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Mating type gene organization in the mushroom forming fungus Flammulinavelutipes

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Mating type gene organization in the mushroom forming fungus...

中国菌物学会2016年学术年会

作者： Wei Wang Lingdan Lian Ping Xu Tiansheng Chou Irum Mukhtar Aron Osakina Muhammad Waqas Bingzhi Chen Xinrui Liu Fang Liu baogui xie Arend F.van Peer Mycological Research Center College of Life SciencesFujian Agriculture and Forestry University College of Crop Sciences Fujian Agriculture and Forestry University College of Food Sciences Fujian Agriculture and Forestry University

Mating involvesthe transition from a self-sterileinto a fertile *** a prerequisite for the production of fruiting bodies,this is a fundamental step in the life cycle of mushroom forming *** mating,two genetically distinct monokaryons called mating types,will fuse and establish a *** compatibilityof mating types as well as the development of a dikaryonare controlled by independent gene clusters atthe MAT-A and the MAT-B *** MAT loci have been studied poorly for the majority of mushroom forming *** deepen our understanding of mating,we identified and mapped the structures of a series of MAT loci in the important edible mushroom *** results showed that the MAT-A and the MAT-B loci of *** each contained two separate,functionally redundantsubloci（Aa/Ab and Ba/Bb）.Depending on the interacting mating types,different MAT-A and MAT-Bsublociare predicted to control the mating *** analysis demonstrated that new combinations of MAT-Aa and MAT-Absubloci could be generated at a low frequency during ***,we demonstrated different combinations of MAT-Ba and *** means that *** can generate new mating types not only by recombining MAT-A with MAT-B loci（i.e.a typical tetrapolar mating type system）,but also can occasionally create new MAT-A and MAT-B mating *** resultsof our study provide important directions for further research on *** type genes of loci that were indicated to control mating in specific combinations are currently subjected to transformation assays that will confirm（or reject） their control over their respective A or B *** resulting mutants will be used to explore thedownstreamgenetic mechanisms of mating in ***.

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来源： cnki会议评论

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草菇α-淀粉酶基因的生物信息学分析

食用菌学报 2014年第3期21卷 6-12,F0003页

作者：杜慕云杨仁德李剑谢宝贵贵州省土壤肥料研究所贵州贵阳550009 福建农林大学菌物研究中心福建福州350002

基于草菇（Volvariella volvacea ）基因组和转录组数据,通过生物信息学的方法对草菇α-淀粉酶基因进行基本理化性质、内含子和外显子结构、信号肽、亚细胞定位和功能位点的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明：编码草菇α-淀粉酶... 详细信息

基于草菇（Volvariella volvacea ）基因组和转录组数据,通过生物信息学的方法对草菇α-淀粉酶基因进行基本理化性质、内含子和外显子结构、信号肽、亚细胞定位和功能位点的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明：编码草菇α-淀粉酶的基因有5个,分别为 GME 2151、GME 6695、GME 9075、GME 10698和GME 10705；5个基因编码的蛋白相对分子量介于38.8~64.6 kD 之间,磷酸化以 Ser 位点为主,大都存在信号肽,亚细胞定位在细胞外,保守结构域和空间结构相似度较高。和其它的担子菌一样,草菇α-淀粉酶可以分为两类：GME9075和 GME10698归为α-淀粉酶Ⅰ类,GME2151、GME6695和 GME10705属于α-淀粉酶Ⅱ类。

关键词：草菇 α-淀粉酶基因生物信息学

vv-2ogo,一个在草菇原基中高表达的基因

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基因组学与应用生物学 2015年第6期34卷 1267-1271页

作者：谢斌王健汪健芳许鸣凤李肖严俊杰谢宝贵福建农林大学菌物研究中心福州350002

本研究结合草菇子实体不同生长时期的表达谱数据及荧光定量PCR分析结果,获得一个在原基高表达的基因,推测它与草菇原基时期子实体的生长分化有关。基因组注释结果显示它是一个编码2-OG依赖性氧合酶(2-oxoglutarate dependent oxygenases... 详细信息

