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走出青藏高原：拉格啤酒酵母的起源与演化

微生物学报 2022年第11期62卷 4188-4201页

作者：白逢彦中国科学院大学生命科学学院中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室

采用低温底层发酵的拉格(lager)啤酒15世纪开始在德国巴伐利亚地区出现，19世纪初流行至全世界，目前已成为全球产量最高的酒精饮料。目前已阐明，拉格啤酒发酵酵母为巴斯德酿酒酵母(Saccharomyces pastorianus)，该种是一个杂交种，由... 详细信息

采用低温底层发酵的拉格(lager)啤酒15世纪开始在德国巴伐利亚地区出现，19世纪初流行至全世界，目前已成为全球产量最高的酒精饮料。目前已阐明，拉格啤酒发酵酵母为巴斯德酿酒酵母(Saccharomyces pastorianus)，该种是一个杂交种，由艾尔(ale)啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)与野生真贝氏酿酒酵母(Saccharomyces eubayanus)杂交而成，后者赋予了拉格啤酒酵母的耐低温能力。近年的群体遗传学和群体基因组学研究表明，拉格啤酒酵母的野生亲本S.eubayanus起源于青藏高原，可能通过丝绸之路传播到了欧洲。比较基因组学研究表明，拉格啤酒酵母包含2个株系，即Ⅰ系/Saaz系和Ⅱ系/Frohberg系，早期分别流行于中欧和西欧地区。前者为近似异源3倍体，后者为近似异源4倍体。2个株系在耐低温、麦芽三糖利用和风味物质产生能力等方面具有明显差异。在中国普通微生物菌种保藏管理中心(China General Microbiological Culture Collection Center,CGMCC)保藏的S.pastorianus菌株绝大多数属于Ⅱ系/Frohberg系。野生S.eubayanus的发现为通过人工杂交创建新的啤酒酵母杂交菌株，从而为选育具有独特发酵性能的新型非转基因啤酒酵母菌株提供了新途径，可能会对啤酒酿造的未来产生重大影响。本文除简要介绍啤酒酵母的研究历史外，重点阐述近年来在拉格啤酒酵母的杂种特性、起源、演化和基因组构成等方面的最新研究进展，并指出需要进一步解决的问题和未来研究趋势。

关键词：拉格啤酒酵母酿酒酵母巴斯德酿酒酵母真贝氏酿酒酵母比较基因组

26S rDNA单链构象多态性分析在临床酵母菌菌种鉴定中的应用

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微生物学报 2009年第8期49卷 1011-1017页

作者：李娟白逢彦中国疾病控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室北京100101

【目的】探讨酵母菌临床分离株26S rDNA D1/D2区序列种内相似性和种间差异性的快速检测方法,为临床酵母菌菌种鉴定方法的改进奠定基础。调查北京地区临床酵母菌的种群多样性,为国内酵母菌感染的流行病学研究提供新的基础数据。【方法】... 详细信息

【目的】探讨酵母菌临床分离株26S rDNA D1/D2区序列种内相似性和种间差异性的快速检测方法,为临床酵母菌菌种鉴定方法的改进奠定基础。调查北京地区临床酵母菌的种群多样性,为国内酵母菌感染的流行病学研究提供新的基础数据。【方法】用5种常见临床酵母菌种的模式和权威菌株作为标准参考菌株,从北京四家综合性医院收集临床酵母菌260余株,PCR扩增其26SrDNAD1/D2区,对扩增产物进行单链构象多态性(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析和序列测定分析。【结果】常见病原酵母菌26SrDNAD1/D2区的SSCP图谱具有明显的种间差异性和种内相似性,可以通过该方法对菌株进行初步的菌种鉴定。D1/D2-SSCP和序列分析相结合,对260余株临床酵母菌进行了菌种鉴定,共鉴定有10个属20个种,优势属为念珠菌属(Candida),优势种及其所占比例分别是:C.albicans(57.7%),C.parapsilosis(10.0%),C.tropicalis(9.2%),C.glabrata(6.7%)和C.krusei(5.8%),并发现过去从未或很少报道致病的酵母菌种,愈来愈多地出现在临床分离菌株中。【结论】26S rDNA D1/D2区的SSCP图谱分析为临床酵母菌株的快速鉴定提供了新的方法;北京地区酵母菌临床分离株呈种群多样性分布,C.albicans虽然仍占优势,但其它念珠菌种的比例已达42%。

关键词：病原酵母菌菌种鉴定单链构象多态性 26SrDNAD1/D2

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酿酒酵母属的分类学研究进展

微生物学通报 2000年第2期27卷 139-142页

作者：白逢彦中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学开放研究实验室北京100080

由于酵母菌的巨大经济价值,国内外对这类微生物从基础到应用各方面的研究一直都非常活跃,而其中最基础的学科,酵母菌分类学,亦经历了巨大变化.

