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Drug repurposing screen identifies vidofludimus calcium and pyrazofurin as novel chemical entities for the development of hepatitis E interventions

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Virologica Sinica 2024年第1期39卷 123-133页

作者： Hongbo Guo dan Liu Kuan Liu Yao Hou Chunyang Li Qiudi Li Xiaohui Ding Monique M.A.Verstegen j.kai Zhang Lingli Wang Yibo Ding Renxian Tang Xiucheng Pan Kuiyang Zheng Luc j.Wvan der Laan Qiuwei Pan Wenshi Wang Department of Pathogen Biology and Immunology Jiangsu Key Laboratory of Immunity and MetabolismJiangsu International Laboratory of Immunity and MetabolismXuzhou Medical UniversityXuzhou221004China Department of Gastroenterology and Hepatology Erasmus MC-University Medical CenterRotterdamNL-3015 CNthe Netherlands Department of Surgery Erasmus MC Transplant InstituteUniversity Medical CenterRotterdam3015CENL-3015 CNthe Netherlands Department of Infectious Diseases The Affiliated Hospital of Xuzhou Medical UniversityXuzhou221002China

Hepatitis E virus(HEV)infection can cause severe complications and high mortality,particularly in pregnant women,organ transplant recipients,individuals with pre-existing liver disease and immunosuppressed ***,there are still unmet needs for treating chronic HEV ***,we screened a best-in-class drug repurposing library consisting of 262 drugs/*** screening,we identified vidofludimus calcium and pyrazofurin as novel anti-HEV *** calcium is the next-generation dihydroorotate dehydrogenase(DHODH)inhibitor in the phase 3 pipeline to treat autoimmune diseases or SARS-CoV-2 *** selectively targets uridine monophosphate synthetase(UMPS).Their anti-HEV effects were further investigated in a range of cell culture models and human liver organoids models with wild type HEV strains and ribavirin treatment failure-associated HEV ***,both drugs exhibited a sizeable therapeutic window against *** instance,the IC50 value of vidofludimus calcium is 4.6–7.6-fold lower than the current therapeutic doses in ***,their anti-HEV mode of action depends on the blockage of pyrimidine ***,two drugs robustly inhibited ribavirin treatment failure-associated HEV mutants(Y1320H,G1634R).Their combination with IFN-αresulted in synergistic antiviral *** conclusion,we identified vidofludimus calcium and pyrazofurin as potent candidates for the treatment of HEV *** on their antiviral potency,and also the favorable safety profile identified in clinical studies,our study supports the initiation of clinical studies to repurpose these drugs for treating chronic hepatitis E.

关键词： Hepatitis Evirus(HEV) Drug repurposing Vidofludimus calcium Pyrazofurin Pyrimidine biosynthesis

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Biomolecular condensates and disease pathogenesis

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Science China Life Sciences 2024年第9期67卷 1792-1832页

作者： Ke Ruan Ge Bai Yanshan Fang dan Li Tingting Li Xingguo Liu Boxun Lu Qing Lu Zhou Songyang Shuguo Sun Zheng Wang Xin Zhang Wen Zhou Hong Zhang Neurology Department at Huashan Hospital State Key Laboratory of Medical Neurobiology and MOE Frontiers Center for Brain Science Institutes of Brain Science School of Life Sciences Fudan University Key Laboratory for the Genetics of Developmental and Neuropsychiatric Disorders Ministry of Education Bio-X Institutes Shanghai Jiao Tong University State Key Laboratory of Biocontrol MOE Key Laboratory of Gene Function and Regulation and Guangzhou Key Laboratory of Healthy Aging Research School of Life Sciences Sun Yat-sen Memorial HospitalSun Yat-sen University Department of Human Anatomy Histology and Embryology School of Basic Medicine Tongji Medical College Huazhong University of Science and Technology The Second Affiliated Hospital School of Basic Medical Sciences Institute of Biomedical Innovation Jiangxi Medical College Nanchang University Westlake Laboratory of Life Sciences and Biomedicine Department of Immunology and Microbiology School of Life Sciences Southern University of Science and Technology National Laboratory of Biomacromolecules Institute of Biophysics Chinese Academy of Sciences College of Life Sciences University of Chinese Academy of Sciences The First Affiliated Hospital & School of Life Sciences Ministry of Education Key Laboratory for Membrane-less Organelles & Cellular Dynamics Hefei National Research Center for Interdisciplinary Sciences at the Microscale Center for Advanced Interdisciplinary Science and Biomedicine of IHM Division of Life Sciences and Medicine University of Science and Technology of China Nanhu Brain-computer Interface Institute Department of Neurology of Second Affiliated Hospital and School of Brain Science and Brain Medicine Zhejiang University School of Medicine Interdisciplinary Research Center on Biology and Chemistry Shanghai Institute of Organic Chemistry Chinese Academy of Sciences University of Chinese Academy of Sciences Bio-X Institutes Key Laboratory for the Genetics of Developmental and Neuropsychiatric Disorders (Ministry of

