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基于生物信息学技术探讨MAP2K3作为胶质瘤预后标志物的研究

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基于生物信息学技术探讨MAP2K3作为胶质瘤预后标志物的研究

作者：张铎瀚吉林大学

学位级别：硕士

研究背景:胶质瘤是颅内中枢神经系统中最常见的恶性肿瘤类型,其发病率占据所有脑肿瘤和中枢神经系统肿瘤的30%,在恶性脑肿瘤中的占比高达80%。由于胶质瘤的种类繁多且复杂,当前的研究中仍缺乏能够有效、精确预测患者预后结局的分子标志... 详细信息

研究背景:胶质瘤是颅内中枢神经系统中最常见的恶性肿瘤类型,其发病率占据所有脑肿瘤和中枢神经系统肿瘤的30%,在恶性脑肿瘤中的占比高达80%。由于胶质瘤的种类繁多且复杂,当前的研究中仍缺乏能够有效、精确预测患者预后结局的分子标志物,这在一定程度上限制了胶质瘤的精准治疗与预后评估。丝裂原活化蛋白激酶3(Mitogen-activated protein kinase kinase 3,MKK3,MAP2K3)被认为是细胞应激、炎症反应以及凋亡过程中的核心分子。研究发现,MAP2K3在肺癌、胰腺癌、食管癌及结直肠癌等多种癌症中均表现出表达上调的趋势,这进一步凸显了其在肿瘤发生发展中的潜在作用。然而,MAP2K3在胶质瘤中所扮演的角色仍不明确,尚需深入研究。故本研究计划采用生物信息学分析和免疫组化技术,探究MAP2K3与胶质瘤之间的关联,以期推测MAP2K3在胶质瘤发生和发展过程中发挥的作用。方法:本研究从加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)数据库下载了经统一标准化的癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)的样本数据,并将其作为研究的主要数据集。同时,还从中国脑胶质瘤基因组图谱计划(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)中获取了样本数据,用作本研究的验证数据集,以确保研究结果的准确性和可靠性。应用R软件包ggpubr(版本0.6.0)统计并删除明显偏倚数据后,删除重复及缺失的数据。分别应用Wilcoxon符号秩检验进行差异显著性分析,应用R软件包survival(版本3.2-7)及p ROC(版本1.***.0.1)进行预后分析,应用Kruskal-Wallis单因子方差分析进行临床相关性分析,应用R软件包***(版本3.1.0)及cluster Profiler(版本3.14.3)进行基因富集分析,应用R软件包IOBR(版本0.99.9)的Timer方法进行免疫浸润评分,应用Spearman相关分析进行MAP2K3与RNA修饰相关基因的相关性分析,最后通过免疫组化染色实验对上述结果进行实验验证。结果:MAP2K3基因在胶质瘤中的表达量高于正常脑组织,胶质瘤的恶性程度与MAP2K3的表达量呈现正相关趋势,即随着胶质瘤恶性程度的增加,MAP2K3的表达量也相应增加。此外,MAP2K3展现出成为区分正常脑组织、LGG和GBM的新型生物标志物的潜力。预后分析表明,随着MAP2K3的表达量增加,胶质瘤患者预后变差,MAP2K3基因可以被用来独立预测患者总生存期(overall survival,OS)及无进展生存期(progression-free survival,PFS)。基因富集分析结果显示,MAP2K3及其相关基因显著的富集在了胞外结构域等相关信号通路上,这表明MAP2K3可能通过改变胶质瘤细胞的胞外结构域来影响胶质瘤细胞的免疫反应过程。MAP2K3与RNA修饰相关基因的相关性分析结果显示,MAP2K3与多个RNA修饰相关基因存在显著相关性,这表示MAP2K3在胶质瘤中可能通过改变胶质瘤DNA甲基化进而影响胶质瘤耐药性。免疫组化染色结果与临床相关性分析结果展现出一致性,更高组织学分级和更高WHO分级的胶质瘤MAP2K3表达量更高。结论:***2K3在胶质瘤中的表达高于正常脑组织,并且其表达量的增加与胶质瘤的恶性程度及WHO等级呈正相关趋势,导致患者预后变差。MAP2K3的表达水平与胶质瘤的免疫浸润和RNA修饰程度存在显著相关性。***2K3的表达量对胶质瘤具有较强的诊断价值和预测预后价值,具有作为新的胶质瘤的分子生物标志物的潜力,能够为临床胶质瘤的诊断提供新的参考指标。

