检索结果-南通市图书馆

4种鲷科鱼类的线粒体细胞色素b基因序列及分子系统学分析

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中国水产科学 2003年第3期10卷 184-188页

作者：江世贵刘红艳苏天凤龚世园中国水产科学研究院南海水产研究所华中农业大学水产学院广东广州 510030 广东广州 510030 华中农业大学水产学院湖北武汉 430070

从鲷科鱼类中黄鳍鲷(Sparus latus)、黑鲷(***)、真鲷(Pagrosomus major)和平鲷(Rhabdosargussarba)的线粒体DNA扩增出约430 bp的细胞色素b(Cytb)基因,经Clastal X同源排序后得408 bp序列,对该序列进行分析并结合GeneBank中黄鲷(Taius tumifrons)、灰鳍鲷(***)、犁齿鲷(Evynnis japonica)和高背四长棘鲷(Argyrops spinifer)的该区段DNA序列比较,共发现126个核苷酸位点存在变异(30.7％),序列中的转换大于颠换,碱基替换多发生在密码子的第3位点。黑鲷和灰鳍鲷亲缘关系最近,序列差异为3.8％;而黄鲷和平鲷的亲缘关系最远,序列差异为21.7％。用MEGA2.1软件中的NJ法构建的分子系统树,将上述8种类分为4组,其中黄鲷属、平鲷属和鲷属分类的结果与形态分类学的观点一致;而传统分类上把犁齿鲷、真鲷和高背四长棘鲷归为3个不同属,在本研究分子系统树中,这3个属却聚成一支。本研究目的在于从分子水平上阐明鲷科鱼类的分类与系统进化关系。

关键词：鲷科鱼类细胞色素b 分子系统学

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合浦珠母贝3个养殖群体的RAPD分析

中国水产科学 2002年第2期9卷 106-109页

作者：苏天凤蔡云川张殿昌江世贵中国水产科学研究院南海水产研究所中国水产科学研究院南海水产研究所广东广州510300 中山大学生命科学学院华中农业大学水产学院广东广州510275 湖北武汉430070

利用RAPD标记技术检测了广西壮族自治区北海市、海南省三亚市、广东省深圳市等 3个地理种群养殖合浦珠母贝(Pinctadamartensii)基因组DNA的多态性 ,并对其遗传结构进行了初步分析。从 4 0个随机引物中筛选出 13个10bp引物 ,它们在 3种... 详细信息

利用RAPD标记技术检测了广西壮族自治区北海市、海南省三亚市、广东省深圳市等 3个地理种群养殖合浦珠母贝(Pinctadamartensii)基因组DNA的多态性 ,并对其遗传结构进行了初步分析。从 4 0个随机引物中筛选出 13个10bp引物 ,它们在 3种群中共扩增出了 14 0条DNA片段 ,3种群共有片段 16条 ,DNA片段数分别为 5 8、91和 71条 ,多态性位点比例分别为 4 1 4 % ,6 5 0 %和 5 8 4 %。遗传距离分析表明 ,广西种群与广东种群的亲缘关系较近 ,而与海南种群亲缘关系较远。 13个引物中 ,引物S11和S3 58扩增出的 3种群指纹图谱差异显著 ,可作为 3种群鉴定的分子标记。

关键词：合浦珠母贝养殖种群 RAPD 分子标记遗传多样性

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合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选

安徽农业科学 2009年第15期37卷 6899-6902,6922页

作者：李小宁张殿昌朱彩艳苏天凤江世贵中国水产科学研究院南海水产研究所广州510300 上海海洋大学上海201306

[目的]研究合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选。[方法]采用生物素标记的5个探针，用磁珠富集法构建合浦珠母贝基因组微卫星富集文库，并对文库进行筛选、测序与引物多态性筛选。[结果]对500个克隆进行PCR筛选，测序分析发现130个克... 详细信息

[目的]研究合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选。[方法]采用生物素标记的5个探针，用磁珠富集法构建合浦珠母贝基因组微卫星富集文库，并对文库进行筛选、测序与引物多态性筛选。[结果]对500个克隆进行PCR筛选，测序分析发现130个克隆含有微卫星重复单元。序列比对后最终获得109个具有特异微卫星序列的阳性克隆，其中包含179个微卫星DNA结构域。基于微卫星两端的侧翼序列设计并获得了13对能够在合浦珠母贝基因组有效扩增的微卫星引物，其中8对在种群中（n=32）具有扩增多态性，其多态信息含量PIC值在0．239～0．787；等位基因数在2～9个；观测杂合度介于0．22～0．56；期望杂合度的变化范围为0．25～0．83。[结论]这研究为进一步开展合浦珠母贝的遗传分析提供了基础资料。

