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Residue substitution enhances the immunogenicity of neoepitopes from gastric cancers

Cancer Biology & Medicine 2021年第4期18卷 1053-1065页

作者： Huahui Yu Jieyu Li Yuan Yuan Yu Chen Jingwen Hong chunmei ye Wansong Lin Huijing Chen Zengqing Guo Bo Li Yunbin ye The School of Basic Medical Sciences Fujian Medical UniversityFuzhou 350122China Laboratory of Immuno-Oncology Fujian Cancer Hospital&Fujian Medical University Cancer HospitalFuzhou 350014China Fujian Key Laboratory of Translational Cancer Medicine Fuzhou 350014China BGI-Shenzhen Shenzhen 518083China BGI Education Center University of Chinese Academy of SciencesShenzhen 518083China Department of Oncology Fujian Cancer Hospital&Fujian Medical University Cancer HospitalFuzhou 350014China

Objective:Neoantigens arising from gene mutations in tumors can induce specific immune responses,and neoantigen-based immunotherapies have been tested in clinical ***,we characterized the efficacy of altered neoepitopes in improving immunogenicity against gastric ***:Raw data of whole-exome sequencing derived from a patient with gastric cancer were analyzed using bioinformatics methods to identify *** were modified by P1Y(the first amino acid was replaced by tyrosine)and P2L(the second amino acid was replaced by leucine).T2 binding and stability assays were used to detect the affinities between the neoepitopes and the HLA molecules,as well as the stabilities of *** cells(DCs)presented with neoepitopes stimulated naïve CD8+T cells to induce specific cytotoxic T *** and carboxyfluorescein succinimidyl ester were used to detect IFN-γand TNF-αlevels,and T cell *** was detected by flow *** cytotoxicity of T cells was determined using the lactate dehydrogenase ***:Bioinformatics analysis,T2 binding,and stability assays indicated that residue substitution increased the affinity between neoepitopes and HLA molecules,as well as the stabilities of *** presented with altered neoepitopes stimulated CD8+T cells to release more IFN-γand had a greater effect on promoting proliferation than wild-type ***8+T cells stimulated with altered neoepitopes killed more wild-type neoepitope-pulsed T2 cells than those stimulated with wild-type neoepitopes,by secreting more IFN-γ,TNF-α,and ***:Altered neoepitopes exhibited greater immunogenicity than wild-type *** substitution could be used as a new strategy for immunotherapy to target neoantigens.

关键词： Gastric cancer bioinformatics neoepitope residue substitution immunotherapy

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中小学生高度近视发生风险预测模型：基于巢式病例对照研究

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中国全科医学 2025年第9期28卷 1115-1121页

作者：陈胜蓝郑永韬胡旺成倪作为夏冰叶春梅杜持新陈晓丹浙江省杭州市萧山区疾病预防控制中心监测科浙江大学医学院附属第一医院护理部浙江萧山医院质管科浙江省杭州市临平区疾病预防控制中心免疫规划管理科

背景中小学生由于学习压力、电子产品普及以及不良用眼习惯，视力健康问题日益严重，成为近视的高发群体，高度近视作为近视的严重阶段，已成为全球范围内的公共卫生问题。尽管现有诸多研究对近视的危险因素进行了探讨，但鲜有研究针对... 详细信息

