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Bivariate association analysis for quantitative traits using generalized estimation equation

Journal of Genetics and Genomics 2009年第12期36卷 733-743页

作者： fang yang Zihui Tang Hongwen Deng Laboratory of Molecular and Statistical Genetics College of Life Sciences Hunan Normal University Changsha 410081 China Center of Systematic Biomedical Research Shanghai University of Science and Technology Shanghai 200093 China Departments of Orthopedic Surgery and Basic Medical Sciences University of Missouri-Kansas City Kansas City MO 64108 USA

Quantitative traits often underlie risk for complex diseases. Many studies collect multiple correlated quantitative phenotypes and perform univariate analyses on each of them respectively. However, this strategy may not be powerful and has limitations to detect plei- otropic genes that may underlie correlated quantitative traits. In addition, testing multiple traits individually will exacerbate perplexing problem of multiple testing. In this study, generalized estimating equation 2 （GEE2） is applied to association mapping of two correlated quantitative traits. We suppose that a quantitative trait locus is located in a chromosome region that exerts pleiotropic effects on multiple quantitative traits. In that region, multiple SNPs are genotyped. Genotypes of these SNPs and the two quantitative traits affected by a causal SNP were simulated under various parameter values： residual correlation coefficient between two traits, causal SNP heritability, minor allele frequency of the causal SNP, extent of linkage disequilibrium with the causal SNP, and the test sample size. By power ana- lytical analyses, it is showed that the bivariate method is generally more powerful than the univariate method. This method is robust and yields false-positive rates close to the pre-set nominal significance level. Our real data analyses attested to the usefulness of the method.

关键词： general estimating equation bivariate quantitative trait linkage disequilibrium

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Effects of polar cortical cytoskeleton and unbalanced cortical surface tension on intercellular bridge thinning during cytokinesis

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Acta Mechanica Sinica 2011年第6期27卷 1081-1090页

作者： Li Wang Mei-Wen An Xiao-Na Li fang yang yang Liu Institute of Applied Mechanics and Biomedical Engineering Taiyuan University of Technology 030024 Taiyuan China

To probe the contributions of polar cortical cytoskeleton and the surface tension of daughter cells to intercellular bridge thinning dynamics during cytokinesis,we applied cytochalasin D（CD） or colchicine（COLC） in a highly localized manner to polar regions of dividing normal rat kidney（NRK） *** observed cellular morphological changes and analyzed the intercellular bridge thinning trajectories of dividing cells with different polar cortical *** blebbistatin（BS） application was used to obtain cells losing active contractile force *** results show that locally released CD or colchicine at the polar region caused inhibition of cytokinesis before *** treatment at phases after ingression allowed completion of cytokinesis but dramatically influenced the trajectories of intercellular bridge *** single polar cortical actin induced transformation of the intercellular bridge thinning process,and polar cortical tension controlled deformation time of intercellular *** study provides a feasible framework to induce and analyze the effects of local changes in mechanical properties of cellular components on single cellular cytokinesis.

关键词： Cytokinesis Normal rat kidney epithelial cells Intercellular bridge Polar cortical cytoskeleton - Cortical surface tension

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lncRNA MEG3调控AMPK-mTOR自噬通路对H_(2)O_(2)诱导的人卵巢颗粒细胞氧化应激损伤的影响

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中国优生与遗传杂志 2024年第7期32卷 1327-1335页

作者：杨芳陈玉兰邹娅绵阳市中心医院妇产科四川绵阳621000

目的探究lncRNA MEG3对H_(2)O_(2)诱导的人卵巢颗粒细胞氧化应激损伤的影响及潜在机制。方法体外培养人卵巢颗粒细胞KGN,不同浓度H_(2)O_(2)处理诱导细胞氧化应激损伤。将KGN细胞分为对照组、H_(2)O_(2)组、si-NC组、si-lncRNA MEG3组... 详细信息

