestic geese,except for Yili,is the swan geese,and the wild ancestor of Chinese Yili and European domestic geese is greylag *** of the demographic history suggests that the domestication of Chinese geese occurred~3499 years ago and that of the European geese occurred~7552 years ***,gene flow was observed between domestic geese and their wild *** of introgression showed that Yili geese had been introgressed by Chinese domestic geese,and the body size of Yili geese may be influenced by introgression events of some growthrelated genes,including *** Our study provides evidence for the origin of geese at the genome-wide level and advances the understanding of the history of goose domestication and the traits affected by introgression events.

关键词： Domestication Goose Introgression Phylogeny

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Significant genomic introgression from grey junglefowl (Gallus sonneratii) to domestic chickens (Gallus gallus domesticus).

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畜牧与生物技术杂志(英文版) 2024年第4期 1482页

作者： Xiurong Zhao Junhui Wen Xinye Zhang Jinxin Zhang Tao Zhu huie wang Weifang Yang Guomin Cao Wenjie Xiong Yong Liu Changqing Qu Zhonghua Ning Lujiang Qu

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乳化炸药的低温乳化工艺改进

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爆破器材 2000年第5期29卷 9-12页

作者：王惠娥淮南工业学院安徽232001

文章提出降低乳化温度的关键是降低氧化剂水溶液的析晶点。根据相似相溶原理 ,采用混和氧化剂、晶形改性剂等添加剂 ,降低乳化温度 ,达到了低温乳化的目的。实验结果表明 ,上述思路正确、可行 ,乳化温度可降低到 6 5℃左右 ,低温乳化制... 详细信息

文章提出降低乳化温度的关键是降低氧化剂水溶液的析晶点。根据相似相溶原理 ,采用混和氧化剂、晶形改性剂等添加剂 ,降低乳化温度 ,达到了低温乳化的目的。实验结果表明 ,上述思路正确、可行 ,乳化温度可降低到 6 5℃左右 ,低温乳化制得的炸药性能符合要求。

关键词：乳化炸药低温乳化析晶点工艺

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塔里木鸽生长发育规律及生长曲线拟合分析

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特产研究 2024年第3期46卷 85-92页

作者：王钧冉穆艾太尔·木塔力甫赵天心王清正王惠娥杨宝钰孙啸渊杨娜王亚茹汤驰依那木江·亚力买买提努尔玛奴·克里木热孜亚古丽·司马义勒吾买尔江·艾孜木格明古丽·木哈台塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 新疆伊宁县喀拉亚尕奇乡畜牧兽医站新疆伊宁835100 伊宁县吉里于孜镇畜牧兽医站新疆伊宁835100 新疆巴楚县畜牧兽医站新疆巴楚8438005

为探究塔里木鸽早期生长发育规律,了解其品种特性。本研究采用亲鸽自繁自养的模式,测量0~28日龄乳鸽的体重、体尺指标进行关联性分析,利用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy 3种非线性生长模型对0~28日龄乳鸽体重进行曲线拟合分析。... 详细信息

为探究塔里木鸽早期生长发育规律,了解其品种特性。本研究采用亲鸽自繁自养的模式,测量0~28日龄乳鸽的体重、体尺指标进行关联性分析,利用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy 3种非线性生长模型对0~28日龄乳鸽体重进行曲线拟合分析。结果显示,塔里木鸽累计体重持续增长,21日龄体重达到最大值,21日龄后体重小幅度降低。相对生长率随着体重增加持续降低,乳鸽7日龄绝对生长量最大,28日龄体重为负增长。不同日龄乳鸽的体重与各项体尺性状均呈极显著正相关(P<0.01),3种非线性模型均能较好的模拟塔里木鸽生长曲线,但Gompertz模型的拟合度最佳(R~2=0.988),拐点日龄为7.541 d,拐点体重为139.57 g,最大日增重为20.795 g,与实际测量值最为接近。塔里木鸽早期生长速度快,生长曲线呈“S”形,符合家禽生长发育的一般规律。Gompertz模型对塔里木鸽生长发育的体重拟合效果最佳,可根据此模型制定科学饲养管理模式,最大程度发挥其生产性能,为品种开发利用提供依据。

关键词：塔里木鸽体尺体重生长发育规律生长曲线关联性分析

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绵羊超数排卵卵巢差异表达基因及生物信息学分析

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中国畜牧兽医 2023年第7期50卷 2740-2754页

作者：晏航郝文王成倩王惠娥塔里木大学动物科学与技术学院阿拉尔843300 塔里木畜牧科技兵团重点实验室阿拉尔843300

【目的】筛选出影响经超数排卵处理的多浪羊卵巢卵泡发育的关键基因、生物过程及信号通路,为进一步了解多浪羊超数排卵状态下卵巢生长发育机制提供依据。【方法】对15只2~3岁身体状况良好的多浪羊进行超数排卵处理后,采集超数排卵中早期... 详细信息

