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传统和机器学习策略在基于结构虚拟筛选中的应用

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Chinese Journal of Chemical Physics 2024年第2期37卷 177-191,I0101,I0102页

作者：张宏高毅勤昌平实验室北京102200 北京大学化学与分子工程学院北京100871 北京大学生物医学前沿创新中心北京100871

计算机辅助药物发现和人工智能驱动药物设计在制药行业中是减少时间和经济成本的重要策略.其中具有代表性的方法包括虚拟筛选、蛋白质-配体相互作用评估、药物药代动力学性质预测以及药物设计.通常来说,虚拟筛选是药物发现的第一步,其... 详细信息

计算机辅助药物发现和人工智能驱动药物设计在制药行业中是减少时间和经济成本的重要策略.其中具有代表性的方法包括虚拟筛选、蛋白质-配体相互作用评估、药物药代动力学性质预测以及药物设计.通常来说,虚拟筛选是药物发现的第一步,其主要目标是识别和发现潜在的先导化合物的候选物.在过去的几十年里,已经开发了多种传统的和基于机器学习的方法来提高虚拟筛选的准确性和速度.本综述总结了传统和机器学习方法在基于结构的虚拟筛选中的应用,讨赖性较弱,且分布非常冷并在j=1处达到峰值,但(0,1,0)振动态的转论了它们的性能、优势和局限性等方面.

关键词：分子对接机器学习基于结构的虚拟筛选计算机辅助药物发现人工智能驱动药物设计

R-spondin2调控Wnt/β-catenin信号通路的机制及其对骨骼系统的影响

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生物化学与生物物理进展 2024年第3期51卷 544-554页

作者：晋俊杰李晶胡广璇吴若萌衣雪洁沈阳体育学院运动健康学院沈阳110102 辽宁师范大学体育学院大连116029

R-spondin2(Rspo2)是蛋白质家族RSPOs成员之一,其可以通过富含亮氨酸重复序列的G蛋白偶联受体4/5(leucine-rich repeat-containing G protein-coupled receptor 4/5,LGR4/5)、细胞表面跨膜E3泛素连接酶ZNRF3/RNF43(zinc and ring finger 3/ring finger protein 43)、硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(heparan sulfate proteoglycans,HSPGs)和含GTP酶激活蛋白质1的IQ基序(IQ motif-containing GTPase-activating protein 1,IQGAP1)来调控Wnt/β连环蛋白(catenin)信号通路,Wnt/β-catenin信号通路是目前研究最广泛且与基础骨生物学直接相关的信号通路,该通路中任何一环节出现问题都可能对骨的调控产生影响。近年来研究发现,Rspo2可以通过Wnt/β-catenin对成骨细胞(osteoblast,OB)、破骨细胞(osteoclast,OC)和软骨细胞产生作用,并参与一些骨骼疾病如脊柱后纵韧带骨化(ossification of the posterior longitudinal ligament,OPLL)、骨关节炎(osteoarthritis,OA)和类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的发生发展,因此对Rspo2的研究可能会成为骨相关疾病新的治疗方向。本文结合最新研究进展,就Rspo2的结构和主要功能、Rspo2调控Wnt/β-catenin信号通路的相关机制及其对骨骼系统的影响作一综述,以期为骨相关疾病的防治提供新的思路和途径。

关键词： R-spondin2 Wnt/β-catenin信号通路成骨细胞破骨细胞软骨细胞

细胞衰老对放射性脑损伤和胶质母细胞瘤复发的作用

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中华放射肿瘤学杂志 2024年第6期33卷 578-582页

作者：伏敏胡广原华中科技大学同济医学院附属同济医院肿瘤科武汉430030

放射性细胞衰老是指细胞受到放射线等离子辐射后,出现细胞功能和形态改变的现象,出现永久性细胞周期停止状态,通常伴随细胞增殖抑制。放射性细胞衰老是多种分子机制共同作用的结果,包括DNA损伤、细胞周期调控、氧化应激和炎症反应。脑... 详细信息

