检索结果-南通市图书馆

中国中药杂志 2011年第13期36卷 1711-1717页

作者：管俊娇虞泓解云峰左世梅马荣锋曾文波云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室云南昆明650091 云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所云南昆明650205

目的:通过球孢虫草、蛹虫草EST设计EST-SSR引物,建立虫草属EST-SSR标记系统。方法:从NCBI公共数据库下载获得虫草EST,利用Sequece Seiners 1.2软件去除冗余序列并设计引物,进行PAGE电泳。结果:通过去除EST总序列中低质量的和冗余的序列... 详细信息

目的:通过球孢虫草、蛹虫草EST设计EST-SSR引物,建立虫草属EST-SSR标记系统。方法:从NCBI公共数据库下载获得虫草EST,利用Sequece Seiners 1.2软件去除冗余序列并设计引物,进行PAGE电泳。结果:通过去除EST总序列中低质量的和冗余的序列后,得到全长为2 953 173 bp的4 556条无冗余球孢虫草EST。从中发掘出718个EST-SSR,分布于616条EST中,出现频率是15.8%。平均分布频率是每4 096 bp出现1个,三核苷酸重复序列有419个,是出现最多的重复类型。蛹虫草EST去冗余后得到1 363条无冗余EST,共含有1 117个EST-SSR,出现频率为81.95%,出现最多的重复类型是A核苷酸重复。根据球孢虫草EST-SSR序列,设计合成50对引物,有扩增产物的引物为34对,占总设计引物数的68%。根据蛹虫草EST-SSR,设计合成40对引物,有扩增产物的引物为39对,占总设计引物数的97.5%。基于SSR标记进行聚类分析,7种虫草无性型均能分开,且分为4支。结论:虫草属EST-SSR出现频率较高、类型较丰富、多态性潜能较高,具有较高的利用价值。球孢虫草和蛹虫草EST开发的SSR标记在虫草属有较好的转移性与通用性,可以很好的应用于虫草种间遗传关系的研究。应用虫草物种EST建立分子标记是一条简便而又有效的途径。

关键词：虫草属球孢虫草蛹虫草 EST-SSR 引物设计

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基于荧光检测技术的青稞品种鉴定方法的建立

生物技术通报 2021年第11期37卷 293-302页

作者：管俊娇杨晓洪张鹏黄清梅张建华云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所昆明650205 云南省农业科学院粮食作物研究所昆明650205

本研究通过筛选出一套SSR核心引物,建立青稞DNA指纹鉴定体系,为青稞品种选育、品种鉴定提供高通量检测技术方法。首先以形态差异大的24份种质为材料,对198对SSR引物进行初筛,筛选出42对多态性好、扩增稳定、条带清晰的SSR引物,并对之进... 详细信息

本研究通过筛选出一套SSR核心引物,建立青稞DNA指纹鉴定体系,为青稞品种选育、品种鉴定提供高通量检测技术方法。首先以形态差异大的24份种质为材料,对198对SSR引物进行初筛,筛选出42对多态性好、扩增稳定、条带清晰的SSR引物,并对之进行荧光标记。采用筛选出的42对引物对226份材料进行PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳检测,最终筛选出28对SSR荧光引物建立基于高通量荧光SSR标记的青稞品种鉴定体系。采用28对SSR引物构建的DNA指纹图谱进行226个青稞材料的鉴定。28对SSR引物共检测到252个等位基因,每对引物可检测到有效等位基因数为5-16个,平均等位基因数为9;基因多样性指数变异范围为0.48-0.86,平均为0.68;多态信息量(PIC)变幅为0.44-0.84,平均为0.65。226份材料的遗传距离为0-0.99,该套引物可以将大部分参试材料区分开。从28对SSR引物中选择了7对分布于不同染色体上、扩增和检测效果较好的引物(Bmag0211、Scssr07759、HVM62、EBmac0679、Scssr03907、Bmag0870、EBmac0827),构建青稞品种(系)DNA的指纹图谱库。为消除不同检测平台、不同试验批次等引起的误差,为7对SSR核心引物各主要等位变异选择相应的参照品种,作为普通聚丙烯酰胺凝胶电泳的读带依据。最终构建了在2个检测平台(毛细管电泳平台及聚丙烯酰胺凝胶电泳平台)通用的SSR分子标记青稞品种鉴定体系。

