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The chromosome-level genome of double-petal phenotype jasmine provides insights into the biosynthesis of floral scent

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Horticultural Plant Journal 2024年第1期10卷 259-272页

作者： Xiangyu Qi Huadi Wang Shuyun Liu shuangshuang chen Jing Feng Huijie chen Ziyi Qin Quanming chen Ikram Blilou Yanming Deng Jiangsu Key Laboratory for Horticultural Crop Genetic Improvement Institute of Leisure AgricultureJiangsu Academy of Agricultural SciencesNanjingJiangsu 210014China School of Life Sciences Jiangsu UniversityZhenjiangJiangsu 212013China College of Horticulture Nanjing Agricultural UniversityNanjingJiangsu 210014China Shanghai Personal Biotechnology Company Limited Shanghai 200231China Biological and Environmental Sciences and Engineering King Abdullah University of Science and TechnologyThuwal 23955-6900Saudi Arabia

Jasmine(Jasminum sambac Aiton)is a well-known cultivated plant species for its fragrant flowers used in the perfume industry and ***,the genetic basis of its floral scent is largely *** this study,using PacBio,Illumina,10×Genomics and highthroughput chromosome conformation capture(Hi-C)sequencing technologies,a high-quality chromosome-level reference genome for *** was obtained,exploiting a double-petal phenotype cultivar‘Shuangbanmoli’(JSSB).The results showed that the final assembled genome of JSSB is 580.33 Mb in size(contig N50=1.05 Mb;scaffold N50=45.07 Mb)with a total of 39618 predicted protein-coding *** analyses revealed that the JSSB genome has undergone an ancient whole-genome duplication(WGD)event at 91.68 million years ago(Mya).It was estimated that *** diverged from the lineage leading to Olea europaea and Osmanthus fragrans about 28.8 *** the basis of a combination of genomic,transcriptomic and metabolomic analyses,a range of floral scent volatiles and genes were identified involved in the benzenoid/phenylpropanoid and terpenoid biosynthesis *** results provide new insights into the molecular mechanism of its fragrance biosynthesis in jasmine.

关键词： Jasminum sambac Aiton Oleaceae Genome evolution Floral scent Terpene synthase

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短链氯化石蜡对人体正常肝细胞的代谢干扰

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色谱 2024年第2期42卷 176-184页

作者：罗云耿柠波陈双双程琳张海军陈吉平临沂大学医学院山东临沂276005 中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析化学重点实验室辽宁大连116023

短链氯化石蜡(SCCPs)是一类新兴的持久性有机污染物,广泛存在于环境基质和人体样本中。SCCPs具有环境持久性以及远距离迁移能力,能够在生物体内积累并具有广泛的生物毒性效应,威胁着人类健康。本研究采用代谢组学方法评估了低剂量组(1μ... 详细信息

短链氯化石蜡(SCCPs)是一类新兴的持久性有机污染物,广泛存在于环境基质和人体样本中。SCCPs具有环境持久性以及远距离迁移能力,能够在生物体内积累并具有广泛的生物毒性效应,威胁着人类健康。本研究采用代谢组学方法评估了低剂量组(1μg/L)、中剂量组(10μg/L)以及高剂量组(100μg/L)的SCCPs暴露对人体正常肝细胞L02的代谢干扰。主成分分析(PCA)与代谢扰乱水平指数(MELI)计算结果表明3个剂量组的SCCPs均能够引起L02细胞代谢活动的紊乱。在3个暴露组中,72个差异代谢物经二级质谱图信息定性或标准品验证。其中,1μg/L SCCPs暴露组与10μg/L SCCPs暴露组、100μg/L SCCPs暴露组分别有33个、36个相同的差异代谢物。10μg/L SCCPs暴露组与100μg/L SCCPs暴露组有46个相同的差异代谢物。3个暴露组有33个相同的差异代谢物。在72个经二级质谱图信息定性或标准品验证的差异代谢物中,参与氨基酸代谢、核苷酸代谢和脂质代谢通路的差异代谢物分别有9、9以及45个。富集通路分析结果表明:SCCPs对L02细胞的代谢干扰主要表现在脂质代谢、脂肪酸β氧化以及核苷酸代谢通路上,且中、高剂量的SCCPs暴露引起更广泛的代谢通路的紊乱。SCCPs暴露干扰了甘油磷脂以及鞘脂类的代谢通路,其中,磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺以及鞘磷脂丰度的显著变化表明SCCPs暴露对细胞的生物膜有一定的损伤。同时,SCCPs暴露通过降低短链和中链酰基肉碱的含量抑制L02细胞中脂肪酸β氧化,提示细胞通过氧化脂肪酸供能减少。值得注意的是,与中剂量和低剂量SCCPs相比,高剂量的SCCPs暴露对脂肪酸β氧化的抑制作用更强。此外,SCCPs暴露诱导了核苷酸代谢通路的紊乱。次黄嘌呤水平显著升高提示SCCPs暴露可能诱导了L02细胞的缺氧、活性氧增多或者致癌等相关不良效应。

