检索结果-南通市图书馆

同方期刊数据库博看期刊

基于二代测序技术的甜橙基因组杂合度与起源研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于二代测序技术的甜橙基因组杂合度与起源研究

作者：焦文标华中农业大学

学位级别：硕士

二代测序技术的快速发展推动了基因组学等组学的高通量定量研究。基于二代测序技术的全基因组重测序研究有助于研究物种遗传多样性,种群结构,物种起源与进化,以及全基因组关联分析。柑橘作为世界第一大水果,同时也是果树类物种的遗传、... 详细信息

二代测序技术的快速发展推动了基因组学等组学的高通量定量研究。基于二代测序技术的全基因组重测序研究有助于研究物种遗传多样性,种群结构,物种起源与进化,以及全基因组关联分析。柑橘作为世界第一大水果,同时也是果树类物种的遗传、育种、基因组学研究的重要参考物种之一。甜橙被认为起源于野生宽皮橘和野生柚的杂交后代,通过珠心胚无性繁殖,并以嫁接等方式培育;因此其基因组具有高度的杂合性。基因组杂合度是植物杂种优势的遗传基础。此前的研究对于甜橙基因组杂合度的研究缺少全基因组范围内研究结果,同时对于甜橙的起源模式和遗传来源缺少全基因组研究的证据。本研究中,我们利用全基因组测序数据,对甜橙基因组的杂合度进行了深入的研究,分析了杂合位点对基因表达的影响,同时确定了甜橙基因组的遗传来源,并对其遗传模式进行了推测。主要研究结果如下： 1)利用甜橙参考基因组的杂合二倍体亲本测序数据,使用生物信息学分析工具预测亲本的杂合位点,总共发现SNP位点868,490个,InDe1位点151,080个,大片段结构变异位点3,517个,包括2,615个删除变异,836个插入变异,66个倒位变异。同时,利用不能比对到参考基因组的读段数据,组装出非参考基因组序列42Mb,并注释出134个蛋白质编码基因。 2)根据杂合位点的注释结果,我们定义了有害突变的位点;并结合不同组织下的RNA-seq基因表达数据,发现了近半数含有该位点的基因存在组织差异表达现象,而位于大片段删除变异区段的基因存在低表达的现象;此外我们发现了1,062个基因呈现等位差异表达的模式。 3)利用野生宽皮橘和野生柚的全基因组测序数据,我们共鉴定出甜橙基因组中39.7Mb和118.2Mb的区段来源于野生柚和野生宽皮橘,两者来源比例接近于1：3,我们推测甜橙的起源模式：野生柚母本与野生宽皮橘父本杂交得到F1代,以F1代为母本再和野生宽皮橘父本杂交,得到的后代就是野生甜橙的祖先,再经过人工培育选择得到现代的甜橙。

关键词：全基因组重测序单核苷酸多态性短片段插入和删除结构变异杂合度基因表达甜橙起源

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

延长马铃薯种质资源低温保存条件的探究

中国马铃薯 2023年第5期37卷 419-427页

作者：陈汝豪周艳华赵喜娟焦文标宋波涛柴婷婷果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室/农业农村部马铃薯生物学与生物技术重点实验室/华中农业大学湖北武汉430070 湖北省农业技术推广总站湖北武汉430070

试管苗离体保存是马铃薯目前应用最广泛的种质资源保存方法,探究延长试管苗继代周期的保存条件可以有效减少风险并降低保存成本。从实验室种质资源库中挑选了6个不同基因型的马铃薯材料,以植株状态、株高和存活率作为指标,探究不同预生... 详细信息