关键词：青稞 SSR标记核心引物指纹图谱品种鉴定

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云南粳稻苗期响应低温胁迫的转录组分析

西南农业学报 2024年

作者：张锦文李小林徐雨然管俊娇奎丽梅杨丽萍吕莹安华余琴邓伟云南省农业科学院粮食作物研究所云南省农业科学院云南省种子种业联合实验室

【目的】低温是影响水稻生长、发育和生产的环境因素，鉴定水稻耐冷新基因，揭示耐冷新机制是提高水稻耐冷性的重要途径。【方法】本研究以苗期低温处理0、12、24、36 h的耐冷水稻品种云科粳1号为试验材料，利用转录组测序技术筛选与低... 详细信息

【目的】低温是影响水稻生长、发育和生产的环境因素，鉴定水稻耐冷新基因，揭示耐冷新机制是提高水稻耐冷性的重要途径。【方法】本研究以苗期低温处理0、12、24、36 h的耐冷水稻品种云科粳1号为试验材料，利用转录组测序技术筛选与低温胁迫紧密相关的代谢通路和差异表达基因。【结果】共获得云科粳1号转录组数据76.16 Gb，与参考基因组位置的比对效率达93.56 %。基因表达数量韦恩图显示，低温胁迫12、24、36 h后有781个基因共表达。三个比较组合（L2vsL1、L3vsL1、L4vsL1）差异基因统计分析显示，L2vsL1差异基因数为6444个，L3vsL1差异基因数为10269个，L4vsL1差异基因数为12576个。不同比较组合基因GO 功能富集将差异基因分为生物过程、细胞组分和分子功能三大类，其中，L2vsL1差异基因生物过程、细胞组分和分子功能占比为63.11%、12.25%、24.64%，L3vsL1差异基因各自占比为62.57%、13.54% ，23.89%，L4vsL1差异基因各自占比为62.71%、13.69%、23.60%；KEGG代谢通路富集分析表明，植物激素信号转导代谢、植物MAPK信号通路、甘油磷脂代谢通路等参与响应低温胁迫过程。实时荧光定量分析表明，MYB转录因子、WRKY转录因子、蛋白磷酸酶7个参与低温胁迫响应相关的差异表达基因qRT-PCR表达模式与RNA-seq 的一致。【结论】云科粳1号具有较强的耐冷性，GO和KEGG代谢通路分析表明，植物MAPK信号、植物激素信号转导及甘油磷脂代谢等均参与响应低温胁迫过程。本研究为水稻耐冷基因克隆及耐冷机制解析提供了理论依据。

关键词：水稻耐冷性转录组苗期

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海藻肥对玉米产量及农艺性状的影响

西南农业学报 2015年第3期28卷 1166-1170页

作者：黄清梅肖植文管俊娇张鹏张惠王燕林杨洲王宝书吕开洲张建华云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所云南昆明650205 云南省农业科学院农业经济与信息研究所云南昆明650205 会泽县农业技术推广中心云南会泽654200 大姚县经济作物工作站云南大姚675400 南华县农业技术推广中心云南南华675200

以云瑞88号为供试材料,研究施用尿素与海藻肥对玉米云瑞88号产量及农艺性状的影响。结果表明,千粒重是影响云瑞88号产量最关键因子,另外产量还与出籽率、单穗粒重、株高、穗位高、穗长呈显著或极显著正相关。施用尿素和海藻肥显著提高... 详细信息

以云瑞88号为供试材料,研究施用尿素与海藻肥对玉米云瑞88号产量及农艺性状的影响。结果表明,千粒重是影响云瑞88号产量最关键因子,另外产量还与出籽率、单穗粒重、株高、穗位高、穗长呈显著或极显著正相关。施用尿素和海藻肥显著提高了云瑞88号的株高、穗位高、穗长、穗粗、穗行数、行粒数、单穗粒重、千粒重、出籽率和产量,而施用尿素与海藻肥2个处理间除了穗位高外,产量和其他农艺性状都没有显著差异。可用海藻肥代替尿素,形成环境友好型玉米海藻肥施肥技术模式。

