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着丝粒蛋白U在结直肠癌患者肠组织中的表达情况及临床意义

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中国现代医生 2024年第11期62卷 1-6页

作者：王若淳黄伟葛思佳陈婧宣晗颜杨姜佳炜肖明兵陆翠华刘肇修南通大学附属医院消化内科江苏南通226001 南通大学附属医院临床医学研究中心江苏南通226001

目的旨在探讨着丝粒蛋白U(centromere protein U,CENpU)在结直肠癌患者肠组织中的表达情况,并结合生物信息学分析其表达水平对结直肠癌患者预后的影响。方法通过实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real time polymerase chain reac... 详细信息

目的旨在探讨着丝粒蛋白U(centromere protein U,CENpU)在结直肠癌患者肠组织中的表达情况,并结合生物信息学分析其表达水平对结直肠癌患者预后的影响。方法通过实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real time polymerase chain reaction,qrT-pCr)、蛋白质免疫印迹(Western blot,WB)法以及免疫组织化学染色(immunohistochemistry,IHC)实验验证CENpU在组织中的表达情况。结合患者临床病例资料,通过单因素和多因素Cox回归分析CENpU的表达与结直肠癌患者临床病例参数的相关性;然后通过绘制受试操作者操作特征(receiver operating characteristic,rOC)曲线和Kaplan-Meier生存曲线,探究CENpU的表达对结直肠癌患者预后的预测作用。最后,通过生物信息学分析CENpU的表达对结直肠癌疾病进展影响的可能分子机制。结果通过qrT-pCr、WB法以及IHC实验均发现,与正常组织比较,CENpU在结直肠癌患者癌组织中表达显著升高。Cox回归分析表明CENpU的表达与患者的年龄和TNM分期显著相关,是影响患者预后的危险因素。Kaplan-Meier生存曲线分析表明:CENpU高表达的结直肠癌患者的生存率显著降低。rOC曲线结果表明:基于CENpU的表达建立的模型具有较高的预测结直肠癌患者预后的能力。生物信息学分析结果表明:CENpI、CENpN、CENpD、CENpK、CENpp、CENpM、CENpQ、CENpH、NDC80以及ITGB3Bp这10个基因与CENpU基因具有相互作用关系;CENpU参与DNA修复、MYC/TArGETS/V1以及pI3K/AKT/MTOr等信号通路。结论结直肠癌患者癌组织中高表达的CENpU与患者的不良预后显著相关,提示CENpU有望成为结直肠癌患者早期诊断及预测预后的潜在靶点。

关键词：结直肠癌着丝粒蛋白U 富集分析

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稻-虾共作模式下水体和土壤细菌群落特征研究

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2024年第2期45卷 29-41页

作者：覃宝利韩光明吴雷明张家宏王守红朱凌宇毕建花寇祥明葛恒来陈选青唐金玉江苏里下河地区农业科学研究所江苏扬州225007 江苏省生态农业工程技术研究中心江苏扬州225008 扬州银谷农业生态发展有限公司江苏扬州225119 浙江省农业科学院水生生物研究所杭州310021

为探究稻-虾共作模式对稻田水体、土壤细菌群落结构和多样性的影响,采用16S rDNA基因高通量测序技术对夏季稻-虾共作和水稻单作模式下稻田水体、土壤细菌群落组成及多样性进行比较。结果表明:与水稻单作相比,稻-虾共作模式水体细菌群落... 详细信息

为探究稻-虾共作模式对稻田水体、土壤细菌群落结构和多样性的影响,采用16S rDNA基因高通量测序技术对夏季稻-虾共作和水稻单作模式下稻田水体、土壤细菌群落组成及多样性进行比较。结果表明:与水稻单作相比,稻-虾共作模式水体细菌群落丰富度和多样性均呈上升趋势,土壤细菌群落丰富度变化不明显,但多样性有所下降,尤其9月显著下降。在细菌群落组成方面,稻-虾共作模式增加水体放线菌门(Actinobacteria)和蓝细菌门(Cyanobacteria)相对丰度,降低变形菌门(proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、酸杆菌门(Acidobacteria)和芽孢杆菌目(Bacillus)相对丰度,增加致病菌不动杆菌属(Acinetobacter)的相对丰度;降低土壤放线菌门(Actinorny cetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)和根瘤菌目(rhizobiales)相对丰度,增加变形菌门、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)和Steroidobacterales目的相对丰度。功能预测分析发现,稻-虾共作模式下细菌碳水化合物代谢通路相对丰度在水体中呈上升趋势,在土壤中呈下降趋势。综上,稻-虾共作模式可改变水体、土壤细菌群落与功能,提高水体细菌群落的丰富度和多样性,降低土壤细菌群落的多样性。

关键词：稻-虾共作细菌群落多样性功能预测

基于ArMA模型的BDS卫星钟差异常值探测及其短期预报

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武汉大学学报（信息科学版） 2021年第2期46卷 244-251,261页

作者：韩松辉宫轶松李建文马朝忠李新娜郭淑妹信息工程大学基础部河南郑州450001 31002.队北京100091 信息工程大学地理空间信息学院河南郑州450001