关键词：酵母菌酿酒酵母属分类

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假丝酵母属的分类学研究进展

微生物学通报 1997年第6期24卷 354-356页

作者：白逢彦中国科学院微生物研究所北京100080

假丝酵母属(CandidaBerkhout)是酵母菌中最大的一个属,现包括200多种,约占目前已知酵母菌总种数的三分之一[1]。由于假丝酵母的经济重要性及其在整个酵母菌中所占的比重,对该属的分类研究作为其他各方面研究的基础,一直是一个颇为活跃... 详细信息

假丝酵母属(CandidaBerkhout)是酵母菌中最大的一个属,现包括200多种,约占目前已知酵母菌总种数的三分之一[1]。由于假丝酵母的经济重要性及其在整个酵母菌中所占的比重,对该属的分类研究作为其他各方面研究的基础,一直是一个颇为活跃的领域。研究手段不断改进,分类系统木断更新。近10多年来该属的定义已经过两次重大修订[2.3],分子分类学方法在该属的分类学研究中已经由辅助手段变为常用指标。1假丝酵母属的建立及其定义的演变假丝酵母属是Berkhout于1923年建立的[4]。Yarrow和Meyet[2]把球似酵母属(TorutopsisBerlese…

关键词：酵母菌假丝酵母属分类学研究进展

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酵母菌专栏序言Ⅰ

菌物学报 2018年第11期37卷 1401-1402页

作者：白逢彦中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101

酵母菌是指主要以单细胞形式存在,以芽殖或裂殖方式进行无性繁殖,有性生殖阶段不产生子实体的真菌。其对应的英语单词＂yeast＂,衍生于用来描述啤酒和面包等的发酵现象的词汇。因此,酵母菌通常被理解为具有发酵能力的单细胞真菌。在遗... 详细信息

酵母菌是指主要以单细胞形式存在,以芽殖或裂殖方式进行无性繁殖,有性生殖阶段不产生子实体的真菌。其对应的英语单词＂yeast＂,衍生于用来描述啤酒和面包等的发酵现象的词汇。因此,酵母菌通常被理解为具有发酵能力的单细胞真菌。在遗传和分子生物学等研究领域,＂yeast＂或＂budding yeast＂（出芽酵母）常被当作＂Saccharomyces cerevisiae＂（酿酒酵母）的代名词。

关键词：酵母菌序言分子生物学无性繁殖生殖阶段英语单词酿酒酵母单细胞

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海南热带雨林腐木上酵母菌物种多样性研究

菌物学报 2009年第3期28卷 354-362页

作者：王辰白逢彦中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室北京100101 中国科学院研究生院北京100039

用含木糖为唯一碳源(培养基X)和含葡萄糖及7.6%乙醇(培养基E)的两种富集培养基分别从采自海南热带雨林的56和57份腐木样品中分离到酵母菌67和75株。依据26SrDNA D1/D2区域序列分析并结合形态学特征对这些菌株进行了分类学研究,探讨了该... 详细信息

用含木糖为唯一碳源(培养基X)和含葡萄糖及7.6%乙醇(培养基E)的两种富集培养基分别从采自海南热带雨林的56和57份腐木样品中分离到酵母菌67和75株。依据26SrDNA D1/D2区域序列分析并结合形态学特征对这些菌株进行了分类学研究,探讨了该地区腐木上的酵母菌物种多样性及其分布。从分离的142株酵母菌中鉴定出14个属63个种,其中疑似新种25个,占总种数的近40%,说明在热带雨林腐木中尚存在大量酵母菌新分类群有待被发现。从用培养基X和E分离的酵母菌中分别鉴定出7属37种和11属33种,优势属均为假丝酵母属Candida Berkhout和毕赤酵母属Pichia Hansen,但种类组成基本不同。用培养基X富集分离的菌株以Candida quercitrusa S.A.Meyer & Phaff的地理分布最广,用培养基E富集分离的菌株以异常毕赤酵母Pichiaanomala (Hansen) Kurtzman、酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae Meyenex Hansen和亚膜毕赤酵母Pichia subpelliculosa Kurtzman分布最广泛。同一样品用两种不同富集培养基分离的菌株大多数属于不同的种,在对比的23份样品中,只从2份样品中分离到了同一个种的菌株。用培养基X和E分离的菌株分别属于可利用木糖和可耐受乙醇的酵母菌,用两种培养基同时分离到的菌株属于具备利用木糖和耐受高浓度乙醇两种能力的菌株。这些酵母菌在木质纤维素物质的生物乙醇转化技术中的应用价值值得进一步研究。