试管苗离体保存是马铃薯目前应用最广泛的种质资源保存方法,探究延长试管苗继代周期的保存条件可以有效减少风险并降低保存成本。从实验室种质资源库中挑选了6个不同基因型的马铃薯材料,以植株状态、株高和存活率作为指标,探究不同预生根处理、保存温度、培养基蔗糖浓度和继代方式对马铃薯试管苗保存的影响,以探索广泛适用于马铃薯试管苗长期低温保存的条件。不进行预生根处理的试管苗在低温保存的第60d几乎不生长,随后死亡,说明预生根处理是试管苗低温保存的必要条件。4℃条件下试管苗的生长比7℃更缓慢,在第90d时的株高明显更小,4个材料的试管苗存活率仅为53.75%,而7℃条件下存活率为100%,说明7℃更适于不同基因型马铃薯种质资源的低温保存。8%蔗糖浓度培养基中的试管苗在第90d时的株高明显低于4%蔗糖浓度,存活率统计显示4%蔗糖浓度培养基中的试管苗在7℃保存第270d时全部死亡,8%蔗糖浓度培养基中的试管苗存活率达到61.25%,表明8%蔗糖浓度能明显延长马铃薯试管苗的低温保存时间。由此可见,可以采用8%蔗糖浓度培养基和7℃环境温度用于大部分马铃薯株系的长期低温保存。此外,探究了一种试管苗-组培盒苗交替继代培养的方法,能有效改善长势弱的种质资源的保存,将这些材料在低温保存第90 d的存活率从直接继代试管苗22.50%提高到试管苗-组培盒苗交替继代95.00%。此研究对优化马铃薯种质资源的长期保存条件具有重要的指导作用。

关键词：马铃薯种质资源试管苗低温保存

维普期刊数据库博看期刊

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

马铃薯种质演化与分类研究进展

中国马铃薯 2023年第6期37卷 536-554页

作者：宋波涛涂卫王海波董建科袁平平景晟林刘园园焦文标华中农业大学园艺林学学院/农业农村部马铃薯生物学与生物技术重点实验室湖北武汉430070 黄冈师范学院生物与农业资源学院/经济林木种质改良与资源综合利用湖北省重点实验室湖北黄冈438000 湖北民族大学生物与食品工程湖北恩施445000 国际马铃薯中心亚太中心(中国) 北京102100 四川师范大学生命科学学院/四川师范大学植物功能基因组及生物信息学研究中心四川成都610101

马铃薯野生种具有丰富的遗传变异,是栽培马铃薯遗传改良的重要优良性状来源。然而,关于野生和栽培马铃薯的分类长期以来一直存在争议。1990年Hawkes将Petota组划分为21个分类系,其中包含7个栽培种和228个野生种。随着分子生物学和测序... 详细信息

马铃薯野生种具有丰富的遗传变异,是栽培马铃薯遗传改良的重要优良性状来源。然而,关于野生和栽培马铃薯的分类长期以来一直存在争议。1990年Hawkes将Petota组划分为21个分类系,其中包含7个栽培种和228个野生种。随着分子生物学和测序技术的发展,2014年Spooner等对马铃薯分类进行整合和补充,基于各种形态学和分子证据,最终将Petota组划分为由107个野生种和4个栽培种组成的3个进化枝。此外,考古学和现代基因组学分析证实了***是栽培马铃薯的直接祖先种。随着近年来大量的马铃薯种质被测序,更多的基因组信息被揭示,结合新兴的基因组选择育种、基因编辑等技术,有望创新马铃薯育种模式与机制,为马铃薯精准分子育种提供新思路。综述探究了马铃薯种质演化、分类进展以及利用展望,以期为马铃薯种质资源改良和育种利用提供参考。

关键词：马铃薯种质资源演化分类野生种

OPA柱前衍生化HPLC同时测定川红工夫红茶20种氨基酸含量

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

贵州师范大学学报（自然科学版） 2024年第4期42卷 53-62页

作者：罗学平蒋宾李丽霞钟晓雪杨丽冉焦文文彭康丽陈岗宜宾职业技术学院现代农业学院四川宜宾644003 宜宾川红工夫红茶工程技术研究中心四川宜宾644000

建立在线柱前衍生液相色谱法同时测定不同品种川红工夫红茶中的20种氨基酸含量,并评价其与滋味品质相关性。以邻苯二甲醛(OPA)为衍生试剂,利用液相色谱仪的自动进样器进行柱前衍生,采用Hypersil BDS C 18柱(150 mm×4.6 mm,3μm),以0.01... 详细信息