关键词：胶质瘤 MAP2K3 生物信息学技术预后生物标志物

不同倾斜方式对倾斜液化场地地震响应的影响分析

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岩土工程学报 2024年第4期46卷 728-736页

作者：张小玲赵显辉许成顺贾科敏北京工业大学建筑工程学院北京100124 北京工业大学城市与工程安全减灾教育部重点实验室北京100124

在倾斜场地地震液化后,土体的侧向流动扩展引起的场地失效以及大变形问题的研究中,不同的倾斜方式会对试验结果产生一定的影响,而目前针对不同倾斜方式对倾斜液化场地土体地震动力响应影响评价的研究成果还较为少见。根据课题组开展的... 详细信息

在倾斜场地地震液化后,土体的侧向流动扩展引起的场地失效以及大变形问题的研究中,不同的倾斜方式会对试验结果产生一定的影响,而目前针对不同倾斜方式对倾斜液化场地土体地震动力响应影响评价的研究成果还较为少见。根据课题组开展的水平液化自由场振动台试验,首先基于OpenSees有限元平台建立了水平液化自由场有限元计算模型,在数值模型中考虑了模型箱对场地土地震响应的影响,通过对比数值计算结果与试验结果验证了数值模型的可靠性。在此基础上建立了倾斜液化自由场有限元计算模型,分别建立了层剪箱整体倾斜模型、层剪箱场地土倾斜模型和刚性箱场地土倾斜3种不同的数值模型来模拟振动台试验中采用的不同的倾斜方式。通过对比,分析了在0.3g汶川地震卧龙波作用下3个数值模型计算得到的自由场土体动力响应结果,并讨论了3种不同的倾斜方式对计算结果的影响,最后给出了针对倾斜液化场地地震动力响应数值模拟和振动台试验研究中的一些有参考价值的结论。

关键词：倾斜方式倾斜液化场地层剪箱模型刚性箱模型

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基于云的条件广播代理重加密方案

计算机应用 2024年

作者：李滨瀚邓伦治刘欢贵州师范大学数学科学学院

针对代理重加密方案中普遍存在的云服务器滥用权限问题，以及现有条件代理重加密方案在多接收者、安全性和计算成本上的局限，提出了一个基于证书的条件广播代理重加密方案。数据拥有者生成可转换密文和重加密密钥时设置一个访问条件，... 详细信息

针对代理重加密方案中普遍存在的云服务器滥用权限问题，以及现有条件代理重加密方案在多接收者、安全性和计算成本上的局限，提出了一个基于证书的条件广播代理重加密方案。数据拥有者生成可转换密文和重加密密钥时设置一个访问条件，云服务器仅在条件匹配时才能生成有效的重加密密文，从而防止云服务器滥用权限，向未授权用户提供重加密密文。方案的安全性规约为判定性迪菲赫尔曼问题，并在随机预言模型下证明了密文具有不可区分性。实验结果表明，当接收者数量取50时，与基于身份的广播代理重加密(Identity-Based Broadcast Proxy Re-Encryption, IB-BPRE)方案、隐私保护代理重加密(Privacy-PreservingProxyRe-Encryption,PP-PRE)方案、可撤销的基于身份的广播代理重加密(RevocableIdentity-Based BroadcastProxyRe-Encryption,RIB-BPRE)方案和多通道的广播代理重加密(Multi-ChannelBroadcastProxyRe-Encryption,MC-BPRE)方案这四个对比方案相比，所提方案的计算时间分别缩短了73%、83%、87%、92%，通信数量分别减少了66%、90%、77%、66%，有效提升了方案的效率，具有更好的应用前景。

关键词：云计算条件代理重加密基于证书加密广播加密随机预言模型

南江县畜禽饲料价格“保险+期货+银行”案例研究

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南江县畜禽饲料价格“保险+期货+银行”案例研究

作者：柯迪瀚山西财经大学

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CFRP及EWSS复合加固震损双层高架桥框架式桥墩恢复力模型研究

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工程力学 2024年第5期41卷 55-67页

作者：许成祥吴永昂胡序辉肖良丽武汉科技大学城市建设学院湖北武汉430065 武汉科技大学高性能工程结构研究院湖北武汉430065 中建五局土木工程有限公司湖南长沙410004

