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雷蒙德氏棉和拟南芥基因启动子中顺式作用元件的分布

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遗传 2013年第10期35卷 1226-1236页

作者：孙高飞何守朴杜雄明中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室安阳455000 安阳工学院计算机科学与信息工程学院安阳455000

随着雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)基因组草图的完成,相关的基因组学研究已经全面展开。文章利用已公布的雷蒙德氏棉和拟南芥基因组序列,结合顺式作用元件(cis-regulatory element,CRE)数据库PLACE中的CRE序列信息,对两个物种中带有5... 详细信息

随着雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)基因组草图的完成,相关的基因组学研究已经全面展开。文章利用已公布的雷蒙德氏棉和拟南芥基因组序列,结合顺式作用元件(cis-regulatory element,CRE)数据库PLACE中的CRE序列信息,对两个物种中带有5′UTR注释的基因启动子上游1 000 bp序列进行CRE扫描和统计。结果表明,雷蒙德氏棉和拟南芥基因组中分别有44(12.3%)和57(15.5%)个CRE在启动子的特定位置呈峰状分布,其中在两个基因组均呈峰状分布的有34个,这些CRE又可以根据核心序列分为4大类。TATABOX类CRE顶峰在启动子中出现的位置和其真实位置(~30 bp)具有一致性,预示CRE真实位置在不同基因启动子中相对保守,从而推测本研究中呈峰状分布CRE的顶峰位置可能就是转录因子和该CRE结合的真实位置。而同一CRE在两个基因组中存在的位置差异则主要源于雷蒙德氏棉基因的5′UTR长度变异大于拟南芥。另外,文章还发现绝大多数峰状分布的CRE的位置都集中在110 bp^0 bp之间,这种集中的分布可能更有利于转录因子之间相互作用,从而调控下游基因的表达。

关键词：雷蒙德氏棉全基因组顺式作用元件

Microstructural evolution and mechanical properties of duplex-phase Ti6242 alloy treated by laser shock peening

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Transactions of Nonferrous Metals Society of China 2024年第8期34卷 2521-2532页

作者： pu-ying SHI Xiang-hong LIU Yong REN Zeng TIAN Feng-shou ZHANG Wei-feng he Institute of Aeronautics Engine School of Mechanical EngineeringXi’an Jiaotong UniversityXi’an 710049China Western Superconducting Technologies Co. Ltd.Xi’an 710018China School of Aeronautical Engineering Air Force Engineering UniversityXi’an 710038China

The effects of laser shock peening(LSP)on the microstructural evolution and mechanical properties of the Ti6242 alloy,including the residual stress,surface roughness,Vickers microhardness,tensile mechanical response,and high-cycle fatigue properties,were *** results showed that the LSP induced residual compressive stresses on the surface and near surface of the *** maximum surface residual compressive stress was−661 MPa,and the compressive-stress-affected depth was greater than 1000μ*** roughness and Vickers micro-hardness increased with the number of shocks,and the maximum hardness-affected depth was about 700μm after three LSP *** enhanced the fraction of low-angle grain boundaries,changed the grain preferred orientations,and notably increased the pole density ofαphase on the near surface from 2.41 to *** surface hardness values of the LSP samples increased with the increase of the number of shocks due to work hardening,while the LSP had a limited effect on the tensile *** high-cycle fatigue life of the LSP-treated sample was significantly enhanced by more than 20%compared with that of the untreated sample,which was caused by the suppression of the initiation and propagation of fatigue cracks.

