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The novel OCT4 spliced variant OCT4B1 can generate three protein isoforms by alternative splicing into OCT4B

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Journal of Genetics and Genomics 2010年第7期37卷 461-465页

作者： Yuan Gao Xia Wang Jin Han Zhifeng Xiao Bing Chen guannan su Jianwu Dai Key Laboratory of Molecular Developmental Biology Institute of Genetics and Developmental Biology Chinese Academy of Sciences Beijing 100190 China The Graduate School Chinese Academy of Sciences Beijing 100190 China

OCT4 is one of the key transcription factors in maintaining the pluripotency and self-renewal of embryonic stem （ES） *** OCT4 can generate two isoforms OCT4A and OCT4B by alternative ***4B1 is a recently discovered novel OCT4 spliced variant,which has been considered as a putative marker of *** with the OCT4B mRNA,OCT4B1 mRNA is generated by retaining intron 2 as a cryptic exon which contains a TGA stop codon in *** a result,the protein product of OCT4B1 mRNA could be ***,we present here that OCT4B1 can indirectly produce the same protein products as *** have demonstrated that OCT4B1 mRNA can be spliced into OCT4B mRNA,and encode three protein *** splicing of OCT4B1 mRNA into OCT4B mRNA can be remarkably inhibited by the mutation of the classical splicing *** result suggests that OCT4B mRNA may originate from OCT4B1 mRNA by alternative splicing.

关键词： OCT4 alternative splicing alternative translation initiation stress

Identification of differently expressed mRNAs by peripheral blood mononuclear cells in Vogt-Koyanagi-Harada disease

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Genes & Diseases 2022年第5期9卷 1378-1388页

作者： Yujing Li guannan su Fanfan Huang Ying Zhu Xiang Luo Aize Kijlstra Peizeng Yang The First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University Chongqing Key Lab of OphthalmologyChongqing Eye InstituteChongqing 400016PR China University Eye Clinic Maastricht Maastricht 6211the Netherlands

Vogt-Koyanagi-Harada disease(VKH)is a rare autoimmune disease characterized by diffuse and bilateral uveitis,alopecia,tinnitus,hearing loss,vitiligo and *** transcriptional expression pattern of peripheral blood mononuclear cells(PBMC)in VKH remains largely *** this study,mRNA sequencing was conducted in PBMC from VKH patients with active uveitis before treatment(n=7),the same patients after prednisone combined with cyclosporine treatment(n=7)and healthy control subjects strictly matched with gender and age(n=7).We found 118 differentially expressed genes(DEGs)between VKH patients and healthy control subjects,and 21 DEGs between VKH patients before and after ***1 was selected as a potential biomarker to monitor the development of VKH according to the mRNA *** Ontology(GO)and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)analysis were performed to predict the possible biological functions and signaling pathways of *** degranulation,peptidase regulator activity,secretory granule membrane,cellular response to peptide,growth factor binding and cell projection membrane were enriched as GO annotations of *** acid metabolism and mitogen-activated protein kinase(MAPK)signaling pathway were potential signaling pathways involved in pathogenesis and drug response of VKH.A protein–protein interaction(PPI)network was constructed by STRING,and colony stimulating factor 1 receptor(CSF1R)was identified as the hubgene of all DEGs by *** cell type presumed to contribute to the aberrant expression of DEGs was analyzed with the use of publicly available single-cell sequencing data of PBMC from a healthy donor and single-cell sequencing dataset of monocytes from VKH *** findings may help to decipher the underlying cellular and molecular pathogenesis of VKH and may lead novel therapeutic applications.

关键词： Vogt-KoyanagiHarada disease uveitis mRNA sequencing Peripheral blood mononuclear cells

A de novo missense mutation in MPP2 confers an increased risk of Vogt–Koyanagi–Harada disease as shown by trio-based whole-exome sequencing

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Cellular & Molecular Immunology 2023年第11期20卷 1379-1392页