为研究碳纤维布(Carbon Fiber Reinforced Polymer,CFRP)及外包型钢(Externally Wrapped Steel Section,EWSS)复合加固震损双层高架桥框架式桥墩的恢复力模型,对1榀原型对比试件、1榀无预损加固试件和2榀遭受不同地震损伤加固试件进行... 详细信息

为研究碳纤维布(Carbon Fiber Reinforced Polymer,CFRP)及外包型钢(Externally Wrapped Steel Section,EWSS)复合加固震损双层高架桥框架式桥墩的恢复力模型,对1榀原型对比试件、1榀无预损加固试件和2榀遭受不同地震损伤加固试件进行了低周往复加载破坏试验,获取了滞回曲线并提取骨架曲线,分析其滞回特性,提出一种弹性段和强化段为双折线、下降段为指数函数且考虑初始损伤的骨架曲线模型;采用试验数据回归拟合方法,定量描述了试件滞回曲线卸载刚度的退化规律,考虑了同级加载承载力退化和定点指向特征,建立了恢复力模型。研究结果表明:复合加固试件滞回曲线捏缩现象明显,呈倒S型,各滞回环分别相交于骨架曲线上正向、负向荷载为屈服荷载0.25倍的点,峰值荷载后EWSS产生包辛格效应;所提出的骨架曲线模型对中度震损和重度震损加固试件下降段指数函数的参数k建议取值分别为3.6和3.4;所建立的骨架曲线模型和恢复力模型计算结果与试验实测结果吻合较好,可为该类结构弹塑性地震反应分析提供依据。

关键词：双层框架式桥墩地震损伤碳纤维布及外包型钢复合加固滞回特性恢复力模型

不同砧木粗度嫁接对平欧杂种榛树生长及光合特性的影响

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林业科技通讯 2024年

作者：王克瀚卢立媛杨伟聪王丽伟杨琛琛赵亮许成林张悦辽宁省经济林研究所凌海市林业草原保护中心辽宁省实验林场

平欧杂种榛（Corylus heterophylla×avellana)作为具有高经济价值的栽培种，其嫁接效果受到砧木粗度的显著影响，并且缺乏较为系统的研究。本研究选用砧木品种为‘达维’，接穗品种为‘先达1号’，通过对嫁接枝条生长量调查和光合的测... 详细信息

平欧杂种榛（Corylus heterophylla×avellana)作为具有高经济价值的栽培种，其嫁接效果受到砧木粗度的显著影响，并且缺乏较为系统的研究。本研究选用砧木品种为‘达维’，接穗品种为‘先达1号’，通过对嫁接枝条生长量调查和光合的测定，旨在探讨平欧杂种榛树在不同砧木粗度下的嫁接效果。结果表明：砧木粗度与嫁接榛树的光合能力及光能利用效率呈正相关关系，但过粗的砧木会降低嫁接成活率。具体而言，3 cm砧木粗度在嫁接成活率、分枝数量、净光合速率、蒸腾速率及水分利用效率等方面均表现出最优的综合效果，表明选择3 cm砧木粗度对于提高嫁接成功率和促进榛树生长具有重要意义。试验结果为榛树低产低效林的嫁接改造提供了科学依据。

关键词：平欧杂种榛 Corylus heterophylla×avellana 砧木粗度生长特性光合影响

中国碳市场建设的经验、成效、挑战与政策思考

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国际经济评论 2024年第3期 108-128,6,7页

作者：齐绍洲程师瀚武汉大学经济与管理学院武汉大学欧洲问题研究中心武汉大学气候变化与能源经济研究中心

碳市场是中国控制温室气体排放、落实碳达峰碳中和目标的重要政策工具。十余年的试点碳市场建设取得了一定的积极成效,也为全国碳市场的发展积累了丰富的经验。本文首先从法律法规保障、行业覆盖范围、配额分配方法、金融产品创新、数... 详细信息

