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Genetic diversity of RNA viruses infecting invertebrate pests of rice

Science China(Life Sciences) 2024年第1期67卷 175-187页

作者： Haoran Wang shufen chao Qing Yan Shu Zhang Guoqing Chen Chonghui Mao Yang Hu Fengquan Yu Shuo Wang Liang Lv Baojun Yang Jiachun He Songbai Zhang Liangsheng Zhang Peter Simmonds Guozhong Feng State Key Laboratory of Rice Biology and Breeding China National Rice Research InstituteChinese Academy of Agricultural SciencesHangzhou 311400China State Key Laboratory of Agricultural Microbiology College of Life Science and TechnologyHuazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China Institute of Plant Protection&Soil Fertilizer Hubei Academy of Agricultural SciencesWuhan 430064China Institute of Plant Protection Guizhou Academy of Agricultural SciencesGuiyang 550000China Institute of Plant Protection Liaoning Academy of Agricultural SciencesShenyang 110161China Sanya Agricultural Technology Extension and Service Centre Sanya 572000China College of Agriculture Yangtze UniversityJingzhou 434000China Fujian Provincial Key Laboratory of Haixia Applied Plant Systems Biology Fujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhou 350002China Genomics and Genetic Engineering Laboratory of Ornamental Plants College of Agriculture and BiotechnologyZhejiang UniversityHangzhou 310012China Nuffield Department of Medicine Peter Medawar Building for Pathogen ResearchUniversity of OxfordOxford OX13SYUnited Kingdom

Invertebrate species are a natural reservoir of viral genetic diversity,and invertebrate pests are widely distributed in crop fields.However,information on viruses infecting invertebrate pests of crops is limited.In this report,we describe the deep metatranscriptomic sequencing of 88 invertebrate samples covering all major invertebrate pests in rice fields.We identified 296 new RNA viruses and 13 known RNA viruses.These viruses clustered within 31 families,with many highly divergent viruses constituting potentially new families and genera.Of the identified viruses,13 RNA viruses clustered within the Fiersviridae family of bacteriophages,and 48 RNA viruses clustered within families and genera of mycoviruses.We detected known rice viruses in novel invertebrate hosts at high abundances.Furthermore,some novel RNA viruses have genome structures closely matching to known plant viruses and clustered within genera of several plant virus species.Fortyfive potential insect pathogenic RNA viruses were detected in invertebrate species.Our analysis revealed that host taxonomy plays a major role and geographical location plays an important role in structuring viral diversity.Cross-species transmission of RNA viruses was detected between invertebrate hosts.Newly identified viral genomes showed extensive variation for invertebrate viral families or genera.Together,the large-scale metatranscriptomic analysis greatly expands our understanding of RNA viruses in rice invertebrate species,the results provide valuable information for developing efficient strategies to manage insect pests and virus-mediated crop diseases.

关键词： invertebrate species metatranscriptome viral diversity viral transmission viral genomes

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Editing of Rice Isoamylase Gene ISA1 Provides Insights into Its Function in Starch Formation

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Rice science 2019年第2期26卷 77-87页

作者： chao shufen CAI Yicong FENG Baobing JIAO Guiai SHENG Zhonghua LUO Ju TANG Shaoqing WANG Jianlong HU Peisong WEI Xiangjin State Key Laboratory of Rice Biology China National Rice Research Institute Southern Regional Collaborative Innovation Center for Grain and Oil Crops College of Agronomy Hunan Agricultural University

Isoamylase 1(ISA1) is an isoamylase-type debranching enzyme which plays a predominant role in amylopectin synthesis. In this study, the clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated endonuclease 9(CRISPR/Cas9) system was used to edit ISA1 gene in rice via Agrobacterium-mediated transformation. We identified 36 genetic edited lines from 55 T_0 transgenic events, and classified the mutation forms into 7 types. Of those, two homozygous mutants, cr-isa1-1(type 1, with an adenine insertion) and cr-isa1-2(type 3, with a cytosine deletion) were selected for further analysis. Seed sizes of both cr-isa1-1 and cr-isa1-2 were affected, and the two mutants also displayed a shrunken endosperm with significantly lower grain weight. Electron microscopy analysis showed that abnormal starch granules and amyloplasts were found in cr-isa1-1 and cr-isa1-2 endosperm cells. The contents of total starch, amylose and amylopectin in the endosperm of the cr-isa1 mutants were significantly reduced, whereas sugar content and starch gel consistency were observably increased compared to the wild-type. The gelatinization temperature and starch chain length distributions of the cr-isa1 mutants were also altered. Moreover, transcript levels of most starch synthesis-related genes were significantly lower in cr-isa1 mutants. In conclusion, the results indicated that gene edition of ISA1 affected starch synthesis and endosperm development, and brought potential implications for rice quality breeding.

