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Genomic characterization of peritoneal lavage cytology-positive gastric cancer

Chinese Journal of Cancer Research 2024年第1期36卷 66-77页

作者： Zhouqiao Wu Tingfei Gu changxian xiong Jinyao Shi Jingpu Wang Ting Guo Xiaofang Xing Fei Pang Ning He Rulin Miao Fei Shan Yuan Zhou Ziyu Li Jiafu Ji Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing) Gastrointestinal Cancer CenterPeking University Cancer Hospital&InstituteBeijing 100142China Department of Biomedical Informatics Department of Physiology and PathophysiologyCenter for Noncoding RNA MedicineMOE Key Lab of Cardiovascular SciencesSchool of Basic Medical SciencesPeking UniversityBeijing 100191China State Key Laboratory of Holistic Integrative Management of Gastrointestinal Cancers Beijing Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational ResearchGastrointestinal Cancer CenterPeking University Cancer Hospital&InstituteBeijing 100142China

Objective: Positive peritoneal lavege cytology(CY1) gastric cancer is featured by dismal prognosis, with high risks of peritoneal metastasis. However, there is a lack of evidence on pathogenic mechanism and signature of CY1and there is a continuous debate on CY1 therapy. Therefore, exploring the mechanism of CY1 is crucial for treatment strategies and targets for CY1 gastric ***: In order to figure out specific driver genes and marker genes of CY1 gastric cancer, and ultimately offer clues for potential marker and risk assessment of CY1, 17 cytology-positive gastric cancer patients and 31matched cytology-negative gastric cancer patients were enrolled in this study. The enrollment criteria were based on the results of diagnostic laparoscopy staging and cytology inspection of exfoliated cells. Whole exome sequencing was then performed on tumor samples to evaluate genomic characterization of cytology-positive gastric ***: Least absolute shrinkage and selection operator(LASSO) algorithm identified 43 cytology-positive marker genes, while Mut Sig CV identified 42 cytology-positive specific driver genes. CD3G and CDKL2 were both driver and marker genes of CY1. Regarding mutational signatures, driver gene mutation and tumor subclone architecture, no significant differences were observed between CY1 and negative peritoneal lavege cytology(CY0).Conclusions: There might not be distinct differences between CY1 and CY0, and CY1 might represent the progression of CY0 gastric cancer rather than constituting an independent subtype. This genomic analysis will thus provide key molecular insights into CY1, which may have a direct effect on treatment recommendations for CY1and CY0 patients, and provides opportunities for genome-guided clinical trials and drug development.

关键词： Cytology gastric carcinoma peritoneal metastasis whole exome sequencing

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SlBBX20 interacts with the COP9 signalosome subunit SlCSN5-2 to regulate anthocyanin biosynthesis by activating SlDFR expression in tomato

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Horticulture Research 2021年第1期8卷 2121-2132页

作者： Dan Luo Cheng xiong Aihua Lin Chunli Zhang Wenhui Sun Junhong Zhang changxian Yang Yongen Lu Hanxia Li Zhibiao Ye Ping He Taotao Wang Key Laboratory of Horticulture Plant Biology Ministry of EducationHuazhong Agriculture University430070 WuhanChina Department of Biochemistry and Biophysics Texas A&M UniversityCollege StationTX 77843USA

Anthocyanins play vital roles in plant stress tolerance and growth ***,we reported that the photomorphogenesis-related transcription factor SlBBX20 regulates anthocyanin accumulation in ***,the underlying mechanism remains ***,we showed that SlBBX20 promotes anthocyanin biosynthesis by binding the promoter of the anthocyanin biosynthesis gene SlDFR,suggesting that SlBBX20 directly activates anthocyanin biosynthesis ***,we found by yeast two-hybrid screening that SlBBX20 interacts with the COP9 signalosome subunit SlCSN5-2,and the interaction was confirmed by bimolecular fluorescence complementation and coimmunoprecipitation ***5 gene silencing led to anthocyanin hyperaccumulation in the transgenic tomato calli and shoots,and SlCSN5-2 overexpression decreased anthocyanin accumulation,suggesting thSlCSN5-2 enhanced the ubiquitination of SlBBX20 and promoted the degradation of SlBBX20 in ***,silencing the SlCSN5-2 homolog in tobacco significantly increased the accumulation of the SlBBX20 *** SlBBX20 is a vital regulator of photomorphogenesis,the SlBBX20-SlCSN5-2 module may represent a novel regulatory pathway in light-induced anthocyanin biosynthesis.

