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昌都地区藏猪群体遗传结构及选择信号的研究

昌都地区藏猪群体遗传结构及选择信号的研究

作者：邱丙姗云南农业大学

学位级别：硕士

藏猪是世界珍稀的高原型猪种,具有抗逆性强、耐粗饲、耐低氧的特点;长期近交导致了一定程度的品种退化,致使藏猪的分布范围和数量正不断减少,同时增大了保种难度。本研究通过对昌都市左贡县扎玉镇(2♂2♀)、碧土乡(2♂2♀)、下林卡乡(2... 详细信息

藏猪是世界珍稀的高原型猪种,具有抗逆性强、耐粗饲、耐低氧的特点;长期近交导致了一定程度的品种退化,致使藏猪的分布范围和数量正不断减少,同时增大了保种难度。本研究通过对昌都市左贡县扎玉镇(2♂2♀)、碧土乡(2♂2♀)、下林卡乡(2♂)、中林卡乡(2♂)、芒康县莽岭乡(1♂2♀)5个乡镇的15头藏猪进行全基因组重测序,检测其基因组内的遗传变异,分析群体遗传结构及亲缘关系,对亲缘关系最远的两个组进行选择信号分析,鉴定受选择区域,对受选择区域内的基因进行GO、KEGG富集分析,筛选昌都地区藏猪种质特性相关基因。结果如下:(1)全基因组重测序结果:共获得695.96 G原始数据,过滤后获得690.07 G高质量测序数据,共检测到35 239 947个SNP位点,遗传变异多位于内含子区域和基因间区,外显子区域变异占比不足1%。(2)群体遗传结构分析结果:15头藏猪的进化树分为3支,A、B聚为一支,C、D、E聚为一支,B中2016-X-1个体单独为一支;群体结构表明5个乡镇的藏猪属于同一亚群,但5个群体之间存在基因交流,其中E组14-c、16-c两头藏猪未发现与其他群体有基因交流,祖先背景相对单一;PCA结果表明5个乡镇的藏猪群体聚类分布明显,A、B组之间遗传距离远,C、D、E组之间遗传距离较近,A、B组与C、D、E组之间的遗传距离较远;5个乡镇的藏猪群体间亲缘关系较远,E组14-c、16-c两头藏猪亲缘关系系数大于0.25,亲缘关系较近。(3)选择信号分析结果:连锁不平衡分析表明5个藏猪群体的有效连锁程度较高,连锁程度高低依次为D>C>E>A>B;联合Fst和πratio两种计算方法对亲缘关系最远的A、E组进行选择信号研究,试验组E共鉴定出379个受选择区域;通过GO、KEGG富集筛选到部分可能与昌都地区藏猪高抗病性(ATM、VCP、NPC1、CA9、PAX5等)、低温低氧适应(CLTA、CA9等)和生长性状(ACVR1、MCEE、TPM2等)相关的差异基因。本研究通过全基因组重测序技术获得了昌都地区5个乡镇藏猪群体的基因组数据及遗传变异信息,发现该地区藏猪群体间存在一定的基因交流,属于同一亚群,并筛选到部分与昌都地区藏猪性能相关的基因。本研究补充了藏猪遗传资源的基础数据,初步揭示了昌都地区藏猪高抗病性、低温低氧适应等种质特性的遗传基础,为该地区藏猪保种、选育工作提供了科学的理论依据,可促进昌都地区藏猪遗传资源的保护和开发利用。

关键词：藏猪全基因组重测序群体遗传结构选择信号

光皮桦AP2/ERF基因家族鉴定与表达分析

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浙江农林大学学报 2022年第6期39卷 1183-1193页

作者：黄奕孜钱旺邱姗王文新黄华宏林二培浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室浙江杭州311300

【目的】深入研究AP2/ERF基因家族在光皮桦Betula luminifera生长发育及环境胁迫响应中的生物学功能。【方法】利用光皮桦基因组数据,通过生物信息学方法开展AP2/ERF基因家族鉴定、基因特征、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元... 详细信息