Biomolecular condensates or membraneless organelles(MLOs) formed by liquid-liquid phase separation(LLPS) divide intracellular spaces into discrete compartments for specific functions. Dysregulation of LLPS or aberrant phase transition that disturbs the formation or material states of MLOs is closely correlated with neurodegeneration, tumorigenesis, and many other pathological processes. Herein, we summarize the recent progress in development of methods to monitor phase separation and we discuss the biogenesis and function of MLOs formed through phase separation. We then present emerging proof-of-concept examples regarding the disruption of phase separation homeostasis in a diverse array of clinical conditions including neurodegenerative disorders, hearing loss, cancers, and immunological diseases. Finally, we describe the emerging discovery of chemical modulators of phase separation.

关键词： liquid-liquid phase separation biomolecular condensate membraneless organelle

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服务业劳动者年龄结构对劳动生产率和工资的影响研究

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科学决策 2024年第4期 90-101页

作者：汤丹华侨大学统计学院/数量经济研究院

将年龄结构引入到Cobb-Douglas生产函数中,采用全国第六次人口普查和全国第七次人口普查的截面数据研究中国服务业劳动者年龄结构对劳动生产率和工资的影响,研究发现不同年龄区间劳动者比重对劳动生产率和工资的影响程度和影响方向存在... 详细信息

将年龄结构引入到Cobb-Douglas生产函数中,采用全国第六次人口普查和全国第七次人口普查的截面数据研究中国服务业劳动者年龄结构对劳动生产率和工资的影响,研究发现不同年龄区间劳动者比重对劳动生产率和工资的影响程度和影响方向存在差异。劳动者数量对劳动生产率影响为负向,16-24岁、25-34岁和45-54岁劳动者比重对劳动生产率产生正向影响,而55-64岁和65-74岁对劳动生产率的影响分别由负转正和由正转负。劳动者数量及各年龄段劳动者比重对工资水平产生正向影响。因此,提出对不同行业劳动者教育水平进行合理要求、综合考虑不同年龄段劳动者能力以及给予老年劳动者合适的工作岗位等政策建议。

关键词：服务业劳动力年龄结构劳动生产率工资

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纳米塑料和砷对斑马鱼的联合毒性

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中国环境科学 2024年第4期44卷 2345-2356页

作者：吕敏李国新李青松邱陈陈张丹丹厦门理工学院环境科学与工程学院厦门市水资源利用与保护重点实验室福建厦门361024 中国科学院城市环境研究所福建厦门361021

以斑马鱼为供试生物,采用半静态实验法,将其分别暴露于5mg/L聚苯乙烯纳米塑料(PS-NPs),1、10和100μg/L砷(As)单一及其复合污染中7d,探讨PS-NPs影响下As在斑马鱼肝脏、肠道、鳃和肌肉组织中的积累,肝脏和鳃中PS-NPs的荧光强度和应激响应... 详细信息

以斑马鱼为供试生物,采用半静态实验法,将其分别暴露于5mg/L聚苯乙烯纳米塑料(PS-NPs),1、10和100μg/L砷(As)单一及其复合污染中7d,探讨PS-NPs影响下As在斑马鱼肝脏、肠道、鳃和肌肉组织中的积累,肝脏和鳃中PS-NPs的荧光强度和应激响应.结果表明:PS-NPs能在斑马鱼的肝脏和鳃中富集,且促进As在斑马鱼各组织中的积累.在5mg/L PS-NPs和100μg/L As复合污染下,肝脏、鳃、肠道和肌肉组织的As含量较As单一暴露时分别上升了35.18%、147.33%、163.12%和66.96%.PS-NPs和As的共同暴露导致肝脏的GST和GPx活性增加,MDA含量减少,氧化胁迫减弱.而鳃的GSH含量和GST活性减少,MDA含量增加,氧化胁迫增强.高浓度(100μg/L)As叠加PS-NPs后,鳃中AChE活性显著降低.相比单一As胁迫,混合暴露导致肝脏和鳃中gpx,Mn-sod,Cu/Zn-sod和ache表达量下降,PS-NPs的存在能降低As对斑马鱼氧化应激和神经毒性相关基因的诱导表达量.