建立在线柱前衍生液相色谱法同时测定不同品种川红工夫红茶中的20种氨基酸含量,并评价其与滋味品质相关性。以邻苯二甲醛(OPA)为衍生试剂,利用液相色谱仪的自动进样器进行柱前衍生,采用Hypersil BDS C 18柱(150 mm×4.6 mm,3μm),以0.016 mol/L的磷酸盐缓冲液(pH=8.2)与甲醇-乙腈-水(4.5∶4.5∶1,V∶V∶V)组成流动相进行梯度洗脱,流速为1.0 mL/min,柱温50℃,荧光检测器激发波长340 nm、发射波长450 nm;通过相关分析,比较不同滋味属性氨基酸含量与红茶滋味的相关性。结果表明:20种氨基酸在0.195~2.584μg/mL的范围内与各自峰面积呈良好的线性关系,其相关系数为0.9954~0.9999,检测限为0.006~0.036μg/mL,定量限为0.020~0.184μg/mL,加标回收率为90.40%~99.13%;除四川群体种红茶和梅占红茶中未检出组氨酸外,其余氨基酸均在5个品种红茶中检出,氨基酸总量27.33~65.29 mg/g之间,其中含量最高的是黄金芽红茶,氨基酸组分中,含量最高的是茶氨酸,然后是天冬氨酸和谷氨酸;红茶中的鲜味氨基酸、甜味氨基酸、苦味氨基酸、氨基酸总量与红茶的鲜味、甜味和综合滋味评分呈显著或极显著正相关,对红茶滋味的鲜爽度和浓强度起着重要作用。采用OPA柱前衍生反相液相色谱荧光法检测氨基酸组分精密度和回收率高,具有成本低、快速、准确的特点,可用于红茶中20种氨基酸组分的快速测定。

关键词：邻苯二甲醛柱前衍生川红工夫红茶氨基酸

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

古代诗歌常见意象（二）

求学 2022年第1期 48-49页

作者：焦文林

鸟兽类1·杜鹃·古代神话中,蜀王杜宇(即望帝)被迫让位给他的臣子,自己隐居山林。其死后灵魂化为杜鹃。于是古诗中的杜鹃也就成了凄凉、哀伤的象征。李白《闻王昌龄左迁龙标遥有此寄》:"杨花落尽子规啼,闻道龙标过五溪。我寄愁心与明月...

鸟兽类1·杜鹃·古代神话中,蜀王杜宇(即望帝)被迫让位给他的臣子,自己隐居山林。其死后灵魂化为杜鹃。于是古诗中的杜鹃也就成了凄凉、哀伤的象征。李白《闻王昌龄左迁龙标遥有此寄》:"杨花落尽子规啼,闻道龙标过五溪。我寄愁心与明月,随风直到夜郎西。"子规鸟即杜鹃鸟。起句写即目之景,在萧瑟悲凉的自然景物中寄寓离别感伤之情。后以寄情明月的丰富想象,表达对友人的无限怀念与深切同情。

关键词：

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中医治疗肿瘤压迫性视神经病变的研究进展

中国中医基础医学杂志 2023年第2期29卷 345-348页

作者：周芷伊龙思羽孙婉钰焦文鑫王影中国中医科学院眼科医院北京100040

肿瘤压迫是造成视神经病变的常见原因之一,现代医学多通过手术及放化疗消除瘤体以减轻视神经损害,但对于慢性期视神经萎缩尚未有确切有效方案。中医认为本病多为本虚标实,治则以补益肝肾、活血消癥为主,临床及药理研究表明其作用涉及多... 详细信息

肿瘤压迫是造成视神经病变的常见原因之一,现代医学多通过手术及放化疗消除瘤体以减轻视神经损害,但对于慢性期视神经萎缩尚未有确切有效方案。中医认为本病多为本虚标实,治则以补益肝肾、活血消癥为主,临床及药理研究表明其作用涉及多靶点、多通路。中医外治法如针刺可抑制肿瘤生长、增强视觉刺激,能够显著提升患者生存质量及改善视功能,广泛应用于本病的治疗。本研究整合近年来中医治疗肿瘤压迫性视神经病变的研究进展,现对中医病因病机、临床经验及作用机制进行综述。

关键词：中医脑瘤视神经病变

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

超链接侵权的法律规制

南京大学学报（哲学．人文科学．社会科学） 2001年第5期38卷 128-135页

作者：焦文铭南京大学学生工作处南京210093

超链接 (hyperlinks)是一种在INTERNET上获取信息的工具 ,它只是提供一个计算机能看懂的文件地址 ,并没有对被链接的信息做任何形式的操作 ,因而不构成复制、发行和演绎侵权 ,尽管它侵犯了公开传播权 ,却属法定许可。根据商标法 ,超链... 详细信息