关键词： ISA1 rice starch biosynthesis starch granule physicochemical property CRISPR Cas9

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人工智能肠镜辅助诊断肠道腺瘤的价值

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内科 2024年第1期19卷 18-22页

作者：晁帅恒段淑芬李岩张龙杰闫方博河南科技大学附属许昌市中心医院消化内镜中心许昌市461000

目的探究人工智能肠镜(肠镜AI)辅助诊断肠道腺瘤的价值。方法选取512例疑似肠道腺瘤患者作为研究对象,所有研究对象均行普通肠镜、肠镜AI辅助诊断和病理组织切片活检。比较普通肠镜与肠镜AI联合普通肠镜诊断肠道腺瘤的效能。结果在512... 详细信息

目的探究人工智能肠镜(肠镜AI)辅助诊断肠道腺瘤的价值。方法选取512例疑似肠道腺瘤患者作为研究对象,所有研究对象均行普通肠镜、肠镜AI辅助诊断和病理组织切片活检。比较普通肠镜与肠镜AI联合普通肠镜诊断肠道腺瘤的效能。结果在512例疑似肠道腺瘤患者中,445例病理组织切片活检结果为肠道腺瘤。肠镜AI联合普通肠镜检查诊断肠道腺瘤的灵敏度、特异度、准确度均高于普通肠镜检查(97.98%比90.34%,92.54%比61.19%,97.27%比86.52%,均P<0.05)。肠镜AI联合普通肠镜检查对腺瘤的病理分型与病理组织切片活检一致的病例数为428例,普通肠镜检查对腺瘤的病理分型与病理组织切片活检一致的病例数为390例(96.18%比87.64%,P<0.05)。445例肠道腺瘤患者中,19例病理组织检查结果为恶性肠道腺瘤,肠镜AI联合普通肠镜检查诊断恶性肠道腺瘤的特异度和准确度均高于普通肠镜检查(96.95%比93.66%,95.96%比91.91%,均P<0.05)。结论肠镜AI联合普通肠镜诊断肠道腺瘤的灵敏度、特异度、准确度和对肠道腺瘤病理分型的判定情况均显著优于普通肠镜,可提高恶性肠道腺瘤病变的检出率,具有较高的临床应用价值。

关键词：人工智能肠镜肠道腺瘤诊断价值

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3种种皮胶的结构特征及其对面包品质的影响

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食品研究与开发 2024年第1期45卷 19-25页

作者：初晓钰贺超武淑芬刘欢欢郭庆彬应歆张立峰王云龙孙振欧天津科技大学食品科学与工程学院天津300457 营养健康与食品安全北京市重点实验室老年营养食品研究北京市工程实验室中粮营养健康研究院有限公司北京102209 山东保安康生物科技有限公司山东临沂273300

为充分开发利用种皮胶资源,拓展种皮胶应用领域,采用水提醇沉法提取沙蒿胶(Artemisia sphaerocephala Krasch. gum,ASKG)、亚麻籽胶(flaxseed gum,FG)和奇亚籽胶[chia(Salvia hispanica L.)seed gum,CSG],对其基本分子结构进行表征,同时考察其对面包品质的影响。结果表明:ASKG、FG和CSG均具有典型的多糖类红外光谱特征,相对分子量分别为(476.2±8.1)、(1 456.4±15.9)、(2 335.6±10.8)kDa。ASKG主要由木糖、半乳糖、甘露糖、葡萄糖和葡萄糖醛酸组成,FG主要由木糖、阿拉伯糖、半乳糖和半乳糖醛酸组成,CSG主要由木糖、葡萄糖醛酸和阿拉伯糖组成。添加ASKG、FG和CSG(1%)能提高面团中自由水的比例,改善面包的弹性和咀嚼性,降低硬度和内聚性。并且,面包的比容和含水量增加,烘焙损失降低,品质得到改善。其中,ASKG相对FG和CSG可以更显著降低面包芯的硬度,制备的面包感官评分最高。