关键词：斑马鱼纳米塑料砷氧化胁迫复合污染

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结合Kd-树和熵编码的密文图像可逆数据隐藏

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中国图象图形学报 2024年第2期29卷 395-407页

作者：金丹徐达文长安大学信息工程学院西安710064 宁波工程学院网络空间安全学院宁波315211

目的密文图像可逆数据隐藏技术既可以保证载体内容不被泄露,又可以传递秘密信息,在军事、医疗等方面发挥着重要的作用。然而,以往的大多数方法存在图像冗余未被充分利用、数据嵌入容量不足等问题。为解决这些问题,提出了一种结合Kd-树... 详细信息

目的密文图像可逆数据隐藏技术既可以保证载体内容不被泄露,又可以传递秘密信息,在军事、医疗等方面发挥着重要的作用。然而,以往的大多数方法存在图像冗余未被充分利用、数据嵌入容量不足等问题。为解决这些问题,提出了一种结合Kd-树和熵编码的高容量密文图像可逆数据隐藏算法。方法该方法在图像加密之前需要对图像应用中值边缘检测(median-edge detector,MED)算法计算预测误差,并把得到的预测误差绝对值图像划分为两个区域:S0区域和S1区域。根据Kd-树标签算法和熵编码生成辅助信息,在对图像使用加密密钥Ke加密之后嵌入辅助信息,生成加密图像;在秘密数据嵌入阶段,根据附加信息和数据隐藏密钥嵌入秘密数据,生成载密图像;在解密阶段可以根据附加信息、图像加密密钥和数据隐藏密钥提取秘密数据并无损恢复图像。结果实验测试了BOWS-2(break our watermarking system 2nd)数据集,平均嵌入容量为3.910 bit/像素。与现有的几种方法进行比较,该算法可以获得更高的秘密数据嵌入容量。结论该方法在图像加密前腾出空间,与相关算法相比,实现了更高的嵌入容量,并且可以实现原始图像的无损恢复。

关键词：图像加密 Kd-树标签 MED预测器可逆数据隐藏(RDH) 预测误差

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终电压对铝合金Mo和V黑色微弧氧化膜形成过程的影响

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表面技术 2024年第9期53卷 34-42页

作者：刘圆敬刘丹单大勇韩恩厚广东腐蚀科学与技术创新研究院广州510530

目的以钼酸盐和钒酸盐为着色剂,探究终电压对黑色微弧氧化膜形成过程的影响。方法在六偏磷酸钠和硅酸钠的微弧氧化体系中,添加NH4VO_(3)和Na2MoO4作为着色剂,在清洁的6063铝合金表面获得不同终电压下的微弧氧化膜,通过SEM、XRD、XPS分... 详细信息

目的以钼酸盐和钒酸盐为着色剂,探究终电压对黑色微弧氧化膜形成过程的影响。方法在六偏磷酸钠和硅酸钠的微弧氧化体系中,添加NH4VO_(3)和Na2MoO4作为着色剂,在清洁的6063铝合金表面获得不同终电压下的微弧氧化膜,通过SEM、XRD、XPS分析膜层的形貌、结构和成分,通过色差仪和紫外可见分光光度计表征膜层的颜色特性和吸光率,通过极化曲线和电化学阻抗谱分析膜层的电化学性能。结果膜层的主要成分为O、Al、P、Si、Mo、V,其中Mo、V以MoO_(3)、MoO_(2)、V_(2)O_(5)、V_(2)O_(3)的形式存在。当终电压从350 V提高至550 V时,微弧氧化膜层的微孔变得少而大,颜色由褐色逐渐变为黑色,L从65.01减小到22.63,对可见光(波长250~800 nm)的吸收率从69.4%增至96.5%以上,膜层厚度和粗糙度从4.00、0.55μm分别增至35.00、2.41μm,自腐蚀电流密度降至1.48×10^(−6) A/cm^(2),自腐蚀电位(***)正移至−0.07 V,阻抗值大幅提高,达到2.48×10^(5)Ω·cm^(2)。结论NH_(4)VO_(3)、Na2MoO4是铝合金黑色微弧氧化的有效着色剂,反应生成的V_(2)O_(5)、V_(2)O_(3)、MoO_(3)、MoO_(2)是膜层呈现黑色的根本原因,随着终电压的升高,膜层吸光率和耐蚀性均提高,氧化膜的完整性对膜层性能的影响显著。

