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外周血白细胞ANAPC1表达水平与冠心病的相关性及其诊断价值

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广西医科大学学报 2024年第1期41卷 67-77页

作者：张书铭张义炜杨英陈宁园黄玲潘尚领彭均华广西医科大学基础医学院病理生理学教研室南宁530021

目的:探讨外周血白细胞(PBLs)细胞周期末期促复合体亚基1(ANAPC1)表达与冠心病(CHD)的相关性及其诊断价值。方法:从GEO数据库检索基因表达数据集和单细胞RNA测序数据集观察ANAPC1在CHD患者PBLs和其他细胞中的表达情况。通过实时荧光定量... 详细信息

目的:探讨外周血白细胞(PBLs)细胞周期末期促复合体亚基1(ANAPC1)表达与冠心病(CHD)的相关性及其诊断价值。方法:从GEO数据库检索基因表达数据集和单细胞RNA测序数据集观察ANAPC1在CHD患者PBLs和其他细胞中的表达情况。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测和比较70例CHD患者与对照人群ANAPC1的表达水平。用受试者工作特征(ROC)曲线和总ROC(SROC)曲线评价ANAPC1对CHD的诊断价值。使用CDB数据库查找ANAPC1的潜在上游转录因子,ANAPC1差异共表达基因通过基因本体论(GO)、疾病本体论(DO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行富集分析。结果:GEO数据库分析显示,ANAPC1在CHD患者PBLs中的表达水平降低(总SMD=-0.74,95%CI:-1.36~-0.13),SROC曲线下面积为0.76,灵敏度为0.73,特异度为0.67。临床标本RT-qPCR显示,ANAPC1在CHD患者PBLs中的表达水平降低,ROC曲线下面积为0.71,灵敏度为0.80,特异度为0.61。GEO数据库查找单细胞RNA测序相关数据集发现,ANAPC1在不同时期、不同细胞中的表达量均无明显差异。上游潜在转录因子预测显示,ETS1(SMD=-0.53,95%CI:-0.99~-0.06)、GATA3(SMD=-0.46,95%CI:-0.87~-0.06)可能正向调控ANAPC1的表达,IRAK1(SMD=0.42,95%CI:0.07~0.77)、ERF(SMD=0.27,95%CI:-0.03~0.51)可能负向调控ANAPC1的表达。DO富集分析提示,ANAPC1差异负相关共表达基因与动脉粥样硬化及动脉粥样硬化性心脏病等疾病相关。结论:ANAPC1在CHD患者PBLs中的表达下调与CHD发生、发展呈正相关关系,且对CHD具有一定的诊断价值。

关键词：细胞周期末期促复合体亚基1 冠心病单细胞RNA测序分析

外周血白细胞PTK7表达水平对冠心病发生发展的影响及其诊断价值

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中国动脉硬化杂志 2023年

作者：杨英张义炜陈宁园黄玲潘尚领广西医科大学基础医学院病理生理学教研室

目的探究蛋白酪氨酸激酶7（PTK7）与冠心病（CHD）的相关性及其诊断价值。方法通过GEO数据库获得目标基因。采用StataSE15求PTK7的总标准化平均差（TotalSMD），绘制总受试者特征（SROC）曲线。采用逆转录定量PCR（RT-qPCR）验证PTK7... 详细信息

目的探究蛋白酪氨酸激酶7（PTK7）与冠心病（CHD）的相关性及其诊断价值。方法通过GEO数据库获得目标基因。采用StataSE15求PTK7的总标准化平均差（TotalSMD），绘制总受试者特征（SROC）曲线。采用逆转录定量PCR（RT-qPCR）验证PTK7在CHD和非CHD人群样本中的表达情况，并从GeneExpressionOmnibus （GEO）数据库搜索CHD相关单细胞RNA测序数据从而分析PTK7在不同细胞中的表达情况。通过CDB数据库预测PTK7的上游转录因子，对差异共表达基因进行GO，KEGG富集分析。结果通过分析从GEO数据库获取的数据集，发现PTK7在CHD患者外周血白细胞（PBLs）中高表达(TotalSMD=0.81，95%置信区间（CI=0.17～1.45)。人群样本验证也证实了上述结果。绘制SROC，曲线下面积（AUC）=0.79，表明PTK7具有中等的区分CHD与非CHD的能力。单细胞RNA测序分析结果显示PTK7在正常PB不同细胞中表达比例较低。此外通过ChIP-seq数据库预测PTK7潜在的上游转录因子，发现IRAK1，SNAI2可能是PTK7的正相关上游转录因子，EP300，NIPBL可能是PTK7的负相关上游转录因子。结论 PTK7在CHD患者PBLs中高表达，并在CHD的发生发展中起重要作用，具有一定的诊断价值。

关键词：冠心病蛋白酪氨酸激酶7 单细胞RNA测序分析逆转录定量PCR 生物信息学

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留学生病理生理学全英文教学的研究及实践

现代职业教育 2022年第10期 40-42页

作者：黄玲陈宁园彭均华潘尚领广西医科大学病理生理学教研室

以留学生基础医学必修课病理生理学的全英文教学为例,针对留学生医学教学展开探讨,先分析了病理生理学教学的基本特征以及留学生的特点,并结合广西医科大学的情况以及分析结果,探讨了留学生病理生理学全英文教学的思路,最后提出了留学... 详细信息

以留学生基础医学必修课病理生理学的全英文教学为例,针对留学生医学教学展开探讨,先分析了病理生理学教学的基本特征以及留学生的特点,并结合广西医科大学的情况以及分析结果,探讨了留学生病理生理学全英文教学的思路,最后提出了留学生线上病理生理学教学实施策略。