【目的】筛选出影响经超数排卵处理的多浪羊卵巢卵泡发育的关键基因、生物过程及信号通路,为进一步了解多浪羊超数排卵状态下卵巢生长发育机制提供依据。【方法】对15只2~3岁身体状况良好的多浪羊进行超数排卵处理后,采集超数排卵中早期(第11天)、中期(第13天)、晚期(第15天)卵巢组织,利用高通量测序技术进行转录组测序,将测序得到的reads序列与参考基因组进行序列比对,筛选出差异表达基因;通过STRING数据库对差异表达基因进行蛋白互作网络分析,采用Cytoscape软件进行可视化编辑处理,利用eggNOG-mapper软件进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】超数排卵卵巢第11和13天共筛选出223个差异表达基因,获得259条互作关系,差异表达基因显著注释在细胞生长、核糖核蛋白复合等条目中,其中显著差异表达的基因为ITGB 3和SNAI 1,未发现显著富集通路。超数排卵卵巢第13和15天共筛选出694个差异表达基因,获得785条互作关系,差异表达基因显著注释在DNA复制的启动、DNA复制、DNA新陈代谢过程等条目中,其中显著差异表达的基因主要有CASP 3、NOTCH 1、WNT 2和RUNX 2,存在2条富集通路:DNA复制和细胞周期信号通路。超数排卵卵巢第11和15天共筛选出238个差异基因,获得151条互作关系,差异表达基因主要注释在蛋白质水解、细胞内信号转导等条目中,其中显著差异表达的基因主要有PRKAR 2 B、AQP 5及HEY 2,存在2条显著富集通路:肥厚型心肌病(HCM)和扩张型心肌病(DCM)信号通路。利用GO功能和KEGG通路富集结果筛选出10个在绵羊卵巢卵泡发育过程中具有直接或间接作用的基因:ITGB 3、SNAI 1、CASP 3、PRKAR 2 B、AQP 5、NOTCH 1、RUNX 2、WNT 2、DPP 10和HEY 2。【结论】本研究从超数排卵卵巢不同发育时期筛选出10个差异表达基因,其相关功能作用的发挥符合不同时期卵巢卵泡发育变化机制,表明这些基因可能是直接或间接影响卵巢卵泡发育的关键基因,为探究超数排卵卵巢卵泡发育机制提供了理论参考。

关键词：绵羊超数排卵转录组测序差异表达基因卵巢卵泡

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极紫外光刻的随机性问题及其研究进展

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中国激光 2024年第7期51卷 85-104页

作者：王翔何建君魏佳亮朱慧娥张江实验室上海201210

极紫外光刻技术是支撑最先端半导体芯片制造工艺的关键核心技术,有力推动了3 nm工艺节点的量产以及2 nm工艺节点的研发进程。极紫外光刻中的随机缺陷是限制其良率提升的关键难题。一方面,急剧减小的光刻图形特征尺寸对光刻胶各组分化学... 详细信息

极紫外光刻技术是支撑最先端半导体芯片制造工艺的关键核心技术,有力推动了3 nm工艺节点的量产以及2 nm工艺节点的研发进程。极紫外光刻中的随机缺陷是限制其良率提升的关键难题。一方面,急剧减小的光刻图形特征尺寸对光刻胶各组分化学结构的规整性要求越来越高,而光刻胶中存在的组分不均一、后烘过程中光酸迁移距离以及位置的不确定性等因素都会导致缺陷,这些统称为化学随机性问题。另一方面,极紫外光源的波长(13.5 nm)较短,致使其光子密度很低,仅为上一代ArF光刻工艺中所使用光源(193 nm)的1/14,因此光子的散粒噪声大幅增加,导致了不可避免的光子随机性问题。这些问题的存在,使得EUV光刻胶中的材料体系在分子尺寸、分布均一性等方面较上一代光刻材料有着更严格的要求。本文系统性综述了近年来针对极紫外光刻胶中上述随机性问题的研究,并从化学随机性、光子随机性以及计算模拟三个方向对研究现状进行了追踪。

关键词：极紫外化学随机性光子随机性光刻胶光酸迁移距离

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南疆绵羊FSHR基因第10外显子多态性检测及序列分析

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黑龙江畜牧兽医 2017年第9期 114-117,294页

作者：王惠娥王永汪澜陆阳薛莹莹塔里木大学动物科学学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

为了研究多浪羊和卡拉库尔羊促卵泡素受体(FSHR)基因第10外显子的多态性及其与多浪羊胎次产羔数相关性,试验采用PCR-SSCP和直接测序的方法进行研究。结果表明:多浪羊和卡拉库尔羊FSHR基因第10外显子存在3个突变位点,分别为Arg 1 328 Lys... 详细信息

为了研究多浪羊和卡拉库尔羊促卵泡素受体(FSHR)基因第10外显子的多态性及其与多浪羊胎次产羔数相关性,试验采用PCR-SSCP和直接测序的方法进行研究。结果表明:多浪羊和卡拉库尔羊FSHR基因第10外显子存在3个突变位点,分别为Arg 1 328 Lys、Gln 1 334 Pro和Asp 1 342Asn,均属于错义突变。在1 328位点有等位基因A和B,基因型仅为AA和AB;在1 334位点有等位基因C和D,基因型只有CD和DD;在1 342位点有等位基因E和F,基因型为EE、FF和EF。多浪羊与卡拉库尔羊在1 334位点基因型分布存在显著差异(P0.05);FSHR基因多态性与多浪羊胎次产羔数之间差异不显著(P>0.05),表明FSHR基因第10外显子对多浪羊产羔数没有显著影响(P>0.05)。

关键词：促卵泡素受体(vsnn) PCR—SSCP 多浪羊卡拉库尔羊多态性检测序列分析

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