关键词：铝合金黑色微弧氧化耐蚀性着色机理吸光率电化学

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苜蓿叶片结构和光合特性对菌磷添加的响应

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草业学报 2024年第8期33卷 133-144页

作者：张盈盈胡丹丹马春晖张前兵石河子大学动物科技学院新疆石河子832003

探究菌磷互作对紫花苜蓿叶片解剖结构及光合特性的影响机制,明确紫花苜蓿叶片结构与光合参数之间的关系。采用双因素完全随机区组设计,接菌处理分别为单接种胶质芽孢杆菌(j.(1))、巨大芽孢杆菌(j.(2))、两种菌混合接种(j.(3))和不接种(j...

探究菌磷互作对紫花苜蓿叶片解剖结构及光合特性的影响机制,明确紫花苜蓿叶片结构与光合参数之间的关系。采用双因素完全随机区组设计,接菌处理分别为单接种胶质芽孢杆菌(j.(1))、巨大芽孢杆菌(j.(2))、两种菌混合接种(j.(3))和不接种(j.(0)),施磷处理为施磷(P_(2)O_(5))100 mg·kg^(-1)(P_(1))和不施磷(P_(0))。通过对紫花苜蓿叶片光合参数和解剖结构指标进行测定,并使用回归分析明确叶片光合特性与解剖结构之间的关系。结果表明,在相同接菌条件下,紫花苜蓿叶片厚度、上表皮厚度、下表皮厚度、栅栏组织厚度、海绵组织厚度、导管直径、筛管直径、净光合速率日均值(P_(n))、蒸腾速率日均值(T_(r))、气孔导度日均值(G_(s))均为P_(1)处理大于P_(0)处理;叶绿素相对含量(SPAD值)均为P_(1)处理显著大于P_(0)处理(Pj.(3)处理达到最大值;而C_(i)日均值为施菌处理小于未施菌处理。菌、磷对苜蓿叶片厚度、上表皮厚度、下表皮厚度、栅栏组织厚度、海绵组织厚度、导管直径有极显著的影响(Pj.(3)P_(1)>j.(1)P_(1)>j.(2)P_(1)>j.(3)P_(0)>j.(0)P_(1)>j.(1)P_(0)>j.(2)P_(0)>j.(0)P_(0),即共同接种胶质芽孢杆菌和巨大芽孢杆菌,并施磷(P_(2)O_(5))100 mg·kg^(-1)时有利于促进紫花苜蓿叶片各组织的生长发育,进而促进紫花苜蓿叶片的光合进程。

关键词：紫花苜蓿解磷细菌磷叶片结构光合特性

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可能性分布距离度量:一种鲁棒的域适应学习方法

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计算机科学与探索 2024年第3期18卷 674-692页

作者：但雨芳陶剑文宁波职业技术学院人工智能应用研究所浙江宁波315800

领域适应(DA)学习旨在解决训练数据集与测试数据集分布不一致问题而广受关注,现有方法大多采用最小化领域间最大均值差(MMD)或其变体来解决域分布不一致问题。然而,领域中存在的噪声数据将会导致领域均值发生明显漂移,会在一定程度上影... 详细信息

领域适应(DA)学习旨在解决训练数据集与测试数据集分布不一致问题而广受关注,现有方法大多采用最小化领域间最大均值差(MMD)或其变体来解决域分布不一致问题。然而,领域中存在的噪声数据将会导致领域均值发生明显漂移,会在一定程度上影响基于MMD及其变体的学习方法的适应性能。故此,提出了可能性分布距离度量下的一种鲁棒的域适应学习方法:首先,将传统MMD准则变换为新颖的可能性聚类模型来削弱噪声数据所带来的影响,以此构建一种鲁棒的可能性分布距离度量(P-DDM)准则,并通过引入模糊熵正则项来进一步提升领域分布配准的鲁棒有效性。其次,基于P-DDM准则,提出一种鲁棒的域适应视觉分类机(C-PDDM),其引入图拉普拉斯矩阵来保留源域与目标域内部数据间的几何结构一致性,以提升标签传播性能,同时通过最大化利用源域判别信息进行最小化领域判别误差,以进一步提升学习模型的泛化性能。理论分析证实,在一定条件下,所提P-DDM是传统分布距离度量方法MMD准则的一个上界,因而通过最小化P-DDM能有效优化MMD目标。最后,与几个代表性的领域适应学习方法进行比较,在6个视觉基准数据集(Office31、Office-Caltech、Office-Home、PIE、MNIST-UPS和COIL20)上的实验结果显示,该方法在泛化性能上平均提升了5%左右,在鲁棒性能上平均提升了10%左右。

