检索结果-南通市图书馆

13株狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与遗传演化分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

13株狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与遗传演化分析

作者：齐瑛琳吉林大学

学位级别：硕士

狂犬病是一种重要的人兽共患传染病，由狂犬病病毒（Rabies virus，RV或RABV）引起，几乎感染所有温血动物和人，发病后死亡率近100%。我国年报告狂犬病发病死亡人数仅次于印度，位居世界第二，严重威胁公民的生命安全，也给人民群众带... 详细信息

狂犬病是一种重要的人兽共患传染病，由狂犬病病毒（Rabies virus，RV或RABV）引起，几乎感染所有温血动物和人，发病后死亡率近100%。我国年报告狂犬病发病死亡人数仅次于印度，位居世界第二，严重威胁公民的生命安全，也给人民群众带来了极为沉重的心理上和经济上的负担。RABV宿主动物众多，使得病毒可在不同的宿主间转化，各种带毒动物又可导致RABV在不同地域间迁移。RABV分子流行病学是应用RT-PCR技术测定不同毒株的基因组序列，借助各种生物信息学软件进行比较和分析，从分子水平上研究RABV基因的变异与病毒毒力、抗原性、宿主特异性等之间的关系，进而确定毒株来源以及相互间的进化历程，系统掌握病毒种系发生及其变异规律，为制定正确的狂犬病防治策略、选择合适的动物及人用疫苗株提供理论基础。本实验的研究对象为13株RABV街毒株，主要内容如下： 1、狂犬病病毒街毒株的分离鉴定乳鼠脑内接种分离法及鼠成神经瘤细胞分离法对13种狂犬病阳性病料进行RABV的分离。使用直接免疫荧光技术及RT-PCR技术对接种后的脑组织及细胞进行鉴定。检测结果表明，本实验分离出13株RABV街毒株。 2、狂犬病病毒街毒株全基因测序与比较分析设计RABV全基因组分段PCR扩增引物，对PCR产物进行克隆并测序，利用DNAStar和Clustalx等生物信息学软件进行序列拼接与编辑，分析全基因组的结构和组成，并对5个结构基因进行多重序列比对及同源性分析。测序获得13株RABV街毒株的全基因组核苷酸序列，基因组全长11921-11924nts，5个结构基因的ORF，长度分别为N基因1575nts、P基因894nts、M基因609nts、G基因1575nts、L基因6386nts，N-P-M-G-L间隔区序列长度分别为2nts、5nts、5nts、422nts，Leader结构和Trailer结构分别长50nts和70nts。本研究发现13株RABV街毒株其全基因组序列在结构及组成上均符合弹状病毒科狂犬病病毒属的特征，结构基因编码蛋白质氨基酸序列的同源性均高于核苷酸序列的同源性，GXQZD01、GDMMD57和HuNPB3这3株病毒间各结构基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性较高，与其他10株病毒间则表现出相对较低的同源性，而这10株病毒相互间同源性较高。5个结构基因推导的氨基酸长度未变，在氨基酸序列上均在一定的变异，但结构蛋白的保守区和主要功能位点均未发生突变。 3、狂犬病病毒街毒株的遗传进化分析利用MEGA等生物信息学软件对本研究中的13株RABV街毒株的结构基因及全基因组绘制遗传进化树，进行种系发生分析。结果显示，13株病毒均属于基因1型，与国外RABV的进化距离较远，具有较为独特的中国地域特点，因此本研究中13株病毒很有可能是存在于自然界中的固有街毒株。N基因进化树与全基因进化树基本上保持一致，基于其他不同基因构建的进化树大体相同。13株病毒中CDMMD57、GXQZD01和HuNPB3间亲缘关系较近，与国内鼬獾分离株共同处于较为独立的进化分支上，与泰国等地的人源街毒株进化距离较近。其他10株病毒间显示出较近的亲缘关系，与国内一些犬源RABV街毒株共处于相同的进化分支。

关键词：狂犬病病毒街毒株全基因组遗传进化分析

蓝舌病病毒血清20型在我国的分离鉴定及基因组遗传进化分析

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

蓝舌病病毒血清20型在我国的分离鉴定及基因组遗传进化分析

中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第九次全国会员代表大会...

