检索结果-南通市图书馆

Asian Herpetological Research 2012年第4期3卷 322-326页

作者： Zhaohui XIE Haijun LI Boying LI Linna CHENG Anfang ZHAO cunshuan xu Department of Bioengineering Henan University of Urban Construction College of Life Sciences and Key Laboratory for Cell Differentiation Regulation Henan Normal University

The pigmentation in the liver of Chinese fire-bellied newt(Cynops orientalis) was described during two periods of the annual cycle(summer activity and winter hibernation). A large number of melanin granules were gathered into clusters and distributed unevenly inside the pigment cells. Liver pigmentation(melanin content) was found unstable,varying during the annual cycle. During the hibernation period,pigmentation accumulation was shown to increase in the liver of the Chinese fire-bellied newt. Hepatocytes during the active period are approximately 14.64% larger than those in the hibernation period,while the nucleus is approximately 7.43% bigger during the active period when compared with that during the hibernation period. These findings indicate that variation in pigment distribution and hepatocyte morphology in Chinese fire-bellied newt liver may be an ecologically adaptive strategy to the adverse physiological conditions during hibernation.

关键词： Chinese fire-bellied newt histology pigment cell hepatocyte seasonal variation

Expression Patterns of the Cell Junction-associated Genes During Rat Liver Regeneration

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Journal of Genetics and Genomics 2007年第10期34卷 892-908页

作者：李红蕾陈晓光张富春马纪徐存拴新疆大学生命科学与技术学院河南师范大学生命科学学院新乡453007

To study actions of the genes associated with tight junction, adherent junction, focal adhesion, and gap junction during liver regeneration （LR）, these genes were obtained by collecting data from databases and thesis, and their expression profiles in rat regenerating liver were detected employing Rat Genome 230 2.0 array. Next the LR-associated genes were identified by comparing the difference between sham operation （SO） and partial hepatectomy （PH） groups. 79, 53, 109, 53 genes involved in the above four junctions were found to be LR-associated. The initial and total expression numbers of these genes occurring in the initial phase of LR, G0/G1, cell proliferation, cell differentiation, and structure-functional rebuilding were 124, 43, 122, 10, and 249, 145, 957, 306, respectively, illustrating that genes were initi^ly expressed mainly in the initiation stage, and functioned in different phases. Up-regulation-and down-regulation to a total of 972 and 540 times, as well as, 41 types of expression patterns showed that the physiological and biochemical activities were diverse and complicated in LR. According to the data, there was an increase in the forepart and prophase, but a decrease in late-metaphase and anaphase for gap junction assembly. Focal adhesion formation displayed an enhancement in forepart, prophase, and anaphase; and formation of tight junctions and adherent junctions last throughout the LR.

关键词： partial hepatectomy (PH) rat genome 230 2.0 array cell junction genes associated with LR

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ZNF143调控基因表达的机理

中国细胞生物学学报 2017年第7期39卷 970-977页

作者：叶丙雨徐存拴河南师范大学生命科学学院省部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地新乡453007

ZNF143(zinc finger protein 143)是由7个锌指结构组成的C2H2型转录因子,其在绝大多数脊椎动物的不同组织、细胞中广泛表达。但通常情况下,ZNF143在癌组织、胚胎发育过程中的表达高于正常组织。研究发现,ZNF143主要通过参与编码和非编... 详细信息

ZNF143(zinc finger protein 143)是由7个锌指结构组成的C2H2型转录因子,其在绝大多数脊椎动物的不同组织、细胞中广泛表达。但通常情况下,ZNF143在癌组织、胚胎发育过程中的表达高于正常组织。研究发现,ZNF143主要通过参与编码和非编码基因的激活,从而在细胞周期、细胞增殖与分裂等细胞活动中发挥重要作用。更为重要的是,近几年研究表明,ZNF143通过与其他调控蛋白质形成转录起始复合物来介导远距离染色质的相互作用,从而参与染色质结构的形成,推测其在细胞身份及命运决定中发挥重要功能。此外,由于ZNF143的表达异常往往伴随着肿瘤的发生,因此,近些年针对ZNF143来设计药物靶点的研究也取得了一定的进展。