关键词：海藻肥尿素云瑞88号产量农艺性状

云南省优质稻标准样品数据采集方法及应用研究

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广东农业科学 2023年第3期50卷 11-21页

作者：管俊娇李小林奎丽梅谷安宇邓伟涂建管敏张建华云南省农业科学院粮食作物研究所云南昆明650205 深圳市农业科技促进中心广东深圳518040

【目的】探索采集优质稻标准样品数据的方法,构建云南省优质稻品种的标准样品数据库,为优质稻品种真实性鉴定及提纯复壮提供技术支撑。【方法】以云恢290、滇屯502的原种及生产用种为研究材料,采用品种农艺性状调查、SSR分子标记构建指... 详细信息

【目的】探索采集优质稻标准样品数据的方法,构建云南省优质稻品种的标准样品数据库,为优质稻品种真实性鉴定及提纯复壮提供技术支撑。【方法】以云恢290、滇屯502的原种及生产用种为研究材料,采用品种农艺性状调查、SSR分子标记构建指纹图谱、稻米品质检测等技术全面系统地描述优质稻品种的特征特性。【结果】利用12对分布在水稻12条染色体上的核心标记采集原种及生产用种的指纹图谱,结果云恢290和滇屯502的生产用种和原种的扩增产物均无差异,可用于云恢290和滇屯502的指纹图谱描述。采用12个核心标记对原种及生产用种随机抽取48个单株进行基因型一致性鉴定,云恢290原种、生产用种在12个标记中扩增产物大小一致,无异型株;滇屯502原种扩增产物整齐一致,无异型株,其生产用种有2个标记出现异带,有2个异型株。采用DUS测试方法采集17个DUS测试性状、4张植株部位图片,根据国家优质稻标准采集11个品质性状。【结论】以品种指纹图谱、DUS测试性状、植株部位图片、品质性状及商品信息5个要素作为数据库基础数据,借助计算机编程软件构建优质稻标准样品数据库。优质稻标准样品数据库的建立可以从基因水平、品种特征特性及外观对品种进行系统描述。

关键词：优质水稻指纹图谱表型性状商品信息数据库

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不同生态条件下玉米品种高产潜力研究

西南农业学报 2015年第2期28卷 487-491页

作者：管俊娇肖植文杨晓洪张建华张惠王江民刘艳芳黄清梅云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所云南昆明650205 云南省农业科学院农业经济与信息研究所云南昆明650205

采用均匀设计方法,研究了在云南不同生态条件下氮肥施用方式和种植密度对3个玉米新品种(云瑞8号、云瑞6号、云瑞88号)产量的影响。结果表明,不同生态条件下,玉米的产量水平和经济性状不同。高密度不影响品种特有的株高、穗位高和穗位系... 详细信息

采用均匀设计方法,研究了在云南不同生态条件下氮肥施用方式和种植密度对3个玉米新品种(云瑞8号、云瑞6号、云瑞88号)产量的影响。结果表明,不同生态条件下,玉米的产量水平和经济性状不同。高密度不影响品种特有的株高、穗位高和穗位系数,茎粗、叶宽随密度增加而显著减小。3个品种的穗长、行粒数和千粒重随着密度的增大显著减少,产量随着密度的增大而显著增高。高密度对穗部性状造成了不利影响,而高密度的增产效应补偿了密度对穗部性状的不利影响。控制施肥时间和施肥空间(时空)的施肥方式,施用较少的氮肥即可有效的增加产量。云瑞88号具有广泛的适应性和较高的耐密植性,为3个品种中最具潜力的高产品种,应大力推广种植。

关键词：玉米生态条件种植密度氮肥水平

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小桐子居群种子表型变异研究

西南农业学报 2011年第3期24卷 1086-1094页

作者：管俊娇虞泓何露和云峰张时刚彭少波范源洪云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室云南昆明650091 云南省农业科学院热区农业生态研究所云南元谋651300 云南德殷集团有限公司云南昆明650228 云南省农业科学院生物质能研究中心云南昆明650205

对小桐子8个居群种子表型进行研究,测量种子长度、宽度、重量等11项形态学指标。种子表型性状,居群间的变异系数c.v.%=10.64~19.33,表型频率分化系数平均Pst=10.02%,表型方差分化系数平均Vst=14.27%,表明小桐子种子表型居群内变异是其... 详细信息