作者：齐瑛琳王芳于力中国农业科学院哈尔滨兽医研究所

引言蓝舌病(BT)是由蓝舌病病毒(BTV)引起、经库蠓等媒介昆虫传播的反刍动物传染病,临床上以黏膜水肿、糜烂、出血为主要特征,死亡率可达30%,每年给全世界造成严重的经济损失[1]。BT于1876年首次发现于南非,随后,中东、美国、亚洲、欧洲...

引言蓝舌病(BT)是由蓝舌病病毒(BTV)引起、经库蠓等媒介昆虫传播的反刍动物传染病,临床上以黏膜水肿、糜烂、出血为主要特征,死亡率可达30%,每年给全世界造成严重的经济损失[1]。BT于1876年首次发现于南非,随后,中东、美国、亚洲、欧洲等地相继出现[2]。2006-2008年,B TV-8在欧洲多地爆发流行,死亡率高达50%,给畜牧业带来前所未有的巨大损失[3]。我国1979年

关键词：

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

反向遗传学技术在狂犬病病毒研究中的应用

中国病原生物学杂志 2010年第11期5卷 865-868页

作者：齐瑛琳杨松涛金宏丽赵丽丽冯娜夏咸柱吉林大学农学部畜牧兽医学院吉林长春130062 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所

狂犬病是一种重要的人兽共患病,病死率几乎达100%,是全球性的重要公共卫生问题。近年来,尽管对狂犬病的防控取得了很大进展,但狂犬病病毒致病机理的研究仍有待深化。反向遗传学是一门新兴学科,近年来已广泛应用于狂犬病病毒研究中的各... 详细信息

狂犬病是一种重要的人兽共患病,病死率几乎达100%,是全球性的重要公共卫生问题。近年来,尽管对狂犬病的防控取得了很大进展,但狂犬病病毒致病机理的研究仍有待深化。反向遗传学是一门新兴学科,近年来已广泛应用于狂犬病病毒研究中的各个领域。本文着重介绍反向遗传学技术在狂犬病病毒基因结构、致病机理、新型载体和疫苗研发中的应用,并对其未来发展方向进行了展望。

关键词：狂犬病病毒反向遗传学技术综述

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

狂犬病病毒样颗粒的构建及其免疫原性研究

狂犬病病毒样颗粒的构建及其免疫原性研究

小胶质细胞在病毒性中枢神经系统感染中的作用

第八届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会

作者：康洪涛齐瑛琳杨松涛夏咸柱中国农业科学院哈尔滨兽医研究所军事医学科学院军事兽医研究所

引言狂犬病是由狂犬病病毒(rabies virus,RABV)感染所致的人兽共患传染病,病死率近乎100%,在众多发展中国家其危害仍然十分严重。疫苗免疫是预防和控制狂犬病最为可靠的方法,研发一种安全有效的新型狂犬病疫苗是极为重要的。病毒样颗粒(...

引言狂犬病是由狂犬病病毒(rabies virus,RABV)感染所致的人兽共患传染病,病死率近乎100%,在众多发展中国家其危害仍然十分严重。疫苗免疫是预防和控制狂犬病最为可靠的方法,研发一种安全有效的新型狂犬病疫苗是极为重要的。病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)是由一个或若干个病毒结构蛋白通过自组装的形式形成的,在形态上类似于天然病毒粒子结构的一种颗粒。这些VLPs具有良好的免疫原性,且安全性高,已被证实可作为疫苗抵抗多种病毒的感染。材料与方法

关键词：

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

中国病原生物学杂志 2012年第1期7卷 66-69页

作者：赵丽丽赵平森齐瑛琳梁红茹金宏丽梁萌王化磊杨松涛夏咸柱吉林大学农学部畜牧兽医学院吉林长春130062 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所吉林省人兽共患病预防与控制重点实验室吉林长春130062 中国医学科学院北京协和医学院医学实验动物研究所北京100021

小胶质细胞是中枢神经系统中的免疫细胞,是中枢神经系统抵抗病原体入侵的第一道防线。当病原微生物进入脑组织后,小胶质细胞迅速做出反应,识别、吞噬病原微生物,呈递抗原和分泌多种生物活性物质。但是,小胶质细胞的过度活化又可诱发中... 详细信息

