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SMXL5 attenuates strigolactone signaling in Arabidopsis thaliana by inhibiting SMXL7 degradation

Molecular Plant 2024年第4期17卷 631-647页

作者： Qingtian Li Haiyang Yu Wenwen Chang Sunhyun Chang Michael Guzman Lionel Faure Eva-Sophie Wallner heqin yan Thomas Greb Lei Wang Ruifeng Yao David C.Nelson Department of Botany and Plant Sciences University of CaliforniaRiversideRiversideCA 2521USA Yazhouwan National Laboratory Sanya 572025China Hainan Seed Industry Laboratory Sanya 57205China State Key Laboratory of Chemo/Biosensing and Chemometrics Hunan Provincial Key Laboratory of Plant Functional Genomics and Developmental RegulationCollege of BiologyHunan UniversityChangsha 410082China Key Laboratory of Seed Innovation Center for Agricultural Resources ResearchInstitute of Genetics and Developmental BiologyChinese Academy of SciencesShijiazhuangHebei 050021China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 10004China School of the Sciences Biology DivisionTexas Woman’s UniversityDentonTX 76204USA Centre for Organismal Studies(COS) Heidelberg University6120 HeidelbergGermany

Hormone-activated proteolysis is a recurring theme of plant hormone signaling *** strigolactone signaling,the enzyme receptor DWARF14(D14)and an F-box protein,MORE AXILLARY GROWTH2(MAX2),mark SUPPRESSOR OF MAX21-LIKE(SMXL)family proteins SMXL6,SMXL7,and SMXL8 for rapid *** of these transcriptional corepressors initiates downstream growth *** homologous proteins SMXL3,SMXL4,and SMXL5,however,are resistant to MAX2-mediated *** discovered that the smxl4 smxl5 mutant has enhanced responses to ***5 attenuates strigolactone signaling by interfering with AtD14-SMXL7 ***5 interacts with AtD14 and SMXL7,providing two possible ways to inhibit SMXL7 ***5 function is partially dependent on an ethylene-responsive-element binding-factor-associated amphiphilic repression(EAR)motif,which typically mediates interactions with the TOPLESS family of transcriptional ***,we found that loss of the EAR motif reduces SMXL5-SMXL7 interactions and the attenuation of strigolactone signaling by *** hypothesize that integration of SMXL5 into heteromeric SMXL complexes reduces the susceptibility of SMXL6/7/8 proteins to strigolactone-activated degradation and that the EAR motif promotes the formation or stability of these *** mechanism may provide a way to spatially or temporally fine-tune strigolactone signaling through the regulation of SMXL5 expression or translation.

关键词： Arabidopsis typically inhibiting

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PABPC1在肝细胞癌患者癌组织中的表达及其与预后的关系

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检验医学与临床 2024年第16期21卷 2373-2379页

作者：白素琴张清雯演何钦李晓波西安交通大学医学院附属3201医院微生物免疫检验科分子诊断实验室陕西汉中723000

目的分析多聚腺苷酸结合蛋白胞质1(PABPC1)在肝细胞癌(HCC)患者癌组织中的表达情况及其对患者预后的影响。方法采用癌症基因组图谱计划(TCGA)中的数据分析369例HCC患者癌组织及50例正常肝组织的PABPC1 mRNA表达水平。回顾性分析、比较... 详细信息

