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Bioinformatics analysis and prediction for structure and function of nitric oxide synthase and similar proteins from Plasmodium berghei

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Asian Pacific Journal of Tropical Medicine 2011年第1期4卷 1-4页

作者： Zhigang Fan Gang Lv lingmin Zhang Xiufeng Gan Qiang Wu Saifeng Zhong Guogang Yan guifen lin School of Tropical and Laboratory Medicine Hainan Medical University Department of Parasitology Medical SchoolJinan University School of Nursing Hainan Medical University

ObjectiveTo search and analyze nitric oxide synthase (NOS) and similar proteins from Plasmodium berghei(Pb).MethodsThe structure and function of nitric oxide synthase and similar proteins from Plasmodium berghei were analyzed and predicted by bioinformatics.ResultsPbNOS were not available, but nicotinamide adenine dinucleotide 2′–phosphate reduced tetrasodium (NADPH)–cytochrome p450 reductase(CPR) were gained. PbCPR was in the nucleus of Plasmodium berghei, while 134aa–229aa domain was localize in nucleolar organizer. The amino acids sequence of PbCPR had the closest genetic relationship with Plasmodium vivax showing a 73% homology. The tertiary structure of PbCPR displayed the forcep–shape with wings, but no wings existed in the tertiary structure of its' host, Mus musculus(Mm). 137aa–200aa, 201aa–218aa, 220aa–230aa, 232aa–248, 269aa–323aa, 478aa–501aa and 592aa–606aa domains of PbCPR showed no homology with MmCPRs', and all domains were exposed on the surface of the protein.ConclusionsNOS can't be found in Plasmodium berghei and other Plasmodium species. PbCPR may be a possible resistance site of antimalarial drug, and the targets of antimalarial drug and vaccine. It may be also one of the mechanisms of immune evasion. This study on Plasmodium berghei may be more suitable to Plasmodium vivax. And 137aa–200aa, 201aa–218aa, 220aa–230aa, 232aa–248, 269aa–323aa, 478aa–501aa and 592aa–606aa domains of PbCPR are more ideal targets of antimalarial drug and vaccine.

关键词： Plasmodium berghei Nitric oxide synthase NADPH–cytochrome p450 reductase Drug target

基于双共轭梯度法医用加速器轫致辐射谱的重建

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核技术 2007年第8期30卷 694-698页

作者：林桂粉罗立民东南大学物理系南京211189 东南大学影像科学与技术实验室南京210096

本文应用双共轭梯度(BiConjugate Gradients,BiCG)法对4MV、10MV和15MV医用加速器的轫致辐射谱进行重建。以蒙特卡罗(MC)法的模拟结果为理论值,将BiCG法与Francois的谱向量代数(Spectral Vectorial Aalgebra,SVA)法的重建结果进行的比... 详细信息

本文应用双共轭梯度(BiConjugate Gradients,BiCG)法对4MV、10MV和15MV医用加速器的轫致辐射谱进行重建。以蒙特卡罗(MC)法的模拟结果为理论值,将BiCG法与Francois的谱向量代数(Spectral Vectorial Aalgebra,SVA)法的重建结果进行的比较表明,在透射系数未引入测量误差或测量得到的信噪比(SNR)较高时,在4—15MeV能量范围内,BiCG法比SVA法重建后的轫致辐射谱更加接近理论值;随着信噪比SNR的下降,BiCG法重建后的轫致辐射谱出现不稳定现象,而SVA法重建的结果则比较稳定。

关键词：轫致辐射谱重建谱向量代数法双共轭梯度法

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基于透射测量X射线谱的重建方法

数据采集与处理 2008年第1期23卷 75-79页

作者：林桂粉罗立民东南大学物理系南京211189 东南大学影像科学与技术实验室南京210096

对透射测量X射线谱两种重建方法进行评估。医用直线加速器产生的最大能量为10MeV X射线谱，用蒙特卡罗方法（Montecarlo，MC）模拟得到的值作为基准X射线谱，代入矩阵系统AF=T得到的穿透系数T，由穿透系数T分别应用谱向量代数法（Spectr... 详细信息

对透射测量X射线谱两种重建方法进行评估。医用直线加速器产生的最大能量为10MeV X射线谱，用蒙特卡罗方法（Montecarlo，MC）模拟得到的值作为基准X射线谱，代入矩阵系统AF=T得到的穿透系数T，由穿透系数T分别应用谱向量代数法（Spectra vectorial algebra，SVA）与双共轭梯度法（Biconjugate gradients，BiCG）来解矩阵系统AF=T，得到重建后的该X射线谱-↑F0与基准X射线谱F相比较，BiCG法比SVA法重建后的X射线谱声更加接近F，且T引入白高斯噪声项，以模拟穿透系数的测量误差，这一结果依然成立。当信噪比SNR高于90dB时，BiCG法比SVA法重建的X射线谱结果更理想。

