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深度学习与分子模拟相结合：高效筛选宏基因组数据中的抗菌肽

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食品科学技术学报 2024年

作者：田源韩爱萍徐春明北京工商大学轻工科学技术学院

抗菌肽是一种可以通过与细菌细胞膜或细胞内生物分子相互作用，破坏细菌生理过程，最终导致细菌死亡，发挥抗菌功能的一种多肽。鉴于食品安全和质量正在面临的挑战，开发新型食品抗菌剂以提高食品安全性，已成为当前食品科学研究的关键... 详细信息

抗菌肽是一种可以通过与细菌细胞膜或细胞内生物分子相互作用，破坏细菌生理过程，最终导致细菌死亡，发挥抗菌功能的一种多肽。鉴于食品安全和质量正在面临的挑战，开发新型食品抗菌剂以提高食品安全性，已成为当前食品科学研究的关键方向。通过构建全新的深度学习模型，从土壤宏基因组数据中筛选抗菌肽，并使用分子对接和分子动力学模拟等技术对筛选出的肽进行验证。模型的精准度为98.7%、准确率为96.5%、召回率为91.9%、F1-score为95.2%、特异性为99.2%，该模型展现了出色的性能和强大的泛化能力，同时在效率、可解释性和实际应用价值方面也体现了显著的优势。经过训练后，模型成功地识别出了若干极具抗菌潜力的短肽，并选择了部分样本进一步研究。结果表明，筛选出的短肽Gly-Thr-Ala-Trp-Arg-Trp-His-Tyr-Arg-Ala-Arg-Ser能有效地附着在细菌的转录调节因子MrkH蛋白上，对肺炎克雷伯氏菌、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌产生抑菌作用。研究旨在结合深度学习与分子模拟技术等技术，为开发食品行业中新型抗菌剂的应用提供一定的理论依据。

关键词：机器学习分子对接分子动力学模拟抗菌肽抗菌活性验证

考虑多模态数据的重载货车危险驾驶行为识别方法

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交通运输系统工程与信息 2024年第2期24卷 63-75页

作者：吴建清张子毅王钰博张昱田源山东大学齐鲁交通学院济南250061 山东大学苏州研究院江苏苏州215123 济南城建集团有限公司济南250031 山东省交通科学研究院济南250012

综合考虑货车操纵数据、驾驶员眼动数据和心电数据,本文提出一种多模态的重载货车危险驾驶指标构建和行为识别方法。首先,设计自然驾驶实验,利用车辆惯导、眼动仪及心理数据记录仪这3种设备采集车辆运行、眼动及心电等多模态驾驶数据,... 详细信息

综合考虑货车操纵数据、驾驶员眼动数据和心电数据,本文提出一种多模态的重载货车危险驾驶指标构建和行为识别方法。首先,设计自然驾驶实验,利用车辆惯导、眼动仪及心理数据记录仪这3种设备采集车辆运行、眼动及心电等多模态驾驶数据,通过多设备时间同步及数据清洗,构建多模态驾驶数据集。其次,将重载货车危险驾驶行为分为危险驾驶操纵行为和疲劳驾驶行为两类,通过提取数据特征,构建9种危险驾驶行为指标,表征超速、速度不稳、急变速、急换道及疲劳驾驶这5种危险驾驶行为。针对危险驾驶操纵行为,组合文献调研、指标计算及四分位差法确定危险行为特征参数阈值;针对疲劳驾驶行为,通过因子分析和K均值聚类法划分疲劳驾驶类型。最后,构建重载货车危险驾驶行为数据集,采用随机森林分类模型识别危险驾驶行为,并与BP神经网络、K近邻及支持向量机等分类模型对比。结果表明,随机森林模型对于5种危险驾驶行为的分类准确率均在90%以上,整体优于其他分类算法,能够较高精度地识别驾驶中出现的危险驾驶行为。本文的多模态重载货车危险驾驶指标构建和分类方法能够用于危险驾驶行为识别,为驾驶员多模态危险驾驶行为预警提供思路和理论依据。

关键词：交通工程驾驶行为识别阈值量化重载货车随机森林

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基于合作捕猎和恐惧效应的捕食-食饵模型定性分析与反馈控制