作者： Xianyang Liu Jiayu Meng Xingyun Liao Yusen Liu Qian Zhou Zongren Xu Shuming Yin Qingfeng Cao guannan su Siyuan He Wanqian Li Xiaotang Wang Guoqing Wang Dali Li Peizeng Yang Shengping Hou The First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University ChongqingChina Chongqing Key Laboratory of Ophthalmology ChongqingChina Chongqing Eye Institute ChongqingChina Sichuan Provincial Key Laboratory for Human Disease Gene Study Sichuan Provincial People’s HospitalUniversity of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu611731China Department of Medical Oncology Chongqing University Cancer HospitalChongqing400030China Shanghai Frontiers Science Center of Genome Editing and Cell Therapy Shanghai Key Laboratory of Regulatory BiologySchool of Life SciencesEast China Normal UniversityShanghai200241China Beijing Institute of Ophthalmology Beijing Tongren Eye CenterBeijing Tongren HospitalCapital Medical UniversityBeijing Ophthalmology&Visual Sciences Key LaboratoryBeijing100730China

Vogt–Koyanagi–Harada(VKH)disease is a leading cause of blindness in young and middle-aged ***,the etiology of VKH disease remains ***,we performed the first trio-based whole-exome sequencing study,which enrolled 25 VKH patients and 50 controls,followed by a study of 2081 VKH patients from a Han Chinese population to uncover detrimental mutations.A total of 15 de novo mutations in VKH patients were identified,with one of the most important being the membrane palmitoylated protein 2(MPP2)p.K315N(MPP2-N315)*** MPP2-N315 mutation was highly deleterious according to bioinformatic ***,this mutation appears rare,being absent from the 1000 Genome Project and Genome Aggregation Database,and it is highly conserved in 10 species,including humans and *** studies showed that pathological phenotypes and retinal vascular leakage were aggravated in MPP2-N315 mutation knock-in or MPP2-N315 adeno-associated virus-treated mice with experimental autoimmune uveitis(EAU).In vitro,we used clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR‒Cas9)gene editing technology to delete intrinsic MPP2 before overexpressing wild-type MPP2 or *** of cytokines,such as IL-1β,IL-17E,and vascular endothelial growth factor A,were increased,and barrier function was destroyed in the MPP2-N315 mutant ARPE19 ***,the MPP2-N315 mutation had a stronger ability to directly bind to ANXA2 than MPP2-K315,as shown by LC‒MS/MS and Co-IP,and resulted in activation of the ERK3/IL-17E ***,our results demonstrated that the MPP2-K315N mutation may increase susceptibility to VKH disease.

关键词： Vogt-Koyanagi-Harada disease Whole exome sequencing De novo mutation Membrane palmitoylated protein 2 Annexin A2 ERK3/IL-17E pathway

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葡萄膜炎诊断中正确应用眼内液检测

眼科 2020年第3期29卷 161-165页

作者：杨培增徐菁苏冠男重庆医科大学附属第一医院眼科眼科学重庆市重点实验室重庆市眼科研究所400016

眼内液检测是指采用房水或玻璃体样本进行的实验室检查,可用于某些类型葡萄膜炎的诊断.本文概述了眼内液检测的具体内容和检查结果的解读,阐述了其在葡萄膜炎诊断中的适应证,并对目前此类检查中存在的误区及其带来的后果进行了剖析.绝... 详细信息

眼内液检测是指采用房水或玻璃体样本进行的实验室检查,可用于某些类型葡萄膜炎的诊断.本文概述了眼内液检测的具体内容和检查结果的解读,阐述了其在葡萄膜炎诊断中的适应证,并对目前此类检查中存在的误区及其带来的后果进行了剖析.绝大多数葡萄膜炎患者可根据病史、临床检查及辅助检查即可做出诊断,并不需要进行眼内液检测,仅在少数特定的炎症如眼内炎、肿瘤所致的伪装综合征、眼弓形虫病、眼弓蛔虫病等才需进行眼内液检测.过度依赖眼内液检测查找病因不仅增加了感染的风险,对多数葡萄膜炎的病因诊断帮助不大甚至误诊误治.

关键词：葡萄膜炎眼内液检测诊断

日本柳杉木构件内嵌钢填板销连接横纹承载性能

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林业科学 2020年第7期56卷 123-134页

作者：王朝晖吕洋波葛蓓清张忠利苏冠男田昭鹏中国林业科学研究院木材工业研究所中国林业科学研究院林业新技术研究所北京100091

【目的】研究日本柳杉木构件内嵌钢填板销连接在横纹荷载作用下的破坏机制和承载性能,为木结构梁、柱构件金属件连接时梁端销连接设计提供依据。【方法】在梁端部开槽钻孔后将单个钢销连接到内嵌钢填板,分别对日本柳杉锯材梁和胶合木梁... 详细信息

