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大肠杆菌烷基过氧化氢还原酶（AhpF-AhpC）的结构与功能研究和大肠杆菌YcjY蛋白的结构与功能研究

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大肠杆菌烷基过氧化氢还原酶（AhpF-AhpC）的结构与功能研究和大...

作者：陈超飞安徽大学

学位级别：硕士

烷基过氧化物还原酶(AhpR)系统还原细胞内各种过氧化物底物,具有解毒功能,因而在细菌中起重要作用。AhpR能够保护细胞抵抗氧化压力,是通过烷基过氧化氢还原酶的两个亚基实现-AhpF和AhpC。AhpC是一个典型的2-cys过氧化物还原酶(peroxired... 详细信息

烷基过氧化物还原酶(AhpR)系统还原细胞内各种过氧化物底物,具有解毒功能,因而在细菌中起重要作用。AhpR能够保护细胞抵抗氧化压力,是通过烷基过氧化氢还原酶的两个亚基实现-AhpF和AhpC。AhpC是一个典型的2-cys过氧化物还原酶(peroxiredoxin),它能够直接将过氧化物底物转化为水或相应的醇,从而起到解毒作用。AhpF是一个黄素蛋白,特异性催化AhpC蛋白,把NADH上的电子转移到AhpC上来再生AhpC。电子从最初的NADH转移到最终的AhpC上,AhpF上有三个催化中心参与电子转移过程：一个N-端氧化还原结构域(NTD),一个FAD结合结构域(FAD结构域)和一个NADH结合的氧化还原结构域(NAD结构域)。目前认为AhpF的调控机制和硫氧还蛋白还原酶-硫氧还蛋白系统(TrxR-Trx)类似。首先,电子在AhpF蛋白分子内部传递,结合在NAD结构域上的NADH把电子传递给FAD结构域的辅酶,辅酶FAD再传递给NAD结构域氧化还原中心Cys345-Cys348,随后电子传递给NTD结构域的Cysl29-Cysl32。最后,电子在AhpF与AhpC分子之间传递,电子从AhpF的结构域NTD (Cysl29-Cysl32)传递给二聚体AhpC的氧化还原中心Cys47-Cys166上。在上述电子传递过程,AhpF中NAD结构域Cys348作为亲核基团攻击NTD结构域Cys129,然后Cys129作为亲核基团攻击AhpC中的Cys166,完成氧化还原催化反应。AhpF蛋白在催化过程中经历剧烈的构象变化,一方面,NTD结构域的Cysl29-Cysl32和NAD结构域Cys345-Cys348需要相互接触接受来自NADH的电子;另一方面,NTD结构域Cysl29-Cysl32需要和AhpC接触。因此NTD结构域需要经历构象变化,以便将电子传递给AhpC蛋白。本论文中,我们纯化了***的内源AhpF蛋白,获得了AhpF蛋白的晶体结构(分辨率为2.2A)。从整体结构来看,AhpF呈现为一个全新的开放构象,它的N-端结构域远离C-端结构域,这一构象和来自鼠伤寒沙门氏菌高度同源蛋白StAhpF和最近报道的大肠杆菌的EcAhpF构象均不相同。我们的实验结果表明,AhpF可能采用一个开放状态去更高效的催化十聚体的AhpC,完成过氧化物的解毒功能。我们在AhpF晶体结构中捕捉到开放的构象可能是AhpF进行分子间电子传递的中间态。肽聚糖是细菌细胞壁中重要和独特的组分,位于细胞质膜外,它的主要功能是通过抵抗高渗透压来保持的的完整性和保持细胞形态。在肽聚糖代谢过程中,PgrR是一个转录因子,它作为一个阻遏蛋白调控参与肽聚糖寡肽降解基因的表达,它可以直接结合到pgrR上游和反向ycjY-ymjD-ymjC-mpaA基因簇之间的操纵子上,调控ycjY-ymjD-ymjC-mpaA基因簇的表达。最近有报道说,过量表达ycjY-ymjD-ymjC-mpaA基因簇中的未知水解酶ycjY能够导致大肠杆菌细胞变长呈丝状表型,推测YcjY可能在大肠杆菌细胞生长和分裂过程中起作用。事实上,肽聚糖水解酶对细胞形状和生长状况有重大影响。本论文我们解析了大肠杆菌YcjY蛋白的晶体结构(分辨率2.0A)。YcjY的单体结构呈现出一个经典的α/β水解酶折叠,它可以分为两部分：一个核心催化结构域和一个插入(insertion)结构域。核心催化结构域有一个中心8β折叠,大部分是平行的p折叠,其中β2是反向平行的。中心p折叠两侧是a螺旋,一侧是α1,α111和α12,另一侧是α2,α3和α10。中心p折叠呈现出一个左手超螺旋扭转,β1和p10呈90℃。插入区域(insertion)位于中心p折叠的β6和β9之间的loop上。插入区域由一个小的反平行p-发夹(β7/β8)和6个a-螺旋(α4,α5,α6,α7,α8和α9)组成,它们共同组成一个位于核心催化结构之上的帽子结构。我们通过凝胶过滤层析研究了YcjY在溶液中的聚集状态,它表现出一个单一的峰,层析峰对应分子量大小为58.88 kDa,表明它在溶液中以二聚体形式存在(单体是33.7 kDa)。与其他a/p水解酶相比,我们确定了YcjY作为半胱氨酸水解酶的催化位点,通过细胞表型实验确定了这些位点的重要性。我们还发现,YcjY的功能可能受到在同一操纵子基因ymjD, ymjC和]mpaA的拮抗效应影响。综上所述,YcjY可能作为一个新的α/β水解酶,参与到肽聚糖寡肽水解和肽聚糖生物合成过程。