小胶质细胞是中枢神经系统中的免疫细胞,是中枢神经系统抵抗病原体入侵的第一道防线。当病原微生物进入脑组织后,小胶质细胞迅速做出反应,识别、吞噬病原微生物,呈递抗原和分泌多种生物活性物质。但是,小胶质细胞的过度活化又可诱发中枢神经系统免疫病理损伤或神经退行性病变。因而,具有生理和病理双重作用。本文就小胶质细胞在病毒感染性中枢神经系统疾病中的作用及其机制进行综述。

关键词：小胶质细胞中枢神经系统病毒感染性疾病炎症反应综述

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

狂犬病病毒感染免疫反应研究进展

中国病原生物学杂志 2011年第8期6卷 614-617页

作者：金宏丽王化磊齐瑛琳赵平森赵丽丽梁萌杨松涛夏咸柱吉林大学畜牧兽医学院吉林长春130062 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所吉林长春130122 北京协和医学院医学实验动物研究所北京100021

狂犬病病毒感染机体后可引起严重的脑炎,病死率几乎为100%。暴露前预防免疫和及时的暴露后免疫可有效阻止脑炎的发生,一旦出现狂犬病临床症状后,几乎所有的治疗方法均无效。病毒感染机体后,激发机体产生先天性和获得性免疫应答,而在病... 详细信息

狂犬病病毒感染机体后可引起严重的脑炎,病死率几乎为100%。暴露前预防免疫和及时的暴露后免疫可有效阻止脑炎的发生,一旦出现狂犬病临床症状后,几乎所有的治疗方法均无效。病毒感染机体后,激发机体产生先天性和获得性免疫应答,而在病毒进入中枢神经系统前,机体产生的免疫应答不足可能是免疫保护失败的原因之一。本文综述了机体对狂犬病病毒感染与疫苗免疫产生的免疫反应。

关键词：狂犬病病毒免疫反应免疫抑制综述

两株犬源狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国病原生物学杂志 2011年第7期6卷 481-485,489,F0003页

作者：齐瑛琳金宏丽赵丽丽王化磊赵平森付玉涂长春杨松涛夏咸柱吉林大学农学部畜牧兽医学院吉林长春130062 军事医学科学院军事兽医研究所吉林长春130122 中国医学科学院医学实验动物研究所北京100021

目的对2株犬源狂犬病病毒街毒株全基因组测序,了解国内狂犬病病毒的流行和变异情况。方法采用乳鼠脑内接种方法分离2株天津地区狂犬病病毒街毒株,RT-PCR扩增病毒DNA覆盖全基因组12个相互重叠的基因片段,PCR产物平端克隆后进行全基因组... 详细信息

目的对2株犬源狂犬病病毒街毒株全基因组测序,了解国内狂犬病病毒的流行和变异情况。方法采用乳鼠脑内接种方法分离2株天津地区狂犬病病毒街毒株,RT-PCR扩增病毒DNA覆盖全基因组12个相互重叠的基因片段,PCR产物平端克隆后进行全基因组核苷酸序列测定,然后对其分子变异和进化特点进行分析。进行两分离株的序列相似性、氨基酸同源性、主要功能位点的变异比较和种系发生分析。结果 TJD04和TJD05两株狂犬病病毒全基因组长均为11 924 nts,全基因组序列的组成和结构均符合弹状病毒科狂犬病病毒属的特征。病毒基因组由5个编码区组成,基因起始位点和终止位点高度保守,氨基酸编码长度未发生变异,5个编码蛋白序列较少发生变化,仅有个别主要功能位点发生变异,且大部分变异均属于无意义沉默突变。多序列相似性比较和种系发生分析显示,两株病毒均属于基因1型,N基因与全基因进化树保持一致,与中国犬源狂犬病病毒BD06同源性最高(99.6%),进化关系近,并具有较为独特的中国地域特点。结论两天津株狂犬病毒可能是自然界中固有的狂犬病病毒街毒株。

关键词：狂犬病病毒街毒株全基因组序列分析

3株我国狂犬病病毒街毒株在细胞和乳鼠脑内的培养及生长特性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国生物制品学杂志 2014年第5期27卷 612-616页

作者：李露王化磊赵国星齐瑛琳郑学星冯娜赵永坤王铁成李忠义高玉伟冯烨杨松涛夏咸柱吉林大学动物医学学院吉林长春130062 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所吉林省人兽共患病预防与控制重点实验室吉林长春130122

