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鞘氨醇单胞菌降解多环芳烃菲过程中菌体全蛋白提取方法的优化及其蛋白的差异表达

Optimization of the methods for extraction of phenanthrene-induced proteins in Sphingomonas *** H and detection of the difference in protein expression

作     者:雷欢 田蕴 郑天凌 Lei Huan;Tian Yun;Zheng Tianling

作者机构:厦门大学生命科学学院厦门大学亚热带湿地生态系统研究教育部重点实验室厦门361005 厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室厦门361005 

出 版 物:《高技术通讯》 (Chinese High Technology Letters)

年 卷 期:2010年第20卷第12期

页      面:1314-1319页

核心收录:

学科分类:07[理学] 09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 0713[理学-生态学] 

基  金:国家自然科学基金(40976069 40930847) 福建省科技计划重点项目(2008Y0061)资助 

主  题:鞘氨醇单胞菌 蛋白质提取 差异表达 双向电泳 

摘      要:采用平板升华技术从厦门博坦油码头表层海水样品中筛选获得一株高效降解多环芳烃(PAHs)的菌,经16S rDNA分子鉴定,该菌株归属鞘氨醇单胞菌属,定名为*** H。Strain H在24h内对初始浓度为50mg/L的多环芳烃菲的降解率可达94%。以strain H为模式菌株,对其在降解过程中菌体全蛋白的提取进行了优化,以获得高质量的降解全程各个阶段具有代表性的菌体蛋白样品。结果表明,超声-三氯乙酸(TCA)/丙酮沉淀的方法可有效去除中间代谢产物的干扰,获得纯度较高的蛋白样品。对以此方法提取的蛋白样品,通过双向电泳技术比较了strain H在有和没有菲诱导条件下的蛋白质表达差异,获得17个差异蛋白点。这些差异蛋白点的获得将为进一步分析参与PAHs降解的关键酶系和探索菲的代谢途径奠定实验基础。

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