关键词：烷基过氧化氢还原酶构象变化 YcjY α/β水解酶催化二联体丝状表型

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大众网《独立调查》报道特色研究

大众网《独立调查》报道特色研究

作者：陈超飞河北大学

学位级别：硕士

随着网络技术的不断进步,人们越来越多地借助互联网来获取和传递信息,与此同时网络自身超时空、便捷、虚拟性等特征也正逐渐改变着人们的生活方式。尤其是微博、微信等自媒体的发展,人人都可以变身成为记者,来记录和传播身边的新鲜事。... 详细信息

随着网络技术的不断进步,人们越来越多地借助互联网来获取和传递信息,与此同时网络自身超时空、便捷、虚拟性等特征也正逐渐改变着人们的生活方式。尤其是微博、微信等自媒体的发展,人人都可以变身成为记者,来记录和传播身边的新鲜事。当今,我们每天所获取的信息量前所未有,在大量网络信息冲击下我们看似离真相越来越近,而由于网民参差不齐的知识水平、难以揣摩的利益出发点、所处不同的社会阶层等原因,使谣言混在网络信息中,影响着人们对事物的正确判断,如此看来我们又离真相越来越远。复杂的网络环境,给媒体出了一个新难题,要在保证新闻真实性的同时,还要承担起辟谣的责任。面对复杂的网络环境,大众网作为主流网络媒体有责任与义务治理网络谣言,及时发出真实、理性、权威的声音。于是大众网在2009年12月开设《独立调查》专栏,以调查性报道为主要形式,以“揭露网络传言、还原事实真相”为宗旨,并在采访报道过程中时时践行新闻真实性原则,对网民关注的网络焦点问题进行调查求证,第一时间遏制网络谣言的传播。它开创了全国网络媒体深度调查报道之先河,填补了网络新闻专栏深度报道的空白。本文第一章为绪论部分;第二章通过描述当前网络谣言肆虐的网络环境,介绍大众网《独立调查》专栏的创办背景及发展进程;第三章运用内容分析法,对《独立调查》专栏进行内容及形式分析,探讨其在调查性报道过程中,在选题、深入调查、客观平衡报道、写作特征、表现形式等方面的独特价值;第四章总结了《独立调查》专栏创办以来所产生的积极影响,以及对其他地方新闻网站的启示。

关键词：大众网《独立调查》报道特色

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探究初中数学教学中学生核心素养的培养策略

中学课程辅导(教师通讯) 2020年第21期 101-102页

作者：陈超飞江苏省宿迁市泗阳县王集初级中学

为了提升初中生的数学学习能力,使教育方式符合我国新课改的要求,注重核心素质的培养,必须对初中课堂的教育方式和重心进行更新。由于近年来核心素养的培养成为了教育中的主要内容,本文提出了提升数学学习兴趣、结合生活实际、鼓励学生... 详细信息

