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栽培薯蓣茎段离体再生体系建立

植物学报 2024年

作者：冯雯王玉国复旦大学生命科学学院复旦大学生命科学学院

为建立栽培薯蓣（Dioscorea polystachya）组培再生体系,分别以茎尖及茎尖下不同长度的茎段为外植体,探讨不同浓度植物生长调节剂组合、培养基类型以及不同成熟度茎段对腋芽诱导和植株再生的影响。结果表明,培养基配比为MS+1.0 mg·L-16... 详细信息

为建立栽培薯蓣（Dioscorea polystachya）组培再生体系,分别以茎尖及茎尖下不同长度的茎段为外植体,探讨不同浓度植物生长调节剂组合、培养基类型以及不同成熟度茎段对腋芽诱导和植株再生的影响。结果表明,培养基配比为MS+1.0 mg·L-16-BA+0.5 mg·L-1KT和茎尖下12.2. cm的茎段为栽培薯蓣不定芽诱导的最佳组合,诱导率达到90.0%;继代培养最适培养基配方为MS+0.5 mg·L-16-BA+0.05 mg·L-1NAA+0.1 mg·L-1KT,低浓度NAA固定时,增殖系数在一定范围内随6-BA浓度的升高而增高;在相同外源激素条件下,快繁生根采用DKW培养基明显优于用常规的1/2.S培养基,生根率显著提高,达92.86%。添加1 mg PVP以及增加转接次数均能明显降低褐化率。该研究有效解决了稳定性栽培薯蓣种质资源离体扩繁取材部位优化的问题,为规模化生产栽培薯蓣优质脱毒苗奠定了良好基础。

关键词：栽培薯蓣茎段组织培养离体再生

植物ABA信号转导途径中选择性剪接的研究进展

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植物生理学报 2024年

作者：周哲陈柳彤谢玉婷杜昶华南师范大学生命科学学院华南师范大学生命科学学院

选择性剪接(alternative splicing， AS)是真核细胞中一种重要的转录后调控方式，前体mRNA通过不同的剪接方式产生多样的成熟转录本，翻译成蛋白质，进而调节多种生命活动。脱落酸(abscisic acid， ABA)是一种重要的植物激素，主要参与... 详细信息

选择性剪接(alternative splicing， AS)是真核细胞中一种重要的转录后调控方式，前体mRNA通过不同的剪接方式产生多样的成熟转录本，翻译成蛋白质，进而调节多种生命活动。脱落酸(abscisic acid， ABA)是一种重要的植物激素，主要参与调控种子休眠、根系发育、叶片衰老、器官脱落及对环境胁迫的反应等。之前的研究表明，选择性剪接在ABA信号转导过程中发挥着重要作用。本综述阐明了已鉴定的ABA信号通路中AS的相关剪接因子和ABA反应中经历AS的相关基因及其机制的最新进展，展示了它们如何与ABA敏感性、种子休眠等过程产生联系，对未来的研究方向作出一定预测，以期为植物生产实践中培育抗逆优良性状的作物品种提供一定理论基础。

关键词： ABA 选择性剪接剪接因子可变转录本

基于3DEEM-PARAFAC的菊花特征组分快速无损鉴别

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食品科学 2024年

作者：陈思雨裴颍顾海洋 1.安徽大学生命科学学院 2.滁州学院生物与食品工程学院安徽大学生命科学学院滁州学院生物与食品工程学院

菊花不仅具有很好的观赏价值，而且气味芬芳，属药、茶两用佳品，它含有丰富的化学成分，赋予了菊花独特的香气和药用价值。为提高菊花特征组分的检测效率，提出一种基于三维荧光光谱耦合平行因子算法（3DEEM-PARAFAC）的快速鉴别方法... 详细信息

菊花不仅具有很好的观赏价值，而且气味芬芳，属药、茶两用佳品，它含有丰富的化学成分，赋予了菊花独特的香气和药用价值。为提高菊花特征组分的检测效率，提出一种基于三维荧光光谱耦合平行因子算法（3DEEM-PARAFAC）的快速鉴别方法。以四种菊花为研究对象，在分别获取样品三维荧光光谱矩阵（EEMs）后，首先通过数据预处理去除如拉曼散射和瑞利散射等干扰数据，并剔除异常值，分析光谱特征。然后，采用PARAFAC进行特征提取，通过方差解释率和残差分析法，确定菊花两种特征荧光组分，为氨基酸和黄酮类化合物。最后利用支持向量机（Support Vector Machines，SVM）和BP神经网络（Back Propagation Neural Network，BPNN）对特征变量进行分析，建立菊花快速无损鉴别模型。SVM和BPNN训练集结果分别为（100%，95.93%），测试集结果分别为（94.50%，89.61%）。分析试验结果表明，3DEEM-PARAFAC结合SVC可以实现对菊花特征组分的定性定量分析，能够对菊花进行快速鉴别。研究对菊花的无损分析检测具有一定的意义。

