两株犬源狂犬病病毒街毒株全基因组序列测定与分析

作     者：齐瑛琳 金宏丽 赵丽丽 王化磊 赵平森 付玉 涂长春 杨松涛 夏咸柱 

作者机构：吉林大学农学部畜牧兽医学院吉林长春130062 军事医学科学院军事兽医研究所吉林长春130122 中国医学科学院医学实验动物研究所北京100021 

出 版 物：《中国病原生物学杂志》 (Journal of Pathogen Biology)

年 卷 期：2011年第6卷第7期

页      面：481-485,489,F0003页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(No.2011CB504706) 国家科技重大项目(No.2009ZX10602-14) 

主　　题：狂犬病病毒 街毒株 全基因组 序列分析 

摘      要：目的对2株犬源狂犬病病毒街毒株全基因组测序,了解国内狂犬病病毒的流行和变异情况。方法采用乳鼠脑内接种方法分离2株天津地区狂犬病病毒街毒株,RT-PCR扩增病毒DNA覆盖全基因组12个相互重叠的基因片段,PCR产物平端克隆后进行全基因组核苷酸序列测定,然后对其分子变异和进化特点进行分析。进行两分离株的序列相似性、氨基酸同源性、主要功能位点的变异比较和种系发生分析。结果 TJD04和TJD05两株狂犬病病毒全基因组长均为11 924 nts,全基因组序列的组成和结构均符合弹状病毒科狂犬病病毒属的特征。病毒基因组由5个编码区组成,基因起始位点和终止位点高度保守,氨基酸编码长度未发生变异,5个编码蛋白序列较少发生变化,仅有个别主要功能位点发生变异,且大部分变异均属于无意义沉默突变。多序列相似性比较和种系发生分析显示,两株病毒均属于基因1型,N基因与全基因进化树保持一致,与中国犬源狂犬病病毒BD06同源性最高(99.6%),进化关系近,并具有较为独特的中国地域特点。结论两天津株狂犬病毒可能是自然界中固有的狂犬病病毒街毒株。