关键词： X射线谱的重建蒙特卡罗方法谱向量代数法双共轭梯度法

基于三维Savitzky-Golay滤波的蒙特卡罗剂量分布去噪

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数据采集与处理 2006年第4期21卷 439-443页

作者：林桂粉罗立民东南大学物理系南京210096 东南大学生物医学工程系南京210096

提出了一种基于三维Sav itzky-G o lay滤波的蒙特卡罗(M C)剂量分布的去噪方法。该方法首先利用M C方法模拟粒子轨迹数目较少时得到剂量的三维分布,然后对该剂量分布用三维Sav itzky-G o lay平滑滤波方法进行去噪处理。结果表明:采用三... 详细信息

提出了一种基于三维Sav itzky-G o lay滤波的蒙特卡罗(M C)剂量分布的去噪方法。该方法首先利用M C方法模拟粒子轨迹数目较少时得到剂量的三维分布,然后对该剂量分布用三维Sav itzky-G o lay平滑滤波方法进行去噪处理。结果表明:采用三维Sav itzky-G o lay平滑滤波方法去噪,不仅提高了剂量分布的可视性,降低了M C计算剂量分布的不确定性,而且也相应地提高了M C剂量计算方法的计算效率。

关键词：蒙特卡罗方法 Savitzky-Golay滤波剂量分布去噪

2020—2021年河北省审定冬小麦品种抗病性分析

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中国植保导刊 2022年第3期42卷 50-51,64页

作者：董策李炎艳蔺桂芬路其祥肖磊河北省邯郸市农业科学院河北邯郸056001

为了解河北省冬小麦品种抗病性水平,以2020—2021年河北省审定的90个冬小麦品种为试验材料,分析其抗病性。结果表明,审定品种抗病性整体水平较低,其中抗条锈病小麦品种占比26.67%,抗白粉病小麦品种占比4.44%,抗叶锈病小麦品种占比6.67%... 详细信息

为了解河北省冬小麦品种抗病性水平,以2020—2021年河北省审定的90个冬小麦品种为试验材料,分析其抗病性。结果表明,审定品种抗病性整体水平较低,其中抗条锈病小麦品种占比26.67%,抗白粉病小麦品种占比4.44%,抗叶锈病小麦品种占比6.67%;兼抗条锈病和叶锈病以及兼抗3种病害的品种均为2个。经系谱分析发现,抗条锈病基因资源相对丰富,而抗白粉病和叶锈病的基因资源相对匮乏。今后应加强抗白粉病和叶锈病种质资源的培育和引进,并做好病害的监测和防控。

关键词：冬小麦品种抗病性锈病白粉病

脑卒中患者在急诊卒中绿色通道中常见症状及早期筛查的临床价值研究

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中国医药指南 2024年第3期22卷 71-73页

作者：李钰陈寒艳林桂芬江南大学附属医院急诊内科无锡214062

目的探讨脑卒中患者在急诊卒中绿色通道中常见症状及早期筛查的临床应用价值。方法 2022年1月开始,本院急诊卒中绿色通道中应用了早期筛查措施,选择实施前(2021年1月1日—12月31日)和实施后(2022年1月1日—12月31日)经急诊卒中绿色通... 详细信息

目的探讨脑卒中患者在急诊卒中绿色通道中常见症状及早期筛查的临床应用价值。方法 2022年1月开始,本院急诊卒中绿色通道中应用了早期筛查措施,选择实施前(2021年1月1日—12月31日)和实施后(2022年1月1日—12月31日)经急诊卒中绿色通道收治的脑卒中患者各70例,分别作为对照组和早筛组。对照组常规开启急诊卒中绿色通道接诊患者,此基础上,早筛组增加早期筛查处理,总结患者常见症状,对比两组急救效率、初步诊断结果等情况。结果早筛组急诊抢救时间、治疗后NIHSS评分、住院时间、转运意外事件发生率少于对照组(P <0.05)。早筛组急诊初步诊断与临床诊断结果符合率为95.71%(67/70),高于对照组(80.00%,56/70)(P <0.05)。结论急诊卒中绿色通道患者症状多样,及时进行早期筛查,可有效提升急救效率,改善患者预后,应用效果良好。

关键词：脑卒中急诊卒中绿色通道常见症状早期筛查应用价值

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秋季野生麦苗穗发芽抗性研究及分子标记检测

西南大学学报（自然科学版） 2022年第8期44卷 48-57页

作者：肖磊张希太董策谢淑芹蔺桂芬邯郸市农业科学院生物技术研究室河北邯郸056001

为获得小麦高抗穗发芽种质资源,秋季冬小麦播种耕地前(9月30日),从夏茬为冬小麦的大田中收集并集中移栽刚出土不久的野生麦苗,获得了118个野生麦苗系.经穗发芽抗性测定,78.80%的野生麦苗系达到了高抗级别,19.50%的野生麦苗系的穗发芽率... 详细信息

