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Efficiency of DNA barcodes for species delimitation:A case in Pterygiella Oliv.(Orobanchaceae)

Journal of Systematics and Evolution 2011年第3期49卷 189-202页

作者： alexandra h.wortley Royal Botanic Garden Edinburgh

DNA barcoding is becoming an increasingly popular means to identify *** obscure discrimination in the genus Pterygiella calls into question the re-assessment of the criterion for species *** collected 20 individuals,representing all five described species of this genus in its distributional *** aim was to use three proposed barcode DNA regions(rbcL,matK,and ITS) to diagnose Pterygiella species,and examine which barcode is more suitable for discerning the congeneric and related *** results showed that the core barcodes matK and rbcL were comparatively less ***,the ITS region,especially ITS-1 and ITS-2,successfully identified all species in the ***,the secondary structure of ITS-2 RNA,especially compensatory base changes,appears complementary to classical primary sequence analysis for DNA barcoding.

关键词： compensatory base changes(CBCs) DNA barcode ITS-2 non-monophyletic species Pterygiella Oliv. secondary structure.

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