关键词：液相色谱质谱短链氯化石蜡肝细胞代谢组学脂质代谢核苷酸代谢

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钢渣混合基质对大花绣球扦插生根的影响

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应用生态学报 2024年第8期35卷 2150-2158页

作者：毛俊丹陈慧杰齐香玉陈双双冯景金玉妍邓衍明张浩安徽工业大学建筑工程学院安徽马鞍山243032 江苏省农业科学院休闲农业研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室南京210014 北京林业大学林木资源高效生产全国重点实验室北京100083 安徽工业大学冶金工程学院安徽马鞍山243032

为研究钢渣混合基质对大花绣球扦插生根的影响,创制可部分替代常规扦插基质、实现固体废弃物高效利用的新型基质,本试验以常规扦插基质(泥炭+珍珠岩)为对照(CK),研究在其中添加体积分数为10%(T_(1))20%(T_(2))、30%(T_(3))和40%(T_(4))... 详细信息

为研究钢渣混合基质对大花绣球扦插生根的影响,创制可部分替代常规扦插基质、实现固体废弃物高效利用的新型基质,本试验以常规扦插基质(泥炭+珍珠岩)为对照(CK),研究在其中添加体积分数为10%(T_(1))20%(T_(2))、30%(T_(3))和40%(T_(4))钢渣的条件下,混合基质的理化性质及其对大花绣球‘红粉佳人’生根的影响。结果表明:钢渣混合基质的pH值、电导率和容重均显著高于CK,T_(2)处理通气孔隙度高于其他处理,但总孔隙度和持水孔隙度无显著差异;扦插苗地上部分生长表现为:各处理鲜重和干重均大于CK,茎粗除T_(4)处理外均大于CK,株高除T_(4)处理外与CK相比无显著差异,叶片叶绿素含量均显著低于CK;扦插苗根系生长表现为:根长为T_(2)>CK>T_(1)>T_(3)>T_(4),根表面积和根体积均为T_(2)>T_(1)>CK>T_(4)>T_(3),根尖数为T_(2)>CK>T_(1)>T_(4)>T_(3),各处理平均根直径和根系活力均显著高于CK,且以T_(2)处理最高;扦插苗叶片可溶性糖含量为T_(2)>T_(4)>T_(3)>CK>T_(1)。根系生长发育指标权重排序为:根系活力>平均根直径>根体积>根表面积>根尖数>根长;允余分析发现,基质pH值、电导率、通气孔隙度和持水孔隙度是影响插穗根系生长发育的关键因子。综上,添加体积分数为10%~40%钢渣的混合基质均能够用于大花绣球扦插育苗,其中以20%(T_(2))的效果最好,可显著改善插穗成活率、生长状况和根系发育。本研究证实了钢渣作为花卉新型育苗基质部分替代泥炭、珍珠岩等常规不可再生基质的可行性,既可降低农业生产成本,又能实现工业固废的高值化利用。

关键词：钢渣绣球花扦插生根混合基质固废

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重量法测定总悬浮颗粒物的方法验证与对比研究

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皮革制作与环保科技 2024年第6期5卷 122-124页