为获得小麦高抗穗发芽种质资源,秋季冬小麦播种耕地前(9月30日),从夏茬为冬小麦的大田中收集并集中移栽刚出土不久的野生麦苗,获得了118个野生麦苗系.经穗发芽抗性测定,78.80%的野生麦苗系达到了高抗级别,19.50%的野生麦苗系的穗发芽率为0.综合考虑农艺性状,选出ZZX21,ZZX46,ZZX63和ZZX1064种高抗穗发芽种质资源系,经连续15 d的模拟穗发芽测试,其相对穗发芽指数仅为0,0.039,0和0,达到了超高抗穗发芽水平.通过连续测定4个高抗穗发芽种质系种子的发芽率,发现从种子生理成熟开始至发芽率达到80.00%以上所需时间通常为40~60 d,其成熟种子具有强休眠特性和较长的休眠期.利用与小麦抗穗发芽基因紧密相关的Vp1B3和TaDFRBb分子标记,检测4个抗穗发芽种质系的基因组DNA,均未检测出阳性条带,说明其抗穗发芽基因是和Vp1B3,TaDFRBb标记基因不同的新类型,为小麦抗穗发芽育种提供了宝贵的新种质资源.

关键词：野生麦苗抗穗发芽分子标记检测

人参多糖和多抗甲素对动物红细胞变形能力的影响

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首都医学院学报 1995年第3期16卷 204-206页

作者：唐玉蔺桂芬首都医学院药理学教研室

研究了人参多糖、多抗甲素经体内、体外给药对红细胞变形能力的影响。实验表明，人参多糖和多抗甲素均可改善红细胞的变形能力，使其滤过速度增快，与生理盐水组比较均有显著性差异（分别为Ｐ＜０．０１．Ｐ＜０．０５），提示应用人参... 详细信息

研究了人参多糖、多抗甲素经体内、体外给药对红细胞变形能力的影响。实验表明，人参多糖和多抗甲素均可改善红细胞的变形能力，使其滤过速度增快，与生理盐水组比较均有显著性差异（分别为Ｐ＜０．０１．Ｐ＜０．０５），提示应用人参多糖和多抗甲素对降低血液粘度，抑制血栓形成都有良好的效果。

关键词：人参多糖多抗甲素实验药理红细胞变形能力

不同治疗时间窗对急性前壁心肌梗死患者行急诊冠脉介入治疗的效果

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中国卫生标准管理 2024年第2期15卷 121-125页

作者：李钰陈寒艳林桂芬江南大学附属医院急诊内科江苏无锡214062

目的探讨不同治疗时间窗急性前壁心肌梗死急诊冠脉介入治疗对其效果的影响。方法选取2021年1月—2022年12月江南大学附属医院行急诊冠脉介入治疗的140例急性前壁心肌梗死患者,其中70例患者发病后至急诊冠脉介入治疗时间<3 h作为<3 h组,7... 详细信息

目的探讨不同治疗时间窗急性前壁心肌梗死急诊冠脉介入治疗对其效果的影响。方法选取2021年1月—2022年12月江南大学附属医院行急诊冠脉介入治疗的140例急性前壁心肌梗死患者,其中70例患者发病后至急诊冠脉介入治疗时间<3 h作为<3 h组,70例患者发病后至急诊冠脉介入治疗时间为3~8 h作为3~8 h组。术后,复查冠脉造影观察病变血管狭窄程度改善情况,评估治疗效果。结果<3 h组总有效率(98.57%,69/70)高于3~8 h组(84.29%,59/70)(P<0.05)。<3 h组治疗后心肌损害指标低于3~8 h组(P<0.05)。<3 h组治疗后左心室收缩末期内径、左心室舒张末期内径、左心房内径少于3~8 h组(P<0.05),左心室射血分数(52.36±4.24)%、二尖瓣口舒张早期血流速度峰值/舒张晚期血流速度峰值(early diastolic peak blood flow velocity of mitral valve opening/late diastolic peak blood flow velocity,E/A)(1.33±0.18)高于3~8 h组[(47.13±5.16)%、(1.29±0.20)](P<0.05)。随访6个月,2组均未见病死者;<3 h组心绞痛、心律失常、心源性休克等不良心血管事件发生次数均低于3~8 h组(P<0.05)。结论急性前壁心肌梗死发病早期尽早实施冠脉介入治疗,可改善患者预后,临床效果更佳。

关键词：不同时机时间窗急性前壁心肌梗死急诊冠脉介入左心室射血分数