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基于机器学习分析的浸润性乳腺癌蛋白质编码基因的标志物鉴定

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中国医学科学院学报 2024年第2期46卷 147-153页

作者：武乐闵开元柳江枫梁万丰杨晔宏胡刚杨俊涛南开大学统计与数据科学学院天津300071 中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所重大疾病共性机制研究全国重点实验室北京100005

目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数... 详细信息

目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数据库下载浸润性乳腺癌的表达数据,采用DESeq2程序包、t检验及Cox单因素分析,对人类浸润性乳腺癌样本中与生存预后相关的差异蛋白质编码基因进行筛选。基于RF、XGBoost、LightGBM、CatBoost等机器学习模型的构建与比较,挖掘浸润性乳腺癌预后相关的蛋白质编码基因标志物,并使用基因表达综合数据库的乳腺癌表达数据作为外部测试进行验证。结果共获得151个与生存预后相关的差异蛋白质编码基因,其中由C3orf80、UGP2和SPC253个基因构建的机器学习模型效果较好。结论筛选出3个(UGP2、C3orf80、SPC25)与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物,为诊断和治疗浸润性乳腺癌提供了新的方向。

关键词：浸润性乳腺癌生物标志物蛋白质编码基因 UGP2 C3orf80 SPC25

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2011—2018年北京市中心城区儿童中耶尔森菌病流行特征及临床诊断

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中华预防医学杂志 2019年第10期53卷 1027-1031页

作者：汪静孙昊祁亮石旭辉周莹闵开元段然王鑫王联君北京市东城区疾病预防控制中心 100009 北京市东城区妇幼保健与计划生育服务中心 100061 北京协和医学院 100005 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的分析北京市中心城区儿童耶尔森菌病流行特征以及临床诊断的准确性。方法选取北京市中心城区一家儿童医院在2011—2018年开展连续性腹泻病例的病原学监测,共3493例;收集患者的流行病学和临床特征信息,分析患者耶尔森菌病、细菌性痢... 详细信息

目的分析北京市中心城区儿童耶尔森菌病流行特征以及临床诊断的准确性。方法选取北京市中心城区一家儿童医院在2011—2018年开展连续性腹泻病例的病原学监测,共3493例;收集患者的流行病学和临床特征信息,分析患者耶尔森菌病、细菌性痢疾临床诊断与病原学诊断情况,比较不同特征患者小肠结肠炎耶尔森菌检出情况。结果3493例患者年龄为6 d至13岁,M(P25,P75)为1.50(0.75,3.17)岁,28例检出小肠结肠炎耶尔森菌,病原学诊断为耶尔森菌病,检出率为0.80%,月份峰值出现在2和5月。耶尔森菌病患者中,5岁以下占85.71%(24例),3~4岁组的检出率最高(1.52%),0~1岁组的检出率最低(0.18%),差异有统计学意义(P=0.025)。出现黏液便、伴随发热症状、便常规中检出白细胞以及红细胞症状体征的患者小肠结肠炎耶尔森菌检出率均高于无该症状体征患者(P>0.05)。28例耶尔森菌病患者中,9例临床诊断都被错诊为细菌性痢疾。结论北京市中心城区14岁以下儿童耶尔森菌病患者以5岁以下为主,腹泻症状以黏液便、伴随发热、便常规镜检可见白细胞、红细胞为特点,临床初步诊断容易与细菌性痢疾相混淆。

关键词：耶尔森菌病,小肠结肠炎腹泻病原学监测

父母社会经济地位与学龄前儿童消费含糖饮料的关联研究

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中华预防医学杂志 2020年第6期54卷 657-661页

作者：苏凤华闵开元汪静杨可欣孙靓廖巍蔡姝雅刘洋张佩雯张娟王联君江宇北京市东城区疾病预防控制中心健康教育科 100009 中国医学科学院北京协和医学院公共卫生学院 100730 北京市东城区疾病预防控制中心 100009 中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所 100730

目的了解父(母)社会经济地位与学龄前儿童含糖饮料消费的关联。方法于2018年6月对北京市东城区教育委员会辖区幼儿园进行等比例分层整群抽样,将15所幼儿园的所有学龄前儿童纳入研究。采用自制问卷对学龄前儿童父(母)进行调查,获取学龄... 详细信息