关键词：沙蒿胶亚麻籽胶奇亚籽胶结构特性功能特性

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温敏光子晶体及自适应结构色迷彩器件制备

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精细化工 2022年第8期39卷 1619-1625页

作者：王超牛文斌李胜铭王云朋张淑芬大连理工大学精细化工国家重点实验室辽宁大连116024 大连理工大学创新创业学院辽宁大连116024

以N,N-二甲基十二烷基氧化胺(C_(12)DMAO)为基本单元,将N-异丙基丙烯酰胺(NIPAM)、双丙酮丙烯酰胺(DAAM)、丙烯酰胺(AM)在紫外聚合的条件下形成PNIPAM-co-PDAAM-co-PAM交联网络,制备了一种快速响应的温敏光子晶体水凝胶C_(12)DMAO/PNIPA... 详细信息

以N,N-二甲基十二烷基氧化胺(C_(12)DMAO)为基本单元,将N-异丙基丙烯酰胺(NIPAM)、双丙酮丙烯酰胺(DAAM)、丙烯酰胺(AM)在紫外聚合的条件下形成PNIPAM-co-PDAAM-co-PAM交联网络,制备了一种快速响应的温敏光子晶体水凝胶C_(12)DMAO/PNIPAM-co-PDAAM-co-PAM。然后,采用硅橡胶对制备的温敏光子晶体水凝胶进行包覆,将包覆的温敏光子晶体水凝胶与集成电加热板复合,构建自适应结构色器件。通过反色光谱、红外成像对器件进行测试。结果表明,通过NIPAM、DAAM、AM比例的调整,水凝胶的响应温度可在4.3~55.0℃范围内调节。当NIPAM 0.20 g、DAAM 0.20 g、AM 0.05 g、MBAA 50 mg,制备的自适应结构色器件可在22~30℃之间调节温度,结构色器件可以实现快速的颜色变化。

关键词：温敏性结构色水凝胶光子晶体迷彩防伪功能材料

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激光多材料增材制造技术研究进展和展望

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航空制造技术 2023年第8期66卷 26-34页

作者：韦超杨潇鲁淑芬程东旭高学浩袁丁中国科学院宁波材料技术与工程研究所宁波315201

以航空航天为代表的极端使役零部件工作环境严酷,结构复杂,功能集成。多材料增材制造(Multi-material additive manufacturing,MMAM)能够满足特殊区域的宏观性能定制化和结构—功能一体化,在核能、军事、航空和医疗等领域具有极大的应... 详细信息

以航空航天为代表的极端使役零部件工作环境严酷,结构复杂,功能集成。多材料增材制造(Multi-material additive manufacturing,MMAM)能够满足特殊区域的宏观性能定制化和结构—功能一体化,在核能、军事、航空和医疗等领域具有极大的应用潜力。重点阐述了MMAM技术影响界面结合强度的主要因素及消除缺陷的方法;介绍了目前MMAM技术不同的送粉方法和每种送粉方法的优缺点;讨论了工艺参数对MMAM技术的影响规律;最后总结MMAM技术目前的瓶颈性难题,展望了未来的主要研究方向。

关键词：多材料增材制造(MMAM) 界面结合工艺参数送粉系统缺陷抑制

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ArcGIS实体化金字塔的瓦片地图漏洞检查方法

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测绘科学 2018年第7期43卷 175-179页

作者：林超侯淑芬饶云广东省国土资源技术中心广州510075

针对GeoGlobe软件在瓦片地图生成过程中容易产生漏洞现象(也称漏片)的问题,该文提出了一种基于ArcGIS实体化金字塔瓦片地图漏洞检查方法。利用ArcGIS软件实体化格网坐标和空间位置自动匹配的检查方式,能够快速地检测地图瓦片数量、定位... 详细信息

针对GeoGlobe软件在瓦片地图生成过程中容易产生漏洞现象(也称漏片)的问题,该文提出了一种基于ArcGIS实体化金字塔瓦片地图漏洞检查方法。利用ArcGIS软件实体化格网坐标和空间位置自动匹配的检查方式,能够快速地检测地图瓦片数量、定位漏洞坐标位置。实验表明,该方法提高了质检员工作效率,作业时间只有传统方法的6%~10%,在保证100%的检测精度上解放了劳动力,降低生产成本。

关键词：瓦片实体化金字塔 “漏洞” GeoGlobe 位置匹配

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尺神经腱鞘纤维瘤超声表现1例

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临床超声医学杂志 2022年第3期24卷 191-191,196页

作者：沈素红陈超刘淑粉耿丰勤付卓河南省洛阳正骨医院河南省骨科医院功能检查科河南省洛阳市471000

患者男,32岁,因左手肌肉萎缩伴环指、小指伸直障碍1年余,加重2个月入院。体格检查:左手肌肉广泛萎缩,尤以虎口区明显,环指和小指屈曲畸形,屈伸活动受限,不能主动分指和并指,左手握力差,手指肌力约3级,左手尺侧感觉麻木迟钝。肌电图检查... 详细信息

患者男,32岁,因左手肌肉萎缩伴环指、小指伸直障碍1年余,加重2个月入院。体格检查:左手肌肉广泛萎缩,尤以虎口区明显,环指和小指屈曲畸形,屈伸活动受限,不能主动分指和并指,左手握力差,手指肌力约3级,左手尺侧感觉麻木迟钝。肌电图检查提示:左腕尺神经深支严重损伤。超声检查.

