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Landscape of genomic imprinting and its functions in the mouse mammary gland

Journal of Molecular Cell Biology 2020年第11期12卷 857-869页

作者： Haibo Xu Lina Zhao Xu Feng Yujie Ma Wei Chen Li Zou Qin Yang Jihong Sun Hong Yu baowei jiao State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution Kunming Institute of ZoologyChinese Academy of SciencesKunming 650223China Kunming College of Life Science University of Chinese Academy of SciencesKunming 650223China Department of Radiology Sir Run Run Shaw HospitalZhejiang University School of MedicineHangzhou 310016China Department of General Surgery Sir Run Run Shaw HospitalZhejiang University School of MedicineHangzhou 310016China KIZ-CUHK Joint Laboratory of Bioresources and Molecular Research in Common Diseases Kunming Institute of ZoologyChinese Academy of SciencesKunming 650223China Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics Chinese Academy of SciencesKunming 650223China

Genomic imprinting is an epigenetic modification of DNA,whereby gene expression is restricted to either maternally or paternally inherited *** genes(IGs)in the placenta and embryo are essential for growth regulation and nutrient ***,despite being an important nutrition delivery organ,studies on mammary gland genomic imprinting remain *** this study,we found that both the number of IGs and their expression levels decreased during development of the mouse mammary *** expression was lineage-specific and related to mammary gland development and ***-analysis of single-cell RNA sequencing data revealed that mammary gland IGs were co-expressed in a network that regulated cell sternness and differentiation,which was confirmed by our functional ***,our data indicated that IGs were essential for the self-renewal of mammary gland stem cells and IG decline was correlated with mammary gland *** together,our findings revealed the importance of IGs in a poorly studied nutrition-related organ,*** mammary gland,thus providing a reference for further studies on genomic imprinting.

关键词： imprinted gene imprinted gene network mammary gland stem cell differentiation metabolism

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Genomic evidence of lung carcinogenesis associated with coal smoke in Xuanwei area, China

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National Science Review 2021年第12期8卷 15-19页

作者： Honglei Zhang Chao Liu Li Li Xu Feng Qing Wang Jihua Li Shaobin Xu Shuting Wang Qianlu Yang Zhenghai Shen Jinhua Su Xiaosan Su Ruifen Sun Xuhong Zhou Junliang Wang Yongchun Zhou baowei jiao Wanbao Ding Xianbao Cao Yue Wang Yunchao Huang Lianhua Ye Center for Scientific Research Yunnan University of Chinese Medicine Department of Nuclear Medicine Third Affiliated Hospital of Kunming Medical UniversityYunnan Cancer Hospital Biotherapy Center Third Affiliated Hospital of Kunming Medical University Yunnan Cancer Hospital Department of Oncology Qujing First People's Hospital Qujing Center for Disease Control and Prevention Supercomputing Platform of Kunming Institute of Zoology Kunming Biological Diversity Center of Instruments Kunming Institute of Zoology Chinese Academy of Sciences Department of Thoracic Surgery Ⅱ Third Affiliated Hospital of Kunming Medical University Yunnan Cancer Hospital Department of Thoracic Surgery Ⅰ Third Affiliated Hospital of Kunming Medical University Yunnan Cancer Hospital Department of Thoracic Surgery Xuanwei People's Hospital State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution Kunming Institute of Zoology Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics Chinese Academy of Sciences KIZ-CUHK Joint Laboratory of Bioresources and Molecular Research in Common Diseases Kunming Institute of Zoology Chinese Academy of Sciences Department of Oncology Yan'an Affiliated Hospital of Kunming Medical University Department of Otolaryngology First People's Hospital of Yunnan Province the Affiliated Hospital of Kunming University of Science and Technology The Affiliated Hospital of Guizhou Medical University

Xuanwei area, in southwestern China,harbors the highest female lung cancer rate in the country(Supplementary Table 1) [1]. Epidemiological studies have shown that lung cancer incidence in Xuanwei area is associated with the use of different types of local coal for household cooking and heating [2]. The genomic landscape of Xuanwei female adenocarcinoma(XWFA), the most distinctive feature of lung cancer in Xuanwei, has yet to be elucidated systematically. Here,we provide the fundamental resource of genomic datasets for further exploration of XWFA molecular mechanisms and development of targetable therapy.