关键词：合浦珠母贝微卫星分子标记多态性位点

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黄鳍鲷2个自然群体遗传变异的RAPD分析

热带海洋学报 2004年第2期23卷 55-61页

作者：杨慧荣江世贵苏天凤吕俊霖中国水产科学研究院南海水产研究所

用RAPD技术对福建和珠江口2个自然黄鳍鲷(Sparuslatus)群体进行群体内与群体间的遗传变异分析。在使用的40个随机引物中,有18个引物扩增出清晰稳定的片段,共计93条,大小为200—2500bp,其中多态性片段41条,多态性片段的比例为44.09%。福... 详细信息

用RAPD技术对福建和珠江口2个自然黄鳍鲷(Sparuslatus)群体进行群体内与群体间的遗传变异分析。在使用的40个随机引物中,有18个引物扩增出清晰稳定的片段,共计93条,大小为200—2500bp,其中多态性片段41条,多态性片段的比例为44.09%。福建和珠江口群体内的相似系数分别为0.8821和0.8785,群体内遗传距离分别为0.1179和0.1215,2个群体间的遗传距离为0.1314。福建和珠江口2个群体内都有较高程度的遗传变异水平,但福建群体的遗传变异水平较珠江口群体的低。用类平均聚类法和邻接法进行聚类分析,结果表明,福建和珠江口群体分别聚成一支,且两者的聚类结果一致。说明福建和珠江口群体已经开始出现了遗传分化,分别属于2个不同的地理群体。

关键词：黄鳍鲷(Sparus latus) 遗传变异 RAPD

中国南海海域斑节对虾群体与西印度洋、西太平洋群体种群遗传结构的比较分析

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水产学报 2008年第6期32卷 855-863页

作者：熊小飞江世贵夏军红苏天凤龚世园中国水产科学研究院南海水产研究所华中农业大学水产学院

采用聚合酶链式反应(PCR)技术对海南三亚、深圳、湛江、北海4个斑节对虾群体共95个个体的延伸因子1-alpha内含子序列进行了扩增,对扩增产物进行克隆转化,并将阳性克隆产物进行序列测定,最终获得了大小约216bp的可供分析的核苷酸序列。... 详细信息

采用聚合酶链式反应(PCR)技术对海南三亚、深圳、湛江、北海4个斑节对虾群体共95个个体的延伸因子1-alpha内含子序列进行了扩增,对扩增产物进行克隆转化,并将阳性克隆产物进行序列测定,最终获得了大小约216bp的可供分析的核苷酸序列。将获得的序列与从Genbank上下载的西太平洋、西印度洋种群的序列进行比较分析,结果表明,中国海域种群的基因多样性最低,西太平洋海域的基因多样性水平最高;通过对遗传分化指数FST的分析,发现西太平洋群体和西印度洋群体之间以及两者与中国海域群体间遗传分化具有极显著性差异(P<0.001)。UPGMA系统树显示,10个斑节对虾群体形成两大分支,一支由西太平洋群体和中国海域群体组成,另一支由西印度洋群体单独组成;中国海域群体中北海群体单独聚成一支。序列差异的分析结果表明,中国海域群体与西印度洋群体之间的亲缘关系最远,与西太平洋群体之间的亲缘关系较近;中国海域内部各群体之间,北海群体与海南、深圳、湛江群体之间的亲缘关系较远,形成一个独特的地理种群。

关键词：斑节对虾延伸因子1-alpha内含子序列种群结构遗传多样性

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海南岛大珠母贝遗传多样性分析

海洋科学 2005年第8期29卷 20-22页

作者：苏天凤朱彩艳江世贵中国水产科学研究院南海水产研究所广东广州510300

利用RAPD技术首次对中国海南岛环岛的大珠母贝(PinctadamaximaJameson)遗传多性进行分析。从20条10bp引物中选取7条引物用于群体遗传多样性分析,共检测出22个位点,其中11个位点(占50%)显多态性,Shannon多样性值为0.117。用非加权配对算... 详细信息

利用RAPD技术首次对中国海南岛环岛的大珠母贝(PinctadamaximaJameson)遗传多性进行分析。从20条10bp引物中选取7条引物用于群体遗传多样性分析,共检测出22个位点,其中11个位点(占50%)显多态性,Shannon多样性值为0.117。用非加权配对算数平均法(UPGMA)聚类分析的结果:12个体间遗传相似系数最大为1.000,最小为0.706,平均遗传相似系数为0.8438。表明海南岛大珠母贝群体间遗传多样性不一,遗传分化较大,因此很有必要对遗传多样性水平较高的种群,划定保护范围加以重点保护,以扩大和恢复大珠母贝的种质资源。