关键词：屈曲畸形屈伸活动肌电图检查手握力环指严重损伤尺侧超声检查

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过敏性紫癜患儿急性期血清白介素-33与抗内皮细胞抗体-IgA、抗心磷脂抗体-IgA相关性分析

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临床儿科杂志 2013年第9期31卷 833-836页

作者：李超任立红仰曙芬哈尔滨医科大学第二附属医院儿内科黑龙江哈尔滨150086

目的探讨不同临床类型过敏性紫癜(HSP)患儿急性期血清白介素-33(IL-33)、抗内皮细胞抗体IgA(AECAIgA)、抗心磷脂抗体IgA(ACA-IgA)水平变化及其临床意义。方法选取2012年11月—2013年1月住院的HSP急性期患儿37例,健康儿童20例作为研究对... 详细信息

目的探讨不同临床类型过敏性紫癜(HSP)患儿急性期血清白介素-33(IL-33)、抗内皮细胞抗体IgA(AECAIgA)、抗心磷脂抗体IgA(ACA-IgA)水平变化及其临床意义。方法选取2012年11月—2013年1月住院的HSP急性期患儿37例,健康儿童20例作为研究对象;采用双抗体夹心ELISA法测定血清IL-33水平,双抗原夹心ELISA法测定血清AECA-IgA、ACA-IgA水平并进行比较。结果 HSP患儿急性期血清IL-33、AECA-IgA、ACA-IgA的水平较健康儿童明显升高,差异均有统计学意义(P均<0.001);混合型HSP患儿[除累及关节外,合并胃肠症状和(或)肾脏受损]血清IL-33、AECA-IgA、ACA-IgA水平与关节型、腹型和肾型相比较,差异均有统计学意义(P均<0.05);急性期HSP患儿血清IL-33与AECA-IgA、ACA-IgA水平呈正相关(r=0.752、0.788,P均<0.001)。结论 IL-33、AECA-IgA、ACA-IgA相互作用所致血管免疫病理损伤,可能是HSP发病的重要因素,可为HSP的早期诊断和治疗提供线索。

关键词：过敏性紫癜白细胞介素-33 抗内皮细胞抗体-IgA 抗心磷脂抗体-IgA

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窄带成像联合近焦放大内镜诊断无蒂锯齿状病变的应用

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中国医学工程 2022年第9期30卷 10-13页

作者：张龙杰晁帅恒丁光伟段淑芬许昌市中心医院消化内镜中心河南许昌461000

目的探讨窄带成像联合近焦放大内镜在无蒂锯齿状病变(SSLs)中的诊断价值。方法前瞻性选取2017年1月至2020年12月于许昌市中心医院接受诊疗的100例疑似SSLs患者临床资料,所有入选者均接受窄带成像联合近焦放大内镜检查,以病理检查结果为... 详细信息

目的探讨窄带成像联合近焦放大内镜在无蒂锯齿状病变(SSLs)中的诊断价值。方法前瞻性选取2017年1月至2020年12月于许昌市中心医院接受诊疗的100例疑似SSLs患者临床资料,所有入选者均接受窄带成像联合近焦放大内镜检查,以病理检查结果为金标准,分析窄带成像联合近焦放大内镜在SSLs中的诊断价值。结果经病理诊断结果显示,100例疑似SSLs患者中无蒂锯齿状病变83例(83.00%),非无蒂锯齿状病变17例(17.00%);窄带成像联合近焦放大内镜诊断SSLs的灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值分别为95.18%(79/83)、82.35%(14/17)、93.00%(93/100)、96.34%(79/82)、77.78%(14/18);窄带成像联合近焦放大内镜诊断无蒂锯齿状病变与病理诊断结果具有极好一致性(Kappa=0.776,P<0.05)。结论窄带成像联合近焦放大内镜在SSLs及性质判定中具有较高应用价值。

关键词：无蒂锯齿状病变窄带成像近焦放大内镜

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