【目的】研究日本柳杉木构件内嵌钢填板销连接在横纹荷载作用下的破坏机制和承载性能,为木结构梁、柱构件金属件连接时梁端销连接设计提供依据。【方法】在梁端部开槽钻孔后将单个钢销连接到内嵌钢填板,分别对日本柳杉锯材梁和胶合木梁进行横纹荷载作用下的弯曲剪切加载试验,按照日本通行数据分析方法确定销连接短期承载力标准值,并与5个不同国家标准规定的屈服荷载计算值进行比较。【结果】加载初期,荷载-位移曲线呈线性关系,构件处于线弹性阶段,随着位移增加曲线呈非线性,构件进入弹塑性阶段,当位移增加到一定数值,梁端出现初始脆性开裂,荷载瞬间急速减小,随后荷载又随位移增加再次上升,加载至极限状态时,梁构件产生劈裂破坏丧失承载力;最终的破坏形态为梁构件沿销孔水平剪切面开裂、销连接屈服模式Ⅲ型;通过足尺试验得到断面尺寸120 mm×240 mm锯材梁和胶合木梁的钢填板单个销连接短期承载力标准值取决于屈服荷载,分别为8.6和13.7 kN,初始开裂对应的荷载平均值分别为15.0和21.1 kN,屈服荷载平均值分别为14.50和15.00 kN,最大荷载平均值分别为27.0和30.8 kN。【结论】胶合木梁钢填板销连接的最大荷载和屈服荷载平均值均大于锯材梁,且变异系数明显小于锯材梁,含水率低而变异小,从而导致试验获得胶合木梁销连接的短期承载力标准值明显高于锯材梁,当销连接作为中小断面梁柱构件的主要连接方式时,宜选用强度等级确定、质量合格的胶合木作为木构件,比锯材具有更高的连接承载力。梁端销连接节点承载力与单个销连接承载力和销数量具有良好的相关性,可作为梁柱节点梁端销连接设计依据。销连接部位发生销屈服后木材开裂,初始开裂取决于木材抗剪强度、横纹抗拉强度和销所在的梁高部位以及销孔到梁端的距离,发生初始开裂后钢销仍能起到支撑作用,连接节点延性较好;锯材梁和胶合木梁短期承载力标准值与标准中规定的屈服荷载公式计算值吻合度较好。各国标准中关于脆性破坏计算公式均能较好预测销连接木材的脆性破坏,与试验值比较,日本标准对于劈裂破坏的计算值最为接近,欧洲和加拿大标准的计算结果更趋于保守,我国现行标准在销连接设计中尚未考虑木材的脆性破坏,今后应进一步研究完善销连接计算公式和参数,更好地保证木构件连接安全可靠度。

关键词：日本柳杉木构件内嵌钢填板销连接横纹承载性能屈服模式脆性破坏

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卡尔曼滤波灰色模型在大坝变形预测中的应用

水电能源科学 2014年第4期32卷 37-40页

作者：苏观南郑东健孙斌斌河海大学水利水电学院江苏南京210098 河海大学水资源高效利用与工程安全国家工程研究中心江苏南京210098 河海大学水文水资源与水利工程科学国家重点实验室江苏南京210098

针对灰色模型在大坝变形预测中的不足,将灰色模型与卡尔曼滤波相结合应用于大坝变形预测中,即先使用卡尔曼滤波消除扰动误差,再进行灰色预测。实例应用表明,该组合模型比单纯灰色模型更适用于大坝的变形预测,可作为一种新的预测方法应... 详细信息

针对灰色模型在大坝变形预测中的不足,将灰色模型与卡尔曼滤波相结合应用于大坝变形预测中,即先使用卡尔曼滤波消除扰动误差,再进行灰色预测。实例应用表明,该组合模型比单纯灰色模型更适用于大坝的变形预测,可作为一种新的预测方法应用于大坝变形监测中。

关键词：大坝卡尔曼滤波灰色模型变形监测预测

改进多级模糊可拓方法在大坝变形评价中的应用

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人民长江 2014年第17期45卷 89-93页

作者：苏观南孔庆梅梁睿斌沈寿亮河海大学水利水电学院江苏南京210098 河海大学水资源高效利用与工程安全国家工程研究中心江苏南京210098 青海黄河水电公司大坝管理中心青海西宁810008