【目的】深入研究AP2/ERF基因家族在光皮桦Betula luminifera生长发育及环境胁迫响应中的生物学功能。【方法】利用光皮桦基因组数据,通过生物信息学方法开展AP2/ERF基因家族鉴定、基因特征、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白互作和表达分析。【结果】在光皮桦基因组中共鉴定到77个AP2/ERF基因,其编码的蛋白理化性质存在差异,大多数蛋白(60个)的理论等电点小于7.0。系统进化分析显示:这77个AP2/ERF转录因子属于5个亚家族,其中ERF亚家族最大,包含34个成员。光皮桦AP2/ERF各亚家族间的基因结构存在较大差异,其中AP2亚家族成员均具有6~9个内含子,而DREB亚家族基因则没有内含子;但AP2/ERF各亚家族内的不同成员具有相似的保守基序类型和分布。同时,AP2/ERF基因启动子上都存在大量与激素、调节、胁迫响应及生长发育相关的顺式作用元件。此外,互作网络分析预测不同的光皮桦AP2/ERF亚家族蛋白间存在广泛的互作关系。进一步的表达分析显示:绝大多数光皮桦AP2/ERF基因(71个)的表达存在较强组织特异性,且在高温胁迫下,多数ERF或DREB基因的表达发生显著变化,表明ERF和DREB基因在高温胁迫应答中可能发挥着重要作用。【结论】通过生物信息学分析获得光皮桦77个AP2/ERF基因,分属于5个亚家族。不同亚家族基因具有相似的基因结构、保守基序等特征。基因启动子区含激素、胁迫响应等相关的作用元件。基因表达具有较强的组织特异性,且多数ERF或DREB基因对高温胁迫有明显响应。图6表1参39。

关键词：光皮桦 AP2/ERF家族表达模式高温胁迫

脂滴特异性荧光探针的构建及可视化肝肿瘤细胞

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有机化学 2024年第4期44卷 1240-1246页

作者：徐冬青童海姗沈杰邱万伟钱立生安徽科技学院生命与健康科学学院安徽凤阳233100

脂滴(LDs)参与了众多活细胞的代谢过程,其异常与多种疾病如脂肪肝、糖尿病和癌症等高度相关,但是准确阐明各种疾病与脂滴之间的相互关系仍然是一个巨大的挑战,尤其是借助异常分布的LDs实现对肝肿瘤的可视化研究报道较少.因此,本论文以... 详细信息

脂滴(LDs)参与了众多活细胞的代谢过程,其异常与多种疾病如脂肪肝、糖尿病和癌症等高度相关,但是准确阐明各种疾病与脂滴之间的相互关系仍然是一个巨大的挑战,尤其是借助异常分布的LDs实现对肝肿瘤的可视化研究报道较少.因此,本论文以三苯胺为供电子基团,多氰基杂环结构为电子受体,通过简单的两步反应合成了一种具有LDs特异性的荧光探针TCN-Tph.制备的探针分子TCN-Tph与脂滴的共定位成像实验表明,探针TCN-Tph对肝肿瘤细胞具有良好的LDs靶向能力.采用不同细胞株对探针分子TCN-Tph的响应实验结果表明,肝肿瘤细胞对其有很好的响应和摄取能力.不同状态的肝组织切片成像结果进一步表明,制备的探针分子TCN-Tph对正常肝组织和肝肿瘤组织具有良好的区分功能,为实现临床上肝肿瘤的早期预诊提供了实验基础.

关键词：脂滴荧光探针肝肿瘤细胞可视化

OLAP和数据挖掘技术在高校科技管理决策中的应用

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OLAP和数据挖掘技术在高校科技管理决策中的应用

作者：邱怀姗北京化工大学

学位级别：硕士

随着人们认识和管理水平的提高,对客观世界的描述越来越全面,存储的数据量也越来越大,然而,对数据库中数据的开发应用主要是检索查询,效率很低,简单的数据查询或统计虽然可以满足某些低层次的需要,但人们更为需要的是从大量数据资源中... 详细信息

随着人们认识和管理水平的提高,对客观世界的描述越来越全面,存储的数据量也越来越大,然而,对数据库中数据的开发应用主要是检索查询,效率很低,简单的数据查询或统计虽然可以满足某些低层次的需要,但人们更为需要的是从大量数据资源中挖掘出对各类决策有指导意义的一般知识.大量的数据未能充分利用这一现象常常被描述为"数据丰富,但信息贫乏".快速增长的数据如果没有强有力的工具来助,其得出的决策结果只能是基于决策者的直觉而不是数据库中丰富的信息.为此,决策者迫切需要从海量数据中提取有价值知识的工具,OLAP和数据挖掘技术基于此而产生.本文介绍了北京化工大学科技信息管理平台的设计与实现,着重阐述了它的网络结构和安全体系,在 OLTP 的基础上对 OLAP 和数据挖掘方面做了进一步研究探索。首先在历年科技数据基础上构建科技数据仓库,该数据仓库综合了ROLAP 组织数据以及 MOLAP 多维形式存储的优点,利用关系数据库存储细节数据,将基本事实数据和汇总数据以多维形式存储.其次利用 OLAP 引擎建立起关于教师的 OLAP 分析主题,包括:教师基本情况、项目、论文与教学任务等。系统提供了多种表格、图形分析 ii