关键词： some anthocyanin vital

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盐霉素原料药中新杂质的检测、分离、鉴定及抗肿瘤活性

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应用与环境生物学报 2020年第6期26卷 1526-1533页

作者：程瑶熊峰王涛谢昌贤云喜报张国林卢晓霞中国科学院成都生物研究所成都610041 金河生物科技股份有限公司呼和浩特010200 深圳劲宇生物科技有限公司深圳518118 中国科学院大学北京100049

盐霉素是第一个用于预防和治疗鸡球虫病的神经元钾通道开放剂.采用HPLC-UV、LC-MS等方法对盐霉素原料药中相关杂质进行检测.通过柱后衍生化高效液相色谱法检测到盐霉素原料药中共含有10个含量在0.18%-3.47%之间的杂质,其中3个杂质含量在... 详细信息

盐霉素是第一个用于预防和治疗鸡球虫病的神经元钾通道开放剂.采用HPLC-UV、LC-MS等方法对盐霉素原料药中相关杂质进行检测.通过柱后衍生化高效液相色谱法检测到盐霉素原料药中共含有10个含量在0.18%-3.47%之间的杂质,其中3个杂质含量在2.0%以上.含量为2.04%的杂质为已知的20-氧代-盐霉素,其由盐霉素C-20位的仲羟基氧化为羰基而形成,但其他2个杂质(SAL-A含量为3.47%,SAL-B含量为2.30%)未见文献报道.通过制备液相色谱(Prep LC)从盐霉素原料药中分离得到该新杂质,并利用红外吸收光谱(IR)、一维及二维核磁(NMR)、高分辨质谱(HR-ESI-MS)和圆二色谱(CD)等测试分析方法对其化学结构进行表征,对这些表征数据进行综合解析,确证了2个盐霉素杂质(SAL-A和SAL-B)的化学结构:SAL-A为盐霉素C-6位的甲基变换为了乙基,SAL-B为盐霉素C-14位的甲基变换为了乙基.SAL-A和SAL-B的CD光谱数据也同盐霉素相似,说明它们具有相同的相对构型.此外,生物活性研究表明SAL-A和SAL-B对人肺癌细胞A549、人肝癌细胞HepG2和乳腺癌细胞SK-BR3具有一定的抑制活性.上述结果表明两个可作为潜在抗肿瘤药物的盐霉素新杂质得到发现和确证.

关键词：盐霉素杂质分离结构确证抗肿瘤活性

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绿水洞煤矿煤层(成)气赋存与地质条件的关系

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煤田地质与勘探 1999年第1期27卷 32-35页

作者：王宏图鲜学福王昌贤贺建明伍厚云熊道渝陈万国熊守祥重庆大学采矿工程系四川省华蓥市绿水洞煤矿

依据绿水洞矿井地质构造和煤层构造变形特征，对该矿煤层（成）气赋存运移规律进行了系统的分析，就该矿生产中煤层（成）气涌出及可能产生的动力现象进行了地质评价，认为在矿井深部仍存在沿岩层裂隙和溶洞发生煤层（成）气涌出的可能... 详细信息

依据绿水洞矿井地质构造和煤层构造变形特征，对该矿煤层（成）气赋存运移规律进行了系统的分析，就该矿生产中煤层（成）气涌出及可能产生的动力现象进行了地质评价，认为在矿井深部仍存在沿岩层裂隙和溶洞发生煤层（成）气涌出的可能，田湾向斜东翼为全井田煤层（成）气突出危险程度最高的区域。