放射性细胞衰老是指细胞受到放射线等离子辐射后,出现细胞功能和形态改变的现象,出现永久性细胞周期停止状态,通常伴随细胞增殖抑制。放射性细胞衰老是多种分子机制共同作用的结果,包括DNA损伤、细胞周期调控、氧化应激和炎症反应。脑内衰老细胞过度或异常积累不仅促进放射性脑损伤等神经退行性疾病发生发展,而且衰老细胞释放大量细胞因子可能导致胶质母细胞瘤复发。本文就放射性细胞衰老与放射性脑损伤发生、胶质母细胞瘤复发的关系做一综述。

关键词：细胞衰老,放射性脑损伤,放射性胶质母细胞瘤复发

支气管肺发育不良模型小鼠肺周细胞变化及对肺血管内皮细胞成管的影响

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中国组织工程研究 2024年第4期28卷 522-527页

作者：胡广志卢红艳江苏大学附属医院儿科江苏省镇江市212001

背景:肺周细胞位于肺血管连接凹陷处,与肺血管的形成和稳定有着密切关系。然而,在支气管肺发育不良发病过程中肺周细胞如何影响肺血管内皮细胞活动的研究较少。目的:分析支气管肺发育不良不同时期肺周细胞亚群与内皮细胞间数目变化关系... 详细信息

背景:肺周细胞位于肺血管连接凹陷处,与肺血管的形成和稳定有着密切关系。然而,在支气管肺发育不良发病过程中肺周细胞如何影响肺血管内皮细胞活动的研究较少。目的:分析支气管肺发育不良不同时期肺周细胞亚群与内皮细胞间数目变化关系,探讨血小板源性生长因子受体β、蛋白聚糖NG2、α-平滑肌肌动蛋白三阳性(PDGFR-β^(+)NG2^(+)α-SMA^(+))肺周细胞对肺血管内皮细胞早期成管活动的影响。方法:①动物实验:取新生C57BL/6小鼠12只,于出生24 h内采用随机数字表法分为常氧组及高氧组,每组6只,高氧组小鼠暴露于体积分数85%O_(2)环境下喂养,建立支气管肺发育不良动物模型;常氧组小鼠置于同一室内空气中喂养。出生后7,14 d取小鼠肺组织,苏木精-伊红染色观察肺组织病理改变,流式细胞术检测肺周细胞3种亚群与血管内皮细胞数量。②细胞实验:将小鼠第3代PDGFR-β^(+)NG2^(+)α-SMA^(+)肺周细胞与小鼠肺血管内皮细胞共培养(实验组),细胞比例为1∶4,以单独培养的小鼠肺血管内皮细胞为对照组。培养15 h后,分析两组血管内皮细胞成管差异。结果与结论:①动物实验:苏木精-伊红染色显示,7 d时,常氧组小鼠肺组织结构规则,存在明显肺泡结构,大小均匀;高氧组小鼠肺组织肺泡数量较少,肺泡形态不规则。14 d时,常氧组小鼠肺泡逐渐发育成熟,肺泡结构逐步规整,大小均匀,肺泡密度逐渐增加;高氧组小鼠肺组织结构相对紊乱,肺泡形成滞后体积逐渐增大,肺泡结构简单化。流式细胞术检测显示,与常氧组相比,高氧组7,14 d肺组织中的PDGFR-β^(+)NG2-α-SMA^(+)和PDGFR-β^(+)NG2^(+)α-SMA^(+)肺周细胞数量增加(P<0.01),PDGFR-β^(+)NG2^(+)α-SMA-肺周细胞与肺血管内皮细胞数量减少(P<0.01,P<0.05)。②细胞实验:对照组肺血管内皮细胞排列成条索状向四周延伸,部分区域中形成类似管腔样结构;实验组未观察到PDGFR-β^(+)NG2^(+)α-SMA^(+)肺周细胞及其伪足,肺血管内皮细胞形成的不规则网格状结构较对照组明显减少,内皮细胞以团块样聚集为主。③结果表明:支气管肺发育不良小鼠肺组织以α-SMA^(+)周细胞亚群为主,PDGFR-β^(+)NG2^(+)α-SMA^(+)肺周细胞则能直接抑制肺血管内皮细胞成管活动,可能参与了支气管肺发育不良发生过程中肺微血管发育异常的过程。