背景中小学生由于学习压力、电子产品普及以及不良用眼习惯，视力健康问题日益严重，成为近视的高发群体，高度近视作为近视的严重阶段，已成为全球范围内的公共卫生问题。尽管现有诸多研究对近视的危险因素进行了探讨，但鲜有研究针对性阐明风险因素与高度近视发生的复杂非线性关系，本研究结合巢式病例对照研究和限制性立方样条，开发一个中小学生高度近视风险预测模型，通过早期识别高风险个体，延缓或阻止高度近视的发展，实现近视的三级预防，对中小学生的学业和生活质量有积极意义。目的探究中小学生高度近视的流行现状及危险因素，构建风险预测模型，为中小学生高度近视防控提供科学依据。方法采用巢式病例对照研究，于2023年选取杭州市12所学校中度近视的学生作为研究对象建立队列，按照全国学生常见病和健康影响因素监测与干预工作方案，对纳入研究的中小学生开展近视状况监测，研究期间进展为高度近视的中小学生作为高度近视发生组，其余未进展为高度近视的中小学生作为对照组，对两组研究对象开展视力保健行为进行调查。采用Lasso回归筛选特征变量后进行多因素Logistic回归分析探究中小学生高度近视发生的影响因素，并采用列线图对风险预测模型可视化，同时采用Hosmer-Lemeshow检验、受试者工作特征（ROC）曲线、Calibration曲线、决策曲线分析（DCA）对模型性能进行评估，最后采用限制性立方样条进一步明确年龄与高度近视发生风险的关系。结果 12所中小学校共纳入2 468名学生，未进展为高度近视的学生1 293名，中度近视进展为高度近视的学生1 175名，高度近视发生率为47.61%(1 175/2 468)。两组学生年龄、年级、BMI、每日入睡时间、地区、户外活动时间、电子产品使用时间、课后作业时间、家用台灯比较，差异有统计学意义（P2 h/d(OR=1.440,95%CI=1.119～1.856)，课后作业时间1～2 h/d(OR=1.461,95%CI=1.126～1.899)、>2 h/d(OR=1.534,95%CI=1.218～1.935)为中小学生高度近视发生的危险因素（P<0.05）；而高中年级（OR=0.560,95%CI=0.419～0.743）为中小学生高度近视发生的保护因素（P<0.05）。基于年级、BMI、每日入睡时间、户外活动时间、电子产品使用时间、课后作业时间等6个变量构建的预测模型ROC曲线下面积为0.840(95%CI=0.825～0.855)，具有良好的拟合优度、一致性、应用性，限制性立方样条分析显示13～15岁为高度近视的高发年龄段。结论中小学生高度近视发生率较高，风险预测模型为高度近视的预防和控制提供了科学依据，应在初中年级加强近视防控措施，改善学生的视力保健行为，降低高度近视的发生。

关键词：近视学生高度近视巢式病例对照研究限制性立方样条预测模型

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Dynamic evaluation of digital and green development policies based on text mining of the PMC framework

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Journal of Southeast University(English Edition) 2024年第3期40卷 319-326页

作者： ye chunmei Wu Lihua School of Economics and Management Southeast UniversityNanjing 211189China

Aiming to identify policy topics and their evolutionary logic that enhance the digital and green development(dual development)of traditional manufacturing enterprises,address weaknesses in current policies,and provide resources for refining dual development policies,a total of 15954 dual development-related policies issued by national and various departmental authorities in China from January 2000 to August 2023 were *** on topic modeling techniques and the policy modeling consistency(PMC)framework,the evolution of policy topics was visualized,and a dynamic assessment of the policies was *** results show that the digital and green development policy framework is progressively refined,and the governance philosophy shifts from a“regulatory government”paradigm to a“service-oriented government”.The support pattern evolves from“dispersed matching”to“integrated symbiosis”.However,there are still significant deficiencies in departmental cooperation,balanced measures,coordinated links,and multi-stakeholder *** policy improvements should,therefore,focus on guiding multi-stakeholder participation,enhancing public demand orientation,and addressing the entire value *** steps aim to create an open and shared digital industry ecosystem to promote the coordinated dual development of traditional manufacturing enterprises.

关键词： digital and green development text mining topic modeling policy modeling consistency(PMC)framework machine learning

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Circulating Tfr cells are increased in latent syphilis patients

Circulating Tfr cells are increased in latent syphilis patie...

