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鞘氨醇单胞菌降解多环芳烃菲过程中菌体全蛋白提取方法的优化及其蛋白的差异表达

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高技术通讯 2010年第12期20卷 1314-1319页

作者：雷欢田蕴郑天凌厦门大学生命科学学院厦门大学亚热带湿地生态系统研究教育部重点实验室厦门361005 厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室厦门361005

采用平板升华技术从厦门博坦油码头表层海水样品中筛选获得一株高效降解多环芳烃(PAHs)的菌,经16S rDNA分子鉴定,该菌株归属鞘氨醇单胞菌属,定名为*** H。Strain H在24h内对初始浓度为50mg/L的多环芳烃菲的降解率可达94%。以strain H为... 详细信息

采用平板升华技术从厦门博坦油码头表层海水样品中筛选获得一株高效降解多环芳烃(PAHs)的菌,经16S rDNA分子鉴定,该菌株归属鞘氨醇单胞菌属,定名为*** H。Strain H在24h内对初始浓度为50mg/L的多环芳烃菲的降解率可达94%。以strain H为模式菌株,对其在降解过程中菌体全蛋白的提取进行了优化,以获得高质量的降解全程各个阶段具有代表性的菌体蛋白样品。结果表明,超声-三氯乙酸(TCA)/丙酮沉淀的方法可有效去除中间代谢产物的干扰,获得纯度较高的蛋白样品。对以此方法提取的蛋白样品,通过双向电泳技术比较了strain H在有和没有菲诱导条件下的蛋白质表达差异,获得17个差异蛋白点。这些差异蛋白点的获得将为进一步分析参与PAHs降解的关键酶系和探索菲的代谢途径奠定实验基础。

关键词：鞘氨醇单胞菌蛋白质提取差异表达双向电泳

基于均匀设计优化新鞘氨醇菌US6-1对高分子量多环芳烃的降解条件

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应用与环境生物学报 2010年第6期16卷 875-878页

作者：郑伟田蕴郑天凌厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室(厦门大学) 厦门361005 近海海洋环境科学国家重点实验室(厦门大学) 厦门361005

运用均匀设计优化一株新鞘氨醇菌Novosphingobium pentaromativorans stain US6-1对芘、荧蒽、苯并[a]芘等高分子量多环芳烃(High molecular weigh polycyclic aromatic hydrocarbons,HMW-PAHs)的降解条件.结果表明,在最适生长条件(30℃、pH 6.5及NaCl浓度为2.5%)下,接种量与底物浓度是影响该菌降解能力的关键因素.在接种量D660 nm为0.6、芘初始浓度56 mg L-1、培养时间5 d的情况下,菌株US6-1对芘的降解达到32.5 mg L-1,预测平均准确率达99.38%;在接种量D660 nm为0.6、荧蒽初始浓度48 mg L-1、培养时间5 d的情况下,对荧蒽的降解达到34.3 mg L-1,预测平均准确率达99.61%;在接种量D660 nm为0.1、苯并[a]芘初始浓度60 mg L-1、培养时间为5 d时,对苯并[a]芘的降解达到24 mg L-1,预测平均准确率达98.75%.菌株US6-1对芘及苯并[a]芘的降解能力比未优化前分别提高了29.2%与58%.

关键词：新鞘氨醇菌均匀设计高分子量多环芳烃(HMW-PAHs) 生物降解接种量

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藻类对生活污水细菌死亡率的影响

厦门大学学报（自然科学版） 1990年第1期29卷 104-107页

作者：郑天凌厦门大学海洋学系

研究了标志星杆藻(Asterionella notata)、小定鞭金藻(Prymnesium parvum)和窄隙角毛藻(Chaetoceros affinis)在模拟生态条件下对生活污水细菌死亡率的影响。结果表明,标志星杆藻和小定鞭金藻对污水中的金黄色葡萄球菌(Staphylococous a... 详细信息

研究了标志星杆藻(Asterionella notata)、小定鞭金藻(Prymnesium parvum)和窄隙角毛藻(Chaetoceros affinis)在模拟生态条件下对生活污水细菌死亡率的影响。结果表明,标志星杆藻和小定鞭金藻对污水中的金黄色葡萄球菌(Staphylococous aureus),粪链球菌(Streptococcus faecalis),大肠菌群(Coliform group)以及细菌总数有很大的加速死亡作用和协同抗菌作用。这种作用在实验前期更加突出。于24h,在含小定鞭金藻水样中粪链球菌和金黄色葡萄球菌的死亡率分别增加 19.35％和 15.29％,在含标志星杆藻水样中,分别增加 14.18％和 14.90％。