关键词： MUTATIONS

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印记基因:发育中的重要调节因子

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遗传 2016年第6期38卷 508-522页

作者：吴瑜冯旭高岚焦保卫兰州大学生命科学院发育生物学研究所兰州730000 中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室昆明650223 昆明理工大学生命科学与技术学院昆明650500

印记基因是一类单等位表达的基因,数量少但功能强大,构成了基因组印记这一表观遗传领域中的独特现象,来源于不同亲本的印记基因在个体发育过程中承担着不同的重要功能。除了印记基因状态的建立、保持,人们围绕印记基因在发育进程中的功... 详细信息

印记基因是一类单等位表达的基因,数量少但功能强大,构成了基因组印记这一表观遗传领域中的独特现象,来源于不同亲本的印记基因在个体发育过程中承担着不同的重要功能。除了印记基因状态的建立、保持,人们围绕印记基因在发育进程中的功能做了大量研究。印记基因最初在核移植研究中被发现,早期研究聚焦在个别基因簇上。随着组学技术的引入,更多的印记基因被筛选和鉴定出来,这也引起了该领域内的热烈讨论和关注。随着全基因组DNA甲基化及组蛋白修饰等研究方法的发展,人们对印记基因的两个经典调控模型又提出新的看法和思考,尤其是最近的一些研究成果对于解释印记基因在哺乳动物中的高度保守性及其存在的意义具有重要启示。本文立足于最新研究进展,从印记基因的特征和基本规律、发育中的调控作用、机制、研究方法、进化以及环境对其影响等几个方面进行了综述,旨在为人们全面了解印记基因概况及研究趋势提供参考和指导。

关键词：印记基因发育进化

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生命共同体理念的哲学意蕴与环境治理创新

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河南师范大学学报（哲学社会科学版） 2024年第2期51卷 91-97页

作者：张保伟汤茂玥河南师范大学科技与社会研究所河南新乡453007 上海交通大学马克思主义学院上海200240

基于个人主义的传统环境治理体系,与环境治理的整体性、系统性、协同性的本质要求之间存在极大的落差和张力,面临治理实践的多重困境。人与自然生命共同体理念的提出确立了人与自然关系的新的定位,对环境治理形成了一种新的认知框架和... 详细信息

基于个人主义的传统环境治理体系,与环境治理的整体性、系统性、协同性的本质要求之间存在极大的落差和张力,面临治理实践的多重困境。人与自然生命共同体理念的提出确立了人与自然关系的新的定位,对环境治理形成了一种新的认知框架和解决方案,是理念、目标和方法论的有机统一体,因而具有治理哲学的意涵。环境治理从个人主义转向生命共同体,带来了主体、思维、手段、制度等方面的治理创新。具体表现为治理主体从个体主体转向治理共同体,治理思维从人对自然的单向治理转向双向建构,治理手段从个体关注转向关系和共同体,治理制度从主体性规范转向结构性连接。

关键词：人与自然生命共同体个人主义环境治理创新

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基于FA-BP神经网络模型的烘丝机设备故障诊断

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中国仪器仪表 2024年第1期 40-44页

作者：汪冬冬侯加文焦帅帅江豪张保威河南中烟驻马店卷烟厂河南驻马店463000 郑州轻工业大学河南郑州450002

烘丝机作为烟丝生产的重要设备,其健康状态直接影响着烟丝的品质及生产效率。为了较早诊断出烘丝机故障,降低因故障带来的损失,提出了一种基于萤火虫算法(FA)优化BP神经网络的烘丝机故障诊断算法。首先,分析烘丝机的故障特征;其次,利用... 详细信息