星载原子钟在运行过程中会受到恶劣空间环境与设备老化等因素的影响,使得卫星钟差数据中经常存在异常值,其中AO(additive outlier)类异常值是钟差序列中常见的一类异常值。结合最大期望算法与自回归滑动平均(autoregressive moving aver... 详细信息

星载原子钟在运行过程中会受到恶劣空间环境与设备老化等因素的影响,使得卫星钟差数据中经常存在异常值,其中AO(additive outlier)类异常值是钟差序列中常见的一类异常值。结合最大期望算法与自回归滑动平均(autoregressive moving average,ArMA)模型,提出一种AO类异常值探测算法。该算法可以准确探测孤立AO类异常值与成片AO类异常值,有效克服了其他算法经常出现的淹没与掩盖现象。在成功探测钟差序列AO类异常值的同时,该算法可以估计得到精确的ArMA模型,进而能准确地进行卫星钟差预报。利用仿真数据与北斗卫星钟差实测数据进行计算分析,结果表明,所提算法可以精确探测出钟差序列AO类异常值,并且具有很好的卫星钟差预报效果。

关键词： ArMA模型异常值探测短期预报岭估计卫星钟差预报

基于SpA和多分类SVM的紫外-可见光光谱饮用水有机污染物判别方法研究

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光谱学与光谱分析 2020年第7期40卷 2267-2272页

作者：黄平捷李宇涵俞巧君王柯尹航侯迪波张光新浙江大学控制科学与工程学院工业控制技术国家重点实验室浙江杭州310027

快速、有效地识别饮用水中污染物类别对于降低突发饮用水污染事件影响十分重要。目前基于紫外-可见光光谱法的饮用水污染物判别模型大多使用主成分分析(pCA)进行特征提取,然而,对于光谱相似度较高的有机污染物,仅从数据驱动的角度提取... 详细信息

快速、有效地识别饮用水中污染物类别对于降低突发饮用水污染事件影响十分重要。目前基于紫外-可见光光谱法的饮用水污染物判别模型大多使用主成分分析(pCA)进行特征提取,然而,对于光谱相似度较高的有机污染物,仅从数据驱动的角度提取其方差最大的方向作为特征进行识别效果往往不佳。针对有机污染物光谱数据多重共线性以及谱峰重叠干扰的问题,开展了基于连续投影算法(SpA)和多分类支持向量机(M-SVM)的紫外-可见光光谱饮用水有机污染物判别方法研究。首先,使用紫外光谱仪测量苯酚、对苯二酚、间苯二酚和间苯二胺的原始光谱数据并进行预处理,在对四种污染物进行了波长与浓度的相关关系对比分析后,发现苯酚和间苯二酚、对苯二酚和间苯二胺的谱峰重叠较为严重;特征提取时,引入SpA筛选有机污染物紫外-可见光光谱数据的特征波长组合,并对不同波长个数时的光谱吸光度进行多元线性回归分析,选取对应最小预测标准偏差的参数及波段组合作为最优参数组合;基于最优特征波长组合,构建基于多分类SVM的饮用水有机污染物分类识别模型;最后,对比分析了全光谱、 pCA及SpA特征提取后的光谱数据在不同分类方法及不同污染物浓度下的分类效果,进一步说明了SpA的适用性和稳定性。实验结果表明, SpA作为一种提取光谱数据原始特征波段的方法,可以有效的对有机污染物的紫外-可见光光谱进行特征提取,提升不同物质之间的差异,在一定程度上消除多重共线性和谱峰重叠干扰,从而提高分类模型的准确率。该方法对于解决饮用水中谱峰重叠的污染物类型判别问题具有参考价值。

关键词：紫外-可见光光谱有机污染物判别连续投影算法多分类支持向量机

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卫星钟差异常值探测的抗掩盖与淹没型算法

测绘科学技术学报 2019年第4期36卷 346-352页

作者：马朝忠张倩倩韩松辉李新娜信息工程大学河南郑州450001 31002.队北京100094

北斗卫星导航系统(BDS)卫星钟差异常值处理过程中,由于成片异常值的存在,往往会产生掩盖与淹没现象,致使异常值探测效率不高甚至失败。基于求和自回归移动平均模型,分析了时间序列中成片加性AO(Additive Outlier)异常值探测时易产生掩... 详细信息

北斗卫星导航系统(BDS)卫星钟差异常值处理过程中,由于成片异常值的存在,往往会产生掩盖与淹没现象,致使异常值探测效率不高甚至失败。基于求和自回归移动平均模型,分析了时间序列中成片加性AO(Additive Outlier)异常值探测时易产生掩盖与淹没现象的原因;考虑了差分及逆差分对异常值探测的影响,提出了成片AO类异常值探测的抗掩盖与淹没新算法。通过仿真算例,验证了新算法对于序列中成片AO类异常值探测的准确性和有效性。将算法应用于BDS卫星钟差异常值探测和钟差预报中,较好地克服了数据中掩盖和淹没现象产生的影响,对于进一步提高卫星钟差的预报精度具有重要作用。

关键词：卫星钟差 AO类异常值掩盖与淹没求和自回归移动平均(ArIMA)模型差分