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基于空间转录组学数据的空间域识别算法综述

作     者:冯振兴 尚文婧 司佳宝 孔令娇 龙春伸 左永春 

作者机构:内蒙古工业大学理学院 内蒙古大学生命科学学院 

出 版 物:《内蒙古大学学报(自然科学版)》 (Journal of Inner Mongolia University(Natural Science Edition))

年 卷 期:2024年

学科分类:0831[工学-生物医学工程(可授工学、理学、医学学位)] 0711[理学-系统科学] 07[理学] 08[工学] 

基  金:自治区高校基本科研业务费项目(RZ2300001661) 自治区级大学生创新创业训练计划项目(SA2300002753) 

主  题:空间转录组学 识别空间域 聚类 

摘      要:空间转录组学数据在保留空间信息的同时,提供了全面的基因表达谱。开发计算方法整合数据中的多模态信息识别组织内复杂的层次结构,并进一步解析相关生物学过程的动态和机制是该领域的关键任务。该综述细致地总结了相关算法的计算原理、常用数据和评价准则,突出了不同算法的优势、局限性及适用范围。这些发现不仅为新算法的开发提供了理论基础和较全面的方法学视角,还指明了算法改进的方向。

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