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Application of Artificially Induced Double-strand Breaks (DSB) and Triplex-forming Oligonucleotides (TFO) in the Improvement of Gene Targeting Efficiency

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Agricultural Biotechnology 2013年第1期2卷 1-6,12页

作者： hegang li Wenke CHENG Ke JIANG Xiaoli REN Yongping JIANG Lele HOU Xiaojing HAO Jinshan ZHAO Qingdao Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Animal Husbandry Technology Extension Station of Hainan Province Laixi Husbandry and Veterinary Bureau of Qingdao City Rizhuang Agricultural Service Center of Laixi City

Gene targeting technology is an important means to investigate gene functions, but its efficiency of gene targeting is very low, especially for somatic cell targeting. Artificially induced double-strand breaks （DSB） and triplex forming oligonucleotide （TFO） are currently developed methods to improve the targeting efficiency. This paper summarized the basic principles, design ideas and application in gene targeting efficiency improvement of these two methods, analyzed and com- pared their characteristics, and finally proposed prospects for their future development.

关键词： Gene targeting Double-strand breaks Zinc finger nuclease Homing endonuclease Triplex-forming oligonucleotides

Advances in Mathematical Modeling of NFκB Signal Transduction in Mammals

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Agricultural Biotechnology 2013年第4期2卷 47-49,52页

作者： Jinshan ZHAO Ke JIANG Zhenghao DAI Xiaoli REN Yumei WANG Yongping JIANG Mingtuan liU Yonglian DAI Lele HOU hegang li Qingdao Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Laixi Municipal Bureau of Animal Husbandry and Veterinary Wangcheng Supervision Station for Animal Epidemic Prevention and Animal Product Quality of Laixi City Rizhuang Agricultural Service Center of Laixi City

NFκB is a basic transcription factor of cell signal transduction in mammals. Mathematical modeling can be used to simulate NFκB signal transduction and investigate the molecular mechanism. The initial IKB-NFκB signal transduction model emphasized the effects of negative feedback on NFκB temporal dynamics and gene expression control, while subsequent studies are concentrated on other feedback loops, input-output behaviors of modules, crosslinking of several NFκB activation paths and NFκB oscillation. Computer technology will continue to contribute to studies of NFKB signaling pathway. Finally, several potential development trends were discussed in this paper.

关键词： NFκB Signal transduction Mathematical modeling

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引水隧洞下穿河道段施工技术研究

水利水电施工 2023年第5期 31-35页

作者：李和刚中国水利水电第九工程局有限公司

本文以小浪底引黄工程引水隧洞下穿板洞河段施工为实例,详细阐述了引水隧洞下穿河道的综合施工方案。实践证明该方案是一种安全、可靠、经济、可行的隧洞穿越复杂软弱地层、大涌水环境的施工方案,对以后类似工程施工有一定的借鉴意义。

关键词：引水隧洞下穿河道施工技术

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渣油加氢装置两种循环氢提纯方案的比较

炼油技术与工程 2014年第7期44卷 23-27页

作者：李合刚中石化洛阳工程有限公司河南省洛阳市471003

以某炼油厂3 Mt/a固定床渣油加氢装置的原料及反应条件等为基准,在相同氢分压条件下,使用流程模拟软件ProII 7.0对膜分离方案和油洗方案进行模拟计算,并从技术、经济等方面对两方案进行对比分析。结果表明,与油洗方案相比,膜分离方案投... 详细信息

以某炼油厂3 Mt/a固定床渣油加氢装置的原料及反应条件等为基准,在相同氢分压条件下,使用流程模拟软件ProII 7.0对膜分离方案和油洗方案进行模拟计算,并从技术、经济等方面对两方案进行对比分析。结果表明,与油洗方案相比,膜分离方案投资高681.9×104RMB$,但操作费用低209.3×104RMB$/a,单位能耗低11.31 MJ/t,且氢气利用率较高。而油洗方案虽然采用液力透平降低了能耗,但存在初、末期油洗量相差较大的问题,投资低的优势并不突出,且油洗量的增加对提高循环氢纯度的作用逐渐减小,从装置长期运行来看,膜分离方案经济效益优于油洗方案,渣油加氢装置循环氢提纯可优先采用膜分离方案。膜分离规模可以根据所选机型的最大流量来选取,实现节省投资和最大程度提高氢分压的目标。

关键词：渣油加氢循环氢膜分离油洗

CRISPR/Cpf1双切刻系统的构建与活性检测

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中国畜牧杂志 2023年第1期59卷 254-259页

作者：张权威都萌萌翟双双赵金山李和刚青岛农业大学动物科技学院山东青岛266109

Cpf1是2类V型CRISPR-Cas系统的单个RNA引导的核酸内切酶,具有切割DNA的核酸酶活性。该系统由Cpf1核酸酶和CRISPR RNA(crRNA)组成,对于如何提高CRISPR/Cpf1系统的基因编辑效率主要集中在增强crRNA的稳定性、设计对PAM要求更简单的Cpf1变... 详细信息

Cpf1是2类V型CRISPR-Cas系统的单个RNA引导的核酸内切酶,具有切割DNA的核酸酶活性。该系统由Cpf1核酸酶和CRISPR RNA(crRNA)组成,对于如何提高CRISPR/Cpf1系统的基因编辑效率主要集中在增强crRNA的稳定性、设计对PAM要求更简单的Cpf1变体或者鉴定新型Cpf1核酸内切酶。然而,其是否适用于构建双切刻系统还有待验证。因此,本研究旨在设计3种AsCpf1突变体以及成对的crRNA,进行瞬时转染,利用双荧光素酶报告基因检测评估AsCpf1双切刻系统的编辑效率;同时探究人工改造的crRNA能否提高AsCpf1双切刻系统的编辑效率;以及设计6对具有拓展PAMs序列的crRNA靶向位点,评估HkCpf1双切刻系统在哺乳动物基因组中的编辑效率。结果显示:3种AsCpf1突变体均能不同程度地提高报告基因的相对活性,并具有切割DNA单链的能力。在AsCpf1 crRNA发生突变和延伸后,它们仍然具有引导AsCpf1双切刻系统切割DNA单链的能力。HkCpf1不仅可以用做构建双切刻系统还具有较高的切割活性,并且可以识别5’-YTN和5’-TYYN PAMs序列,与AsCpf1相比,显著拓宽了其靶向范围。