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应用数学 2024年第3期37卷 840-846页

作者：田源闫鑫蕊刘艺大连海事大学理学院辽宁大连116026

在自然界中,种群与种群之间的关系错综复杂.捕食者之间的合作捕猎行为以及食饵对捕食者的恐惧会对种群间的动力学行为带来一定的影响,为此本文研究一类具有合作捕猎和恐惧效应的捕食-食饵模型.首先,建立具有Smith型增长率和恐惧效应以... 详细信息

在自然界中,种群与种群之间的关系错综复杂.捕食者之间的合作捕猎行为以及食饵对捕食者的恐惧会对种群间的动力学行为带来一定的影响,为此本文研究一类具有合作捕猎和恐惧效应的捕食-食饵模型.首先,建立具有Smith型增长率和恐惧效应以及捕食者合作捕猎的捕食-食饵模型,分析该模型解的存在性与一致有界性,并给出平衡点存在和稳定的条件;其次,通过对捕食者进行控制,建立基于反馈控制的捕食-食饵模型,讨论阶-1周期解的存在性和稳定性;最后,借助于MATLAB进行数值模拟,对以上理论结果进行验证和说明.

关键词：反馈控制合作捕猎恐惧效应阶-1周期解稳定性

安氏Ⅱ类错颌畸形正颌术后复发情况及影响因素研究进展

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空军军医大学学报 2022年第3期43卷 371-375页

作者：党禄赵华强齐田源荀文兴李金清李学拥空军军医大学唐都医院烧伤整形科陕西西安710038 空军军医大学唐都医院口腔科陕西西安710038

正颌手术能够快速有效地矫治安氏Ⅱ类错颌畸形,术后复发是影响患者面型和咬合功能的重要因素之一。安氏Ⅱ类错颌畸形正颌术后复发比例较高,影响因素较多,包括上下颌骨手术中位移量、髁突重塑、特发性髁突吸收、肌肉的持续牵拉、内固定... 详细信息

正颌手术能够快速有效地矫治安氏Ⅱ类错颌畸形,术后复发是影响患者面型和咬合功能的重要因素之一。安氏Ⅱ类错颌畸形正颌术后复发比例较高,影响因素较多,包括上下颌骨手术中位移量、髁突重塑、特发性髁突吸收、肌肉的持续牵拉、内固定的选择、患者自身情况、术后正畸、咬合平衡的重建与手术技巧等,且各因素之间有交互作用。通过文献复习和总结,本文拟对安氏Ⅱ类错颌畸形正颌术后复发情况和影响因素作一综述,以期对预防术后复发提供依据。

关键词：安氏Ⅱ类错颌畸形正颌外科手术骨性复发复发因素

GDF11调控NF-κB通路影响巨噬细胞M1极化介导的炎症反应

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中国医科大学学报 2024年第4期53卷 342-348,354页

作者：肖雯田源蒋宇陈芳湖南师范大学附属第一医院湖南省人民医院湖南省急救医学研究所长沙410002 湖南师范大学生命科学学院生理学系长沙410081 湖南中医药大学临床医学院内科教研室长沙410007

目的探讨生长转化因子11(GDF11)对巨噬细胞M1极化介导的炎症反应的影响及其作用机制。方法体外培养RAW264.7巨噬细胞,100 ng/mL LPS+30 ng/mL IFN-γ诱导巨噬细胞M1极化,并将细胞分成对照组、LPS+IFN组、GDF11组及LPS+IFN+GDF11组。流... 详细信息

目的探讨生长转化因子11(GDF11)对巨噬细胞M1极化介导的炎症反应的影响及其作用机制。方法体外培养RAW264.7巨噬细胞,100 ng/mL LPS+30 ng/mL IFN-γ诱导巨噬细胞M1极化,并将细胞分成对照组、LPS+IFN组、GDF11组及LPS+IFN+GDF11组。流式细胞术检测巨噬细胞的极化,实时PCR检测IL-6、TNF-α、NF-κB及GDF11 mRNA的表达水平,Western blotting检测细胞GDF11、NF-κB及P-NF-κB蛋白表达水平,免疫荧光检测细胞GDF11、NF-κB的蛋白表达和分布。结果与对照组相比,LPS+IFN组巨噬细胞M1极化比例增加,IL-6、TNF-α及NF-κB mRNA表达升高,GDF11 mRNA及蛋白表达降低,NF-κB、P-NF-κB蛋白表达升高,P-NF-κB/NF-κB比值升高,NF-κB入核明显(P0.05);与LPS+IFN组相比,LPS+IFN+GDF11组RAW264.7巨噬细胞M1极化比例显著降低,IL-6、TNF-α、NF-κB mRNA表达降低,NF-κB、P-NF-κB蛋白表达降低,P-NF-κB/NF-κB比值降低(P<0.05)。结论GDF11可减轻巨噬细胞M1极化介导的炎症反应,其机制可能与调节NF-κB通路有关。

