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特克赛尔羊×阿勒泰羊F_(2)绵羊肉质嫩度全基因组关联分析

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家畜生态学报 2024年第4期45卷 22-26页

作者：赵义龙黄金凤贺三刚刘明军新疆农业职业技术学院动物科技分院新疆昌吉831100 昌吉市华牧动物门诊新疆昌吉831100 新疆畜牧科学院生物技术研究所/农业农村部草食家畜遗传育种与繁殖重点实验室/新疆动物生物技术重点实验室新疆乌鲁木齐830000

为了定位影响绵羊嫩度相关SNP位点及其重要候选基因,该研究选取462只特克赛尔羊×阿勒泰羊F_(2)绵羊,其中公羔229只、母羔233只,所有试验羊均在统一条件下饲养至8月龄后进行屠宰,利用C-LM4嫩度仪对嫩度进行测定,利用Illumina绵羊高密度(... 详细信息

为了定位影响绵羊嫩度相关SNP位点及其重要候选基因,该研究选取462只特克赛尔羊×阿勒泰羊F_(2)绵羊,其中公羔229只、母羔233只,所有试验羊均在统一条件下饲养至8月龄后进行屠宰,利用C-LM4嫩度仪对嫩度进行测定,利用Illumina绵羊高密度(600K)SNP芯片进行基因分型,使用GEMMA软件的MLM模型对嫩度性状进行全基因组关联分析。结果表明,经质控后,剩余613178个SNPs位点用于全基因组关联分析,发现9个潜在SNPs位点与嫩度相关,分别分布在2、6、23、24号染色体上。根据基因生物学功能及相关研究文献,推测EREG、AREG、PDE1A基因参与肌肉再生、肌纤维形成等生物学过程,可作为影响嫩度的重要候选基因。研究结果可为利用分子生物学方法改良绵羊肌肉嫩度提供科学依据。

关键词：嫩度特克赛尔羊×阿勒泰羊 F_(2) 候选基因全基因组关联分析 SNP

不同基因编辑类型对FGF5基因编辑羊羊毛性状的影响

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新疆农业科学 2024年第3期61卷 734-741页

作者：岳成广李忠慧刘晨曦贺三刚马海叶刘璇李婧平李文蓉新疆畜牧科学院生物技术研究所乌鲁木齐830011 新疆维吾尔自治区动物生物技术重点实验室乌鲁木齐830011 新疆农业大学动物科学学院乌鲁木齐830052

【目的】分析不同基因编辑类型对成纤维生长因子5(FGF5)基因编辑细毛羊羊毛性状的影响,为开展基因编辑细毛羊的羊毛性状遗传参数评估提供理论依据。【方法】收集181只FGF5周岁基因羊,分析编辑细毛羊羊毛自然长度、伸直长度、羊毛纤维直... 详细信息

【目的】分析不同基因编辑类型对成纤维生长因子5(FGF5)基因编辑细毛羊羊毛性状的影响,为开展基因编辑细毛羊的羊毛性状遗传参数评估提供理论依据。【方法】收集181只FGF5周岁基因羊,分析编辑细毛羊羊毛自然长度、伸直长度、羊毛纤维直径和剪毛量等性状的数据。【结果】FGF5基因编辑细毛羊羊毛自然长度平均值为10.49 cm,变异系数为11.82%。FGF5-InDel和FGF5-HDR基因编辑细毛羊羊毛自然长度和剪毛量均极显著高于野生型(PT)的羊毛自然长度和伸直长度均极显著长于wt(P<0.01),-28 bp或-26 bp的剪毛量显著高于wt(P<0.05)。-28 bp基因型的双等位基因编辑和单等位基因编辑突变的羊毛自然长度和伸直长度均极显著长于野生型(P<0.01)。【结论】不同基因编辑类型的FGF5基因编辑细毛羊均可显著提高羊毛自然长度和剪毛量,可利用表型性状突出的后代组建核心编辑羊群体,促进FGF5基因编辑细毛羊选育扩繁。