关键词：领域适应(DA) 可能性聚类最大均值差(MMD) 模糊熵

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Unveiling the pressure-driven metal–semiconductor–metal transition in the doped TiS_(2)

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Chinese Physics B 2024年第6期33卷 63-67页

作者：陈佳骏吕心邓李思敏但雅倩黄艳萍崔田 Institute of High Pressure Physics School of Physical Science and TechnologyNingbo UniversityNingbo 315211China State Key Laboratory of Superhard Materials College of PhysicsJilin UniversityChangchun 130012China

Conventional theories expect that materials under pressure exhibit expanded valence and conduction bands,leading to increased electrical ***,we report the electrical properties of the doped 1T-TiS_(2) under high pressure by electrical resistance investigations,synchrotron x-ray diffraction,Raman scattering and theoretical *** to 70 GPa,an unusual metal-semiconductor-metal transition *** first-principles calculations suggest that the observed anti-Wilson transition from metal to semiconductor at 17 GPa is due to the electron localization induced by the intercalated Ti *** electron localization is attributed to the strengthened coupling between the doped Ti atoms and S atoms,and the Anderson localization arising from the disordered *** pressures exceeding 30.5 GPa,the doped TiS_(2) undergoes a re-metallization transition initiated by a crystal structure phase *** assign the most probable space group as P2_(1)2_(1)2_(1).Our findings suggest that materials probably will eventually undergo the Wilson transition when subj.cted to sufficient pressure.

关键词： high pressure transition metal dichalcogenides doped TiS_(2) electronic phase transition

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The super-pangenome of Populus unveils genomic facets for its adaptation and diversification in widespread forest trees

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Molecular Plant 2024年第5期17卷 725-746页

作者： Tingting Shi Xinxin Zhang Yukang Hou Changfu j.a Xuming dan Yulin Zhang Yuanzhong j.ang Qiang Lai j.aj.n Feng j.anj. Feng Tao Ma j.ali Wu Shuyu Liu Lei Zhang Zhiqin Long Liyang Chen Nathaniel R.Street Par K.Ingvarsson j.anquan Liu Tongming Yin j.ng Wang Key Laboratory for Bio-Resources and Eco-Environment of Ministry of Education College of Life SciencesSichuan UniversityChengduSichuanChina College of Horticulture and Forestry Tarim UniversityAlar 843300China Umea Plant Science Centre Department of Plant PhysiologyUmea UniversityUmeaVasterbottenSweden Linnean Centre for Plant Biology Department of Plant BiologyUppsala BioCenterSwedish University of Agricultural SciencesUppsalaSweden The Key Laboratory of Tree Genetics and Biotechnology of j.angsu Province and Education Department of China Nanjing Forestry UniversityNanjingJiangsuChina

Understanding the underlying mechanisms and links between genome evolution and adaptive innovations stands as a key goal in evolutionary ***,among the world’s most widely distributed and cultivated trees,exhibit extensive phenotypic diversity and environmental *** this study,we present a genus-level super-pangenome comprising 19 Populus genomes,revealing the likely pivotal role of private genes in facilitating local environmental and climate *** the integration of pangenomes with transcriptomes,methylomes,and chromatin accessibility mapping,we unveil that the evolutionary traj.ctories of pangenes and duplicated genes are closely linked to local genomic landscapes of regulatory and epigenetic architectures,notably CG methylation in gene-body *** comparative genomic analyses have enabled the identification of 142202 structural variants across species that intersect with a significant number of genes and contribute substantially to both phenotypic and adaptive *** have experimentally validated a∼180-bp presence/absence variant affecting the expression of the CUC2 gene,crucial for leaf serration ***,we developed a user-friendly web-based tool encompassing the multi-omics resources associated with the Populus super-pangenome(http://***).Together,the present pioneering super-pangenome resource in forest trees not only aids in the advancement of breeding efforts of this globally important tree genus but also offers valuable insights into potential avenues for comprehending tree biology.

关键词： Populus pangenomes whole-genome duplication structural variation genome evolution

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