目的分析多聚腺苷酸结合蛋白胞质1(PABPC1)在肝细胞癌(HCC)患者癌组织中的表达情况及其对患者预后的影响。方法采用癌症基因组图谱计划(TCGA)中的数据分析369例HCC患者癌组织及50例正常肝组织的PABPC1 mRNA表达水平。回顾性分析、比较2018年1月至2019年2月在该院就诊的166例HCC患者癌组织和癌旁正常组织PABPC1 mRNA表达水平及不同临床病理特征的HCC患者癌组织中PABPC蛋白表达情况。绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析采用PABPC1 mRNA表达水平区分癌组织和癌旁正常组织的效能,根据随访结果采用多因素COX回归模型分析影响HCC患者预后的因素。结果 TCGA数据结果显示,369例HCC患者癌组织中PABPC1 mRNA表达量显著高于50例正常肝组织中的表达量(P<0.05)。在临床病例分析中,166例HCC患者癌组织中PABPC1 mRNA表达水平及PABPC1蛋白阳性率均显著高于癌旁组织(P<0.05),且PABPC1蛋白阳性表达患者PABPC1 mRNA表达水平为2.76±0.79,显著高于阴性表达患者的1.52±0.84(P<0.001)。ROC曲线结果显示,PABPC1 mRNA区分癌组织和癌旁正常组织的曲线下面积为0.913。UICC分期Ⅲ~Ⅳ期、伴有淋巴结转移以及多发肿瘤灶HCC患者的PABPC1蛋白阳性表达率分别高于UICC分期Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移及单发肿瘤灶的患者,差异均有统计学意义(P<0.05)。随访期间,50例(30.12%)患者在术后1年内死亡,95例(57.23%)患者在术后3年内死亡,101例(60.84%)患者在术后5年内死亡;多因素COX回归分析结果显示,癌组织PABPC1蛋白表达情况是影响HCC患者1年、3年、5年生存情况的独立因素(P<0.05)。癌组织PABPC1蛋白阳性表达及阴性表达HCC患者的1年、3年和5年总生存期比较,差异均有统计学意义(P<0.001)。结论 PABPC1 mRNA和蛋白在HCC患者癌组织中均呈高表达,且PABPC1蛋白高表达预示HCC患者生存预后不良。

关键词：多聚腺苷酸结合蛋白胞质1 肝细胞癌临床病理特征预后总生存期

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不同种质油茶的比较转录组分析

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分子植物育种 2023年第11期21卷 3523-3533页

作者：李杨严和琴于靖郑蔚吴友根海南大学园艺学院海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海口570228

本研究采用高通量Illumina转录组测序技术对‘万海4号’(WH4)、‘博白大果’(BBDG)、‘长林40’(CL40)、‘岑软’(CR)和‘红花油茶’(HH)五个不同种质的油茶进行转录组测序并进行差异比较分析。结果表明,WH4、BBDG、CL40、CR以及HH通过... 详细信息

本研究采用高通量Illumina转录组测序技术对‘万海4号’(WH4)、‘博白大果’(BBDG)、‘长林40’(CL40)、‘岑软’(CR)和‘红花油茶’(HH)五个不同种质的油茶进行转录组测序并进行差异比较分析。结果表明,WH4、BBDG、CL40、CR以及HH通过组装分别获得了71 852、111 693、75 436、15 899和96 205个Unigenes,将所有Unigenes与公共数据库(Nr, Swiss-Prot, KOG, KEGG)进行相似性比对并注释,五种油茶注释基因所占百分比依次为65.51%、46.41%、60.57%、91.94%、54.98%;KEGG富集分析表明WH4、BBDG、CL40和HH中基因丰度最高的都是核糖体途径,而CR中基因丰度最高的是碳代谢途径;GO富集分析显示,WH4、BBDG、CL40、CR和HH基因分布结果一致。结合KEGG、GO和KOG富集分析,绘制出了油茶三萜皂苷生物合成途径通路图,筛选出该途径中的关键酶及相关基因,并对其进行了差异分析。该研究结果完善了油茶三萜皂苷生物合成途径相关基因的表达特征,可为油茶三萜皂苷的生物合成提供科学依据。

关键词：油茶(Camellia oleifera) 比较转录组三萜皂苷

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基于SRAP分子标记的海南油茶品种遗传多样性分析

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分子植物育种 2022年第6期20卷 1901-1908页

作者：严和琴郑蔚代佳妮严武平于靖吴友根海南大学园艺学院海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海口570228