本研究结合草菇子实体不同生长时期的表达谱数据及荧光定量PCR分析结果,获得一个在原基高表达的基因,推测它与草菇原基时期子实体的生长分化有关。基因组注释结果显示它是一个编码2-OG依赖性氧合酶(2-oxoglutarate dependent oxygenases)的基因,系统发育分析也支持基因注释的结果,该基因被我们命名为vv-2ogo。转录组Reads定位结果表明,该基因全长1 451 bp,含有3个外显子,2个内含子,编码440个氨基酸,其中第二个内含子在RNA加工过程中有保留现象。

关键词：草菇 2-OG依赖性氧合酶基因结构表达分析

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分子标记鉴别灰树花种质资源的研究

热带作物学报 2011年第7期32卷 1330-1336页

作者：温志强熊芳陈吉娜朱坚谢宝贵福建农林大学菌物研究中心福州福建350002

长期以来,食用菌菌种同名异种、同种异名问题给科研带来许多不必要的重复,也阻碍了菌种调剂供给。利用RAPD、ISSR、SRAP三种DNA分子标记分别对来源不同的30个灰树花(Grifola frondosa)菌株进行鉴别,并将得到的部分多态性条带转化为SCAR... 详细信息

长期以来,食用菌菌种同名异种、同种异名问题给科研带来许多不必要的重复,也阻碍了菌种调剂供给。利用RAPD、ISSR、SRAP三种DNA分子标记分别对来源不同的30个灰树花(Grifola frondosa)菌株进行鉴别,并将得到的部分多态性条带转化为SCAR标记。3种分子标记对30个灰树花菌株的分析结果表明,共产生77条多态性条带。采用Jaccard聚类距离中的类平均法(UPGMA)进行聚类分析可知,在D=0.77的相异系数水平上,可以将30个灰树花菌株分为10个类群,其中包括6个单一类别和4个复合类群。同时实验成功转化并验证了8个灰树花的SCAR标记。8个SCAR标记对30个灰树菌株的鉴定结果,也将30个灰树花菌株分为10类。

关键词： ISSR RAPD SRAP SCAR 灰树花

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灵芝原生质体单核化杂交育种

中国农学通报 2009年第23期25卷 64-69页

作者：吴小平刘方谢玉荣王政龙何桥兰谢宝贵福建农林大学生命科学学院福州350002 福建农林大学菌物研究中心福州350002

由于灵芝孢子难以在人工条件下萌发,因此灵芝无法通过常规的担孢子萌发的方法获得灵芝杂交育种所需的单核菌株,这使灵芝的育种进展缓慢。利用生物统计软件和分子生物学方法,选择遗传距离较远和农艺性状互补的G.l0006、G.l0012、G.l0024... 详细信息

由于灵芝孢子难以在人工条件下萌发,因此灵芝无法通过常规的担孢子萌发的方法获得灵芝杂交育种所需的单核菌株,这使灵芝的育种进展缓慢。利用生物统计软件和分子生物学方法,选择遗传距离较远和农艺性状互补的G.l0006、G.l0012、G.l0024、G.l0030+2和G.l0003+1作为亲本菌株。通过原生质体单核化技术,获得了81株灵芝单核菌株,对此单核菌株进行了交配型测定,获得了7种不同交配型的型芝。单原根核生据菌质灵株体芝。单单从核核理菌菌论丝丝上的的说2生,类双长交核速配菌度型丝,的选体比择经例原8株并生单非质核1体∶菌1单,株有核作的化为菌后杂丝2交种体育交经种配原材型生料的质,比体将例单筛应核选为化出1的后∶1,单只但核找结菌到果株1显种进示交行,灵配两两配对,根据锁状联合的有无,共得到24株杂交菌株,通过拮抗反应验证,证实24株杂交菌株是真正的杂交菌株。结果表明:灵芝原生质体单核化杂交育种技术是可行的。

关键词：灵芝原生质体单核化杂交育种交配型因子

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对一种可以抑制疣孢霉生长的细菌的鉴定

食用菌学报 2009年第1期16卷 92-94页

作者：蔡少芬温志强张婷温建荣谢宝贵福建农林大学菌物研究中心福建福州350002

对分离获得的FJ-08菌株进行形态特征的观察、生理生化实验,VITEK全自动微生物鉴定仪鉴定以及16S rDNA测序,结果表明该菌为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis);该菌对福建省蘑菇生产中广泛分布的3类疣孢霉菌的生长有抑制作用。

