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The structure of microbia. popula.ions in Nelore GIT revea.s inter-dependency of metha.ogens in feces a.d rumen.

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畜牧与生物技术杂志(英文版) 2020年第2期

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The structure of microbia. popula.ions in Nelore GIT revea.s inter-dependency of metha.ogens in feces a.d rumen

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Journa. of a.ima. Science a.d Biotechnology 2020年第2期11卷 577-586页

作者： Bruno G.N.a.dra.e flavia a.bressani Ra.a.l R.C.Cua.ra. Polya.a.C.Tizioto Priscila.S.N.de Oliveira.Gerson B.Mourão Luiz L.Coutinho Ja.es M.Reecy Ja.es E.Koltes Pa.l Wa.sh a.exa.dre Berndt Julio C.P.Pa.ha.es Lucia.a.C.a.Regita.o Embra.a.Southea.t Livestock São CarlosBrazil Depa.tment of Molecula. Epidemiology German Institute of Human Nutrition Potsdam-Rehbrücke(DIfE)NuthetalGermany NGS Genomic Solutions PiracicabaBrazil Depa.tment of a.ima. Science University of São Paulo/ESALQPiracicabaBrazil Depa.tment of a.ima. Science Iowa State UniversityAmesIAUSA NSilico Life Science DublinIreland

Ba.kground:The success of different species of rumina.ts in the coloniza.ion of a.diverse ra.ge of environments is due to their a.ility to digest a.d a.sorb nutrients from cellulose,a.complex polysa.cha.ide found in lea.es a.d *** rely on a.complex a.d diverse microbia. community,or microbiota.in a.unique compa.tment known a. the rumen to brea. down this *** in microbia. popula.ions of the rumen ca. a.fect the host’s development,hea.th,a.d ***,a.cessing the rumen is stressful for the ***,the development a.d use of a.terna.ive sa.pling methods a.e needed if this technique is to be routinely used in ca.tle *** this end,we tested if the feca. microbiome could be used a. a.proxy for the rumen microbiome due to its *** investiga.ed the ta.onomic composition,diversity a.d inter-rela.ions of two different GIT compa.tments,rumen a.d feces,of 26 Nelore(Bos indicus)bulls,using Next Genera.ion Sequencing(NGS)meta.a.coding of ba.teria.a.cha.a.a.d cilia.e ***:We identified 4265 a.plicon Sequence Va.ia.ts(a.Vs)from ba.teria.571 from a.cha.a.a.d 107 from protozoa.of which 143(96 ba.teria.a.d 47 a.cha.a.were found common between both *** most prominent ba.teria. phyla.identified were Ba.teroidetes(41.48%)a.d Firmicutes(56.86%)in the rumina. a.d feca. microbiomes,respectively,with Prevotella.a.d Ruminococca.ea. UCG-005 the most rela.ively a.unda.t genera.identified in ea.h *** most a.unda.t a.cha.a. phylum identified wa. Eurya.cha.ota.of which Metha.obreviba.ter gottscha.kii,a.metha.ogen,wa. the preva.ent a.cha.a. species identified in both *** were found exclusively identified in the rumen with Boza.ella.Tripluma.ia.being the most frequent genus ***-occurrence a.ong rumina. a.d feca. a.Vs reinforces the rela.ionship of microorga.isms within a.biologica. ***,the co-occurrence of sha.ed a.cha.a. a.Vs between microbiomes indica.

关键词： a.cha.a Ba.teria Bos indicus Meta.a.coding Metha.obreviba.ter Microbiome Microbiota

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