关键词： FGF5基因编辑细毛羊编辑类型羊毛自然长度剪毛量基因型突变类型

不同因素对特哈杂交绵羊消化道线虫感染情况的影响

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中国畜牧兽医 2024年第7期51卷 3067-3076页

作者：王钰琪贺三刚梁龙海拉提·卡斯木焦文静岳晨冰韩冰宋雪彬阎晓菲新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052 新疆畜牧科学院生物技术研究所农业农村部草食家畜遗传育种与繁殖重点实验室新疆动物生物技术重点实验室乌鲁木齐830011 新疆农业大学动物科学学院乌鲁木齐830052 新疆维吾尔自治区地方国营伊犁种马场哈萨克羊种羊场昭苏835612 新疆农业大学生命科学学院新疆极端环境生物生态适应与进化重点实验室乌鲁木齐830052

【目的】研究季节、性别、组别和群别对特克塞尔和哈萨克(以下简称特哈)杂交绵羊中消化道线虫(gastrointestinal nematodes,GIN)感染强度、体重、红细胞比容和特异性抗体免疫球蛋白G(immunoglobulin G,IgG)含量的影响,为绵羊消化道线虫... 详细信息

【目的】研究季节、性别、组别和群别对特克塞尔和哈萨克(以下简称特哈)杂交绵羊中消化道线虫(gastrointestinal nematodes,GIN)感染强度、体重、红细胞比容和特异性抗体免疫球蛋白G(immunoglobulin G,IgG)含量的影响,为绵羊消化道线虫的防治和抗消化道线虫育种等方面的研究提供参考依据。【方法】采集特哈杂交绵羊直肠粪便及颈静脉血液,称量体重。用饱和盐水漂浮法对消化道线虫虫卵进行定性检测,运用改良的McMaster法进行消化道线虫虫卵计数,计算感染率和感染强度;使用兽用全自动血液细胞分析仪对血液进行红细胞比容检测;制备线虫L3期幼虫体细胞抗原,运用间接ELISA法测定绵羊血清中特异性抗体IgG含量。【结果】特哈杂交绵羊消化道线虫感染率较高,为94.44%,呈中度感染,鉴定出毛圆属线虫(Trichostrongylus spp.)、捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)、奥斯特属线虫(Ostertagia spp.)、羊仰口线虫(Bumastomum trigonocephalum)、夏伯特属线虫(Chabertia spp.)、马歇尔属线虫(Marshallagia spp.)、细项属线虫(Nematodirus spp.)、食道口属线虫(Oesophagostomum spp.)和球鞘毛首线虫(Trichuris globuulosa)共9种消化道线虫。季节对绵羊消化道线虫感染强度和体重有显著影响(P0.05)。【结论】季节、性别、组别和群别对绵羊消化道线虫感染情况存在影响,可根据因素对感染情况的影响和各因素不同水平之间的差异对绵羊选择不同的防治措施,为抗消化道线虫育种策略提供理论依据。

关键词：特哈杂交绵羊消化道线虫感染率感染强度

特克赛尔羊×阿勒泰羊F2代部分肉质性状的全基因组关联分析

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中国畜牧杂志 2023年第6期59卷 161-166,171页

作者：赵义龙贺三刚黄金凤刘明军石河子大学动物科技学院新疆石河子832000 新疆农业职业技术学院动物科技分院新疆昌吉831100 新疆畜牧科学院生物技术研究所农业农村部草食家畜遗传育种与繁殖重点实验室新疆动物生物技术重点实验室新疆乌鲁木齐830000 昌吉市华牧动物诊所新疆昌吉831100

本研究测定了462只特克赛尔羊×阿勒泰羊杂交F2代羊背最长肌的肉质性状,利用全基因组关联分析(GWAS)方法初步筛选肉质性状(熟肉率、失水率)的候选基因,并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明,以上肉质性状群体层化分析没... 详细信息