关键词：酵母菌分类木糖利用酵母菌耐乙醇酵母菌 26S rDNA D1/D2区序列分析

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拉格啤酒酵母菌物种和株系的快速分子鉴定

菌物学报 2018年第11期37卷 1441-1453页

作者：邴健白逢彦中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101

近年来的基因组学研究结果已证实拉格啤酒酵母Saccharomycespastorianus是一个由艾尔啤酒酵母S.cerevisiae和真贝氏酿酒酵母S.eubayanus杂交而成的杂交种,并可根据地域传承和染色体倍性分为两个株系,即I型/Saaz系和II型/Frohberg系。前... 详细信息

近年来的基因组学研究结果已证实拉格啤酒酵母Saccharomycespastorianus是一个由艾尔啤酒酵母S.cerevisiae和真贝氏酿酒酵母S.eubayanus杂交而成的杂交种,并可根据地域传承和染色体倍性分为两个株系,即I型/Saaz系和II型/Frohberg系。前者主要为异源3倍体,后者则主要为异源4倍体。为了探讨中国啤酒酿造酵母菌的物种和菌系归属,我们根据拉格啤酒酵母及其两个菌系的基因组特性,制定了一套基于IntFR片段种特异性扩增和ITS-RFLP分析的精确但简便易行的拉格啤酒酵母菌物种和株系鉴定新方法,并以酿酒酵母属内相关种的模式或权威菌株和部分酒精及面包酵母为参照,对保藏于中国普通微生物菌种保藏中心(CGMCC)的41株啤酒酿造酵母菌进行了重新鉴定和分型。这些菌株除1株原定名为贝氏酿酒酵母S. bayanus外,其余菌株的原定名均为S. cerevisiae。研究结果确认了S. bayanus菌株鉴定的正确性,但在其余的40株啤酒酵母菌株中,21株属于S. cerevisiae,1株属于葡萄汁酿酒酵母S. uvarum,18株属于S. pastorianus。菌系鉴定和流式细胞测定结果显示在确认的S. pastorianus菌株中,1株为I型/Saaz系,3倍体;17株为II型/Frohberg系,其中9株为4倍体,两株为3倍体,5株介于3倍至4倍体之间。啤酒酵母物种和株系的确认对优化发酵工艺和菌种选育及遗传改造等具有重要意义。

关键词：拉格啤酒酵母艾尔啤酒酵母酿酒酵母巴斯德酿酒酵母真贝氏酿酒酵母

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中国部分昆虫上的镰刀菌

真菌学报 1991年第2期10卷 120-128页

作者：白逢彦陈庆涛中国科学院微生物研究所北京100080

镰刀菌与昆虫具有密切的关系,许多种是昆虫致病菌,在农林业虫害的生物防治上有其应用价值。作者在研究中国镰刀菌属(Fusarium Link:Fr.)分类的过程中,在全国范围内采集了大量昆虫标本,用表面消毒法从中分离镰刀菌,累计得到了180多株,鉴... 详细信息

镰刀菌与昆虫具有密切的关系,许多种是昆虫致病菌,在农林业虫害的生物防治上有其应用价值。作者在研究中国镰刀菌属(Fusarium Link:Fr.)分类的过程中,在全国范围内采集了大量昆虫标本,用表面消毒法从中分离镰刀菌,累计得到了180多株,鉴定出16种和变种,其中1种和1变种是中国新记录,它们是:

关键词：昆虫真菌镰刀菌

假丝酵母属疑难菌株大亚基rDNA D1/D2区域序列分析及其分类学意义

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菌物系统 2002年第1期21卷 27-32页

作者：白逢彦贾建华梁慧燕中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学开放研究实验室北京100080

对根据常规形态和生理生化性状难以确定分类学地位的8株假丝酵母菌，进行了以大亚基（26S）rDNA中D1/D2区域（均500-600bp)的碱基序列分析为依据的分子分类学研究。根据系统树上所显示的供试菌株与假丝酵母属及相关子囊菌酵母已知种的... 详细信息

对根据常规形态和生理生化性状难以确定分类学地位的8株假丝酵母菌，进行了以大亚基（26S）rDNA中D1/D2区域（均500-600bp)的碱基序列分析为依据的分子分类学研究。根据系统树上所显示的供试菌株与假丝酵母属及相关子囊菌酵母已知种的亲缘关系，以及与最近缘种模式菌株D1/D2区域序列的相似性比较，确定了各个菌株的归属，本研究也显示了DNA序列分析在假丝酵母菌快速鉴定中的优越性。

关键词：酵母菌 rRNA基因序列分析分子分类假丝酵母属