目的了解父(母)社会经济地位与学龄前儿童含糖饮料消费的关联。方法于2018年6月对北京市东城区教育委员会辖区幼儿园进行等比例分层整群抽样,将15所幼儿园的所有学龄前儿童纳入研究。采用自制问卷对学龄前儿童父(母)进行调查,获取学龄前儿童及父(母)基本信息、学龄前儿童含糖饮料的消费情况和父(母)对含糖饮料的认知情况,最终将3217名学龄前儿童的调查结果纳入分析。采用广义结构方程模型分析学龄前儿童消费含糖饮料与父(母)社会经济地位的关系及父(母)含糖饮料认知的中介效应。采用偏差校正非参数百分位Bootstrap法估算中介效应的大小。结果3217名学龄前儿童的年龄为(4.23±0.67)岁,其中男生占52.60%(1692名),学龄前儿童中消费含糖饮料者占77.62%(2497名)。3217名学龄前儿童父(母)中,父亲和母亲分别占24.90%(801名)和75.10%(2416名),社会经济地位得分的M(P25,P75)分别为66.7(62.5,69.5)和69.5(64.6,71.4)分;父(母)中主动了解孩子含糖饮料消费情况、对限制学龄前儿童消费含糖饮料缺乏信心和购买食物前阅读营养标签的占比分别为74.08%(2383名)、82.90%(2667名)和36.24%(1166名)。广义结构方程模型分析结果显示:调整学龄前儿童性别、年龄,以及学龄前儿童和父(母)体重指数后,学龄前儿童含糖饮料消费与父(母)社会经济地位得分呈负相关[路径系数(95%CI):-4.69×10^-2(-6.56×10^-2,-2.69×10^-2)]。父(母)对含糖饮料认知的中介效应可解释总效应的48.71%[路径系数(95%CI):-2.28×10^-2(-3.54×10^-2,-1.10×10^-2)]。结论学龄前儿童含糖饮料消费与父(母)社会经济地位负相关,父(母)对含糖饮料的认知发挥了中介效应。

关键词：儿童,学龄前饮料膳食蔗糖社会阶级

四川某地区中小学生营养与食品安全知信行及影响因素分析

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中国健康教育 2021年第5期37卷 448-451页

作者：王焕倩尤莉莉王蓉胡东陈新月闵开元潘钰婷刘远立北京协和医学院卫生健康管理政策学院北京100730 四川省泸州市合江县疾病预防控制中心四川泸州646200

目的了解四川省某地区中小学生营养与食品安全知识及饮食行为的现状及影响因素,为制定有效的干预措施提供依据。方法采取多阶段分层整群抽样法,对四川省某地区7所学校共1740名中小学生营养与食品安全知识、饮食态度及行为进行问卷调查... 详细信息

目的了解四川省某地区中小学生营养与食品安全知识及饮食行为的现状及影响因素,为制定有效的干预措施提供依据。方法采取多阶段分层整群抽样法,对四川省某地区7所学校共1740名中小学生营养与食品安全知识、饮食态度及行为进行问卷调查。结果营养与食品安全知识总正确回答率为67.5%,知识得分及格率为71.5%,其中小学为68.5%,中学为74.7%。94.9%的中小学生认为好好吃饭对健康重要,27.7%每天食用新鲜水果,20.0%每天摄入乳制品,40.0%经常饮用含糖饮料。Logistic回归分析显示,小学生中独生子女(OR=1.864)、母亲高文化程度(OR=4.262)的学生知识及格比例高,中学生中住校生(OR=1.672)知识及格比例高。结论该地区中小学生营养与食品安全知识水平较低,饮食态度较好但行为有待加强,应对不同年级有针对性地开展家庭和学校健康教育工作,提高师生及家长健康素养,改变不良饮食习惯。

关键词：中小学生营养知信行影响因素

健康城市建设背景下四川省泸州市居民体力活动状况及其影响因素

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中国健康教育 2019年第9期35卷 807-812页

作者：潘钰婷尤莉莉闵开元苏夏雯郭婧刘牧宇刘霞赵勇杨志勇刘远立中国医学科学院/北京协和医学院北京100730 四川省泸州市卫生与计划委员会四川泸州646000

目的了解健康城市建设对四川省泸州市居民体力活动的影响,为健康城市建设和改善居民体力活动提供科学参考依据。方法基于泸州市2015年和2018年重复横断面调查资料,选取18~75岁的居民作为调查对象纳入研究,并采用多水平Logistic回归模型... 详细信息