关键词：疣孢霉抑制枯草芽孢杆菌FJ-08

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植物制片一步二重染色混合液的研究

广西农学院学报 1986年第2期 13-20页

作者：林鉴钊谢宝贵

1982年以来,笔者用碱性染料,先后研配成功番红—苏木精、番红—龙胆紫、盐基品红—龙胆紫等二重染色混合液,对粮食作物、果树、药用植物、花卉、田间杂草等植物切片,可以在115—60分钟内一步完成二重染色,效果均良好。一般木化、栓化、... 详细信息

1982年以来,笔者用碱性染料,先后研配成功番红—苏木精、番红—龙胆紫、盐基品红—龙胆紫等二重染色混合液,对粮食作物、果树、药用植物、花卉、田间杂草等植物切片,可以在115—60分钟内一步完成二重染色,效果均良好。一般木化、栓化、角化的细胞和花粉粒的外壁染成红色或紫红色,薄壁细胞染成篮黑色或紫蓝色,染色体染成紫红色或红黑色。二重染色混合液的研配成功,改变了旧法二重染色分别进行的程序,大大地缩短了染色时间,同时节省了染料。

关键词：混合液番红薄壁细胞木化细胞苏木精二重染色盐基品红植物

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阿魏蘑的DNA指纹分析与鉴定

中国农学通报 2011年第16期27卷 132-135页

作者：刘芳刘新锐熊芳朱坚谢宝贵福建农林大学菌物研究中心福州350002

为及时制止阿魏蘑菌株混乱现象的产生,对国内现有的11株栽培常用的阿魏蘑菌株进行DNA指纹分析;以RAPD、ISSR、SRAP多态性分析的方法为主,用筛选出来的8条RAPD、ISSR、SRAP引物共扩增出116个较为清晰的DNA条带,然后进行聚类分析;结果表明... 详细信息

为及时制止阿魏蘑菌株混乱现象的产生,对国内现有的11株栽培常用的阿魏蘑菌株进行DNA指纹分析;以RAPD、ISSR、SRAP多态性分析的方法为主,用筛选出来的8条RAPD、ISSR、SRAP引物共扩增出116个较为清晰的DNA条带,然后进行聚类分析;结果表明,可将11个供试菌株分为4个群体:类Ⅰ:包括Pl.f 0007;类Ⅱ:包括Pl.f 0002;类Ⅲ:包括Pl.f 0003;类Ⅳ:包括余下的8个菌株。为阿魏蘑的核心种质的构建和资源的科学保存提供了依据,并为规范阿魏蘑的生产奠定了基础。

关键词：阿魏蘑 DNA指纹分析综合聚类分析

金针菇凝集素基因Fv-mJRL1的生物信息学分析及其共表达

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厦门大学学报（自然科学版） 2016年第3期55卷 323-329页

作者：陈仁良王威严俊杰熊宏民谢宝贵福建农林大学生命科学学院菌物研究中心福建福州350002

Jacalin凝集素(jacalin-related lectins,JRLs)是一类含有一个或多个JRL结构域的蛋白质,参与生物或非生物环境刺激应答.本研究基于金针菇(Flammulina velutipes)基因组数据,注释筛选到其中一个JRL基因Fv-mJRL1,对其基因结构、蛋白质性... 详细信息

Jacalin凝集素(jacalin-related lectins,JRLs)是一类含有一个或多个JRL结构域的蛋白质,参与生物或非生物环境刺激应答.本研究基于金针菇(Flammulina velutipes)基因组数据,注释筛选到其中一个JRL基因Fv-mJRL1,对其基因结构、蛋白质性质进行了生物信息学分析,并利用其上游调控序列进一步预测到该基因潜在的转录因子Fv-Mbp1.通过实时荧光定量PCR分析得知,无论是在不同栽培基质培养的金针菇菌丝还是在金针菇各发育时期的组织中,Fv-mJRL1基因与潜在的转录因子基因Fv-Mbp1之间都存在极强的共表达规律.生物信息学及实时荧光定量PCR分析为筛选挖掘基因潜在的转录因子提供便利,后期仍需利用下游分子实验进行更为精确的验证.

关键词： jacalin凝集素子实体形成潜在转录因子皮尔森相关系数