对小桐子8个居群种子表型进行研究,测量种子长度、宽度、重量等11项形态学指标。种子表型性状,居群间的变异系数c.v.%=10.64~19.33,表型频率分化系数平均Pst=10.02%,表型方差分化系数平均Vst=14.27%,表明小桐子种子表型居群内变异是其变异的主要来源。居群间欧氏距离Q-聚类分析表明,种子表型分化基本与居群间的地理距离远近相关联。11个表型性状间多数呈极显著或显著的正相关,种子长度、宽、厚、周长和种子百粒重为小桐子易测定和重要的表型性状。

关键词：小桐子居群种子表型性状变异分化

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辣椒杂交种纯度鉴定的SSR核心引物筛选

生物技术通报 2014年第9期30卷 97-101页

作者：管俊娇张建华张惠马芙蓉杨晓洪王江民云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所昆明650205

旨在确定一套适于辣椒杂交种纯度鉴定的核心SSR引物,利用17对SSR引物对100份已知辣椒(Capsicum)杂交种进行DNA指纹分析。根据多态性和杂合率两个指标,确定Hpms1-214、Es395和Hpms1-5为辣椒杂交种纯度鉴定的首选核心引物,利用这3个引物... 详细信息

旨在确定一套适于辣椒杂交种纯度鉴定的核心SSR引物,利用17对SSR引物对100份已知辣椒(Capsicum)杂交种进行DNA指纹分析。根据多态性和杂合率两个指标,确定Hpms1-214、Es395和Hpms1-5为辣椒杂交种纯度鉴定的首选核心引物,利用这3个引物进行筛选,97个品种(占97%)能够找到具有杂合带型的鉴定引物,确定5个引物Es330、Es363、Epms923、Es120和Es64为辣椒杂交种纯度鉴定的备选核心引物。筛选出14个品种的特异性引物,可进一步筛选每个辣椒杂交种的双亲互补型引物。

关键词：辣椒 SSR 杂交种纯度鉴定核心引物

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蝴蝶兰品种数量性状与分组性状的DUS判定

西北农林科技大学学报（自然科学版） 2018年第11期46卷 81-88页

作者：张鹏王江民管俊娇刘艳芳杨晓洪马芙荣张建华云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所云南昆明650205

【目的】对48个蝴蝶兰品种数量性状和分组性状的判定进行研究,为建立蝴蝶兰品种DUS性状的科学判定方法提供支持。【方法】依据DUS测试指南,对蝴蝶兰植株大小、叶片长度、叶片宽度、花序长度、花朵数量、花序梗长度、花序梗粗度、花长度... 详细信息

【目的】对48个蝴蝶兰品种数量性状和分组性状的判定进行研究,为建立蝴蝶兰品种DUS性状的科学判定方法提供支持。【方法】依据DUS测试指南,对蝴蝶兰植株大小、叶片长度、叶片宽度、花序长度、花朵数量、花序梗长度、花序梗粗度、花长度、花宽度、萼片长度、萼片宽度、花瓣长度、花瓣宽度、唇瓣中裂片长度、唇瓣中裂片宽度等15个数量性状进行测量并采集数据,利用SPSS统计分析软件,采用LSD最小显著差法和主成分分析法对数据进行分析。【结果】依据蝴蝶兰15个数量性状表达均值和极差,采用LSD最小显著差法,将其划分为9级表达状态;蝴蝶兰不同部位数量性状的变异系数的平均值表现为花序性状(31.83%)>花瓣性状(25.72%)>萼片性状(23.40%)>叶片性状(20.26%)>唇瓣性状(18.96%),其中花序长度与花朵数量的选择空间较大,变异系数分别为34.63%和44.59%;叶片宽度的多样性指数较大,为2.099 8,DUS表达状态较为丰富,但有可能存在性状稳定性问题;通过主成分分析,在15个数量性状中选择出花宽度、叶片长度、花朵数量3个性状作为分组性状。【结论】可以利用主成分分析法确定DUS测试数量性状的分组性状;数量性状的分级存在不稳定因素,如品种内变异、栽培条件、地域差异等,不能以固定的性状表达范围作为分级标准,需要大量数据支撑并进行年度校正。

关键词：蝴蝶兰数量性状分组性状 DUS判定