为了提升初中生的数学学习能力,使教育方式符合我国新课改的要求,注重核心素质的培养,必须对初中课堂的教育方式和重心进行更新。由于近年来核心素养的培养成为了教育中的主要内容,本文提出了提升数学学习兴趣、结合生活实际、鼓励学生提问等培养措施,旨在改善初中数学课堂教育现状,增强学生的品质和思维能力,带动学生更好的成长。

关键词：初中数学教学核心素养数学学习兴趣

初中生物学单元教学的逆向设计——以“生物的生殖和发育”为例

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中学生物学 2024年第11期 82-84+88页

作者：陈超飞湖南师大附中雨花学校

本文以“生物的生殖和发育”一章内容为例，基于逆向设计和单元教学的理念构建学习型课堂。其设计过程包括三个阶段：根据学科课程标准的要求，确定生物学学科核心素养目标并搭建相应的目标框架；根据预期目标确定评估证据；基于WHERET... 详细信息

本文以“生物的生殖和发育”一章内容为例，基于逆向设计和单元教学的理念构建学习型课堂。其设计过程包括三个阶段：根据学科课程标准的要求，确定生物学学科核心素养目标并搭建相应的目标框架；根据预期目标确定评估证据；基于WHERETO模式设计学习任务。本文旨在运用情境激发学生的学习兴趣，通过问题和任务驱动概念的生成，将多元评价方式嵌入各个阶段的学习任务中，从而构建出高效、互动、以学习为中心的初中生物学课堂。

关键词：逆向设计 WHERETO模式单元教学设计学习型课堂

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U形渠道弧顶三角剖面堰的数值模拟

人民黄河 2019年第5期41卷 152-156,160页

作者：柳双环陈超飞马孝义张敏西北农林科技大学水利与建筑工程学院陕西杨凌712100

为提高三角剖面堰的过流能力,改善其水力特性,提高测流的精确度和可靠性,将堰顶改良形成弧顶三角剖面堰,探究弧顶三角剖面堰的水力特性,为灌区的科学化管理提供科学依据。利用AutoCAD结合GAMBIT软件建立U形渠道弧顶三角剖面堰的基本模型... 详细信息

为提高三角剖面堰的过流能力,改善其水力特性,提高测流的精确度和可靠性,将堰顶改良形成弧顶三角剖面堰,探究弧顶三角剖面堰的水力特性,为灌区的科学化管理提供科学依据。利用AutoCAD结合GAMBIT软件建立U形渠道弧顶三角剖面堰的基本模型,并进行模拟计算,经过Tecplot软件后处理,从而获得水面线沿程变化规律和流速沿垂直方向的变化规律,得到水头损失最大为0.049 m,小于量水规范要求的5 cm。根据回归分析试验数据得到流量公式,比较渠道流量、模拟流量与计算流量,模拟流量最大相对误差为8.69%,计算流量最大相对误差绝对值为9.75%,三者吻合度较好,说明弧顶三角剖面堰测流精度较高。

关键词：弧顶三角剖面堰数值模拟过流能力

前牙残冠残根伴瘘管根管治疗与桩冠修复一次完成

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现代中西医结合杂志 2001年第6期10卷 545-546页

作者：江丽陈超飞安徽省六安市第二医院口腔科 237005

前牙残冠残根在临床上的治疗和修复越来越被人们重视.不仅要求符合保留牙齿的修复原则性,而且还要注重美观.笔者在这方面作了许多的探讨和尝试.采用了根管治疗术与桩冠修复一次完成前牙残冠残根慢性根尖周炎伴瘘管的治疗和修复全过程,... 详细信息

前牙残冠残根在临床上的治疗和修复越来越被人们重视.不仅要求符合保留牙齿的修复原则性,而且还要注重美观.笔者在这方面作了许多的探讨和尝试.采用了根管治疗术与桩冠修复一次完成前牙残冠残根慢性根尖周炎伴瘘管的治疗和修复全过程,并取得显著疗效,现将其方法叙述如下.