关键词： duplex-phase Ti6242 alloy surface modification laser shock peening gradient microstructure high-cycle fatigue properties

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亚洲棉种质资源的SSR遗传多样性分析

棉花学报 2013年第3期25卷 217-226页

作者：周忠丽杜雄明潘兆娥何守朴棉花生物学国家重点实验室/中国农业科学院棉花研究所河南安阳455000

对我国棉花中期库保存的200份不同地理来源的亚洲棉代表性样本进行了SSR遗传多样性分析,结果表明:亚洲棉分子水平的遗传多样性较高。83个多态性位点共检测到368个等位基因变异,其中多态性的等位基因数为329个,平均每个SSR位点3.964个。... 详细信息

对我国棉花中期库保存的200份不同地理来源的亚洲棉代表性样本进行了SSR遗传多样性分析,结果表明:亚洲棉分子水平的遗传多样性较高。83个多态性位点共检测到368个等位基因变异,其中多态性的等位基因数为329个,平均每个SSR位点3.964个。位点多态性信息量(PIC)变幅为0.010～0.882,平均0.578,PIC值大于0.7的标记有33个(占39.8%)。基因多样性(H′)变幅为0.031～2.163,有效等位基因数(Ne)变幅为1.010～8.496。华南棉区基因遗传多样性最高,其次为长江流域棉区、黄河流域棉区,从理论上支持被广泛接受的亚洲棉在我国的传播路线是由南到北,华南棉区是中棉种系的遗传多样性富集中心。利用软件NYSTS-pc2.20,采用类平均法(UPGMA)进行聚类分析,种质间SSR相似系数变幅为0.58～0.997,平均0.745,在阈值0.73处200份亚洲棉聚为8个类群,贵池小子棉白子单独聚为一群,与其他种质遗传距离较远。遗传距离和地理距离没有必然联系,但种质间亲缘关系处于极端远或极端近时,则地理距离一般也趋于较远或较近。

关键词：亚洲棉遗传多样性 SSR标记

不同天然彩色棉纤维品质和纤维超微结构的差异

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棉花学报 2013年第2期25卷 184-188页

作者：茹宗玲王国喜何守朴杜雄明中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳455000 安阳工学院化学与环境工程学院河南安阳455000

对不同品种彩色棉纤维品质、纤维素含量、蜡质含量研究结果表明,纤维素含量越高、蜡质含量越少,纤维品质越好;同时电镜检测结果发现,棕色棉和绿色棉纤维中色素分布位置具有较明显差异,细胞中色素含量越少,纤维品质越好。从总体材料来看... 详细信息

对不同品种彩色棉纤维品质、纤维素含量、蜡质含量研究结果表明,纤维素含量越高、蜡质含量越少,纤维品质越好;同时电镜检测结果发现,棕色棉和绿色棉纤维中色素分布位置具有较明显差异,细胞中色素含量越少,纤维品质越好。从总体材料来看,绿色棉纤维品质总体最差,个别经过改良的棕色棉纤维品质已经达到甚至超过对照白棉;棕色棉纤维品质可能和其色泽深度有关系,颜色越浅纤维品质越好,这可能是因为与白色棉杂交改良的结果。

关键词：天然彩色棉超微结构纤维品质纤维素蜡质

Possibility of reaching the predicted center of the“island of stability”via the radioactive beam-induced fusion reactions

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Nuclear Science and Techniques 2024年第9期35卷 186-195页

作者： Ming-Hao Zhang Ying Zou Mei-Chen Wang Gen Zhang Qing-Lin Niu Feng-shou Zhang The Key Laboratory of Beam Technology of Ministry of Education School of Physics and AstronomyBeijing Normal UniversityBeijing 100875China Institute of Radiation Technology Beijing Academy of Science and TechnologyBeijing 100875China School of Physical Science and Technology Guangxi UniversityNanning 530004China Center of Theoretical Nuclear Physics National Laboratory of Heavy Ion Accelerator of LanzhouLanzhou 730000China

Based on the dinuclear system model,the synthesis of the predicted double-magic nuclei^(298)Fl and 304120 was investigated via neutron-rich radioactive beam-induced fusion *** reaction^(58)Ca+^(244)pu is predicted to be favorable for producing^(298)Fl with a maximal ER cross section of 0.301 *** of the entrance channel effect reveal that the^(244)pu target is more promising for synthesizing^(298)Fl than the neutron-rich targets^(248)Cm and^(249)Bk,because of the influence of the Coulomb *** the synthesis of 304120,the maximal ER cross section of 0.046 fb emerges in the reaction^(58)V+^(249)Bk,indicating the need for further advancements in both experimental facilities and reaction mechanisms.