关键词：藻类生活污水污水细菌死亡率

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自然环境中细菌的生存方式及其群落特征

应用与环境生物学报 2013年第4期19卷 553-560页

作者：李祎杨彩云郑天凌厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室 361005 厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室 361005

细菌在环境中是以群落的形式存在的,群落中的细菌有多种生存方式.当处于适宜的环境中,细菌通过互作而快速生长,而营养物质的消耗又造成细菌之间的竞争.不同细菌通过复杂的作用形成的群落容易受到外界环境的影响,并且特殊的功能基因也改... 详细信息

细菌在环境中是以群落的形式存在的,群落中的细菌有多种生存方式.当处于适宜的环境中,细菌通过互作而快速生长,而营养物质的消耗又造成细菌之间的竞争.不同细菌通过复杂的作用形成的群落容易受到外界环境的影响,并且特殊的功能基因也改变了原有的群落结构.细菌群落在环境中有着重要的生态功能及理论与应用价值.本文介绍了细菌的生存方式,结合作者相关研究阐述了细菌群落结构及其生态功能,并予以展望,旨在为细菌群落的深入研究、开发和应用提供参考.

关键词：自然环境细菌生存方式细菌群落结构生态功能

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海洋环境中降解多环芳烃的微生物

海洋科学 2004年第9期28卷 50-55页

作者：田蕴郑天凌厦门大学生命科学学院应用与环境微生物研究所福建厦门361005

多环芳烃(polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)是一类广泛分布于海洋环境中的含有两个苯环以上的有毒有害污染物,主要来源于人类活动和能源利用过程,如石油、煤、木材等的燃烧过程,石油及石油化工产品的生产过程,海上通过地面径流,... 详细信息

多环芳烃(polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)是一类广泛分布于海洋环境中的含有两个苯环以上的有毒有害污染物,主要来源于人类活动和能源利用过程,如石油、煤、木材等的燃烧过程,石油及石油化工产品的生产过程,海上通过地面径流,污水排放及机动车辆等燃料不完全燃烧后的废气随大气颗粒的沉降进入海洋环境中。由于其自身的疏水性及低水溶性,能很快进入到沉积环境中,可长期存在,并且随着苯环数量增加,多环芳烃的脂溶性越强,水溶性越低,在环境中存在时间越长,遗传毒性越高,致癌性增强。通过生物累积及食物链的传递作用,给海洋生物体、生态环境和人体健康带来极大危害,已引起各国科学家的极大重视。美国环保局在80年代初把16种未带分支的多环芳烃确定为环境中的优先污染物,我国也把多环芳烃列入环境优先监测的污染物名单中。

关键词：海洋环境多环芳烃微生物污染物生物降解

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海洋微生物多样性及其分子生态学研究进展

微生物学通报 2013年第4期40卷 655-668页

作者：李祎郑伟郑天凌厦门大学滨海湿地生态系统教育部重点实验室生命科学学院福建厦门361005 厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室福建厦门361005

海洋微生物多样性的深入研究将有助于微生物资源更好的开发和利用,海洋微生物多样性有很大的研究价值和研究空间。海洋中大多数微生物处于未可培养状态,在分子生态学基础上对海洋未可培养微生物进行研究是当今微生物多样性研究的主要方... 详细信息

海洋微生物多样性的深入研究将有助于微生物资源更好的开发和利用,海洋微生物多样性有很大的研究价值和研究空间。海洋中大多数微生物处于未可培养状态,在分子生态学基础上对海洋未可培养微生物进行研究是当今微生物多样性研究的主要方向。近年来相关研究进展迅速,研究方法不断更新。主要从分子生态学角度对微生物多样性研究现状进行概述并详细分析探讨了相关的研究方法,而且从分子生态学与海洋微生物多样性研究相结合的层面,对本领域的研究进行展望。旨在为海洋微生物多样性的研究及海洋资源的可持续开发与利用提供参考。

关键词：海洋微生物微生物多样性分子生态学

模拟潮汐和植被对湿地温室气体通量的影响研究

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环境科学学报 2013年第12期33卷 3376-3385页