目的了解健康城市建设对四川省泸州市居民体力活动的影响,为健康城市建设和改善居民体力活动提供科学参考依据。方法基于泸州市2015年和2018年重复横断面调查资料,选取18~75岁的居民作为调查对象纳入研究,并采用多水平Logistic回归模型分析居民体力活动的影响因素。结果2次调查分别纳入泸州市18~75岁常住居民5536和7949人。实施健康城市建设后,泸州市居民体力活动标化达标率由2015年的52.60%上升到2018年的56.80%。2水平Logistic回归分析显示,体力活动达标率在社区(村)水平存在聚集性(P<0.01);工人、企事业单位职工和其他职业的体力活动达标率分别是农民的1.54、1.45和1.25倍,中年人体力活动达标率是青年人的1.38倍,经济水平好的人群体力活动达标率是经济水平差的0.74倍,个体健康状况中和好的人群体力活动达标率分别是个体健康状况差的1.32和1.40倍,对健康知识宣传满意人群的体力活动达标率是非满意的1.24倍。结论健康城市建设有助于提高居民体力活动达标率,同时在该背景下需针对不同人群开展有针对性的体力活动健康促进行动。

关键词：健康城市建设体力活动 2水平Logistic模型影响因素

北京市东城区3~5岁学龄前儿童膳食、身体活动和屏幕时间达到指南推荐要求情况及相关因素研究

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中国健康教育 2020年第3期36卷 210-214页

作者：汪静张娟闵开元苏凤华廖巍孙靓杨可欣蔡姝雅张佩雯刘洋王联君北京市东城区疾病预防控制中心北京100009 中国医学科学院北京协和医学院公共卫生学院北京100730 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100730

目的研究北京市东城区3~5岁学龄前儿童膳食、身体活动和屏幕时间达到指南推荐要求的情况及相关因素,为制定预防学龄前儿童超重肥胖的干预措施提供科学依据。方法使用等比例分层整群抽样,2018年4—7月在东城区开展横断面调查。15所幼儿... 详细信息

目的研究北京市东城区3~5岁学龄前儿童膳食、身体活动和屏幕时间达到指南推荐要求的情况及相关因素,为制定预防学龄前儿童超重肥胖的干预措施提供科学依据。方法使用等比例分层整群抽样,2018年4—7月在东城区开展横断面调查。15所幼儿园小班和中班的3585对儿童和家长参与了调查,应答率为84.61%。使用改编的问卷调查儿童的膳食、身体活动和屏幕时间,并从幼儿园体检数据库中获取儿童的体重和身高。使用有序Logistic回归分析儿童膳食、身体活动和屏幕时间达到推荐要求项数的相关因素。结果在被调查的儿童中,超重肥胖者占15.54%(11.05%超重、4.49%肥胖)。未发现膳食、身体活动和屏幕时间均达到推荐要求的儿童,有2项达到推荐要求的儿童31人(1.98%)。自身超重肥胖(OR=0.72,95%CI:0.59~0.89)和父母超重肥胖(OR=0.79,95%CI:0.67~0.93)的儿童达到推荐要求的项数较少,而父母社会经济地位较高的儿童达到推荐要求的项数较多(OR=1.48,95%CI:1.22~1.80)。结论东城区3~5岁儿童超重肥胖率较高,达15.54%,儿童自身和父母的超重肥胖是儿童膳食、身体活动和屏幕时间达到推荐要求的影响因素,应倡导儿童健康生活方式。

关键词：学龄前儿童超重肥胖膳食身体活动屏幕时间

四川省泸州市居民健康城市建设满意度与主观幸福感的关系

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中国健康教育 2019年第9期35卷 813-817,847页

作者：闵开元尤莉莉潘钰婷何紫棠沈冰洁朱之恺葛波休刘霞赵勇杨志勇刘远立中国医学科学院/北京协和医学院北京100730 四川省泸州市卫生和计划生育委员会健康城市建设指导中心四川泸州646000

目的了解四川省泸州市居民对健康城市建设的满意度与主观幸福感的关系,为我国健康城市建设提供科学依据。方法采用多阶段抽样的方法抽取了7964名居民,通过问卷调查了解其对健康城市建设的满意度和主观幸福感,利用多水平Logistic回归模... 详细信息