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2019年浙江省医学会医学微生物与免疫学分会学术大会

作者： Yumei Ge Zhaozhao Yonglie Zhou chunmei ye Jinlin Liu Department of Clinical Laboratory Zhejiang Provincial People's HospitalHangzhou Medical College Zhejiang Chinese Medicine University Key Laboratory of Tumor Molecular Diagnosis and Individualized Medicine of Zhejiang Province

Objective:The host immune response could be critical in the pathogenesis of Treponema pallidum(Tp) in latent syphilis *** aim of the present study was to examine changes of cellular homeostasis in T follicular regulatory T(Tfr) cells in secondary syphilis patients and latent syphilis ***:Thirty healthy controls(HCs),24 secondary syphilis patients and 41 latent syphilis patients were *** percentages of total Tfr,Tfrl,Tfr2,Tfr17,and the PD-1,ICOS and CTLA-4 on the Treg cells,CXCR5-Treg cells and Tfr cells in the peripheral blood were all determined by the flow ***:Comparing to the HCs and secondary syphilis patients,the percentage of total Tfr cells and the Tfr/Tfh ratio was significantly higher in latent syphilis patients,while the total Treg cells were not significant changed in the latent syphilis patients when compared to the secondary syphilis ***,no significant change was found on the Tfrl,Tfr2,Tfr17 among the HCs and secondary syphilitic infection patients or the latent syphilis patients,except the Tfr2 cells were increased in the latent syphilis ***,the ICOS and CTLA-4 percentages were all significantly increased on the Tfr cells in latent syphilis patients when compared to the secondary syphilis ***:Increased Tfr cells may play an important role in the immune evasion of Tp in latent syphilis patients.

关键词： Tfr cells CTLA-4 Secondary syphilis Latent syphilis

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Dysregulated Tfh subset in secondary and latent syphilis patients

Dysregulated Tfh subset in secondary and latent syphilis pat...

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2019年浙江省医学会医学微生物与免疫学分会学术大会

Objective:The aim of the present study was to examine changes of cellular homeostasis in T follicular helper(Tfh)cells in secondary syphilis patients and latent ***:Thirty healthy controls(HCs),24 secondary syphilis patients and 41 latent syphilis patients were *** percentages of total Tfh,ICOS+Tfh,PD-1+Tfh,resting Tfh,effector Tfh,naive Tfh,effector memory Tfh,central memory Tfh and Tfh1,Tfh2,Tfh17 cells in the peripheral blood were all determined by the flow ***:Comparing to the HCs,the percentage of total Tfh cells was significantly higher in secondary syphilis *** the ICOS+Tfh,PD-1+Tfh,resting Tfh,effector Tfh,naive Tfh,effector memory Tfh,central memory Tfh,Tfhl,Tfh2 and Tfh17 *** the percentage of Tfh17,ICOS+Tfh and effector memory Tfh cells were significantly increased in secondary syphilis patients and decreased in latent syphilis ***,the percentage of Tfh2 cells were significantly increased in latent syphilis patients,while the Tfhl cells were significantly decreased in secondary syphilis patients,and the percentage of PD-1+Tfh cells was increased,while the naive Tfh cells were decreased in the secondary syphilis patients when compared to the *** no significant change was found on the resting Tfh,effector Tfh and central memory Tfh among the HCs and secondary syphilis patients or the latent syphilis ***:Dysregulated Tfh17,ICOS+Tfh or the effector memory Tfh cells may play an important role in the immune evasion of the latent syphilis patients.

关键词： Tfh17 cells ICOS+Tfh effector memory Tfh Secondary syphilis Latent syphilis.Short title:Tfh17 cells in syphilis

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实体肿瘤TCR-T治疗研究的现状与面临的挑战

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中国肿瘤生物治疗杂志 2020年第9期27卷 959-967页

作者：叶春梅叶韵斌福建医科大学基础医学院福建医科大学附属肿瘤医院暨福建省肿瘤医院福建省肿瘤转化医学重点实验室福建福州350014

T细胞表面含有特异性的T细胞受体(T cell receptors,TCR),能够识别不同的肿瘤抗原,从而实现对癌变细胞的杀伤和清除。TCR工程化T细胞(TCR-engineered T cells,TCR-T)治疗即是通过钓取针对肿瘤细胞的特异性TCR,并应用基因工程技术改造T细... 详细信息