作者：王海涛杨小茹郑天凌厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室厦门361102 中国科学院城市环境研究所城市环境与健康重点实验室厦门361021

以福建省九龙江入海口的滩涂潮间带作为研究对象,通过原位采样和室内人工微宇宙实验,利用静态箱-气相色谱法,研究了潮汐植被对湿地CH4、CO2和N2O 3种重要温室气体通量的影响.结果表明,3种温室气体通量在模拟潮汐和植被作用下表现出明显... 详细信息

以福建省九龙江入海口的滩涂潮间带作为研究对象,通过原位采样和室内人工微宇宙实验,利用静态箱-气相色谱法,研究了潮汐植被对湿地CH4、CO2和N2O 3种重要温室气体通量的影响.结果表明,3种温室气体通量在模拟潮汐和植被作用下表现出明显的差异.模拟潮汐对CH4和N2O通量的影响没有明显的规律,总量上都表现为排放;对CO2通量具有显著影响,退潮时抑制,表现为吸收,涨潮时促进,表现为排放.植被促进CH4的排放,对CO2通量影响无明显规律,对N2O通量表现为抑制作用.植被除了自身对温室气体直接作用外,还通过改变沉积物的理化性质影响微生物活动,进而影响温室气体通量.综合分析,植被对温室气体通量的影响要比模拟潮汐作用明显.

关键词：人工微宇宙潮汐植被温室气体通量

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海洋藻类病毒与赤潮防治

应用与环境生物学报 2012年第6期18卷 1056-1065页

作者：柏仕杰王慧郑天凌滨海湿地生态系统教育部重点实验室(厦门大学) 生命科学学院厦门361005 近海海洋环境科学国家重点实验室(厦门大学) 厦门361005

病毒是海洋中丰度最高的生物,全球海洋中大约有1030个病毒,海洋病毒的宿主包括从细菌到大型海洋生物等几乎所有的海洋生物.海洋病毒在调控种群结构及生物地球化学循环中起着至关重要的作用,并且,病毒可以通过水平基因转移来操控宿主的... 详细信息

病毒是海洋中丰度最高的生物,全球海洋中大约有1030个病毒,海洋病毒的宿主包括从细菌到大型海洋生物等几乎所有的海洋生物.海洋病毒在调控种群结构及生物地球化学循环中起着至关重要的作用,并且,病毒可以通过水平基因转移来操控宿主的代谢活动.藻类病毒能够通过裂解藻类从而起到控制赤潮的作用.随着藻类病毒研究的不断发展,人们已经分离到大量的藻类病毒,包括双链或单链的DNA病毒及RNA病毒,其分布于细胞质或细胞核中.本文简要概述了海洋病毒研究方面的发展现状,及海洋病毒在生态环境中的重要作用.集中综述了藻类病毒(包括原核藻类病毒和真核藻类病毒)的研究进展,讨论了海洋藻类病毒与赤潮生物的关系.介绍了藻类病毒在赤潮控制方面所取得的一些成果,展望了藻类病毒调控赤潮的前景.我国在藻类病毒方面的探索研究还只是刚刚起步,研究藻类病毒的前景十分广阔.

关键词：海洋病毒藻类病毒赤潮生态环境

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海洋溶藻功能菌作用机理研究的若干进展

地球科学进展 2013年第2期28卷 243-252页

作者：李东李祎郑天凌厦门大学生命科学学院近海海洋环境科学国家重点实验室及滨海湿地生态系统教育部重点实验室福建厦门361102 华侨大学化工学院福建厦门361021

基于"菌—藻关系"的理念,深入探讨海洋溶藻功能细菌作为潜在的有效防治有害藻华的微生物,已成为学者们的研究热点。但大多的研究主要涉及菌株的分离、鉴定及功能活性物质的纯化,溶藻机理的研究鲜有报道。主要概述了当前国内外海洋环境... 详细信息

基于"菌—藻关系"的理念,深入探讨海洋溶藻功能细菌作为潜在的有效防治有害藻华的微生物,已成为学者们的研究热点。但大多的研究主要涉及菌株的分离、鉴定及功能活性物质的纯化,溶藻机理的研究鲜有报道。主要概述了当前国内外海洋环境中溶藻功能细菌溶藻机理的研究进展,并探讨分析了利用海洋溶藻功能细菌防治有害藻华的未来发展方向,提出了该领域今后的重点研究任务。

关键词：有害藻华溶藻细菌溶藻机理化感作用