为了解海南油茶(Camellia oleifera)种质资源的遗传多样性,本研究采用SRAP技术分析了25份油茶材料的亲缘关系和遗传多样性。结果表明,筛选的16对多态性较高的引物组合,共扩增得到500条清晰稳定的条带,其中多态性条带465个,多态性条带百... 详细信息

为了解海南油茶(Camellia oleifera)种质资源的遗传多样性,本研究采用SRAP技术分析了25份油茶材料的亲缘关系和遗传多样性。结果表明,筛选的16对多态性较高的引物组合,共扩增得到500条清晰稳定的条带,其中多态性条带465个,多态性条带百分比(PPB)为93.00%,Nei’s遗传一致度范围为0.510 0~0.868 0,遗传距离范围为0.141 6~0.673 3。遗传多样性参数等位基因数(N_(a))、有效等位基因数(N_(e))、基因多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)和总遗传多样性(H_(t))分别为1.930 0、1.546 8、0.319 5、0.479 0和0.319 5,表明25份油茶种质资源遗传多样性丰富。聚类结果将25份油茶材料分为三大类,未严格按照地理区域划分,说明其遗传背景复杂,一定程度上反映出了目前海南油茶资源的混乱现状。SRAP标记可以反映油茶种质资源间的遗传关系,本研究结果对油茶引种、育种、种质资源保存以及新品种开发等方面具有指导作用,可为海南油茶资源分类鉴定提供参考。

关键词：油茶(Camellia oleifera) SRAP 遗传多样性聚类分析

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越南油茶环阿屯醇合酶基因的克隆及表达分析

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分子植物育种 2022年第7期20卷 2188-2195页

作者：郑蔚代佳妮严和琴于靖王勇吴友根海南大学园艺学院海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海口570228 海南师范大学生命科学学院海口571158

为研究越南油茶(Camellia vietnamensis *** ex Hu)中环阿屯醇合酶(cycloartenol synthase,CAS)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆的方法克隆得到环阿屯醇合酶基因全长并命名为CvCAS,对其进行生物信息学分析及表达模式研究。结果表... 详细信息

为研究越南油茶(Camellia vietnamensis *** ex Hu)中环阿屯醇合酶(cycloartenol synthase,CAS)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆的方法克隆得到环阿屯醇合酶基因全长并命名为CvCAS,对其进行生物信息学分析及表达模式研究。结果表明,CvCAS全长2411 bp,包括一个2277 bp完整的开放阅读框,编码758个氨基酸,与茶(Camellia sinensis)、中华猕猴桃(Actinidia chinensis ***),刺楸(Kalopanax septemlobus)和人参(Panax ginseng)的CAS蛋白序列相似度均在85%以上,系统发育树分析显示CvCAS与茶(Camellia sinensis)和向日葵(Helianthus annuus)的CAS蛋白序列聚为一支。预测其蛋白分子质量为86.6 kD,理论等电点为6.20,无跨膜螺旋区,属于不稳定亲水性蛋白。序列比对分析表明,CvCAS具有氧化鲨烯环化酶(OSCs)超家族典型结构位点(DCTAE),三萜合成酶高度保守结构位点(DGSWYGSWGVCFTYG)和OSCs稳定结构保守位点(QW)。CvCAS基因在种子不同成熟期及植株不同组织部位均有表达,其中种子的表达量最高,且在九月与十月的表达量显著高于其他月份。本研究结果为越南油茶三萜皂苷等活性成分合成研究提供理论依据。

关键词：越南油茶阿屯醇合酶基因克隆表达分析

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越南油茶HMGCR基因的克隆及表达分析

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分子植物育种 2022年第13期20卷 4296-4304页

作者：郑蔚代佳妮严和琴于靖王勇吴友根海南大学园艺学院海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海口570228 海南师范大学生命科学学院海口571158

为研究越南油茶(Camellia vietnamensis *** ex Hu)中HMGCR(3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆得到HMGCR基因全长并命名为CvHMGCR,对其进行生物信息学分析及表达模式研究。结果表明,CvHMGCR全长180... 详细信息