烘丝机作为烟丝生产的重要设备,其健康状态直接影响着烟丝的品质及生产效率。为了较早诊断出烘丝机故障,降低因故障带来的损失,提出了一种基于萤火虫算法(FA)优化BP神经网络的烘丝机故障诊断算法。首先,分析烘丝机的故障特征;其次,利用萤火虫算法寻优特性找到BP神经网络的最优权值和阈值,使故障诊断模型效果达到最佳状态。通过与SVM和BP神经网络模型进行对比分析,结果表明,使用FA-BP神经网络模型的烘丝机故障诊断准确率高达94.5%,诊断效果优于所对比的模型。

关键词：烘丝机萤火虫算法 BP神经网络故障诊断

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塔里木盆地荒漠区柽柳属植物总DNA提取及RAPD体系优化

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基因组学与应用生物学 2015年第9期34卷 2015-2023页

作者：庞新安白宝伟姜喜陈加利焦培培新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地阿拉尔843300 塔里木大学生命科学学院阿拉尔843300 塔里木大学植物科学学院阿拉尔843300

本研究以干旱荒漠盐生植物柽柳的幼嫩叶片为实验材料,探究摸索其总DNA的提取方法与RAPD-PCR的反应体系及扩增条件。结果表明,改良CTAB-高盐沉淀法较好地提取出了柽柳植物的总DNA,其产量、质量均有明显提高,比较适合于多数柽柳属植物的DN... 详细信息

本研究以干旱荒漠盐生植物柽柳的幼嫩叶片为实验材料,探究摸索其总DNA的提取方法与RAPD-PCR的反应体系及扩增条件。结果表明,改良CTAB-高盐沉淀法较好地提取出了柽柳植物的总DNA,其产量、质量均有明显提高,比较适合于多数柽柳属植物的DNA提取;同时,通过单因素试验比较优化筛选出了适合于柽柳植物RAPD分析的最佳的PCR反应体系与扩增条件,其25μL的反应体系中包含有Mg2+=2.5 mmol/L、d NTPs=0.25 mmol/L、引物=0.30μmol/L、Taq DNA聚合酶=1.5 U、模板DNA=200 ng;其最适扩增条件为95℃预变性4 min,94℃变性30 s、36℃退火40 s、72℃延伸1 min、40个循环;最终在72℃下延伸10 min,4℃下保存;另外,通过6条多态性引物的扩增效果证实该优化体系比较稳定,扩增条件比较合适,能够满足多数柽柳植物分子多态性的检测要求。

关键词：塔里木盆地柽柳属 DNA提取 RAPD体系优化

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大肠杆菌乙酰辅酶A代谢调控及其应用研究进展

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化工进展 2019年第9期38卷 4218-4226页

作者：陈露刘丁玉汪保卫赵玉姣贾广韬陈涛王智文天津大学化工学院天津300350 天津大学系统生物工程教育部重点实验室天津300350 天津大学化工协同创新中心天津300350 潍坊医学院生物科学与生物技术学院山东潍坊261053

利用生物法合成生物基化学品具有高效、绿色、可持续发展等优势。乙酰辅酶A作为细胞内物质代谢的重要中间产物,是利用生物转化法合成许多生物基化学品的重要前体,在微生物碳代谢过程中发挥着枢纽作用。本文综述了大肠杆菌乙酰辅酶A的合... 详细信息

利用生物法合成生物基化学品具有高效、绿色、可持续发展等优势。乙酰辅酶A作为细胞内物质代谢的重要中间产物,是利用生物转化法合成许多生物基化学品的重要前体,在微生物碳代谢过程中发挥着枢纽作用。本文综述了大肠杆菌乙酰辅酶A的合成、代谢调控策略及其重要应用,重点总结了乙酰辅酶A的合成途径及近期发展的提高乙酰辅酶A胞内通量的代谢调控策略,包括乙酸途径的代谢调控、丙酮酸合成乙酰辅酶A途径的代谢调控、中心碳代谢途径的代谢调控、β氧化合成乙酰辅酶A途径的代谢调控和乙酰辅酶A合成新途径的发掘,进一步展望了提高乙酰辅酶A供给的策略,利用基因组编辑技术构建合成乙酰辅酶A为前体化学品细胞工厂的方法。