关键词：菊花三维荧光光谱特征组分鉴别平行因子算法支持向量机 BP神经网络

黑水虻成虫触角感器超微结构及其雌雄成虫对气味物质的嗅觉反应

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昆虫学报 2024年 1-10页

作者：王鑫桐周琼田苏周凯灵杨自强 1.湖南师范大学生命科学学院 2.宁乡丰裕生物科技有限公司湖南师范大学生命科学学院宁乡丰裕生物科技有限公司

[目的]明确黑水虻Hermetia illucens成虫触角感器的超微结构,探究其雌雄成虫对气味物质的嗅觉反应。[方法]利用透射电子显微镜观察黑水虻成虫触角感器的超微结构,再分别采用触角电位测量系统和Y型嗅觉仪测试雌雄成虫对异戊酸、乳酸、乙... 详细信息

[目的]明确黑水虻Hermetia illucens成虫触角感器的超微结构,探究其雌雄成虫对气味物质的嗅觉反应。[方法]利用透射电子显微镜观察黑水虻成虫触角感器的超微结构,再分别采用触角电位测量系统和Y型嗅觉仪测试雌雄成虫对异戊酸、乳酸、乙酸乙酯和壬醛4种气味物质的触角电位(electroantennogram,EAG)反应和行为响应。[结果]黑水虻成虫触角上的毛形感器表皮壁厚,壁上无孔,内部淋巴液中有神经树突;腔锥形感器腔内有多分支的锥形突起,锥形突起的表皮壁薄,壁上有微孔,内部淋巴液中有神经树突。E A G测试结果表明,所测试的4种气味物质在各浓度下都能引起雌雄黑水虻成虫明显的EAG反应,不同物质引起的反应随浓度变化呈现不同趋势。其中,雌雄成虫对异戊酸的EAG反应最大,二者的EAG反应相对值均随浓度升高而升高;雌成虫对乳酸的EAG反应随浓度升高先升高后降低,雄成虫的则相反;对于乙酸乙酯和壬醛两种物质的EAG反应,随着测试浓度的升高,黑水虻雌成虫的EAG反应呈现出先降低后升高的趋势,而雄成虫的EAG反应则各不相同且无规律。行为选择实验表明,0.001-0.1μg/μL浓度的乳酸对黑水虻雌成虫有显著的吸引作用,0.1μg/μL的异戊酸对雄成虫有显著的吸引作用。[结论]黑水虻成虫触角鞭节上的毛形感器可能为温湿度感受器,腔锥形感器可能为嗅觉感器。黑水虻雌雄成虫的触角均对高浓度的异戊酸比较敏感;低浓度的乳酸、异戊酸对黑水虻成虫具有一定的引诱作用,有作为引诱剂成分的潜力。

关键词：黑水虻透射电镜嗅觉感器触角电位行为选择嗅觉反应

嗜水气单胞菌噬菌体（Yyong）的分离与基因组分析

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中国生物工程杂志 2024年

作者：陈慧珏刘文才钱敏桦潘灵婷徐锦鹏李登峰童贻刚 1.宁波大学海洋学院 2.北京化工大学生命科学学院宁波大学海洋学院北京化工大学生命科学学院

目的：嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）的致病范围十分广泛，耐药现象日益普遍，危害鱼类、家畜和人类健康。本研究目的在于分离、鉴定烈性A. hydrophila噬菌体。方法：以A. hydrophila Ah2.指示菌，用双层平板法从污水中分离获... 详细信息