作者：陈霜霜朱英皓上海市奉贤区环境监测站上海201406

总悬浮颗粒物是大气污染的一个重要指标,对于空气中总悬浮颗粒物的测定一直使用的是《环境空气总悬浮颗粒物的测定重量法》(GB/T 15432-1995)[1]。2023年1月15日起实施新标准《环境空气总悬浮颗粒物的测定重量法》(HJ 1263-2022)[2]替... 详细信息

总悬浮颗粒物是大气污染的一个重要指标,对于空气中总悬浮颗粒物的测定一直使用的是《环境空气总悬浮颗粒物的测定重量法》(GB/T 15432-1995)[1]。2023年1月15日起实施新标准《环境空气总悬浮颗粒物的测定重量法》(HJ 1263-2022)[2]替代旧标准。本文通过对新旧标准进行对比以及对新标准的适应性进行验证,以更准确地测定空气中总悬浮颗粒物的浓度。与旧标准相比,新标准虽然原理与样品分析步骤基本一致,但增加了规范性引用的文件、总悬浮颗粒物的术语和定义、采样与分析过程中的质量控制;细化了分解样品、分析步骤、结果与计算几个过程,也增加了样品保存的规定;新标准修改了关于方法检出限的规定,明确了检出限的测定条件,对于天平精度的要求也更加严格。

关键词：环境空气总悬浮颗粒物重量法方法验证

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绣球花铝转运蛋白HmALMT11的生物信息学及其表达特性分析

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华北农学报 2024年第4期39卷 94-101页

作者：王晓玥陈双双齐香玉冯景陈慧杰孙明邓衍明林木资源高效生产全国重点实验室(北京林业大学) 花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室国家花卉工程技术研究中心城乡生态环境北京实验室北京林业大学园林学院北京100083 江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室江苏省农业科学院休闲农业研究所江苏南京210014

铝激活苹果酸转运蛋白(ALMT)是植物中广泛存在的一个基因家族,其编码的蛋白质在调控植物根部酸分泌和对铝离子的响应方面起着重要作用。为了明晰大花绣球无尽夏HmALMT11的序列特征及其在逆境胁迫后的表达特征,进一步探索大花绣球无尽夏... 详细信息

铝激活苹果酸转运蛋白(ALMT)是植物中广泛存在的一个基因家族,其编码的蛋白质在调控植物根部酸分泌和对铝离子的响应方面起着重要作用。为了明晰大花绣球无尽夏HmALMT11的序列特征及其在逆境胁迫后的表达特征,进一步探索大花绣球无尽夏的生物学功能,为后续HmALMT11功能鉴定提供理论依据。以大花绣球无尽夏为材料,克隆得到HmALMT11基因,并对其进行生物信息学、亚细胞定位和铝胁迫响应分析。结果表明,HmALMT11包含1个1590 bp的开放阅读框,编码529个氨基酸,蛋白分子质量为59.1 ku,理论等电点为9.10。为不稳定的碱性蛋白;HmALMT11蛋白含有6个跨膜结构域,定位于细胞质膜;实时荧光定量PCR分析发现,低浓度100μmol/L和高浓度800μmol/L的Al 2(SO 4)3处理都可诱导HmALMT11在无尽夏根、茎、叶中的上调表达,且在根中相对表达量最高,具有明显的组织表达特异性。研究表明,HmALMT11蛋白可能在绣球花适应铝胁迫过程中发挥重要调控作用。

关键词：绣球花 ALMT 铝胁迫生物信息学分析亚细胞定位实时荧光定量PCR

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超疏水/超亲油含棉复合材料构造及其油水分离应用

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印染 2024年第1期50卷 72-75,78页

作者：井一凡广靖陈双双刘浩钥陈诚新疆大学特色纺织品与清洁染整技术重点实验室新疆乌鲁木齐830017 新疆智能与绿色纺织重点实验室新疆乌鲁木齐830017

以多丙烯酸酯基化合物与多氨基化合物胶凝作用形成的凝胶体系为基础,引入棉纤维、含短氟碳链单体、交联单体、引发剂,基于原位聚合法制得超疏水/超亲油含棉复合材料[OC-PG@P(DVB-HFBMA)]。采用扫描电子显微镜(SEM)观察其微观结构,探究... 详细信息