关键词：肺周细胞肺血管内皮细胞肺发育血管成管支气管肺发育不良动物实验

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生物安全建筑:筑牢国家生物安全屏障

科学通报 2024年第7期69卷 823-824页

作者：王清勤中国建筑科学研究院有限公司建筑安全与环境国家重点实验室北京100013

生物安全是我国国家安全的重要组成部分,关乎人民生命健康、国家长治久安、中华民族永续发展.近年来,全球生物安全形势呈现影响国际化、危害极端化、发展复杂化的特点.2020年10月,《中华人民共和国生物安全法》正式颁布,明确了生物安全... 详细信息

生物安全是我国国家安全的重要组成部分,关乎人民生命健康、国家长治久安、中华民族永续发展.近年来,全球生物安全形势呈现影响国际化、危害极端化、发展复杂化的特点.2020年10月,《中华人民共和国生物安全法》正式颁布,明确了生物安全是国家安全的重要组成部分,是贯彻总体国家安全观,全面提升国家生物安全治理能力的重要体现.党的二十大报告中也特别提到了要“强化经济、重大基础设施、金融、网络、数据、生物、资源、核、太空、海洋等安全保障体系建设”.

关键词：人民生命健康安全保障体系全球生物永续发展总体国家安全观安全治理国际化安全形势

市域社会治理主体价值网络关系：社会计算实验分析

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情报科学 2024年

作者：舒媛媛李伟印玥胡广伟南京大学信息管理学院南京大学政务数据资源研究所

【目的/意义】随着我国现代化进程的推进，市域社会治理成为国家治理体系与治理能力现代化的重要议题，揭示市域社会治理主体之间的关系及其特征对于优化治理结构具有关键意义。【方法/过程】目前有关社会治理主体价值网络关系对现代化... 详细信息

【目的/意义】随着我国现代化进程的推进，市域社会治理成为国家治理体系与治理能力现代化的重要议题，揭示市域社会治理主体之间的关系及其特征对于优化治理结构具有关键意义。【方法/过程】目前有关社会治理主体价值网络关系对现代化进程影响的研究仍较少见，本研究综合运用自然语言处理和社会网络分析方法，通过对市域社会治理现代化第一批试点城市68个优秀案例进行实体抽取，识别社会治理主体结构，计算社会治理主体价值网络关系并进行可视化。【结果/结论】本研究提炼出社会治理主体价值网络关系的主要模式，有政府引导型、社会组织协作型、政企互补联合型等，并给出引领企业参与治理模式创新、拓宽公众参与渠道、挖掘社会组织协作效能等对策建议。【创新/局限】本文通过计算分析了社会治理主体价值网络关系，以期为社会治理决策提供理论支撑和实践指导，但这种计算方法可能存在词频和语义信息兼顾不足的问题。

关键词：市域社会治理治理主体价值网络自然语言处理社会网络分析

数字环境下社区养老精准化服务价值网络构建——基于政策文本内容的分析

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情报科学 2024年

作者：王新建胡广伟司文峰滕起南京大学政务数据资源研究所南京邮电大学社会与人口学院南京大学信息管理学院

【目的/意义】随着我国老龄化进程的加速，养老成为老百姓心头的“急难愁盼”问题，有限的养老资源与庞大的老年群体个性化、快速增长的需求难以匹配，社区养老服务质量和效率不高，精准化程度严重不足；如何提升社区养老服务的精准化... 详细信息

【目的/意义】随着我国老龄化进程的加速，养老成为老百姓心头的“急难愁盼”问题，有限的养老资源与庞大的老年群体个性化、快速增长的需求难以匹配，社区养老服务质量和效率不高，精准化程度严重不足；如何提升社区养老服务的精准化水平是亟待研究的社会问题；数字技术的发展和应用为社区养老服务精准化水平提升提供了驱动力。【方法/过程】基于价值网络理论，采用内容分析法对养老政策文本开展质性研究，通过多轮编码分析，总结提炼社区养老服务价值网络的构成要素，并以精准化为目标构建数字环境下社区养老服务的价值网络模型。【结果/结论】多元化的参与主体、互动关系、外部环境、价值创造过程等要素构成了社区养老服务的价值网络模型，数字平台为价值创造全过程赋能，是提升服务精准化水平的关键要素。【创新/局限】研究回答了数字环境下“怎样的价值网络”更有助于实现社区养老服务“精准化”的问题，希望能为建立社区养老服务体系提供参考，也为参与主体在价值创造过程中协同共赢提供借鉴。