目的：嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）的致病范围十分广泛，耐药现象日益普遍，危害鱼类、家畜和人类健康。本研究目的在于分离、鉴定烈性A. hydrophila噬菌体。方法：以A. hydrophila Ah2.指示菌，用双层平板法从污水中分离获得烈性噬菌体Yyong。对其进行了电镜观察、宿主范围检测、一步生长试验、全基因组测序、基因注释和系统进化分析。结果：Yyong呈肌尾病毒样，头部直径为（83±2.nm，尾部长度为（115±5）nm。基因组全长165 663 bp，G+C含量为40.90%，含有16 个tRNA基因和2.2.个开放阅读框（ORF），含有诸多为辅助代谢基因（AMGs），主要涉及DNA合成和抗氧化应激。有两个ORF分别被预测为编码TA（Toxin-Antitoxin）防御系统的毒素（PAAR重复蛋白）和抗毒素DarG，这有利于Yyong在细菌细胞内生存。有三个ORF分别被预测为编码σ因子、抗σ70蛋白和σ70诱饵，这些因子可能修饰RNA聚合酶使之优先识别噬菌体基因的启动子区域。在系统进化树中，与Yyong进化距离最小的病毒是Tulanevirus属的气单胞菌噬菌体。Yyong与它们间分享的最高ANI值和isDDH值分别是94.51%和53.30%，均小于定义一个种的边界值，与它们间分享的最大PASC值和VIRIDIC值，分别是90.51%和90.2.%，均大于属的边界值；Tulanevirus属和Straboviridae科的另一个属Biquartavirus聚成一簇（clade），它们共享的核心基因（core genes）占比为68.53%，符合ICTV关于建立一个亚科的标准（2.%～79%）。结论：Yyong是一个新种，属于Tulanevirus属。我们建议在Straboviridae科下建立一个新的亚科以包含Tulanevirus属和Biquartavirus属。Yyong携带的数量和种类多样的AMGs和tRNA基因，使其有效地控制宿主细菌，高效合成噬菌体自身核酸和蛋白。一些AMGs具有良好的开发潜力。本研究丰富了噬菌体基因数据库与噬菌体分类系统，为噬菌体的功能基因研究和噬菌体研发奠定了基础。

关键词：分离基因组噬菌体嗜水气单胞菌辅助代谢基因新亚科

一组加速白茶寿眉陈化用菌株的筛选及其效果检测

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复旦学报(自然科学版) 2024年

作者：武全刘明秋复旦大学生命科学学院上海工业菌株工程研究中心复旦大学生命科学学院上海工业菌株工程研究中心

白茶是一种微发酵茶,因滋味香甜甘醇、药用价值高而倍受关注,但陈化期长限制了其市场发展。本研究利用从白茶寿眉中分离的10株菌种(W1～W10),对菌种产纤维素酶、淀粉酶、蛋白酶和多酚氧化酶的能力进行测定。纤维素酶活力较高的菌株有W1... 详细信息

白茶是一种微发酵茶,因滋味香甜甘醇、药用价值高而倍受关注,但陈化期长限制了其市场发展。本研究利用从白茶寿眉中分离的10株菌种(W1～W10),对菌种产纤维素酶、淀粉酶、蛋白酶和多酚氧化酶的能力进行测定。纤维素酶活力较高的菌株有W1和W5,其中最高的是W1,达到118.4U/mL。淀粉酶活力较高的菌株有W1、W3和W5,其中最高的是W3,达到2.2..2./mL。蛋白酶活力较高的菌株有W1和W3,其中最高的是W1,达到12..2./mL。多酚氧化酶活力最高的菌株是W8,达到54.0U/mL。因此选择枯草芽孢杆菌(W1)、贝莱斯芽孢杆菌(W3)、解淀粉芽孢杆菌(W5)和嗜盐土地芽孢杆菌(W8)的三种组合形式(W3、W1+W3+W5、W1+W3+W5+W8)应用于未陈化寿眉的发酵,通过感官审评和内含物成分检测以探究菌种发酵效果。结果显示,菌种组合(W1+W3+W5+W8)可以起到加速寿眉陈化的作用,经发酵的未陈化寿眉在感官品质和内含物成分上均接近三年陈寿眉,且总黄酮量提升显著,有较高的药用价值。

关键词：环境微生物寿眉陈化内含物成分总黄酮量

基于视频和BCE-YOLO模型的奶牛采食行为检测研究

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华南农业大学学报 2024年

作者：张立印张姬杨庆璐李玉道于镇伟田富洋于素芳 1.山东农业大学机械与电子工程学院 2.山东农业大学生命科学学院山东农业大学机械与电子工程学院山东农业大学生命科学学院

【目的】动物采食行为是一个重要的动物福利评价指标，本研究旨在解决复杂饲养环境下奶牛采食行为识别精度差、特征提取不充分的问题，实现对奶牛采食行为的自动监控。【方法】本文提出了一种基于改进BCE-YOLO模型的识别方法，该方法通... 详细信息