碳市场是中国控制温室气体排放、落实碳达峰碳中和目标的重要政策工具。十余年的试点碳市场建设取得了一定的积极成效,也为全国碳市场的发展积累了丰富的经验。本文首先从法律法规保障、行业覆盖范围、配额分配方法、金融产品创新、数据监测报告和核查、能力建设活动六个方面总结了中国试点碳市场的建设经验。其次参照欧盟碳市场评估指南,以效果、效率、一致性为原则,构建了三级多维评估指标体系,对中国试点碳市场及碳配额分配方法进行了系统的后评估。最后结合中国试点和全球其他碳市场建设的经验和教训,从覆盖范围、总量设定、配额分配、交易体系、价格机制、数据质量、能力建设、与其他政策协同八个方面分析了全国碳市场面临的挑战,并以问题为导向,提出了相应的政策思考。本文可以为中国更好地利用碳市场降低全社会减排成本、推动低碳技术创新、促进基于能源转型的产业低碳转型提供翔实的政策参考。

关键词：碳中和碳市场建设经验成效评估政策思考

地震动持时对双层高架桥框架式桥墩抗震性能评价的影响

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地震工程学报 2024年

作者：许成祥吴双玙吴永昂朱红兵武汉科技大学城市建设学院武汉科技大学高性能工程结构研究院

为研究地震动持时对双层高架桥框架式桥墩抗震性能评价的影响,基于双层框架式桥墩的拟静力试验,借助OpenSees有限元软件建立数值模型,将模拟结果与试验结果进行对比,两者吻合较好。选取两组具有长、短持时特性的地震动记录,通过增量动... 详细信息

为研究地震动持时对双层高架桥框架式桥墩抗震性能评价的影响,基于双层框架式桥墩的拟静力试验,借助OpenSees有限元软件建立数值模型,将模拟结果与试验结果进行对比,两者吻合较好。选取两组具有长、短持时特性的地震动记录,通过增量动力分析(IDA)建立峰值地面加速度(PGA)与位移延性比u的关系,得到易损性曲线。长持时地震动作用下PGA中位值为0.35g、0.55g、0.78g、0.98g;短持时地震动作用下PGA中位值为0.35g、0.59g、0.91g、1.20g。随着损伤程度的加大,双层框架式桥墩易损性曲线的差异区间也随着PGA的增大而增大。9度(0.40g)罕遇地震时,长、短持时地震动作用下双层框架式桥墩发生严重损伤和完全破坏的概率分别为25.57%、8.61%和16.98%、4.79%。说明当PGA较大时,双层框架式桥墩在长持时地震动作用下更容易受到损伤。

关键词：地震动持时框架式桥墩抗震性能增量动力分析易损性曲线

基于声发射-数字图像相关技术的泡沫混凝土冻融破坏特征及损伤演化规律

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复合材料学报 2024年

作者：牛瀚仪陈波袁志颖河海大学水利水电学院河海大学水灾害防御全国重点实验室南京水利科学研究院中国电建集团中南勘测设计研究院有限公司

为研究冻融环境下泡沫混凝土压缩破坏特征及损伤演化规律，对密度为800 kg/m3的泡沫混凝土开展了单轴压缩-声发射（AE）-数字图像相关（DIC）技术联合测试试验，获取了泡沫混凝土加载过程中的应变演化云图以及声发射参数变化特征。结果... 详细信息

为研究冻融环境下泡沫混凝土压缩破坏特征及损伤演化规律，对密度为800 kg/m3的泡沫混凝土开展了单轴压缩-声发射（AE）-数字图像相关（DIC）技术联合测试试验，获取了泡沫混凝土加载过程中的应变演化云图以及声发射参数变化特征。结果表明：泡沫混凝土的压缩破坏过程曲线呈现明显的阶段效应，且试件经历的冻融循环次数越多，延性破坏特征越明显；随着冻融循环次数的增加，DIC监测到试件应变集中带面积逐渐递增，应变场均值逐渐下降，同时，试件表面裂缝的形态由最初的垂直型单一裂缝向倾斜的剪切型多裂缝演变；冻融为0、20、40、60和80次的泡沫混凝土试件最终破坏时剪切裂缝所占比例分别为52.5%、57.8%、59.2%、65.3%和69.2%，声发射b值下降阶段分别出现在加载进程的92.3%、89.1%、88.5%、76.5%和72.3%；冻融环境可以促进泡沫混凝土由拉伸破坏向剪切破坏的转变，加剧泡沫混凝土内部损伤，从而在材料内部诱发大尺度破裂现象；AE和DIC的结果相辅相成，它们的结合有助于全面了解泡沫混凝土中微裂缝的发展规律和损伤破坏机制。

关键词：冻融循环声发射数字图像相关技术损伤演化裂缝