为研究越南油茶(Camellia vietnamensis *** ex Hu)中HMGCR(3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆得到HMGCR基因全长并命名为CvHMGCR,对其进行生物信息学分析及表达模式研究。结果表明,CvHMGCR全长1800 bp,包括一个1770 bp完整的开放阅读框,编码589个氨基酸,与茶树(Camellia sinensis)、毛柄连蕊茶(Camellia fraterna)、喜树(Camptotheca acuminata)、风铃辣椒(Capsicum baccatum)和三七(Panax notoginseng)的HMGCR蛋白序列相似度均在75%以上,系统发育树显示Cv HMGCR与茶树(Camellia sinensis)、毛柄连蕊茶(Camellia fraterna)和喜树(Camptotheca acuminata)的HMGCR蛋白序列聚为一支。预测其蛋白分子质量为63.1kD,理论等电点为6.37,有两个跨膜螺旋区,属于不稳定疏水性蛋白。序列比对分析表明,CvHMGCR有4个典型的HMGCR保守基序,即2个HMG-CoA结合基序和2个NADP(H)结合基序。CvHMGCR基因在种子不同成熟期及植株根叶中均有表达,其中种子在九月的表达量显著高于其他月份;而对于不同组织部位中,叶的表达量最高。本研究结果为越南油茶次生代谢产物合成研究提供理论依据。

关键词：越南油茶 HMGCR基因克隆生物信息学分析

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槟榔果实不同发育时期的转录组分析及差异基因的筛选

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分子植物育种 2023年第14期21卷 4595-4605页

作者：严和琴于靖郑蔚李杨刘立云李志刚海南大学园艺学院海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海口570228 中国热带农业科学院椰子研究所文昌571339 中国热带农业科学院香料饮料研究所万宁571533

为了探知槟榔(Areca catechu L.)果实发育过程及挖掘其主要次生代谢产物生物合成途径相关的关键酶基因,本研究以3个不同时期的槟榔果皮和种子为研究材料,利用高通量测序技术测序,组装共获得78320条unigenes,其中35399条unigenes在NR、Sw... 详细信息

为了探知槟榔(Areca catechu L.)果实发育过程及挖掘其主要次生代谢产物生物合成途径相关的关键酶基因,本研究以3个不同时期的槟榔果皮和种子为研究材料,利用高通量测序技术测序,组装共获得78320条unigenes,其中35399条unigenes在NR、Swiss-Prot、KOG、KEGG四大数据库得到注释。在错误发现率FDR<0.05、差异倍数FC(Fold Change)≥2的条件下,G140和S140的差异表达基因共有21065个,其中上调的有11811个,下调的有9254个;G110和S140次之,共有20613个unigenes,其中上调的有8314个,下调的有12299。KEGG分析中共有570个DEGs被注释到次生代谢标准生物合成通路。其中,有149个DEGs被注释到苯丙烷生物合成途径,分别有37个DEGs被注释到莨菪烷类、哌啶和哌啶生物碱生物合成和异喹啉生物碱生物合成途径。RT-qPCR结果表明转录组数据真实可靠。本研究初步筛选了与槟榔主要次生代谢物生物合成相关的关键酶基因,为槟榔基因功能鉴定、次生代谢途径解析及调控机制的研究提供理论依据。

关键词：槟榔果实发育时期转录组差异表达基因

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槟榔不同发育时期的代谢产物分析及抗氧化活性研究

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中国食品添加剂 2022年第8期33卷 72-79页

作者：严和琴于靖郑蔚李杨刘立云李志刚海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海南大学园艺学院海口570228 中国热带农业科学院椰子研究所文昌571339 中国热带农业科学院香料饮料研究所万宁571533