目的了解四川省泸州市居民对健康城市建设的满意度与主观幸福感的关系,为我国健康城市建设提供科学依据。方法采用多阶段抽样的方法抽取了7964名居民,通过问卷调查了解其对健康城市建设的满意度和主观幸福感,利用多水平Logistic回归模型分析居民对健康城市建设满意度与主观幸福感的关系。结果居民对健康城市建设医疗卫生服务、医疗保障体系、自然环境、健康知识宣传、社会治安、社会保障体系、食品安全和健身娱乐活动的满意率分别为:78.07%(95%CI:77.13%~78.99%),75.74%(95%CI:74.77%~76.69%),75.05%(95%CI:74.08%~76.02%),74.77%(95%CI:73.79%~75.74%),74.60%(95%CI:73.61%~75.56%),71.22%(95%CI:70.20%~72.23%),65.51%(95%CI:64.44%~66.57%)和58.88%(95%CI:57.78%~59.98%),其中居民对食品安全和健身娱乐活动的满意率较其他维度低,P<0.05。调整混杂因素后,居民对社会保障体系(OR=1.63,95%CI:1.34~1.98)、健身娱乐活动(OR=1.49,95%CI:1.28~1.74)和食品安全(OR=1.49,95%CI:1.25~1.76)的满意度与主观幸福感之间存在正向关联。结论四川省泸州市居民对健康城市建设的满意率较高,其对健康城市建设的满意度与主观幸福感正向相关。

关键词：健康城市主观幸福感多水平统计模型

汉化版最新关键指标量表(NVS)在青少年健康素养测量中的信效度

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中国健康教育 2022年第1期38卷 14-17页

作者：王焕倩陈新月昝子晴杨志勇刘霞赵勇潘钰婷闵开元尤莉莉刘远立北京协和医学院卫生健康管理政策学院北京100730 四川省泸州市卫生健康委四川泸州646000

目的对国际通用量表“最新关键指标(NVS)”进行汉化,探讨其在我国青少年群体中的信效度,从而为我国青少年健康素养测量提供一个更经典更简短的工具,并且可用于进行国际间青少年健康素养水平的比较。方法采用Brislin翻译原则对NVS量表进... 详细信息

目的对国际通用量表“最新关键指标(NVS)”进行汉化,探讨其在我国青少年群体中的信效度,从而为我国青少年健康素养测量提供一个更经典更简短的工具,并且可用于进行国际间青少年健康素养水平的比较。方法采用Brislin翻译原则对NVS量表进行翻译和文化调适。选取2018年1—2月泸州市3754名中小学生进行调查,评价量表的信度和效度。结果汉化版NVS量表保留了原量表全部6个条目,Cronbach′sα系数为0.748,重测信度为0.685,与《中国居民健康素养调查问卷》得分呈正相关(r=0.506,P1的公因子,累计方差解释率为63.694%。验证性因子分析总体拟合较好,GFI=0.993,RMSEA=0.051,CFI=0.987,NFI=0.985,SRMR=0.021。结论汉化版NVS量表在青少年群体中具有良好的信效度,可用来测量我国青少年健康素养水平。

关键词：健康素养青少年 NVS量表信度效度

四川省泸州市健康城市建设对居民健康素养促进的作用

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中国健康教育 2019年第9期35卷 802-806,826页

作者：尤莉莉潘钰婷杨志勇刘霞赵勇宋益喆沈冰洁闵开元何紫棠郭婧苏夏雯朱之恺刘远立中国医学科学院/北京协和医学院北京100730 四川省泸州市卫生与计划委员会四川泸州646000

目的了解四川省泸州市健康城市建设对居民健康素养影响情况,为政府主导健康城市建设提供科学依据。方法采取按人口比例分层随机抽样方法,对泸州市居民进行"健康城市建设效果居民评估调查"及居民健康素养调查,将基线期与中期进行比较,分... 详细信息

目的了解四川省泸州市健康城市建设对居民健康素养影响情况,为政府主导健康城市建设提供科学依据。方法采取按人口比例分层随机抽样方法,对泸州市居民进行"健康城市建设效果居民评估调查"及居民健康素养调查,将基线期与中期进行比较,分析健康城市建设成效及对居民健康素养促进的作用。结果沪州市健康城市项目实施3年后,城乡居民对泸州市健康城市建设的总体满意度为77.1%;居民综合健康素养具备率由9.21%增长至12.3%,农村居民健康素养水平增幅(93.8%)显著,城乡差距减小;居民卫生行为有明显改善;居民体力活动达标率由52.6%提高至57.40%,公共场所吸烟现象得到改善;多元回归分析显示,对健康城市建设服务满意者具备基本健康素养的可能性增加1.5~3.5倍。结论以"政府主导、各部门协调、社会参与"的健康城市建设模式对提高城乡居民的综合健康素养、改善卫生环境和习惯具有促进作用。

关键词：健康城市健康素养项目评价健康相关行为