目的探究lncRNA MEG3对H_(2)O_(2)诱导的人卵巢颗粒细胞氧化应激损伤的影响及潜在机制。方法体外培养人卵巢颗粒细胞KGN,不同浓度H_(2)O_(2)处理诱导细胞氧化应激损伤。将KGN细胞分为对照组、H_(2)O_(2)组、si-NC组、si-lncRNA MEG3组、AMPK激活剂组和si-lncRNA MEG3+AMPK激活剂组,除对照组外,其余组均使用200μmol/L H_(2)O_(2)处理。qRT-PCR测量lncRNAMEG3表达;CCK-8评价细胞活力;流式细胞术分析细胞凋亡;荧光探针DCFH-DA检测细胞内ROS含量;商品化试剂盒检测细胞MDA、SOD、GSH水平;单丹磺酰尸胺(MDC)染色检测细胞自噬;Western blot测定AMPK-mTOR通路和自噬相关蛋白表达。结果 50、100、200、400μmol/L H_(2)O_(2)均可诱导KGN细胞氧化应激损伤和lncRNAMEG3表达水平上调。与对照组比较,H_(2)O_(2)组KGN细胞活力、SOD、GSH水平以及mTOR蛋白磷酸化水平显著降低,lncRNA MEG3表达水平、凋亡率、ROS含量、MDA水平、MDC阳性细胞率、Beclin 1、LC3Ⅱ/Ⅰ蛋白水平以及AMPK蛋白磷酸化水平显著升高(P<0.05)。与si-NC组比较,si-lncRNAMEG3组KGN细胞活力、SOD、GSH水平以及mTOR蛋白磷酸化水平显著升高,lncRNA MEG3表达水平、凋亡率、ROS含量、MDA水平、MDC阳性细胞率、Beclin1、LC3Ⅱ/Ⅰ蛋白水平以及AMPK蛋白磷酸化水平显著降低(P<0.05)。si-lncRNA MEG3+AMPK激活剂组KGN细胞凋亡率、ROS含量、MDA水平、MDC阳性细胞率、Beclin 1、LC3Ⅱ/Ⅰ蛋白水平以及AMPK蛋白磷酸化水平显著高于si-lncRNAMEG3组,而显著低于AMPK激活剂组(P<0.05);细胞活力、SOD、GSH水平以及mTOR蛋白磷酸化水平显著低于si-lncRNAMEG3组,而显著高于AMPK激活剂组(P<0.05)。结论 lncRNA MEG3可能通过调控AMPK-mTOR通路抑制自噬,减轻H_(2)O_(2)诱导的人卵巢颗粒细胞氧化应激损伤。

关键词： lncRNA MEG3 人卵巢颗粒细胞氧化应激损伤 AMPK-mTOR通路自噬

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Non-Uniform APSK Optimization for BICM Systems

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Tsinghua Science and Technology 2015年第2期20卷 175-181页

作者： Keqian Yan Kewu Peng fang yang Jian Song Tsinghua National Laboratory for Information Science and Technology (TNList) Department of Electronic EngineeringTsinghua University

Traditional Amplitude Phase Shift Keying （APSK） consists of rings with points uniformly spaced. By giving up this uniform-spacing feature, we propose an APSK optimization method based on the uniform APSK with Gray labeling （Gray-APSK）. The aim of the optimization is to maximize the Generalized Mutual Information （GMI） of Bit-Interleaved Coded Modulation （BICM） for the targeted code rate and channel. We show that our optimized non-uniform APSK could offer further performance gain compared with the conventional uniform Gray-APSK and considerably outperforms the traditional quadrature amplitude modulation at the targeted SNR and channel.

关键词： Bit-Interleaved Coded Modulation (BICM) non-uniform Amplitude Phase Shift Keying (APSK) mutual information geometrical shaping

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Monitoring impact of mefenacet treatment on soil microbial communities by PCR-DGGE fingerprinting and conventional testing procedures

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Journal of Environmental Sciences 2006年第2期18卷 373-378页

作者： YE yang-fang MIN Hang LU Zhen-mei College of Life Science and Biotechnology Ningbo University Ningbo 315211 China College of Life Science Zhejiang University Hangzhou 310029 China