关键词：前牙残冠残根瘘管根管治疗桩冠修复

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中西医结合治疗广泛性焦虑障碍验案1则

湖南中医杂志 2015年第1期31卷 99-100页

作者：陈超飞颜红天津中医药大学天津300193 天津中医药大学第一附属医院天津300192

随着社会竞争压力增大,生活工作节奏加快,焦虑障碍患者发病有逐年上升趋势。广泛性焦虑障碍（GAD）是临床常见的心身疾病,易复发,难自愈,严重影响患者工作及生活。清热除烦方为导师颜红教授自拟方,结合化学抗焦虑药物,在临床治疗广泛性... 详细信息

随着社会竞争压力增大,生活工作节奏加快,焦虑障碍患者发病有逐年上升趋势。广泛性焦虑障碍（GAD）是临床常见的心身疾病,易复发,难自愈,严重影响患者工作及生活。清热除烦方为导师颜红教授自拟方,结合化学抗焦虑药物,在临床治疗广泛性焦虑障碍中取得良好疗效,现将验案1则报告如下。崔某,女,53岁,2013年2月27日就诊。主诉：焦虑心烦伴失眠近10个月,加重2个月。

关键词：广泛性焦虑障碍社会竞争压力子宫切除术热除抗焦虑药物师颜心身疾病镇静催眠疏肝解郁焦虑抑郁症状

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U形渠道三角剖面堰水力特性的数值模拟

节水灌溉 2018年第4期 37-41页

作者：柳双环马孝义陈超飞西北农林科技大学旱区农业水土工程教育部重点实验室陕西杨凌712100

因三角剖面堰多被应用于矩形和梯形渠道,将其用于U形渠道并利用数值模拟方法分析尚未深入。为了探究U形渠道三角剖面堰的适用性以及数值模拟的准确性,利用AUTO CAD和GAMBIT建立U形渠道三角剖面堰物理模型,利用FLUENT6.3软件对其进行模... 详细信息

因三角剖面堰多被应用于矩形和梯形渠道,将其用于U形渠道并利用数值模拟方法分析尚未深入。为了探究U形渠道三角剖面堰的适用性以及数值模拟的准确性,利用AUTO CAD和GAMBIT建立U形渠道三角剖面堰物理模型,利用FLUENT6.3软件对其进行模拟计算,用Tecplot软件进行后处理,从而获得不同工况下水位和流速分布情况以及水位流量关系曲线。结果表明,不同工况下流量和水位的模拟值与实际值比较接近,流量的平均相对误差为0.21%,水位的平均相对误差为6.02%,水位流量曲线均符合指数函数关系。因此,U形渠道中三角剖面堰测流准确度较高,具有一定的可靠性和实用性,可以为灌区用水配水提供科学依据,提高水资源科学管理水平。

关键词： U形渠道三角剖面堰数值模拟

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U形渠道三角剖面堰数值模拟与水力性能探究

节水灌溉 2018年第8期 108-113页

作者：柳双环张敏陈超飞马孝义西北农林科技大学水利与建筑工程学院陕西杨凌712100

为探究U形渠道三角剖面堰量水的可靠性及其水力特性,以更好地进行灌区科学化管理,合理分配水量。基于堰流原理,通过Fluent 6.3软件,采用VOF方法和RNG k-ε湍流模型对U形渠道三角剖面堰进行三维数值模拟,并对模拟结果进行分析。对不同流... 详细信息

为探究U形渠道三角剖面堰量水的可靠性及其水力特性,以更好地进行灌区科学化管理,合理分配水量。基于堰流原理,通过Fluent 6.3软件,采用VOF方法和RNG k-ε湍流模型对U形渠道三角剖面堰进行三维数值模拟,并对模拟结果进行分析。对不同流量工况下沿程水面线,流速分布,佛劳德数以及水头损失进行探究分析,得到水面线在量水堰处急剧下降,同时流速增大。水流流态从缓流到急流再恢复成缓流,临界流出现在堰顶处,且最大水头损失不超过上游总水头的13%,理论分析发现各项水力特性均符合经典水力学基本原理。建立流量公式并比较分析计算流量,模拟流量和渠道流量,最大误差为13.86%,最小误差为0.03%,基本符合灌区量水堰测流的精度。

关键词： U形渠道三角剖面堰量水水力特性数值模拟