关键词：锌指结构转录因子锌指蛋白143 染色质结构

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哺乳动物脂蛋白脂肪酶基因的进化研究

生物技术通报 2010年第10期26卷 139-142,148页

作者：杨献光刘奕徐存拴河南师范大学生命科学学院新乡453007 省部共建细胞分化调控重点实验室新乡453007

脂蛋白脂肪酶(LPL)是脂肪细胞、心肌细胞、骨骼肌细胞、乳腺细胞以及巨噬细胞等实质细胞合成和分泌的一种糖蛋白,其生理功能为促进乳糜微粒和极低密度脂蛋白中甘油三脂(TG)的分解,此外,lpl基因的异常可导致血TG水平的升高和高密度脂蛋... 详细信息

脂蛋白脂肪酶(LPL)是脂肪细胞、心肌细胞、骨骼肌细胞、乳腺细胞以及巨噬细胞等实质细胞合成和分泌的一种糖蛋白,其生理功能为促进乳糜微粒和极低密度脂蛋白中甘油三脂(TG)的分解,此外,lpl基因的异常可导致血TG水平的升高和高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平的降低,导致冠状动脉粥样硬化等疾病的形成和发展。采用生物信息学手段来分析在不同哺乳动物中lpl基因的长度多态性、终止密码子多态性、ORF多态性以及氨基酸序列的同源性,建立不同哺乳动物lpl基因上的进化关系图谱,为了解哺乳动物脂蛋白脂肪酶基因的演化关系,研究该基因的作用机理提供资料。

关键词：脂蛋白脂肪酶基因序列多态性系统进化

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Importin的结构与功能研究进展

中国细胞生物学学报 2015年第7期37卷 1013-1020页

作者：郭建林徐存拴河南省–科技部共建细胞分化调控国建重点实验室培育基地新乡453007 河南师范大学生命科学学院新乡453007

输入蛋白(importin)是一类广泛分布于真核生物、相对保守的,将胞质内的转录因子、剪接因子、核糖体蛋白和病毒衣壳蛋白等通过核孔复合体运输到核内的蛋白。Importin由α和β两个亚基构成,每个亚基又包含多个成员。研究表明,importin与... 详细信息

输入蛋白(importin)是一类广泛分布于真核生物、相对保守的,将胞质内的转录因子、剪接因子、核糖体蛋白和病毒衣壳蛋白等通过核孔复合体运输到核内的蛋白。Importin由α和β两个亚基构成,每个亚基又包含多个成员。研究表明,importin与再生、肿瘤、阿尔茨海默病、口蹄疫病等及其他疾病的发生紧密相关。该文就importin的基因结构、蛋白结构、功能以及与生理和病理活动的相关性等方面的研究进展进行简要总结。

关键词：输入蛋白基因结构与功能蛋白转运

基于IPA分析自噬对大鼠肝再生中树突状细胞的调节作用

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遗传 2015年第3期37卷 276-282页

作者：王棋文靳伟常翠芳徐存拴河南师范大学河南省生物工程重点实验室新乡453007 河南师范大学河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地新乡453007 河南师范大学生命科学学院新乡453007

为探讨自噬对大鼠肝再生中树突状细胞(Dendritic cells,DCs)的调节作用,文章通过Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠DCs,Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中自噬相关基因表达变化,利用IPA等软件分析自噬在DCs中的生理活... 详细信息