关键词： CRISPR/Cpf1 双切刻系统突变体人工改造 crRNA

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铝合金板冲压摩擦试验机开发与试验

北京航空航天大学学报 2024年第6期50卷 1898-1910页

作者：李小强张贺刚王烁李高峰孟庆阔张永生北京航空航天大学机械工程及自动化学院北京100191 航发智造(北京)科技有限公司北京100083 首钢集团有限公司技术研究院北京100041

针对铝合金板冲压成形对摩擦测试的需求,确定考虑加热条件下铝合金板材冲压摩擦伺服压力摩擦测试平台的总体设计方案,开发适用于铝合金板材成形的小载荷高精度多功能摩擦试验机系统。该系统由运动组件、加热系统及控制系统组成。运动组... 详细信息

针对铝合金板冲压成形对摩擦测试的需求,确定考虑加热条件下铝合金板材冲压摩擦伺服压力摩擦测试平台的总体设计方案,开发适用于铝合金板材成形的小载荷高精度多功能摩擦试验机系统。该系统由运动组件、加热系统及控制系统组成。运动组件实现上模具和夹头的运动支撑;加热系统实现模具与试件单独加热;在伺服控制模式下,结合外部力传感器和光栅尺,实现试件压力和模具间隙高精度高稳定性控制。实际应用检验该试验机对不同因素的区分度和重复性,并设计正交试验,探索不同因素对铝合金板材摩擦的影响。结果表明:试验机性能稳定,重复性好;影响摩擦系数因素的重要次序为:模具温度、压力、速度、润滑剂;温度越低,压力越大,速度越快,摩擦系数越小;同一种类型的润滑剂对摩擦系数的影响较小。随着压力的增大,摩擦系数减少的趋势越来越小,逐渐趋于平稳。

关键词：摩擦试验机铝合金板冲压伺服控制摩擦试验摩擦学行为

基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因

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畜牧兽医学报 2023年第5期54卷 1905-1914页

作者：王子渲王巧张锦 Astrid lissette Barreto Sanchez 郑麦青李庆贺崔焕先安炳星赵桂苹文杰李和刚青岛农业大学动物科技学院青岛266109 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条... 详细信息

旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡,测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据,采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据,结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明,热应激组相比于对照组,北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因,其中169个上调表达,144个下调表达;广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因,其中152个上调表达,83个下调表达。利用WGCNA分析,在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块,在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因,发现两品种中均存在TRIM 29基因,说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析,揭示了不同鸡种在热应激下基因的表达差异规律,并鉴定到与耐热相关的候选基因,为进一步研究鸡的耐热机制提供了新的思路和线索。

关键词：北京油鸡广明白鸡热应激差异表达基因加权基因共表达网络分析

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接触网过渡施工技术

铁道建筑技术 2011年第1期 59-62页

作者：李和刚中铁十二局集团电气化工程有限公司太原030024

为配合线路施工,接触网就涉及到过渡工程,接触网过渡工程依据线路改造的不同情况,采取区间曲内拨转、区间曲外拨转、区间双线同时拨转、车站过渡施工。区间上下行换边、新建网与既有网接火等方案合理组织,为配合轨道改建工程创造施工开... 详细信息

为配合线路施工,接触网就涉及到过渡工程,接触网过渡工程依据线路改造的不同情况,采取区间曲内拨转、区间曲外拨转、区间双线同时拨转、车站过渡施工。区间上下行换边、新建网与既有网接火等方案合理组织,为配合轨道改建工程创造施工开通条件,并保证接触网改造施工顺利进行。

关键词：接触网铁道电气化铁路提速过渡方案

橡胶支座应用于地铁车站结构减震设计方法研究

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现代城市轨道交通 2024年第4期 43-50页

作者：李洋张梓鸿杜贺港麻全周中国铁道科学研究院集团有限公司城市轨道交通中心北京100081 北京工业大学城市与工程安全减灾教育部重点实验室北京100124 天津智能轨道交通研究院有限公司天津301700

参考建筑工程和桥梁工程中橡胶支座相关的设计方法和要求,基于地下结构的受力特性和地震反应特点,提出1套橡胶支座应用于地铁车站结构的减震设计方法。同时,以某实际两层两跨地铁车站为对象,采用有限元方法构建土-结构非线性全时程动力... 详细信息

参考建筑工程和桥梁工程中橡胶支座相关的设计方法和要求,基于地下结构的受力特性和地震反应特点,提出1套橡胶支座应用于地铁车站结构的减震设计方法。同时,以某实际两层两跨地铁车站为对象,采用有限元方法构建土-结构非线性全时程动力分析模型,橡胶支座采用精细化实体建模。基于该模型对有、无橡胶支座工况下地铁车站结构的地震反应进行对比分析。研究发现柱子布设橡胶支座后其损伤程度、层间位移与内力均显著降低,结果表明,橡胶支座布设于中柱端部后起到良好的减震效果,从而验证所提出的橡胶支座应用于地铁车站结构减震设计方法的有效性。

关键词：地铁车站结构橡胶支座柱子减震

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