本研究测定了462只特克赛尔羊×阿勒泰羊杂交F2代羊背最长肌的肉质性状,利用全基因组关联分析(GWAS)方法初步筛选肉质性状(熟肉率、失水率)的候选基因,并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明,以上肉质性状群体层化分析没有发现明显的整体系统偏差,也不存在明显群体层化效应。关联分析结果表明共有16个SNP位点达到基因组显著水平,其中与熟肉率显著相关的位点8个,与失水率显著相关的位点8个。根据基因注释和文献检索结果,推测DOCK4、AOAH和CREB5基因可作为影响绵羊熟肉率的候选基因,所筛选出的候选基因主要通过调控肌纤维类型、参与肌肉生长过程等途径影响熟肉率;推测PRKCE和PRKG1基因可作为影响绵羊失水率的候选基因,筛选出的候选基因主要通过调控细胞分化、肌肉收缩、脂肪生成及参与肌动蛋白细胞骨架等作用而影响失水率。本研究结果将为改良绵羊肉质嫩度、多汁性提供候选分子标记,为地方品种绵羊标记辅助选择提供新的思路。

关键词：全基因组关联分析肉质性状熟肉率失水率

特克赛尔羊×阿勒泰羊F代部分肉质性状的全基因组关联分析

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中国畜牧杂志 2023年

作者：赵义龙贺三刚黄金凤刘明军新疆畜牧科学院生物技术研究所/农业农村部草食家畜遗传育种与繁殖重点实验室/新疆动物生物技术重点实验室昌吉市华牧动物诊所石河子大学动物科技学院新疆农业职业技术学院动物科技分院

本研究测定了462只特克赛尔羊×阿勒泰羊杂交F2代羊背最长肌的肉质性状，利用全基因组关联分析(GWAS)方法初步筛选肉质性状(熟肉率、失水率)的候选基因，并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明，以上肉质性状群体层化分析... 详细信息

本研究测定了462只特克赛尔羊×阿勒泰羊杂交F2代羊背最长肌的肉质性状，利用全基因组关联分析(GWAS)方法初步筛选肉质性状(熟肉率、失水率)的候选基因，并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明，以上肉质性状群体层化分析没有发现明显的整体系统偏差，也不存在明显群体层化效应。关联分析结果表明共有16个SNP位点达到基因组显著水平，其中与熟肉率显著相关的位点8个，与失水率显著相关的位点8个。根据基因注释和文献检索结果，推测DOCK4、AOAH和CREB5基因可作为影响绵羊熟肉率的候选基因，所筛选出的候选基因主要通过调控肌纤维类型、参与肌肉生长过程等途径影响熟肉率；推测PRKCE和PRKG1基因可作为影响绵羊熟肉率的候选基因，筛选出的候选基因主要通过调控细胞分化、肌肉收缩、脂肪生成及参与肌动蛋白细胞骨架等作用而影响失水率。本研究结果将为改良绵羊肉质嫩度、多汁性提供候选分子标记，为地方品种绵羊标记辅助选择提供新的思路。

关键词：全基因组关联分析肉质性状熟肉率失水率

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数字图像法测定绵羊眼肌面积的应用研究

黑龙江畜牧兽医 2022年第18期 52-55页

作者：张志峰贺三刚孙亚伟南阳师范学院生命科学与农业工程学院河南南阳473061 新疆畜牧科学院生物技术研究所河南南阳473061

为了建立一种快速、准确的绵羊眼肌面积测定方法,试验以102只8月龄特克塞尔羊×阿勒泰羊的横交F2代为研究对象,将其眼肌横断面轮廓描绘在硫酸纸上,以求积仪法作为对照组,公式法(采用0.70,0.73,0.79三个系数,即公式法1、公式法2、公式法3... 详细信息