超链接 (hyperlinks)是一种在INTERNET上获取信息的工具 ,它只是提供一个计算机能看懂的文件地址 ,并没有对被链接的信息做任何形式的操作 ,因而不构成复制、发行和演绎侵权 ,尽管它侵犯了公开传播权 ,却属法定许可。根据商标法 ,超链接将他人的商品贴上自己的商标 ,构成了反向假冒 ,同时会削弱驰名商标的显著性或区分性 ,也构成了商标注水。由反不正当竞争法来完成规制超链接侵权的使命更为妥当更为合理。目前有必要先采取一些治标之法。

关键词：版权复制权公开传播权发行权演绎权超链接侵权不正当竞争知识产权法法律规制商标法

ICP-AES法同时测定YBC-2中氧化铜、氧化镉、二氧化硅和氮化硼含量

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

航空维修与工程 2023年第4期 90-92页

作者：胡桂英焦文建张桂陈哲成都航利(集团)实业有限公司

YBC-2粉体主要由镍粉、石墨、氧化铜、氧化镉、氮化硼和硅酸钠组成,是一种常用的封严涂层材料。本文采用盐酸、硝酸混合酸溶解YBC-2粉体试样,酸不溶物经过滤灼烧后以无水碳酸钠熔融后合并入溶液;采用电感耦合等离子体发射光谱(ICP-AES)... 详细信息

YBC-2粉体主要由镍粉、石墨、氧化铜、氧化镉、氮化硼和硅酸钠组成,是一种常用的封严涂层材料。本文采用盐酸、硝酸混合酸溶解YBC-2粉体试样,酸不溶物经过滤灼烧后以无水碳酸钠熔融后合并入溶液;采用电感耦合等离子体发射光谱(ICP-AES)标准加入法同时测定溶液中Cu、Cd、Si、B的浓度,换算成氧化物含量。该方法检出限小于0.1mg/L,该方法的加标回收率为96.0%~104.5%,测定值的相对标准偏差小于1%。

关键词： YBC-2粉体标准加入法氧化物含量电感耦合等离子体发射光谱法

维普期刊数据库博看期刊

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

4种藤茶多糖的检测方法比较

现代食品科技 2022年第11期38卷 342-350页

作者：黄耀宗郭清泉焦文娟赵甜甜张友胜黄国滋广东工业大学轻工化工学院广东广州511400 广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所农业部功能食品重点实验室广东省农产品加工重点实验室广东广州510610 广东省农业科学院茶叶研究所广东广州510640

该研究对比探讨了苯酚-硫酸法、蒽酮-硫酸法、硫酸-紫外法、二硝基水杨酸法测定藤茶中多糖含量的准确性,利用单因素试验对4种方法的关键检测条件进行了优化,并对方法学的精密度、重复性、稳定性、加标回收率进行了比较,再用最佳实验条... 详细信息

该研究对比探讨了苯酚-硫酸法、蒽酮-硫酸法、硫酸-紫外法、二硝基水杨酸法测定藤茶中多糖含量的准确性,利用单因素试验对4种方法的关键检测条件进行了优化,并对方法学的精密度、重复性、稳定性、加标回收率进行了比较,再用最佳实验条件检测藤茶样品中多糖的含量。结果表明,用于藤茶多糖测定的最佳方法为苯酚-硫酸法,其最适紫外检测波长为485.5 nm,以葡萄糖为标准在0.1~0.6 mg/mL范围内吸光度具有良好的线性关系。在0.5 mL藤茶粗多糖溶液(质量浓度为0.5 mg/mL)反应体系中,在500μL浓硫酸、600μL 5wt%苯酚溶液、60℃水浴温度和20 min水浴时间的最佳实验条件下,测得其多糖含量为59.43%,其精密度最高(RSD 0.18%),稳定性最好(RSD 0.30%)。最后测得藤茶中幼嫩茎叶和粗老茎叶的多糖含量为9.87~10.47 mg/g和29.77~30.47 mg/g。

关键词：藤茶多糖检测方法比较