基于IPA分析自噬对大鼠肝再生中树突状细胞的调节作用

作     者：王棋文 靳伟 常翠芳 徐存拴 Qiwen Wang;Wei Jin;Cuifang Chang;Cunshuan Xu

作者机构：河南师范大学河南省生物工程重点实验室新乡453007 河南师范大学河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地新乡453007 河南师范大学生命科学学院新乡453007 

出 版 物：《遗传》 (Hereditas（Beijing))

年 卷 期：2015年第37卷第3期

页      面：276-282页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：河南省重大科技攻关项目(编号:111100910600) 河南师范大学博士启动课题(编号:qd14175) 河南师范大学青年科学基金项目资助 

主　　题：肝再生 自噬 树突状细胞 Rat Genome 230 2.0芯片 IPA 

摘      要：为探讨自噬对大鼠肝再生中树突状细胞(Dendritic cells,DCs)的调节作用,文章通过Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠DCs,Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中自噬相关基因表达变化,利用IPA等软件分析自噬在DCs中的生理活动。结果表明,LC3、BECN1、ATG7和SQSTM1等关键基因在部分肝切除后不同恢复时间段有明显表达变化;芯片中对应的自噬相关基因为593个,其中210个基因发生了有意义的变化。比较分析自噬生理活动情况,发现自噬在再生早期和晚期阶段增强,增殖期减弱。与自噬相关的生理活动主要有RNA表达、RNA转录细胞分化和增殖,其中涉及的信号通路主要有PPARα/RXRα激活、急性期反应、TREM1信号通路、IL-6信号通路、IL-8信号通路和IL-1信号通路等,它们在肝再生阶段发生了不同程度的上调或下调。Cluster分析还发现,P53和AMPK信号参与调控DCs的自噬活动,在肝再生早期主要是AMPK信号,在肝再生末期P53和AMPK信号共同参与自噬的调节。以上研究结果说明DCs自噬可能在肝再生早期激活细胞免疫反应和后期清除DCs等方面发挥着重要作用。