为了建立一种快速、准确的绵羊眼肌面积测定方法,试验以102只8月龄特克塞尔羊×阿勒泰羊的横交F2代为研究对象,将其眼肌横断面轮廓描绘在硫酸纸上,以求积仪法作为对照组,公式法(采用0.70,0.73,0.79三个系数,即公式法1、公式法2、公式法3)、称重法及本试验所建的数字图像法为处理组,将各组眼肌面积的平均值和组间差值绝对值的平均值进行比较,并将上述眼肌面积测定方法进行相关性分析。结果表明:处理组中公式法3、称重法和数字图像法测定的眼肌面积与对照组差异不显著(P>0.05),而公式法1和公式法2极显著低于对照组(P公式法2>公式法3>称重法>数字图像法。公式法、称重法、数字图像法测定的眼肌面积与求积仪法均极显著相关(P称重法>公式法。说明数字图像法是一种简单、快速、准确、可靠的绵羊眼肌面积测定方法。

关键词：眼肌面积绵羊测定方法数字图像法求积仪法称重法公式法

哈萨克羊与特克赛尔羊不同杂交组合羔羊背膘厚度和眼肌面积等肉用性状的比较分析

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中国畜牧杂志 2023年第10期59卷 157-165页

作者：何鹏飞梁龙巴音花贺鑫李佳莹贺三刚李文蓉新疆畜牧科学院生物技术研究所新疆乌鲁木齐830026 新疆农业大学动物科学学院新疆乌鲁木齐830052

本研究旨在通过比较哈萨克羊与特克赛尔羊不同杂交组合后代羔羊肉用性状,筛选出早期产肉性能好、增重显著的杂交组合,为确定最优横交固定模式、加快哈萨克羊肉用新类型培育提供理论依据。选用以纯种特克赛尔羊为父本、哈萨克羊为母本杂... 详细信息

本研究旨在通过比较哈萨克羊与特克赛尔羊不同杂交组合后代羔羊肉用性状,筛选出早期产肉性能好、增重显著的杂交组合,为确定最优横交固定模式、加快哈萨克羊肉用新类型培育提供理论依据。选用以纯种特克赛尔羊为父本、哈萨克羊为母本杂交获得的4种杂交组合(级进特哈F2×哈萨克羊、级进特哈F2×特哈F1、特哈F1×级进特哈F2和纯种特克赛尔羊×特哈F1)后代为研究对象,利用B超测定了4个杂交组合762只6月龄羔羊的背膘厚度、眼肌深度及眼肌面积,比较了4个杂交组合羔羊上述性状的差异;分析羔羊上述性状与体重之间的相关性,建立了体重与各肉用性状间的趋势方程;利用Gompertz模型,对4个杂交组合羔羊日龄在100 d、150 d、180 d、210 d 4个生长阶段的体重进行校正,将同一日龄的体重分别代入预测方程对背膘厚度等3个肉用性状进行预测。在日龄100 d时,F2×F1组合羔羊具有背膘厚度较薄且眼肌深度和眼肌面积较大的特点,为最优组合。在日龄150 d后最优杂交组合公羔为纯特×F1,母羔为F2×F1组合。出栏体重在45kg之前,F2×F1组合羔羊肉用性状较优,出栏体重在45 kg之后,纯特×F1组合羔羊肉用性状较优。本研究对哈萨克羊与特克赛尔羊杂交后代的选育和生产提供了重要依据。

关键词： 6月龄羔羊背膘厚眼肌深度眼肌面积 B超活体测定

哈萨克羊不同杂交组合羔羊背膘厚度和眼肌面积等肉用性状的比较分析

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中国畜牧杂志 2023年

作者：何鹏飞梁龙巴音花贺鑫李佳莹贺三刚李文蓉新疆畜牧科学院生物技术研究所新疆农业大学动物科学学院

本研究旨在通过比较哈萨克羊与特克赛尔羊不同杂交组合后代羔羊肉用性状，筛选出早期产肉性能好、增重显著的杂交组合，为确定最优横交固定模式、加快哈萨克羊肉用新类型培育提供理论依据。选用以纯种特克赛尔羊为父本、哈萨克羊为母本... 详细信息