关键词： Superheavy nuclei Dinuclear system model Fusion reaction Double-magic nucleus Radioactive beam

陆地棉幼苗NaCl胁迫下转录因子的转录组学分析

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作物学报 2017年第3期43卷 354-370页

作者：彭振何守朴龚文芳潘兆娥贾银华卢艳丽杜雄明中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳455000 四川农业大学玉米研究所四川温江611130

以棉花耐盐种质早熟长绒7号和感盐种质南丹巴地大花为材料,利用转录组测序(RNA-Seq)技术分析2个种质在200 mmol L–1 Na Cl胁迫4 h和24 h后幼苗叶片的转录因子家族及转录因子的表达情况。结果表明,从样本中鉴定出54个转录因子家族的281... 详细信息

以棉花耐盐种质早熟长绒7号和感盐种质南丹巴地大花为材料,利用转录组测序(RNA-Seq)技术分析2个种质在200 mmol L–1 Na Cl胁迫4 h和24 h后幼苗叶片的转录因子家族及转录因子的表达情况。结果表明,从样本中鉴定出54个转录因子家族的2815个转录因子。盐胁迫4 h后,长绒7号有249个转录因子基因表达发生变化;南丹巴地大花中有261个转录因子基因表达发生变化。在胁迫24 h后,2个种质对盐响应的转录因子数量均剧增。只在耐盐种质长绒7号特异表达的有106个(4 h)和184个(24 h)转录因子基因,对于2个种质共同表达的转录因子有143个(4 h)和282个(24 h)。通过筛选,鉴定出26个与耐盐相关的转录因子家族124个转录因子基因,并采用荧光定量验证转录组数据的准确性。推测高表达的11个转录因子的基因CotAD_66280(HD-ZIP)、CotAD_47058(ERF)、CotAD_18472(G2-like)、CotAD_04289(C2H2)、CotAD_57763(HSF)、CotAD_23656(TCP)、CotAD_02221(ERF)、CotAD_23975(WRKY)、CotAD_54036(MYB)、CotAD_27788(NAC)和CotAD_23815(HSF)有可能与陆地棉抗盐性密切相关,可作为陆地棉耐盐育种的候选基因源。

关键词：陆地棉 NaCl胁迫转录组分析转录因子

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棉花种质资源光子性状的遗传分析

遗传 2012年第8期34卷 1073-1078页

作者：孙亚莉贾银华何守朴周忠丽孙君灵庞保印杜雄明中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室安阳455000

文章利用来源于不同国家和地区的102份陆地棉材料和85份海岛棉材料分别与陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉毛子品种新海13号杂交,得到陆地棉和海岛棉两种F_1群体,同时从陆地棉F_1群体中随机选取呈隐性性状的材料"库光子"、"SA65"和"陆无絮... 详细信息

文章利用来源于不同国家和地区的102份陆地棉材料和85份海岛棉材料分别与陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉毛子品种新海13号杂交,得到陆地棉和海岛棉两种F_1群体,同时从陆地棉F_1群体中随机选取呈隐性性状的材料"库光子"、"SA65"和"陆无絮"后代,配制3个F_2分离群体,用于进一步研究陆地棉和海岛棉光子性状遗传特征。结果表明:(1)同一材料种植于不同生态区,其种子短绒多少存在变化,新疆和海南要少于安阳,说明棉花短绒多少和生态环境有关系;(2)陆地棉光子材料中26份(25.49%)呈显性遗传,8份(7.84%)呈不完全显性遗传,22(21.57%)份呈隐性遗传;海岛棉光子材料中5份(5.88%)呈显性遗传,16份(18.82%)呈部分显性遗传,9份(10.59%)呈隐性遗传。其余为隐性性状或显性性状不明显材料和毛子材料;(3)库光子的光子性状由两对隐性等位基因控制,并且有互补效应;陆无絮的光子性状由两对隐性等位基因控制,基因间呈积加作用;SA65的光子性状由单隐性基因控制。大量光子材料的初步鉴定为深入研究棉花纤维发育和育种利用提供了基础材料和理论依据。