为探讨自噬对大鼠肝再生中树突状细胞(Dendritic cells,DCs)的调节作用,文章通过Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠DCs,Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中自噬相关基因表达变化,利用IPA等软件分析自噬在DCs中的生理活动。结果表明,LC3、BECN1、ATG7和SQSTM1等关键基因在部分肝切除后不同恢复时间段有明显表达变化;芯片中对应的自噬相关基因为593个,其中210个基因发生了有意义的变化。比较分析自噬生理活动情况,发现自噬在再生早期和晚期阶段增强,增殖期减弱。与自噬相关的生理活动主要有RNA表达、RNA转录细胞分化和增殖,其中涉及的信号通路主要有PPARα/RXRα激活、急性期反应、TREM1信号通路、IL-6信号通路、IL-8信号通路和IL-1信号通路等,它们在肝再生阶段发生了不同程度的上调或下调。Cluster分析还发现,P53和AMPK信号参与调控DCs的自噬活动,在肝再生早期主要是AMPK信号,在肝再生末期P53和AMPK信号共同参与自噬的调节。以上研究结果说明DCs自噬可能在肝再生早期激活细胞免疫反应和后期清除DCs等方面发挥着重要作用。

关键词：肝再生自噬树突状细胞 Rat Genome 230 2.0芯片 IPA

类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生中表达模式和作用分析

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东北农业大学学报 2011年第3期42卷 110-117页

作者：蔺芳王书丽徐存拴新乡学院生命科学与技术系河南新乡453000 河南省-科技部共建细胞分化调控重点试验室河南新乡453000

为在基因转录水平了解类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生(Liver regeneration,LR)中作用,文章通过搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得了参与上述代谢活动的基因,用基因芯片检测了它们在大鼠再生肝中表达情况,初步证实上述基因中83个基... 详细信息

为在基因转录水平了解类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生(Liver regeneration,LR)中作用,文章通过搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得了参与上述代谢活动的基因,用基因芯片检测了它们在大鼠再生肝中表达情况,初步证实上述基因中83个基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5～4h)、G0/G1过渡(PH后4～6h)、细胞增殖(PH后6～66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72～168h)等四个阶段起始表达的基因数为48、11、33和3;总表达的基因数为48、41、80和54。表明肝再生相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调286次,下调286次,表达和功能的相关性分为12类,表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。根据上述结果推测,肝再生前期雌激素合成增强;后期胆固醇、胆汁酸合成增强;雄激素、糖皮质激素、孕酮合成几乎在整个肝再生中增强。肝再生早期、前期和后期孕酮和雌激素分解增强;后期胆固醇分解增强;胆汁酸、雄激素、盐皮质激素分解几乎在整个肝再生中增强。

关键词：部分肝切除基因芯片类固醇代谢肝再生相关基因

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自噬在大鼠肝再生中作用的初步探讨

生物信息学 2017年第3期15卷 156-163页

作者：尹丽徐存拴河南师范大学生命科学学院河南新乡453007 河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地(河南师范大学) 河南新乡453007 漯河医学高等专科学校河南漯河462002

自噬对肝再生有积极的作用,但具体作用机制仍有待阐明。为了解自噬在大鼠肝再生的变化和机理,通过蛋白质组学(i TRAQ方法)检测了大鼠肝再生中调控自噬的信号通路相关蛋白和自噬过程相关蛋白的变化。结果表明,调控自噬的PI3K/Akt,m TOR,A... 详细信息

自噬对肝再生有积极的作用,但具体作用机制仍有待阐明。为了解自噬在大鼠肝再生的变化和机理,通过蛋白质组学(i TRAQ方法)检测了大鼠肝再生中调控自噬的信号通路相关蛋白和自噬过程相关蛋白的变化。结果表明,调控自噬的PI3K/Akt,m TOR,AMPK均被激活,泛素-蛋白酶体相关蛋白发生显著表达变化,溶酶体相关膜蛋白和水解酶发生显著变化。IPA分析发现,自噬在肝再生的启动阶段和进展阶段上调。根据研究结果,提出线粒体和溶酶体共存假说,并初步探讨并图示其存在的可能性和机理。