The effect of acetanilide herbicide mefenacet on soil microbial communities was studied using paddy soil samples with different short-term treatments. The culturable bacteria （plate counts）, dehydrogenase activity and changes in community structure （denaturing gradient gel electrophoresis （DGGE） analysis） were used for biological community assessments. Mefenacet was a significant stimulus to cultural aerobic bacteria and dehydrogenase activity while Sphingobacterium multivorum Y1, a bacterium efficiently degrading the mefenacet, only induced the increasing colony-forming unit （CFU） of bacteria but little effect on dehydrogenase activity during the whole experiment. The degree of similarity between the 16S rDNA profiles of the communities was quantified by numerically analyzing the DGGE band patterns. Similarity dendrograms showed that the microbial community structures of the mefenacet-treated and non-treated soils were not significantly different. But supplement of S. multivorum Y1 could increase the diversity of the microbial community in the mefenacet-polluted paddy soil. This work is a new attempt to apply the S. multivorum Y1 for remediation of the mefenacet-polluted environments.

关键词： denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE) soil microbial diversity mefenacet dehydrogenase

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Cu含量对Ag/LSCO电接触材料物理性能的影响

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贵金属 2024年第1期45卷 15-22页

作者：王大帅曹旭丹杨芳儿郑晓华浙江工业大学材料科学与工程学院杭州310014 浙江大学材料科学与工程学院杭州310027

采用溶胶凝胶法辅以高能球磨工艺合成Cu粉体改性La_(0.5)Sr_(0.5)CoO_(3-δ)(LSCO)粉体,用粉末冶金工艺结合热挤压技术制备了系列Cu改性Ag/LSCO电接触材料与成品丝,研究了Cu粉体对改性Ag/LSCO材料界面润湿性、物理力学性能等影响规律。... 详细信息

采用溶胶凝胶法辅以高能球磨工艺合成Cu粉体改性La_(0.5)Sr_(0.5)CoO_(3-δ)(LSCO)粉体,用粉末冶金工艺结合热挤压技术制备了系列Cu改性Ag/LSCO电接触材料与成品丝,研究了Cu粉体对改性Ag/LSCO材料界面润湿性、物理力学性能等影响规律。结果表明,随着Cu含量的增加,改性Ag/LSCO-xCu(x=0、1、2、4、6、8)电接触材料的电阻率呈先增加后减小的趋势,与Ag和LSCO基底的润湿角变化趋势相一致,但其密度和硬度性能变化趋势相反;当Cu含量为4%时,Ag和LSCO-4Cu基底的润湿角达最小值55.0°,相应的成品丝(φ2.35mm)性能最佳:电阻率2.29μΩ·cm,硬度(HV^(0.3))946.7MPa,密度9.73g/cm^(3),断后延伸率3.9%,为纯Ag/LSCO的3.9倍。

关键词：电接触材料 Ag/LSCO Cu改性物理性能润湿角

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β-葡聚糖的生物学功能及其在动物生产中的应用

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饲料研究 2024年第7期47卷 126-130页

作者：赵若含杨方晓杨敏柏毅承贾俊静豆腾飞云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南农业职业技术学院畜牧兽医学院云南昆明650212 云南西南农牧集团股份有限公司云南昆明650220

葡聚糖是一种天然多糖,可作为绿色添加剂应用于食品和养殖等多个领域,具有可持续性和生态友好性。β-葡聚糖具有多种生物学功能,可抑制和清除体内过量的自由基,激活机体抗氧化酶系统,降低氧化应激的程度;β-葡聚糖可通过调控炎症通路降... 详细信息

葡聚糖是一种天然多糖,可作为绿色添加剂应用于食品和养殖等多个领域,具有可持续性和生态友好性。β-葡聚糖具有多种生物学功能,可抑制和清除体内过量的自由基,激活机体抗氧化酶系统,降低氧化应激的程度;β-葡聚糖可通过调控炎症通路降低炎性因子的产生,缓解炎症引起的组织损伤;β-葡聚糖可修复肠道屏障及调节肠道微生态,减少细菌和毒素的渗透;β-葡聚糖可调节糖脂代谢,确保动物获得足够的能量供应,从而维持机体健康。文章主要围绕β-葡聚糖的特性、生物学功能及其在畜禽和水产养殖中的应用现状进行综述,以期为β-葡聚糖在动物养殖领域中的进一步应用提供参考。