关键词：棉花光子性状显隐性遗传分析

陆地棉矮化突变体Ari1327茎尖的转录组分析

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植物遗传资源学报 2014年第5期15卷 1046-1052页

作者：安文燕孙君灵龚文芳何守朴潘兆娥杜雄明华中农业大学生命科学技术学院武汉430072 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳455000

为了从分子水平上研究陆地棉矮秆突变体Ari1327的矮化机理,本研究以矮秆突变体Ari1327、野生型Ari971和高秆突变体Ari3697的茎尖为材料,建立3个cDNA文库,用Illumina HiSeqTM2000系统对3个材料的茎尖cDNA进行转录组测序。3个文库测序共得... 详细信息

为了从分子水平上研究陆地棉矮秆突变体Ari1327的矮化机理,本研究以矮秆突变体Ari1327、野生型Ari971和高秆突变体Ari3697的茎尖为材料,建立3个cDNA文库,用Illumina HiSeqTM2000系统对3个材料的茎尖cDNA进行转录组测序。3个文库测序共得4.9 G数据量,拼接得到Unigene 70877个。通过矮化突变体Ari1327与野生型Ari971和高秆突变体Ari3697两个文库的差异筛选,得到13919个与矮化相关的差异表达基因,其中5406个表现上调,8513个表现下调。GO功能和KEGG通路富集发现,差异基因在植物激素信号转导途径显著富集。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,推测Ari1327的矮化可能与赤霉素和生长素2种激素的信号转导及互作有关。转录组测序得到的大量差异基因,为深入研究棉花的矮化机理具有重要参考价值,同时为棉花的矮化育种工作奠定了基础。

关键词：棉花(Gossypium hirsutum L.) 矮化转录组

亚洲棉短绒突变体纤维发育及其差异基因表达分析

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作物学报 2020年第5期46卷 645-660页

作者：王晓阳王丽媛潘兆娥何守朴王骁龚文芳杜雄明中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳455000 棉花生物学国家重点实验室郑州研究基地/郑州大学河南郑州450001 中南林业科技大学/经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙410004

棉花纤维是重要的天然纺织材料,是最长的单细胞,是研究纤维发育的良好材料。本研究以亚洲棉短绒突变体(FZ)及其野生型(fz)为材料,结合扫描电镜、石蜡切片、RNA-seq技术,解析棉花短绒起始的可能机制。与野生型(fz)的0DPA时期胚珠相比,突... 详细信息

棉花纤维是重要的天然纺织材料,是最长的单细胞,是研究纤维发育的良好材料。本研究以亚洲棉短绒突变体(FZ)及其野生型(fz)为材料,结合扫描电镜、石蜡切片、RNA-seq技术,解析棉花短绒起始的可能机制。与野生型(fz)的0DPA时期胚珠相比,突变体的胚珠在该时期仅有少量的纤维起始。在+3DPA时,突变体没有短绒细胞起始,仅有长纤维细胞,而野生型有大量的短纤维细胞和长纤维细胞。对这2个材料的0DPA、+3DPA、+5DPA和+8DPA胚珠差异基因分析结果显示,在短绒突变体(FZ)和野生型(fz)的4个纤维发育时期共挖掘出3780个差异表达基因,其中0DPA时差异基因数目最少,随着胚珠发育时间的延长,差异基因的数目逐渐增加。KEGG分析发现这些基因主要参与蜡质、角质生物合成,以及苯丙烷代谢和植物信号传导过程。共表达趋势分析显示,在突变体+3DPA上调的差异基因中,参与离子结合、MAPK级联反应、氧化还原活性和转录调控的基因表达受到正影响(表达水平提高),造成突变体短绒纤维不能正常起始。这些结果描述了二倍体亚洲棉短绒起始的动态变化,可为进一步研究棉纤维发育提供参考。

关键词：亚洲棉短绒突变体差异表达基因共表达趋势