目的比较3株来自我国不同地区的狂犬病病毒街毒株在细胞和乳鼠脑内的生长特性,为建立狂犬病病毒感染模型奠定基础。方法分别通过乳鼠脑内接种和细胞培养法进行连续传代,测定不同代次SXYQ、YN01和GDMMD57株狂犬病病毒街毒株的病毒滴度,... 详细信息

目的比较3株来自我国不同地区的狂犬病病毒街毒株在细胞和乳鼠脑内的生长特性,为建立狂犬病病毒感染模型奠定基础。方法分别通过乳鼠脑内接种和细胞培养法进行连续传代,测定不同代次SXYQ、YN01和GDMMD57株狂犬病病毒街毒株的病毒滴度,计算半数细胞感染量(TCID50)。结果 SXYQ、YN01和GDMMD57株病毒乳鼠脑内接种传代至10代,病毒滴度随传代次数的增加,呈上升趋势,至第8代后,病毒滴度趋于稳定,分别为105.85、105.63和105.97 TCID50/g,不同毒株间病毒滴度存在差异。SXYQ、YN01和GDMMD57株病毒接种N2a细胞后,随着传代次数的增加,病毒对细胞的适应性不断增强,病毒滴度呈上升趋势,至第15代后,病毒滴度趋于稳定,不同毒株间病毒滴度存在差异;第20代SXYQ株病毒的滴度在感染后2.5 d达到峰值(106.80 TCID50/ml),YN01和GDMMD57株病毒滴度在感染后3 d达到峰值(均为107.30 TCID50/ml)。结论 3株病毒在细胞和乳鼠脑内经连续传代后均能达到较高滴度,可用于狂犬病病毒感染模型的建立及新型疫苗的研究。

关键词：狂犬病病毒街毒株细胞培养生长特性

我国2株野生动物源细小病毒VP2和NS1基因序列及所编码蛋白的分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国兽医学报 2013年第3期33卷 345-351页

作者：梁萌王化磊冯昊金宏丽胡桂秋郭鹤齐瑛琳冯娜郑学星张仁舟赵永坤高玉伟杨松涛夏咸柱吉林大学动物医学学院吉林长春130062 军事医学科学院军事兽医研究所吉林长春130122 吉林农业大学吉林长春130062

为了解我国野生动物源细小病毒VP2、NS1基因序列和进化特点,用PCR方法获得貉源细小病毒CR86106和猴源细小病毒BJ-22的目的基因片段,对其核苷酸和氨基酸序列进行测定分析。结果显示CR86106和BJ-22细小病毒基因组长均为4 269nt,其中NS1基... 详细信息

为了解我国野生动物源细小病毒VP2、NS1基因序列和进化特点,用PCR方法获得貉源细小病毒CR86106和猴源细小病毒BJ-22的目的基因片段,对其核苷酸和氨基酸序列进行测定分析。结果显示CR86106和BJ-22细小病毒基因组长均为4 269nt,其中NS1基因全长2 007nt,共编码668个氨基酸;VP2基因全长1 755nt,共编码584个氨基酸。CR86106VP2蛋白除第300位氨基酸为脯氨酸(P)以外,其余关键氨基酸位点均与猫泛白细胞减少症病毒(feline panleukopenia virus,FPLV)一致;BJ-22VP2蛋白除第323位为天冬酰胺(N)、第564位为丝氨酸(S)以外,其余关键氨基酸位点均与FPLV一致。CR86106NS1蛋白氨基酸序列与细小病毒参考毒株的相似性是98.4%～99.3%,VP2是97.6%～99.7%;BJ-22NS1蛋白氨基酸序列与细小病毒参考毒株的相似性是98.5%～99.4%,VP2是98.1%～99.3%。种系发生分析结果显示,CR86106VP2和NS1与FPLV亲缘关系较近;BJ-22NS1归到CPV分支,VP2归到FPLV分支且单独分在一支。结果表明,CR86106具有FPLV样细小病毒序列特征,BJ-22具有FPLV和CPV重组病毒特征,为猴源细小病毒的重组现象,研究结果同时也证实了基因重组在FPLV进化过程中起重要作用的推论。

关键词：细小病毒 NS1基因 VP2基因测序分析