关键词：数据仓库,OLAP,数据挖掘,MDX,关联规则, FP-Tree 算法

硫酸盐侵蚀下混杂纤维/橡胶混凝土力学性能及微观结构

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复合材料学报 2024年第4期41卷 2055-2064页

作者：刘雨姗庞建勇安徽理工大学土木建筑学院淮南232001

为研究混杂纤维/橡胶混凝土(HF/RC)的抗硫酸盐侵蚀性能,对比分析硫酸盐环境下干湿循环240次内,普通混凝土(NC)和HF/RC的表观现象、质量损失、超声参数、抗压强度损失等性能指标劣化过程,采用SEM及XRD微观表征手段分析硫酸盐/干湿循环前... 详细信息

为研究混杂纤维/橡胶混凝土(HF/RC)的抗硫酸盐侵蚀性能,对比分析硫酸盐环境下干湿循环240次内,普通混凝土(NC)和HF/RC的表观现象、质量损失、超声参数、抗压强度损失等性能指标劣化过程,采用SEM及XRD微观表征手段分析硫酸盐/干湿循环前后试件微观形貌及物相组成。结果表明:随硫酸盐/干湿循环次数增加,NC、HF/RC试件的质量、抗压强度呈先增后减的趋势,超声参数与抗压强度、耐蚀系数具有密切相关性;侵蚀初期SO_(4)^(2−)与胶凝物质反应填充原生孔隙,基体密实度提高。侵蚀过程胶凝材料不断被消耗,基体在硫酸钠反复结晶的物理侵蚀及硫酸盐化学侵蚀的共同作用下出现空隙和孔洞。但橡胶颗粒和混杂纤维可阻断裂缝扩展继而减缓SO_(4)^(2−)扩散,抑制膨胀性产物生成,延缓结晶应力诱发的表层裂纹发育。硫酸盐侵蚀各阶段HF/RC的劣化程度均优于NC,经240次硫酸盐/干湿循环后,NC、HF/RC的耐蚀系数分别为69.00%、78.87%。

关键词：硫酸盐环境橡胶混凝土玄武岩纤维聚乙烯醇纤维干湿循环微观结构

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“智能+教育”相适应的卓越教师培养体系探索

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实验室科学 2022年第4期25卷 212-215,219页

作者：张迪邱姗李兵罗金红华中师范大学国家级生物学虚拟仿真实验教学中心湖北武汉430079 华中师范大学2.湖北省生物学实验教学示范中心湖北武汉430079 华中师范大学生命科学学院湖北武汉430079

实验教学是验证理论知识、培养实验技能、提高学生生物学素养的重要途径。但生物学教学始终存在重理论轻实验、学生实验积极性差等问题。为落实国家卓越教师培养计划、建设一流本科课程,通过深度剖析师范类生物实验教学现存问题,提出与... 详细信息

实验教学是验证理论知识、培养实验技能、提高学生生物学素养的重要途径。但生物学教学始终存在重理论轻实验、学生实验积极性差等问题。为落实国家卓越教师培养计划、建设一流本科课程,通过深度剖析师范类生物实验教学现存问题,提出与智能教育相适应、以师范生为中心、以培养卓越生物教师为目标的实验课程动态培养体系。该体系有助于推进实验教学改革,提高师范生实践动手及实验教学能力,引领师范生科学价值观的建立,为基础教育培养并输送更多符合时代需要的卓越生物教师。

关键词：实验教学动态培养体系卓越教师培养信息化

“新”“旧”文学互动下的“情感学习”——沈祖棻20世纪三四十年代的文学实践

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文艺研究 2024年第08期 94-106页

作者：孙慈姗北京大学中国语言文学系

在现代中国文学的发展过程中，“新”与“旧”两种文学形制及文化心态都深切作用于时代情感的生成。于20世纪三四十年代从事各体裁文学创作的沈祖棻，或可成为观照这一过程的微观个案。以个体成长经历为标尺，沈祖棻创作初始阶段的“情...