关键词：肝再生自噬泛素蛋白酶体线粒体自噬线粒体溶酶体共存

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盘基网柄菌DdLIS1蛋白生物信息学分析

基因组学与应用生物学 2019年第1期38卷 182-188页

作者：郭倩楠薛楠刘坚徐存拴薛德明河南师范大学生命科学学院新乡453007 河南师范大学附属中学新乡453007 贝勒医学院分子细胞生物系休斯顿77030 河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地新乡453007

LIS1蛋白是一种与人类无脑回疾病以及细胞癌变相关的重要蛋白。对盘基网柄菌DdLIS1进行生物信息学分析,探究盘基网柄菌能否作为研究人类无脑回疾病及细胞癌变机制的模型。现从NCBI中的Genank找到盘基网柄菌DdLIS1的氨基酸序列,随后进行b... 详细信息

LIS1蛋白是一种与人类无脑回疾病以及细胞癌变相关的重要蛋白。对盘基网柄菌DdLIS1进行生物信息学分析,探究盘基网柄菌能否作为研究人类无脑回疾病及细胞癌变机制的模型。现从NCBI中的Genank找到盘基网柄菌DdLIS1的氨基酸序列,随后进行blastp找到模式生物中相似序列,利用理化性分析网站ProtScale、ProtParam分析DdLIS1的理化性质,通过NCBI中的保守结构域库(CDD)分析DdLIS1的保守结构域,使用MEGA6.0并选用邻位连接法构建系统进化树,分别使用PredictProtein、SWISS-MODEL网站预测Dd LIS1蛋白的二级结构、三维结构。结果得出DdLIS1蛋白全长为419,属于亲水性蛋白,有7个保守结构域,属于WD40家族,与人类和小鼠的氨基酸序列相似性为72%。二级结构中β折叠所占比例最高,为49.40%,α螺旋、随机卷曲分别占该蛋白7.16%、43.44%,与三级结构一致。以上结果说明DdLIS1与LIS1高度相似,有助于盘基网柄菌能够作为研究人类无脑回疾病以及细胞癌变机制的模型。

关键词：盘基网柄菌 DdLIS1 生物信息学分析

盘基网柄菌早衰蛋白结构与功能生物信息学分析

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基因组学与应用生物学 2019年第6期38卷 2567-2573页

作者：薛楠郭倩楠刘坚徐存拴薛德明河南师范大学附属中学新乡453007 河南师范大学生命科学学院新乡453007 贝勒医学院分子细胞生物系休斯顿77030 河南赛诺特生物技术有限公司郑州450001

早衰蛋白(presenilin, PS)是γ分泌酶的组成成分,其突变可造成阿尔兹海默病(Alzheimer disease,AD)的形成。因PS所造成AD的发病机理较复杂,因而我们想探究一下模式生物盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)是否能够作为研究早衰蛋白的... 详细信息

早衰蛋白(presenilin, PS)是γ分泌酶的组成成分,其突变可造成阿尔兹海默病(Alzheimer disease,AD)的形成。因PS所造成AD的发病机理较复杂,因而我们想探究一下模式生物盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)是否能够作为研究早衰蛋白的模型。从NCBI网站中得到盘基网柄菌早衰蛋白DdPsenA和DdPsenB氨基酸序列,随后利用ProtScale、ProtParam理化性分析工具、保守结构域、TMHMM2跨膜区分析网站、进化树软件MEGA6.0、二级结构PredictProtein以及三级结构SWISS-Model服务器对上述蛋白进行生物信息学分析。DdPsenA的氨基酸长度为622,是亲水性蛋白,其相对分子质量为69 502.79,等电点为4.53。DdPsenB的氨基酸长度为473,属于疏水性蛋白,其相对分子质量为52 558.74,等电点为4.49,与DdPsenA同属于Peptidase_A22B超家族。跨膜分析出DdPsenA和DdPsenB均有8个跨膜区。DdPsenA与人类presenilin-2序列相似性为67%,Dd PsenB与人类presenilin-1序列相似性分别为60%。盘基网柄菌可以作为研究早衰蛋白功能和作用机制的模型。

关键词：早衰蛋白盘基网柄菌生物信息学分析