关键词：大珠母[Pinctada maxima(Jameson)] RAPD 遗传多样性

6种笛鲷属鱼类Cyt b基因片段序列的比较

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热带海洋学报 2004年第4期23卷 87-92页

作者：周发林江世贵苏天凤吕俊霖中国水产科学研究院南海水产研究所广东广州510300

采用聚合酶链式反应直接测序法,获得紫红笛鲷(Lutjanusargentimaculatus)、白星笛鲷(***)、千年笛鲷(***)、勒氏笛鲷(***)、红鳍笛鲷(***)5种笛鲷属鱼的线粒体细胞色素b(Cytb)425bp序列,并结合基因库中的斜带笛鲷(***)Cytb同源序列进行... 详细信息

采用聚合酶链式反应直接测序法,获得紫红笛鲷(Lutjanusargentimaculatus)、白星笛鲷(***)、千年笛鲷(***)、勒氏笛鲷(***)、红鳍笛鲷(***)5种笛鲷属鱼的线粒体细胞色素b(Cytb)425bp序列,并结合基因库中的斜带笛鲷(***)Cytb同源序列进行比较分析,共发现88个核苷酸位点存在变异(20.7%)。用MEGA2.1软件中的Pairwisedistance工具计算了6种笛鲷属鱼类的相对遗传距离,表明6种笛鲷属鱼类的序列差异在0.096—0.129之间,其中红鳍笛鲷和紫红笛鲷序列差异最大为0.129,千年笛鲷与红鳍笛鲷的序列差异最小为0.096;序列变异的转换/颠换比值较低,平均只有2.160。

关键词：笛鲷属(Lutjanus) 细胞色素b 序列比较:遗传距离

6种笛鲷属鱼类线粒体16SrRNA基因片段的序列比较

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中国水产科学 2004年第2期11卷 99-103页

作者：周发林江世贵苏天凤吕俊霖中国水产科学研究院南海水产研究所中国水产科学研究院南海水产研究所广东广州510300

对笛鲷属(Lutjanus)的紫红笛鲷(Lutjanusargentimaculatus)、白星笛鲷(Lutjanusstellatus)、千年笛鲷(Lutjanussebae)、勒氏笛鲷(Lutjanusrussellii)、红鳍笛鲷(Lutjanuserythropterus)线粒体DNA16SrRNA基因片段进行了PCR扩增和测序,得到长度约418bp的序列。结合GenBank中斜带笛鲷(Lutjanusdecussatus)该区段的16SrRNA序列,用Clustal＿X排序软件进行16SrRNA序列的对位排列。通过Mega2.1软件对所得线粒体16SrRNA片段序列进行比较,共检测53个碱基存在变异,其中包括21个简约信息位点,并用"Pairwisedistance"计算了各属间的相对遗传距离,结果表明,其序列差异(转换+颠换)在0.027～0.083,其中勒氏笛鲷与斜带笛鲷的序列差异最小,红鳍笛鲷与勒氏笛鲷的序列差异最大。以高体四长棘鲷(Argyropsspinifer)为外类群,采用Mega2.1软件中的"Neighbore-Joining"法得到唯一1个分子系统树,系统树各分支的置信度由"Bootstrap"1000循环检验。结果表明,6种笛鲷鱼类聚成明显的3个分支,第1个分支,包括勒氏笛鲷、斜带笛鲷和白星笛鲷;第2个分支,包括紫红笛鲷;第3个分支,包括红鳍笛鲷和千年笛鲷。

关键词：笛鲷属线粒体DNA 16SrRNA 序列比较

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长肋日月贝的营养成分分析及评价

海洋科学 2011年第3期35卷 87-91页

作者：朱彩艳王雨张殿昌苏天凤吴开畅中国水产科学研究院南海水产研究所广东广州510300

对野生长肋日月贝(Amusium pleuronectes)的闭壳肌和贝肉其他部分的基本营养成分进行分析。结果表明:闭壳肌的平均质量分数为18.13%±2.15%,超过优良养殖海湾扇贝"中科红"。闭壳肌的蛋白质质量比(干质量)为847.62 g/kg,贝肉其他部分蛋... 详细信息

对野生长肋日月贝(Amusium pleuronectes)的闭壳肌和贝肉其他部分的基本营养成分进行分析。结果表明:闭壳肌的平均质量分数为18.13%±2.15%,超过优良养殖海湾扇贝"中科红"。闭壳肌的蛋白质质量比(干质量)为847.62 g/kg,贝肉其他部分蛋白质质量比为662.50 g/kg。必需氨基酸与非必需氨基酸含量的比值在闭壳肌中为44.57%,在其他贝肉部分中的比值为44.12%。5种呈味氨基酸(谷氨酸、天冬氨酸、丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸)在闭壳肌和其他贝肉部分中的含量分别占氨基酸总量的36.23%和38.21%。闭壳肌中还富含Mg、P、Zn和Se等矿物质和微量元素。

关键词：长肋日月贝(Amusium pleuronectes) 营养成分分析营养评价氨基酸闭壳肌贝肉