【目的】动物采食行为是一个重要的动物福利评价指标，本研究旨在解决复杂饲养环境下奶牛采食行为识别精度差、特征提取不充分的问题，实现对奶牛采食行为的自动监控。【方法】本文提出了一种基于改进BCE-YOLO模型的识别方法，该方法通过添加BiFormer、CoT、EMA 3个增强模块，提高YOLOv8模型特征提取的能力，进一步与优于Staple、SiameseRPN算法的Deep SORT算法结合，实现对奶牛采食时头部轨迹的跟踪。在奶牛采食过程的俯视和正视视频中提取102.8张图像，按照6：1比例分为训练集和测试集，构建为采食数据集。【结果】改进的BCE-YOLO模型在前方和上方拍摄的数据集上精确度分别为77.73%、76.32.，召回率分别为82.57%、86.33%，平均精度分别为83.70%、76.81%，相较于YOLOv8模型，模型整体性能提升6～8个百分点，Deep SORT算法相比于Staple、SiameseRPN算法，综合性能提高1～4个百分点，并且改进的BCE-YOLO模型与Deep SORT目标跟踪算法结合良好，能对奶牛采食行为进行准确跟踪且有效抑制奶牛ID（Identity document）的变更。【结论】本文提出的方法能有效解决复杂饲养环境下奶牛采食行为识别精度差、特征提取不充分的问题，为实现智能畜牧与精确养殖提供重要参考。

关键词：奶牛采食行为识别优化YOLOv8模型 Deep SORT

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白喉噪鹛的繁殖生态

四川动物 2024年

作者：范彪张袁李鹏映陈静付义强王琼 1.四川师范大学生命科学学院 2.云南乌蒙山国家级自然保护区管护局四川师范大学生命科学学院云南乌蒙山国家级自然保护区管护局

白喉噪鹛Pterorhinus albogularis是一种典型的森林鸟类，迄今该鸟类的基础生态学资料十分匮乏。2.2.—2.2.年繁殖季（4—9月），在云南乌蒙山国家级自然保护区小岩方片区内，对白喉噪鹛的繁殖生态进行了初步研究。共记录2.群89只次白... 详细信息

白喉噪鹛Pterorhinus albogularis是一种典型的森林鸟类，迄今该鸟类的基础生态学资料十分匮乏。2.2.—2.2.年繁殖季（4—9月），在云南乌蒙山国家级自然保护区小岩方片区内，对白喉噪鹛的繁殖生态进行了初步研究。共记录2.群89只次白喉噪鹛，区域种群密度为（2..3±12.2.只/km2.发现的4个白喉噪鹛巢均在筇竹Qiongzhuea tumidinoda上。巢呈杯状，隐蔽度高。4个巢的窝卵数均为3枚，卵呈暗蓝色。白喉噪鹛具有合作繁殖行为。该鸟类喜好在乔木数量多、乔木高大、乔木盖度高和植被总盖度大的栖息地活动。逻辑斯蒂回归分析表明：乔木因子和植被总盖度是影响白喉噪鹛活动区选择的关键生态因子。本研究结果丰富了白喉噪鹛的生态生物学资料。

关键词：白喉噪鹛繁殖生态活动区选择合作繁殖

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虾源肌球蛋白抗原表位的计算机辅助计算

吉林大学学报(理学版) 2024年

作者：时月明张哲刘剑兰刘明皓 1.中国医科大学附属第四医院 2.中国医科大学医学人文学院 3.吉林大学生命科学学院中国医科大学附属第四医院中国医科大学医学人文学院吉林大学生命科学学院

运用在线软件和线下软件对来源于刀额新对虾（Metapenaeus ensis）的过敏原Met e1的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位进行预测与筛选.通过uniprot蛋白数据库获取Met e1蛋白质氨基酸序列，然后用ExPASY ProtParam、SignalP-5.0 Server和TMHM... 详细信息

运用在线软件和线下软件对来源于刀额新对虾（Metapenaeus ensis）的过敏原Met e1的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位进行预测与筛选.通过uniprot蛋白数据库获取Met e1蛋白质氨基酸序列，然后用ExPASY ProtParam、SignalP-5.0 Server和TMHMM Server v. 2.0 在线工具对Met e1的理化性质、信号肽与跨膜区域进行分析.用PSIPRED在线工具、SOPMA在线工具和DNAstar软件联合预测Met e1二级结构，用Swiss model 在线软件预测Met e1三级结构.用DNAStar线下软件和IEDB在线软件综合预测线性B细胞表位，用IEDB在线软件预测CD8+T 细胞表位和CD8+T 细胞表位.最后将所得结果进行B细胞表位和T细胞表位的筛选.结果表明，Met e1蛋白的B细胞表位为7～15，56～61，76～84，151～159，179～183，2.3～2.8，2.3～2.9，2.1～2.6，2.6～2.4，2.6～2.8位氨基酸，T细胞表位为78～84，2.3～2.2.氨基酸.

关键词： Met e1蛋白质 B细胞表位 T细胞表位抗原表位筛选