以多丙烯酸酯基化合物与多氨基化合物胶凝作用形成的凝胶体系为基础,引入棉纤维、含短氟碳链单体、交联单体、引发剂,基于原位聚合法制得超疏水/超亲油含棉复合材料[OC-PG@P(DVB-HFBMA)]。采用扫描电子显微镜(SEM)观察其微观结构,探究了其对水相及油相展现的不同特殊润湿行为并评价其应用稳定性。结果表明,OCPG@P(DVB-HFBMA)的水接触角大于158°,水滚动角为1°,油接触角为0°,具有出色的超疏水/超亲油性及突出的油水分离性能。

关键词：原位聚合超疏水超亲油棉纤维复合材料油水分离

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相分离Cu-Zr-Al-Nb非晶合金的塑性变形行为及增韧机理

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中国有色金属学报 2024年第7期34卷 2273-2282页

作者：陈双双崔家乐邢栋边博凯洪泽源程万林苑和锋安徽工业大学材料科学与工程学院马鞍山243032 安徽工业大学教育部先进金属材料绿色制造与表面技术重点实验室马鞍山243002 宁波兴业盛泰集团有限公司宁波315336 南京航空航天大学材料科学与技术学院南京211106

本文采用铜模喷铸法制备Cu_(48-x)Zr_(46.2)Al_(5.8)Nb_(x)(x=0,1.5,3)系列非晶合金,研究了Nb元素的添加对其微观结构和力学性能的影响。结果表明:随着Nb含量的增加,合金成分向两个非晶相的亚稳混溶间隙移动。当Nb含量为3%(摩尔分数)时... 详细信息

本文采用铜模喷铸法制备Cu_(48-x)Zr_(46.2)Al_(5.8)Nb_(x)(x=0,1.5,3)系列非晶合金,研究了Nb元素的添加对其微观结构和力学性能的影响。结果表明:随着Nb含量的增加,合金成分向两个非晶相的亚稳混溶间隙移动。当Nb含量为3%(摩尔分数)时,在快速凝固的过程中发生相分离,形成富Cu和富Zr非晶相。相分离非晶合金表现出良好的力学性能,其抗压强度和塑性应变分别达到(2193±14)MPa和(11.98±2.25)%。相分离非晶合金的塑性变形能力与两个非晶相之间的剪切模量差异(ΔG)大小有关;当ΔG较小时,“剪切转变区”的形成动力学很相似,它们就会往相邻的非晶相扩展,最终使剪切带分布在整个材料表面。

关键词：非晶合金相分离塑性剪切带剪切模量

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Mantle sources of Cenozoic volcanoes around the South China Sea revealed by geochemical and isotopic data using the principal component analysis

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Journal of Oceanology and Limnology 2023年第2期41卷 562-574页

作者： shuangshuang chen Zewei WANG Rui GAO Yongzhang ZHOU School of Earth Sciences and Engineering Sun Yat-sen UniversityGuangzhou 510275China Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory(Zhuhai) Zhuhai 519080China Guangdong Provincial Key Lab of Geological Processes and Mineral Resources Guangzhou 510275China State Key Laboratory of Marine Environmental Science Xiamen UniversityXiamen 361102China Department of Earth and Space Sciences Southern University of Science and TechnologyShenzhen 518055China State Key Laboratory of Tibetan Plateau Earth System Environment and Resources(TPESER)Institute of Tibetan Plateau ResearchChinese Academy of SciencesBeijing 100101China

Principal component analysis(PCA)was employed to determine the implications of geochemical and isotopic data from Cenozoic volcanic activities in the Southeast Asian region,including China(South China Sea(SCS),Hainan Island,Fujian-Zhejiang coast,Taiwan Island),and parts of Vietnam and *** analyzed 15 trace element indicators and 5 isotopic indicators for 623 volcanic rock samples collected from the study *** principal components(PCs)were extracted by PCA based on the trace elements and Sr-Nd-Pb isotopic ratios,which probably indicate an enriched oceanic island basalt-type mantle plume and a depleted mid-ocean ridge basalt-type spreading *** results show that the influence of the Hainan mantle plume on younger volcanic activities(13 Ma)at the same location in the Southeast Asian *** was employed to verify the mantle-plume-ridge interaction model of volcanic activities beneath the expansion center of SCS and refute the hypothesis that the tension of SCS is triggered by the Hainan *** study reveals the efficiency and applicability of PCA in discussing mantle sources of volcanic activities;thus,PCA is a suitable research method for analyzing geochemical data.