关键词： β-葡聚糖抗氧化免疫调节肠道健康动物生产

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一种减少对威胁情报标注依赖的自动化IOC抽取方法

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四川大学学报（自然科学版） 2024年第4期61卷 14-26页

作者：余坚王俊峰陈熳熳方智阳四川大学计算机学院(软件学院) 成都610065 四川大学网络空间安全学院成都610065

为了应对日益严峻的网络威胁,需要对网络攻击做深入的分析.网络威胁指标(IOC)是网络威胁情报(CTI)的重要组成部分,贯穿了网络攻击整个生命周期,准确描述了每个攻击阶段的关键信息(攻击行为、威胁体等).从CTI中抽取IOC可以帮助进行网络... 详细信息

为了应对日益严峻的网络威胁,需要对网络攻击做深入的分析.网络威胁指标(IOC)是网络威胁情报(CTI)的重要组成部分,贯穿了网络攻击整个生命周期,准确描述了每个攻击阶段的关键信息(攻击行为、威胁体等).从CTI中抽取IOC可以帮助进行网络防御、追踪和对抗.现有的IOC抽取方法基于机器学习或深度学习方法取得了巨大进展,但是需要大量人工标注的CTI进行训练.为了应对这一挑战,本文提出了一种新颖的IOC自动提取方法(L-AIE),仅使用少量标注的CTI就能达到优秀的提取准确率. L-AIE通过细粒度的分词方式以从较少的CTI中获得足够的信息,上下文层和组合层用于充分提取子词级别的上下文信息.在训练阶段,L-AIE利用额外的关系层来扩大IOC类别之间的差异.实验证明,L-AIE对训练数据量的依赖较小,而且提取效果也优于其他对比方法 . L-AIE仅使用其他模型10%的数据训练,就达到了87.54%Macro F1值,比其他方法高出20%.当训练数据量进一步减少时,L-AIE受影响的程度也小于其他模型的一半.

关键词：网络威胁网络威胁情报威胁指标小样本学习

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Internet intelligent remote sensing scientific experimental satellite LuoJia3-01

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Geo-Spatial Information Science 2023年第3期26卷 257-261页

作者： Deren Li Mi Wang fang yang Rongfan Dai State Key Laboratory of Information Engineering in Surveying Mapping and Remote SensingWuhan UniversityWuhanChina School of Cyber Science and Engineering Wuhan UniversityWuhanChina DFH Satellite Co LtdBeijingChina

With the development of new technologies such as 5G/6G,cloud computing,the Internet of Things,and artificial intelligence,humanity has entered the era of the interconnection of *** traditional remote sensing satellite data acquisition,processing,and application models have been unable to meet the popular and real-time application *** order to meet the service needs of the geospatial information industry in the era of the Internet of Things,it has become an inevitable trend to move from isolated remote sensing satellites to space-based information networks.

关键词： Internet artificial service

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122体系铁基超导单晶的制备及其化学掺杂研究进展

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材料研究学报 2024年第5期38卷 321-329页

作者：余启航杨芳刘吉星贺一轩张胜楠闫果张平祥西北工业大学超导材料与应用技术研究院西安710072 西北有色金属研究院西安710016 西安聚能医工科技有限公司西安710028

制备铁基超导体122体系的高质量、大尺寸单晶较为容易,对于研究铁基超导机理有重要的意义。122铁砷超导体母相没有超导性,进行化学掺杂在体系中引入电子、空穴或加化学压力,可诱导出超导性。本文总结了助熔剂法、布里奇曼法和光学浮区... 详细信息

制备铁基超导体122体系的高质量、大尺寸单晶较为容易,对于研究铁基超导机理有重要的意义。122铁砷超导体母相没有超导性,进行化学掺杂在体系中引入电子、空穴或加化学压力,可诱导出超导性。本文总结了助熔剂法、布里奇曼法和光学浮区法等几种122体系铁基超导单晶的制备方法,并介绍了相关方法和研究进展。本文还概述了电子掺杂、空穴掺杂、等价掺杂等几种122铁砷超导体的化学掺杂以及相关研究进展。

关键词：评述铁基超导体单晶制备方法化学掺杂

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