关键词：巨噬细胞极化脓毒症生长转化因子11

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温暖现实主义的时代镜像:《狂飙》的审美意蕴建构

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美与时代（美学）（下） 2024年第3期 133-135页

作者：田源安徽师范大学新闻与传播学院

中国的影视创作在漫长的发展过程中与现实主义密切相关,它们如实记录、深刻再现不同时代的社会风貌,折射出不同历史时期人民群众的不同审美需求。时下《狂飙》作为2023年爆款电视剧,秉持温暖现实主义的创作意图,在创作理念上坚持人民美... 详细信息

中国的影视创作在漫长的发展过程中与现实主义密切相关,它们如实记录、深刻再现不同时代的社会风貌,折射出不同历史时期人民群众的不同审美需求。时下《狂飙》作为2023年爆款电视剧,秉持温暖现实主义的创作意图,在创作理念上坚持人民美学,对英雄“祛魅”、以家庭叙事丰盈反面人物设定、以局部轻松诙谐幽默的方式铺设轻松的创作基调;在创作主旨上,温暖现实主义是“温暖的关怀”,通过对时代背景的真实还原,彰显以人民为中心的主流价值观。

关键词：温暖现实主义人民美学时代镜像

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坑式钢管静压桩在地基加固中的应用

砖瓦 2024年第5期 143-145页

作者：田源甘肃省建筑科学研究院(集团)有限公司甘肃兰州730070

为解决建筑地基承载力不足及基础下沉问题,以甘肃省劳改局家属住宅楼为研究对象,提出一种新型钢管静压桩地基加固技术,详细分析了该加固方法的施工工艺,并基于现场监测技术对加固后的基础沉降进行监测,验证加固效果。结果表明,提出的新... 详细信息

为解决建筑地基承载力不足及基础下沉问题,以甘肃省劳改局家属住宅楼为研究对象,提出一种新型钢管静压桩地基加固技术,详细分析了该加固方法的施工工艺,并基于现场监测技术对加固后的基础沉降进行监测,验证加固效果。结果表明,提出的新型坑式钢管静压桩托换装置具有结构简洁、安装简单、成本较低、拆卸后可重复使用的优点;在加固前,建筑基础的变形沉降呈现非线性增加的趋势,在加固施工阶段,由于受到施工扰动作用,基础的沉降变形量出现一定的波动;在加固后,建筑的沉降量呈现不断收敛的趋势,收敛值约为97mm,坑式钢管静压桩取得了良好的加固效果。

关键词：坑式钢管静压桩地基加固建筑工程沉降监测

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蒲公英（外一首）

三角洲 2024年第9期 55-56页

作者：田源

关键词：

来源：博看期刊

助力非遗生产性保护打造非遗经济产业--第五届中国非遗博览会创新与特色研究

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产业与科技论坛 2024年第12期23卷 23-25页

作者：田源山东工艺美术学院

非物质文化遗产是中华优秀传统文化的重要组成部分,是各族人民在生产生活实践中创造的精神财富,是维系民族情感的精神纽带和重要桥梁。进入21世纪以来,非物质文化遗产保护工作取得显著成绩,以非物质文化遗产为代表的中华优秀传统文化得... 详细信息

非物质文化遗产是中华优秀传统文化的重要组成部分,是各族人民在生产生活实践中创造的精神财富,是维系民族情感的精神纽带和重要桥梁。进入21世纪以来,非物质文化遗产保护工作取得显著成绩,以非物质文化遗产为代表的中华优秀传统文化得以传承与发展。中国非物质文化遗产博览会是全国影响广、规模大、规格高的国家级非物质文化遗产博览会,第五届实现了从组织机制、内容策划到展览形式的全方位创新,对促进非物质文化遗产保护与传承创新发展意义重大。本文对第五届中国非遗博览会的创新与特色进行分析总结,探讨非遗博览会在促进非遗传承发展、促进地方经济文化繁荣、带动活态非遗经济发展方面的经验与路径。

关键词：非物质文化遗产博览会非遗经济生产性保护