vv-2ogo,一个在草菇原基中高表达的基因
vv-2ogo, a Gene of Volvariella volvacea Having Higher Expression Level in Primordium作者机构:福建农林大学菌物研究中心福州350002
出 版 物:《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)
年 卷 期:2015年第34卷第6期
页 面:1267-1271页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学]
基 金:国家自然科学基金项目(31470107) 国家重点基础研究发展计划(2014CB13830X)共同资助
主 题:草菇 2-OG依赖性氧合酶 基因结构 表达分析
摘 要:本研究结合草菇子实体不同生长时期的表达谱数据及荧光定量PCR分析结果,获得一个在原基高表达的基因,推测它与草菇原基时期子实体的生长分化有关。基因组注释结果显示它是一个编码2-OG依赖性氧合酶(2-oxoglutarate dependent oxygenases)的基因,系统发育分析也支持基因注释的结果,该基因被我们命名为vv-2ogo。转录组Reads定位结果表明,该基因全长1 451 bp,含有3个外显子,2个内含子,编码440个氨基酸,其中第二个内含子在RNA加工过程中有保留现象。