本研究旨在通过比较哈萨克羊与特克赛尔羊不同杂交组合后代羔羊肉用性状，筛选出早期产肉性能好、增重显著的杂交组合，为确定最优横交固定模式、加快哈萨克羊肉用新类型培育提供理论依据。选用以纯种特克赛尔羊为父本、哈萨克羊为母本杂交获得的4种杂交组合(即级进特哈F2×哈萨克羊、级进特哈F2×特哈F1、特哈F1×级进特哈F2和纯种特克赛尔羊×特哈F1)后代为研究对象，利用B超测定了4个杂交组合762只6月龄羔羊的背膘厚度、眼肌深度及眼肌面积，比较了4个杂交组合羔羊上述性状的差异；分析羔羊上述性状与体重之间的相关性，建立了体重与各肉用性状间的趋势方程；利用Gompertz模型，对4个杂交组合羔羊日龄在100 d、150 d、180 d、210 d 4个生长阶段的体重进行校正，将同一日龄的体重分别代入预测方程对背膘厚度等3个肉用性状进行预测。在日龄100 d时，F2×F1组合羔羊具有背膘厚度较薄且眼肌深度和眼肌面积较大的特点，为最优组合。在日龄150 d后最优杂交组合公羔为纯特×F1，母羔为F2×F1组合。出栏体重在45 kg之前，F2×F1组合羔羊肉用性状较优，出栏体重在45 kg之后，纯特×F1组合羔羊肉用性状较优。本研究对哈萨克羊与特克赛尔羊杂交后代的选育和生产提供了重要依据。

关键词： 6月龄羔羊背膘厚眼肌深度眼肌面积 B超活体测定

特克塞尔与哈萨克羊杂交F_(2)代胴体性状的多元分析

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中国畜牧杂志 2022年第1期58卷 123-128页

作者：蒋芳芳贺三刚刘金瑞李文蓉刘武军新疆农业大学动物科学学院新疆乌鲁木齐830052 新疆畜牧科学院生物技术研究所农业部草食家畜遗传育种与繁殖重点实验室新疆动物生物技术重点实验室新疆乌鲁木齐830011

实验旨在研究特克塞尔×哈萨克羊杂交F_(2)代的尾部脂肪大小对胴体性状的影响。选用体况良好的520只8月龄羔羊,运用SPSS与R语言对羔羊的表型数据进行主成分与聚类分析,研究尾部脂肪的分化情况,并对杂交F_(2)代各类型尾脂羊屠宰前体重、... 详细信息

实验旨在研究特克塞尔×哈萨克羊杂交F_(2)代的尾部脂肪大小对胴体性状的影响。选用体况良好的520只8月龄羔羊,运用SPSS与R语言对羔羊的表型数据进行主成分与聚类分析,研究尾部脂肪的分化情况,并对杂交F_(2)代各类型尾脂羊屠宰前体重、胴体重、断奶重及脂肪沉积性状进行差异比较分析。结果发现,主成分分析中41个表型值提取到9个主成分,累计贡献率达到87.694%,屠宰前体重、胴体重、断奶重与5个脂肪表型性状的特征值较高;聚类分析结果可将杂交F_(2)代分为A型、B型、C型和D型4个类型;D型的屠宰前体重、断奶重与A型屠宰前体重、断奶重差异不显著,C型背膘厚极显著高于A型,B型的屠宰前体重、胴体重、断奶重极显著高于A型、C型和D型。B型、C型和D型间背膘厚差异不显著。综上,杂交F_(2)代的尾部脂肪发生性状分离,屠宰前体重随着尾部脂肪的增加而下降,结合特克塞尔与哈萨克羊的体型外貌特征,C型和D型更趋近于哈萨克羊,B型则更趋近于特克塞尔羊。

关键词：特克塞尔羊哈萨克羊胴体性状主成分分析 K-means聚类分析