关键词：乙酰辅酶A 大肠杆菌代谢工程通量

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带有离散和分布时滞的不确定广义系统的保性能控制

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长春理工大学学报（自然科学版） 2009年第2期32卷 339-343页

作者：焦建民孙小军吴保卫宝鸡文理学院数学系宝鸡721013 陕西师范大学数学与信息科学学院西安710062

研究了一类带有离散和分布时滞的不确定广义系统的保性能控制问题。基于Lyapunov稳定性理论,应用线性矩阵不等式处理方法,给出了系统鲁棒保性能状态反馈控制器存在的充分条件和设计方法。所设计的保性能控制器保证了对所有允许的不确定... 详细信息

研究了一类带有离散和分布时滞的不确定广义系统的保性能控制问题。基于Lyapunov稳定性理论,应用线性矩阵不等式处理方法,给出了系统鲁棒保性能状态反馈控制器存在的充分条件和设计方法。所设计的保性能控制器保证了对所有允许的不确定性,闭环系统正则、无脉冲、渐近稳定,且闭环性能指标函数具有上界。数值算例说明了所给方法的有效性。

关键词：离散和分布时滞广义系统保性能控制线性矩阵不等式

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塔里木盆地荒漠区柽柳属植物花器官形态特征及其分类学意义

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塔里木大学学报 2009年第2期21卷 65-68页

作者：庞新安姜喜白宝伟焦培培新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学生物技术研究开发中心新疆阿拉尔843300 塔里木大学植物科学学院新疆阿拉尔843300 塔里木大学生命科学学院新疆阿拉尔843300

柽柳属植物外形特征相似,种间容易杂交,分种鉴定困难。本文整理分析了塔里木盆地荒漠区内柽柳属植物的花器官形态特征,并编制了分种检索表,同时探讨了花器官形态特征在柽柳属植物中的分类学意义。

关键词：塔里木盆地柽柳属花器官形态特征分类学意义

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维生素B1对5～15周龄鹅营养物质利用率、肠道形态及微生物菌群的影响

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动物营养学报 2014年第6期26卷 1444-1452页

作者：王宝维王姣葛文华张名爱岳斌徐晨晨贾玉辉史雪萍青岛农业大学优质水禽研究所青岛266109

本试验旨在研究维生素B1对5～15周龄鹅营养物质利用率、肠道形态及微生物菌群的影响。试验选用5周龄青农灰鹅360只，随机分为6个处理，每个处理6个重复，每个重复10只鹅（公母各占1/2）。各组维生素B1的水平分别为0.8、2.6、4.4、6.2、... 详细信息

本试验旨在研究维生素B1对5～15周龄鹅营养物质利用率、肠道形态及微生物菌群的影响。试验选用5周龄青农灰鹅360只，随机分为6个处理，每个处理6个重复，每个重复10只鹅（公母各占1/2）。各组维生素B1的水平分别为0.8、2.6、4.4、6.2、8.0、9.8 mg/kg。试验期11周。结果表明：饲粮中添加不同水平维生素B1能够极显著提高鹅对饲粮营养物质的利用率（P〈0.01）；显著（P〈0.05）或极显著（P〈0.01）提高15周龄各肠段肠长指数和肠体指数；显著降低15周龄盲肠内容物大肠杆菌的数量（P〈0.05），显著（P〈0.05）或极显著（P〈0.01）增加15周龄双歧杆菌和乳酸杆菌的数量；显著（P〈0.05）或极显著（P〈0.01）增加空肠绒毛高度和绒毛高度/隐窝深度，降低隐窝深度和肠壁厚度。由此可见，5~15周龄鹅饲粮中添加适宜水平维生素B1能够促进肠道发育和有益菌群增殖；鹅肠道形态变化与饲粮中营养物质利用率密切相关。

关键词：维生素B1 鹅营养物质利用率消化道菌群组织学

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