本研究以槟榔花及不同发育阶段的果实为材料,运用GC-MS技术检测了槟榔的主要代谢产物,共检测到46种已知物质,其中包含14种含氮化合物,13种有机酸和14种糖醇类物质和其他5种已知代谢物。同时测定了其主要活性成分及抗氧化活性,利用Topsi... 详细信息

本研究以槟榔花及不同发育阶段的果实为材料,运用GC-MS技术检测了槟榔的主要代谢产物,共检测到46种已知物质,其中包含14种含氮化合物,13种有机酸和14种糖醇类物质和其他5种已知代谢物。同时测定了其主要活性成分及抗氧化活性,利用Topsis法对不同发育时期的槟榔进行评价。结果表明,总体上种子中含氮化合物含量随着发育呈上升趋势,果皮中呈下降趋势,雄花大于雌花;种子中有机酸含量呈下降趋势,糖醇类物质在S140大量积累。槟榔的不同部位在不同发育时期的抗氧化能力各异,种子中S110最强,果皮P80最强;雄花略强于雌花。该研究对理解槟榔的生长发育历程和药用槟榔适宜采收期的确定有重要的理论指导意义,有益于槟榔资源的开发利用和产业发展。

关键词：槟榔代谢产物活性成分抗氧化活性

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抑郁障碍对决策行为的影响

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心理科学 1991年第5期14卷 11-15,62页

作者：肖泽萍严和駸上海第二医科大学精神医学教研室

本研究结果表明:抑郁症患者决策自信力较低,感到较强的决策压力,较少采用良好的决策方式而趋于采用适应不良的决策反应方式;抑郁障碍越严重,决策功能的损害愈明显,而与抑郁障碍的分型关系不大;抑郁障碍缓解后,患者决策能力大大改善,可... 详细信息

本研究结果表明:抑郁症患者决策自信力较低,感到较强的决策压力,较少采用良好的决策方式而趋于采用适应不良的决策反应方式;抑郁障碍越严重,决策功能的损害愈明显,而与抑郁障碍的分型关系不大;抑郁障碍缓解后,患者决策能力大大改善,可达到与正常人无显著差别的水平。

关键词：抑郁症决策行为应激

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茶皂素处理对黄皮果实贮藏品质及生理活性的影响

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中国南方果树 2022年第5期51卷 99-103页

作者：郑蔚代佳妮严和琴于靖吴友根王健赖杭桂曾教科海南大学园艺学院海口570228 海南大学热带作物新品种选育教育部工程研究中心海口5702283 海南大学热带作物学院海口5702283

以“大鸡心”黄皮果实为材料,研究了不同浓度茶皂素处理对黄皮贮藏品质及生理活性变化的影响。结果表明,低浓度茶皂素处理能显著抑制黄皮果实贮藏后期褐变,保持果实较高的可溶性固形物含量及相对适宜的酸度,有效抑制果实多酚氧化酶、过... 详细信息

以“大鸡心”黄皮果实为材料,研究了不同浓度茶皂素处理对黄皮贮藏品质及生理活性变化的影响。结果表明,低浓度茶皂素处理能显著抑制黄皮果实贮藏后期褐变,保持果实较高的可溶性固形物含量及相对适宜的酸度,有效抑制果实多酚氧化酶、过氧化物酶活性的上升,并提升超氧化物歧化酶的活性。其中,贮藏12 d时,低浓度茶皂素处理的果实多酚氧化酶活性为(0.39±0.03)U·g^(-1)·min^(-1),低于对照(空白)和高浓度茶皂素处理;贮藏6 d时,超氧化物歧化酶活性为(5.07±0.08)U·g^(-1)·min^(-1),显著高于对照(空白)和高浓度茶皂素处理。而高浓度茶皂素处理可抑制果实保护酶——过氧化氢酶的下降与脂质过氧化产物丙二醛的积累。说明适宜浓度茶皂素处理有利于减缓黄皮果实褐变并维持贮藏品质,提高其商品价值。

关键词：油茶粕茶皂素黄皮可溶性固形物酶活性

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