在现代中国文学的发展过程中，“新”与“旧”两种文学形制及文化心态都深切作用于时代情感的生成。于20世纪三四十年代从事各体裁文学创作的沈祖棻，或可成为观照这一过程的微观个案。以个体成长经历为标尺，沈祖棻创作初始阶段的“情感学习”主要表现为在文坛与高校环境中对各类文体写作的尝试；随着战争经验对文学实践日益深化的影响，沈祖棻选择动用“旧形式”因应时局，并为一己之情寻找妥帖的安置方式，这在《涉江词》的写作中得到集中体现。在这些词作中，比兴作为一种渊源有自的修辞形态在情感与道统间建构了紧密关联，而程千帆对《涉江词》的笺注又将与“情”构成张力关系的“事”带入古典文体，使其生长出一定的现代性。最终，沈祖棻的文学实践呈现出新旧各种文体与文学要素对时代情感的形塑过程。

关键词：

作为社会情绪的“同情”——郁达夫文学实践的情感主义路径

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中国现代文学研究丛刊 2024年第7期 142-159页

作者：孙慈姗北京大学中文系 100086

在郁达夫的文学观念中,情感始终是文艺活动的动力机制与旨归。郁达夫借鉴心理学理论将情感区分为“情绪”与“情操”两大类型,这其中作为“社会情绪”的“同情”被视为情绪与情操的连通媒介,也是文学情感发挥社会功能的通路。而对同情... 详细信息

在郁达夫的文学观念中,情感始终是文艺活动的动力机制与旨归。郁达夫借鉴心理学理论将情感区分为“情绪”与“情操”两大类型,这其中作为“社会情绪”的“同情”被视为情绪与情操的连通媒介,也是文学情感发挥社会功能的通路。而对同情这一情感要素的表现和分析也在郁达夫的文学实践中占据关键位置,并连带着更为宏观的时代文化议题。具体而言,郁达夫和他的批评者们对于“血泪文学”的识别与批判体现出文学者对同情之感伤倾向的警惕,使得同情成为反思性情感。在此意识下,郁达夫《春风沉醉的晚上》等作品于叙事层面展开的情感分析则从同情发生学的角度对这类情感的特性及其与文学语言的内在关系进行了更为细致的分梳。这样的情感分析也影响了郁达夫在时代巨变中对自身文学方向的调整。在革命文学的潮流下,郁达夫以“人化的自然”为形式要素,通过人与自然的关联结构将同情转化为一种“审美的情操”,并以这种文学情感为基底塑造出自身独特的文学路径。

关键词：郁达夫同情青感伤《春风沉醉的晚上》审美情操

“向生活学习”:沙汀“三记”中的杂语性与自然性问题

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文学评论 2024年第3期 78-86页

作者：孙慈姗北京大学中文系

沙汀创作于1941-1946年间的长篇小说《淘金记》《困兽记》《还乡记》聚焦于战时四川乡镇空间的社会样貌与生活历史,在观照对象与写作手法的不断调试中呈现出“生活”的多种面向,与作家1944年写作的短文《向生活学习》互为参照,可以勾勒... 详细信息

沙汀创作于1941-1946年间的长篇小说《淘金记》《困兽记》《还乡记》聚焦于战时四川乡镇空间的社会样貌与生活历史,在观照对象与写作手法的不断调试中呈现出“生活”的多种面向,与作家1944年写作的短文《向生活学习》互为参照,可以勾勒出沙汀文学实践的一条重要线索。作为一个整体,“三记”中由人物对话及人物语言与叙事话语的关系构成的“杂语”可被视作小说的基本诗学要素,体现出文学对各种社会方言的加工组织过程以及对生活的对象化处理。而从历时性角度看,三部小说杂语形态的变化也意味着作家在时势体认下对文学观念与创作方法的调整。除去对社会生活的观照,自然空间及自然性因素的引入也为文本制造了更为丰富的意义取向,它们最终共同通向了作家在相应历史阶段对“生活”的理解和感知,并昭示了文学与生活互动的可能性。

关键词：沙汀 “三记” 杂语叙事自然向生活学习