T细胞表面含有特异性的T细胞受体(T cell receptors,TCR),能够识别不同的肿瘤抗原,从而实现对癌变细胞的杀伤和清除。TCR工程化T细胞(TCR-engineered T cells,TCR-T)治疗即是通过钓取针对肿瘤细胞的特异性TCR,并应用基因工程技术改造T细胞,输注体内后可达到治疗肿瘤的目的。尽管TCR-T治疗取得一定成果,但是还存在治疗毒性、T细胞浸润有限、抗原特异性不佳等问题,需要不断优化TCR-T治疗的安全性和有效性。因此,本文阐述了目前国内外关于实体肿瘤TCR-T治疗的研究现状以及存在的问题与对策。

关键词：实体肿瘤过继性细胞免疫治疗 TCR工程化T细胞新抗原

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添加剂强化热脱附修复菲污染土壤

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环境污染与防治 2023年第5期45卷 595-601页

作者：叶春梅上海市环境科学研究院上海200233 国家环境保护城市土壤污染控制与修复工程技术中心上海200233

针对多环芳烃污染土壤热脱附能耗较高的问题,采用K_(2)CO_(3)、CaCO_(3)和Fe2O_(3)等添加剂强化热脱附过程,以降低能耗。通过室内模拟实验研究了热脱附温度、停留时间、添加剂种类与投加量等对菲(Phe)去除效果的影响,分析了热脱附去除... 详细信息

针对多环芳烃污染土壤热脱附能耗较高的问题,采用K_(2)CO_(3)、CaCO_(3)和Fe2O_(3)等添加剂强化热脱附过程,以降低能耗。通过室内模拟实验研究了热脱附温度、停留时间、添加剂种类与投加量等对菲(Phe)去除效果的影响,分析了热脱附去除过程、能耗以及热脱附后土壤理化性质的变化。结果表明:在100、200℃下停留30 min,投加5.0%(质量分数)的K_(2)CO_(3)、CaCO_(3)和Fe2O_(3)均能显著提高Phe的去除率(p<0.05),效果最好的是K_(2)CO_(3)。添加剂投加后土壤导热系数的提高可能是促进热脱附的重要原因。200℃停留30 min时,Phe去除率随K_(2)CO_(3)投加量增加呈现先增加后下降趋势,最优投加量为5.0%,此时去除率为85.90%,较无添加剂组提高了11.82百分点。200℃时,投加5.0%的K_(2)CO_(3)可将脱附速率常数提高85.71%,单位能耗降低56.78%。K_(2)CO_(3)强化热脱附后土壤黏粒占比增加,土壤粒径变小。在Phe污染土壤热脱附过程中投加适量的K_(2)CO_(3)有望在保证污染物去除率的同时大幅降低修复能耗。

关键词：菲污染土壤添加剂热脱附能耗

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环境政策、动态能力与企业绿色转型——广西柳州钢铁集团纵向案例分析

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科技进步与对策 2023年第10期40卷 1-12页

作者：叶春梅吴利华东南大学经济管理学院江苏南京211189

环境政策通过改变企业绿色转型成本和收益,从供给侧推动和需求侧拉动企业绿色转型。动态能力是指企业感知机会与威胁、学习创造新知识以及重构内外部资源,从而应对环境快速变化的能力。构建“环境政策—外部压力—绿色转型环节—动态能... 详细信息