关键词：煤层气瓦斯赋存瓦斯涌出矿井地质条件

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重庆深埋地铁车站公共区环境实测研究

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制冷与空调（四川） 2019年第1期33卷 82-86页

作者：熊武标冯炼刘江袁中原付强卢昌宪西南交通大学机械工程学院成都610031 中铁第一勘察设计院集团有限公司西安710043

通过对重庆地铁六号线红土地车站站厅、站台、出入口通道进行环境逐时监测,分析对比了各区域的温湿度状况,针对空调季工况下站厅、站台环境状况及长出入口通道单排风运行状况进行研究。研究结果表明站厅存在风机节能潜力,长出入口通道... 详细信息

通过对重庆地铁六号线红土地车站站厅、站台、出入口通道进行环境逐时监测,分析对比了各区域的温湿度状况,针对空调季工况下站厅、站台环境状况及长出入口通道单排风运行状况进行研究。研究结果表明站厅存在风机节能潜力,长出入口通道在运营初期采用单排风方式符合规范要求。

关键词：深埋地铁车站环境监测出入口通道

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湖北武汉岩溶塌陷易发性评价

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中国地质灾害与防治学报 2020年第4期31卷 94-99页

作者：涂婧刘长宪姜超郑晓明熊志涛廖明政李海涛湖北省地质环境总站湖北武汉430000 中国地质环境监测院北京100081

近年来,武汉市岩溶塌陷地质灾害时有发生,给城市建设和人民生命财产造成了一定的损失,严重制约了武汉市社会经济的发展。为了提出科学合理的岩溶塌陷地质灾害防治措施和保障城市化进程的顺利进行,开展岩溶塌陷易发性评价是一项十分重要... 详细信息

近年来,武汉市岩溶塌陷地质灾害时有发生,给城市建设和人民生命财产造成了一定的损失,严重制约了武汉市社会经济的发展。为了提出科学合理的岩溶塌陷地质灾害防治措施和保障城市化进程的顺利进行,开展岩溶塌陷易发性评价是一项十分重要的工作。本文在武汉市岩溶塌陷调查成果的基础上,采用层次分析法和综合指数法相结合,对武汉市主要城区的岩溶塌陷易发性进行了评价,为制定武汉市岩溶塌陷地质灾害防治措施奠定了坚实的基础。

关键词：岩溶塌陷评价指标体系层次分析法综合指数法

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武汉地铁三、四号线工程建设对地下水流场的影响分析

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资源环境与工程 2014年第3期28卷 308-312页

作者：熊志涛张艺文美霞柯鹏振杨登刘长宪肖建红湖北省地质环境总站湖北武汉430034 湖北省地质灾害防治中心湖北武汉430034 湖北省环境监测中心站湖北武汉430070 恩施市环境监测站湖北恩施445000

随着城市地铁的大规模开发建设,地铁工程对地下水环境的影响日益引起人们关注。资料表明,地铁建设直接或间接干扰地下水与周围岩土体的相互作用,从而可能诱发一系列的环境地质问题。以武汉地铁三、四号线为例,首先建立工程区含水层三维... 详细信息

随着城市地铁的大规模开发建设,地铁工程对地下水环境的影响日益引起人们关注。资料表明,地铁建设直接或间接干扰地下水与周围岩土体的相互作用,从而可能诱发一系列的环境地质问题。以武汉地铁三、四号线为例,首先建立工程区含水层三维水流模型,采用有限差分法,分析地铁建成前后,地下水流场的变化,减少地下水过水断面面积,造成地下水位壅高,并分析两条地铁线路之间的叠加影响,从而总结地下水环境变化规律,为采取适当的保护措施提供相应依据。

关键词：地铁工程地下水环境地下水流场地下水位壅高

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