关键词： volcanic rocks geochemical indicators mantle source principal component analysis South China Sea

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茉莉花TCP基因家族全基因组鉴定及其表达分析

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华北农学报 2024年第1期39卷 63-71页

作者：齐香玉李新茹陈双双冯景陈慧杰金玉妍苗艳华邓衍明江苏省农业科学院休闲农业研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室江苏南京210014 河南科技学院园艺园林学院河南新乡453003

为探讨茉莉花TCP基因家族在其生长发育过程中的作用,基于茉莉花的基因组数据,利用生物信息学方法对茉莉花TCP(JsTCP)基因进行了全基因组鉴定及分析,并分析了TCP基因家族在花发育不同时期和花粉-柱头互作中的表达水平。结果显示,茉莉花... 详细信息

为探讨茉莉花TCP基因家族在其生长发育过程中的作用,基于茉莉花的基因组数据,利用生物信息学方法对茉莉花TCP(JsTCP)基因进行了全基因组鉴定及分析,并分析了TCP基因家族在花发育不同时期和花粉-柱头互作中的表达水平。结果显示,茉莉花全基因组中共鉴定出27个TCP基因家族成员,命名为JsTCP1~JsTCP25,其蛋白包含208~539个氨基酸残基,分子量为22.95~56.96 ku,等电点为5.70~9.97,均为不稳定的亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果显示,JsTCPs均位于细胞核内。染色体定位结果显示,JsTCPs不均匀分布在10条染色体上。基因结构分析结果显示,JsTCPs具有1~5个外显子以及0~4个内含子。蛋白保守基序和系统进化分析结果显示,JsTCPs均含保守的TCP结构域,可分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚类。启动子顺式作用元件的分析结果显示,JsTCPs启动子上含有多个植物激素响应、胁迫响应和生长发育相关等元件。表达模式分析结果显示,24个JsTCPs基因在茉莉花花发育不同时期表达,22个基因在花粉-柱头互作中表达。总之,本研究鉴定了27个茉莉花TCP基因家族成员,并发现家族成员在花发育不同时期和授粉后不同时期特异表达。

关键词：茉莉花 TCP基因家族全基因组鉴定系统进化分析表达分析

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The horizon of bone organoid: A perspective on constructionand application

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Bioactive Materials 2022年第12期7卷 15-25页

作者： shuangshuang chen Xiao chen Zhen Geng Jiacan Su Institute of Translational Medicine Shanghai UniversityShanghai200444China Department of Orthopaedics Trauma Changhai HospitalSecond Military Medical UniversityShanghai200433China

Bone defects repair and regeneration by various causes such as tumor resection, trauma, degeneration, etc. havealways been a key issue in the clinics. As one of the few organs that can regenerate after adulthood, bone itselfhas a strong regenerative ability. In recent decades, bone tissue engineering technology provides various types offunctional scaffold materials and seed cells for bone regeneration and repair, which significantly accelerates thespeed and quality of bone regeneration, and many clinical problems are gradually solved. However, the bonemetabolism mechanism is complicated, the research duration is long and difficult, which significantly restrictsthe progress of bone regeneration and repair research. Organoids as a new concept, which is built in vitro withthe help of tissue engineering technology based on biological theory, can simulate the complex biologicalfunctions of organs in vivo. Once proposed, it shows broad application prospects in the research of organdevelopment, drug screening, mechanism study, and so on. As a complex and special organ, bone organoidconstruction itself is quite challenging. This review will introduce the characteristics of bone microenvironment,the concept of organoids, focus on the research progress of bone organoids, and propose the strategies for boneorganoid construction, study direction, and application prospects.

关键词： Bone organoid Bone regeneration Scaffold Disease models

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