环境政策通过改变企业绿色转型成本和收益,从供给侧推动和需求侧拉动企业绿色转型。动态能力是指企业感知机会与威胁、学习创造新知识以及重构内外部资源,从而应对环境快速变化的能力。构建“环境政策—外部压力—绿色转型环节—动态能力—内部选择”的理论框架,综合内、外部视角研究企业绿色转型机制发现,企业绿色转型涉及绿色产品开发、绿色材料投入、绿色生产工艺、绿色供应链管理和绿色营销等多个环节,政策提供的外部支持与企业内部动态能力相互匹配,支撑企业全生命周期绿色转型。基于广西柳州钢铁集团的案例分析表明,企业绿色转型不是一劳永逸的,在动态变化环境下,企业实施转型并获得成功的关键在于具有与外部环境变化相匹配的动态能力。企业既需要把握外部环境政策变化带来的商机,又需要抓住转型重点环节,通过动态更新内部能力持续推进企业全生命周期绿色转型。

关键词：环境政策动态能力绿色转型案例研究文本分析

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不同CO_2气压对双孔腹腔镜阑尾周围脓肿手术的观察分析

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中国医药科学 2017年第1期7卷 170-173页

作者：叶春梅广东省韶关市曲江区人民医院手术室广东韶关512100

目的探讨不同CO_2气压对双孔腹腔镜阑尾周围脓肿手术效果的影响,选择最佳的手术CO_2气压。方法选择2014年6月~2016年8月,该院接受治疗的30例急性阑尾炎合并周围脓肿患者作为该研究的对象,按照随机数表法随机均分为对照组和研究组。对照... 详细信息

目的探讨不同CO_2气压对双孔腹腔镜阑尾周围脓肿手术效果的影响,选择最佳的手术CO_2气压。方法选择2014年6月~2016年8月,该院接受治疗的30例急性阑尾炎合并周围脓肿患者作为该研究的对象,按照随机数表法随机均分为对照组和研究组。对照组气腹压力设定为13~15mmHg,持续给予患者气腹至气腹压力恒定。研究组气腹压力设定为8~12mmHg,间断给予患者气腹至气腹压力恒定,对不同组患者肩部的疼痛程度和疼痛的发生率进行比较和分析,对气腹前后患者的呼吸状况进行比较,包括气道风压(Ppeak)、呼气末二氧化碳(PETCO_2)和血氧饱和度(SpO_2)。结果研究组患者的下床时间(18.8±3.6)h、住院时间(7.5±2.6)d明显短于对照组(28.1±5.8)h、(10.7±5.5)d,差异具有统计学意义(P0.05);放气后5min,研究组患者和对照组患者Ppeak比较无统计学意义(P>0.05),SpO_2、PETCO_2比较有统计学意义(P<0.05)。结论选择合适的CO_2气压能够在最大程度上消除患者的疼痛,减少手术后的恢复时间和治疗的总费用,恢复快、损伤小、并发症少、感染率低、住院时间短且安全可靠,值得推广。

关键词：阑尾周围脓肿气腹双孔腹腔二氧化碳

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草木灰协同热脱附修复多环芳烃污染土壤

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广东化工 2023年第11期50卷 128-131,210页

作者：叶春梅上海市环境科学研究院上海200233

本文采用玉米草木灰协同热脱附修复菲和芘污染土壤,考察了不同温度和时间下的协同热脱附效果,探究了最优技术参数,并分析了热脱附前后土壤的小麦萌发特性。结果表明:草木灰协同热脱附修复的效果与温度和污染物性质相关,温度为100、200、... 详细信息

本文采用玉米草木灰协同热脱附修复菲和芘污染土壤,考察了不同温度和时间下的协同热脱附效果,探究了最优技术参数,并分析了热脱附前后土壤的小麦萌发特性。结果表明:草木灰协同热脱附修复的效果与温度和污染物性质相关,温度为100、200、300℃时,添加草木灰均能促进土壤中Phe的去除,但仅在300℃时能促进土壤中芘的去除。200℃时,去除土壤中菲的最优草木灰投加量为5%,该条件下土壤中菲的去除过程可加速48%,去除率可提高11.53%。与单一热处理相比,添加5%草木灰处理后土壤的小麦发芽、根生长和芽伸长无明显变化或略有提高。

关键词：多环芳烃菲芘污染土壤热脱附草木灰小麦种子萌发

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