关键词：数字驱动养老服务价值网络服务精准化政策文本内容分析

大蒜油功能化炭纳米材料的制备及其摩擦学性能

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摩擦学学报 2024年

作者：胡广浩刘沙张瑞刘淑娟叶谦周峰西北工业大学先进润滑与密封材料研究中心凝固技术国家重点实验室中国科学院兰州化学物理研究所固体润滑国家重点实验室

在日常生活和工业生产中，摩擦会导致能量损耗、机械使用寿命缩短和效率降低。寻求有效的减摩抗磨方法引起了广泛的关注。润滑油是降低摩擦，减小磨损的有效方法。随着工业的飞速发展，基础油由于性能单一已经难以满足现代工业的飞速发... 详细信息

在日常生活和工业生产中，摩擦会导致能量损耗、机械使用寿命缩短和效率降低。寻求有效的减摩抗磨方法引起了广泛的关注。润滑油是降低摩擦，减小磨损的有效方法。随着工业的飞速发展，基础油由于性能单一已经难以满足现代工业的飞速发展，而润滑添加剂可以弥补基础油的性能不足，是改善润滑性能的有效方法。炭纳米材料由于具有良好的化学稳定性、优异的机械性能和高导热性能等，成为润滑剂添加剂的理想材料。本文中采用苯胺和吡咯界面聚合的方式制备聚苯胺吡咯（PACP），并将其作为前驱体，经过一定温度碳化后制备1类有机炭纳米材料（PCN）。随后用KH590对PCN进行表面改性，制备出表面接枝-SH的炭纳米材料（SH-PCN）。最后用大蒜油（GO）对SH-PCN进一步功能化，提高炭纳米材料在基础油中的分散稳定性及摩擦学性能。大蒜油由于富含一系列有机硫化物，主要成分包括二烯丙基二硫化物，其化学结构与硫化异丁烯相似，因此表现出良好的极压能力，通过偶联剂接枝将大蒜油与炭基体进行化学键合，获得大蒜油功能化的炭纳米材料。对大蒜油功能化的炭纳米材料的结构、形貌和组成等进行了一系列的分析表征。从形貌中可以看出经过高温炭化后PCN依然保持着良好的球体，这是由于PACP的超交联共轭结构；FT-IR，XPS及Zeta电位测试结果表明了大蒜油GO成功接枝到有机炭纳米材料上。研究了其作为润滑油添加剂的摩擦学性能，所制备的GO-SH@PCN-500作为润滑添加剂可将基础油的抗载荷能力从200 N提高到450 N，平均摩擦系数从0.18降低到0.11，磨损体积从2.5×105μm3降低到0.13×105μm3。进一步对磨斑表面分析后得知，在摩擦过程中炭纳米材料和钢基体发生摩擦化学反应，生成以碳氮化物、铁硫化物和铁氧化物等为主的摩擦保护膜，其可以阻止摩擦副的直接接触，从而保护摩擦副表面，减少摩擦磨损。本研究为制备炭纳米润滑添加剂材料提供了1种可行思路，获得了影响润滑添加剂摩擦学性能的因素，有助于进一步设计高性能炭纳米润滑添加剂材料。

关键词：炭纳米材料润滑添加剂大蒜油点击反应减摩抗磨

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压力表检定标准与实际操作中的差异分析

中文科技期刊数据库（全文版）工程技术 2024年第7期 0083-0085页

作者：胡广新疆生产建设兵团第十师综合检验检测中心新疆北屯836099

在工业生产与科学实验中,压力表作为一种重要的测量工具,其准确性和可靠性对于保障设备安全、提高生产效率以及确保实验结果的准确性具有重要的意义,但是在实际应用中,压力表检定标准与实际操作之间存在着一定的差异。因此本文将深入分... 详细信息

在工业生产与科学实验中,压力表作为一种重要的测量工具,其准确性和可靠性对于保障设备安全、提高生产效率以及确保实验结果的准确性具有重要的意义,但是在实际应用中,压力表检定标准与实际操作之间存在着一定的差异。因此本文将深入分析差异产生的原因,并提出相应的解决方案,以期为压力表的实际应用提供更为科学、准确的指导。

关键词：压力表检定标准实际操作差异分析