传统模糊可拓模型在大坝工作性态评价中,一般通过主观赋权法来确定物元特征的权重,而忽视了客观因素的影响。将同级的物元特征(即同级评价指标)关联度组成原始数据矩阵,再利用熵权法计算出该级物元特征的权重,而对于最底层的物元特征值... 详细信息

传统模糊可拓模型在大坝工作性态评价中,一般通过主观赋权法来确定物元特征的权重,而忽视了客观因素的影响。将同级的物元特征(即同级评价指标)关联度组成原始数据矩阵,再利用熵权法计算出该级物元特征的权重,而对于最底层的物元特征值则仍采用简单关联函数法确定权重,由此提出了一种改进的多级模糊可拓评价模型。随后选取某混凝土重力拱坝的3个典型坝段的变形性态进行评价,所得结果与实际情况相符,表明改进的多级模糊可拓方法可用于大坝工作性态的评价,且能避免人为确定权系数所造成的主观误差。

关键词：模糊可拓模型大坝变形熵权法物元特征权重

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基于蛇形分布式光纤的堤防浸润线定位试验

人民长江 2021年第3期52卷 193-197页

作者：苏观南徐勇俊袁叔洋朱昆浙江广川工程咨询有限公司浙江杭州310020 浙江省水利河口研究院浙江杭州310020 浙江省水利防灾减灾重点实验室浙江杭州310020

在堤防浸润线监测中,传统的光纤布置型式大部分采用直线布置,因光纤定位精度技术的限制,其监测结果受到严重影响。为提高堤防浸润线定位精度,根据测温光纤测点定位特点,设计并制作了一种新的蛇形分布式光纤用于浸润线的监测。通过水深... 详细信息

在堤防浸润线监测中,传统的光纤布置型式大部分采用直线布置,因光纤定位精度技术的限制,其监测结果受到严重影响。为提高堤防浸润线定位精度,根据测温光纤测点定位特点,设计并制作了一种新的蛇形分布式光纤用于浸润线的监测。通过水深测量试验模拟堤防浸润线监测,确定了新布型监测光纤长度与浸润线位置的关系式。计算水深与实际水深对比结果表明,两者之间的误差在3%以内,验证了蛇形分布式光纤新布型具有较高的定位精度。

关键词：浸润线监测蛇形分布式光纤定位试验堤防工程

纳布啡超前镇痛对颅脑外科手术患者全麻苏醒期躁动及炎症反应的干预作用

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郑州大学学报（医学版） 2020年第5期55卷 685-689页

作者：苏冠男王凯利董铁立夏莉郑州大学第二附属医院外科部麻醉科郑州450014

目的:观察纳布啡超前镇痛对颅脑外科手术患者全麻苏醒期躁动的干预效果,并探讨其对炎症反应的影响。方法:选择ASAⅠ级/Ⅱ级择期行颅脑肿瘤切除术的全麻患者100例,分为纳布啡组(N组)和对照组(C组)各50例。手术开始之前15 min,N组静脉注... 详细信息

目的:观察纳布啡超前镇痛对颅脑外科手术患者全麻苏醒期躁动的干预效果,并探讨其对炎症反应的影响。方法:选择ASAⅠ级/Ⅱ级择期行颅脑肿瘤切除术的全麻患者100例,分为纳布啡组(N组)和对照组(C组)各50例。手术开始之前15 min,N组静脉注射纳布啡0.2 mg/kg,C组给予等体积生理盐水;术后接同一配方静脉镇痛泵(PCA)。观察和记录患者全麻苏醒期躁动发生情况、拔管后Ramsay镇静评分和VAS疼痛评分,记录术后PCA追加次数。记录麻醉诱导前(T0)、手术开始时(T1)、手术缝皮结束时(T2)、拔管时(T3)、拔管后5 min(T4)、拔管后30 min(T5)、拔管后120 min(T6)的心率(HR)和平均动脉压(MAP),检测血清IL-6、CRP和TNF-α的浓度。结果:与C组比较,N组T1~T6的血清CRP、IL-6和TNF-α浓度降低,MAP、HR也降低(P<0.05);躁动发生率降低(P=0.043);T4~T6时VAS疼痛评分和术后PCA追加次数均减少(P<0.05),且N组无镇静过度发生。结论:纳布啡超前镇痛可减轻颅脑外科手术患者炎性反应和术后早期急性疼痛,稳定血流动力学指标,减少全麻苏醒期躁动。

关键词：纳布啡超前镇痛全麻苏醒期躁动炎性因子颅脑外科手术