关键词：病理生理学全英文教学教学实施线上教学

过氧化物酶增殖物激活受体δ对糖脂代谢的影响

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中国老年学杂志 2015年第10期35卷 2838-2840,2841页

作者：陈宁园潘尚领广西医科大学病理生理学教研室广西南宁530021

过氧化物酶增殖物激活受体(PPARs)是核受体超家族的成员之一,发现于1990年,迄今为止已确定3个亚型:PPARα、PPARβ/δ和PPARγ。其中PPARδ在糖脂代谢、转运和胰岛素敏感性方面发挥重要的调节作用。PPARδ的活化不仅可以减轻肥胖、改善... 详细信息

过氧化物酶增殖物激活受体(PPARs)是核受体超家族的成员之一,发现于1990年,迄今为止已确定3个亚型:PPARα、PPARβ/δ和PPARγ。其中PPARδ在糖脂代谢、转运和胰岛素敏感性方面发挥重要的调节作用。PPARδ的活化不仅可以减轻肥胖、改善胰岛素抵抗(IR),还可促进巨噬细胞胆固醇代谢,抑制炎症介质表达而减缓动脉粥样硬化的进程。

关键词：过氧化物酶增殖物激活受体δ 糖脂代谢

外周血白细胞PTK7表达水平与冠心病的相关性及其诊断价值

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中国动脉硬化杂志 2023年第11期31卷 958-968页

作者：杨英张义炜陈宁园黄玲潘尚领广西医科大学基础医学院病理生理学教研室广西南宁市530021

[目的]探究蛋白酪氨酸激酶7(PTK7)与冠心病(CHD)的相关性及其诊断价值。[方法]通过GEO数据库获得目标基因。采用StataSE15求PTK7的总标准化平均差(total SMD),绘制总受试者特征(SROC)曲线。采用反转录定量PCR(RT-qPCR)验证PTK7在CHD和... 详细信息

[目的]探究蛋白酪氨酸激酶7(PTK7)与冠心病(CHD)的相关性及其诊断价值。[方法]通过GEO数据库获得目标基因。采用StataSE15求PTK7的总标准化平均差(total SMD),绘制总受试者特征(SROC)曲线。采用反转录定量PCR(RT-qPCR)验证PTK7在CHD和对照组人群样本中的表达情况,并从GEO数据库搜索CHD相关单细胞RNA测序数据从而分析PTK7在不同细胞中的表达情况。通过CDB数据库预测PTK7的上游转录因子,对差异共表达基因进行GO和KEGG富集分析。[结果]通过分析从GEO数据库获取的数据集,发现PTK7在CHD患者外周血白细胞(PBL)中高表达(total SMD=0.81,95%CI=0.17~1.45)。人群样本验证也证实了上述结果。绘制SROC,曲线下面积(AUC)=0.79,表明PTK7具有中等的区分CHD与非CHD的能力。单细胞RNA测序分析结果显示PTK7在正常外周血不同细胞中表达比例较低。此外通过ChIP-seq数据库预测PTK7潜在的上游转录因子,发现IRAK1、SNAI2可能是PTK7的正相关上游转录因子,EP300、NIPBL可能是PTK7的负相关上游转录因子。[结论]PBL中PTK7的高表达与CHD发生呈正相关,具有一定的诊断价值。

关键词：冠心病蛋白酪氨酸激酶7 单细胞RNA测序分析反转录定量PCR 生物信息学

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呼吸系统基础与疾病教学模块建设及优化

基础医学教育 2023年第2期25卷 115-118页

作者：陈宁园黄玲邓冯媛唐君彭均华潘尚领罗彬广西医科大学基础医学院病理生理学教研室南宁530021 广西医科大学基础医学院组织胚胎学教研室

文章立足于新医科背景,在深入剖析广西医科大学临床医学教学改革班呼吸系统基础与疾病教学模块整合前后所遇主要问题及原因的基础上,系统阐述了呼吸系统基础与疾病教学团队在课程整合及优化中所采取的系列教学改革措施及课程建设取得的... 详细信息

文章立足于新医科背景,在深入剖析广西医科大学临床医学教学改革班呼吸系统基础与疾病教学模块整合前后所遇主要问题及原因的基础上,系统阐述了呼吸系统基础与疾病教学团队在课程整合及优化中所采取的系列教学改革措施及课程建设取得的初步成效。

关键词：呼吸系统基础与疾病整合课程教学改革

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留学生病理生理学教学的探索和思考

广西医科大学学报 2006年第S1期23卷 92-93页

作者：潘尚领黄龄瑾刘承武广西医科大学病理生理学教研室南宁530021

基于lncRNA表达谱变化探讨Scoparone对肝损伤的干预效应

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广西大学学报（自然科学版） 2021年第3期46卷 778-784页

作者：吕建林潘尚领广西医科大学基础医学院广西南宁530021 广西中医药大学第一附属医院广西南宁530023

对乙酰氨基酚(APAP)诱导大鼠急性药物性肝损伤,基于大鼠肝脏长链非编码RNA(lncRNA)表达谱的检测,探讨中药茵陈蒿(Artemisia capillaris Thunb)活性成分6,7-二甲氧基香豆素(Scoparone,简称Sco)保护肝损伤的分子机制。将30只大鼠随机分为... 详细信息

对乙酰氨基酚(APAP)诱导大鼠急性药物性肝损伤,基于大鼠肝脏长链非编码RNA(lncRNA)表达谱的检测,探讨中药茵陈蒿(Artemisia capillaris Thunb)活性成分6,7-二甲氧基香豆素(Scoparone,简称Sco)保护肝损伤的分子机制。将30只大鼠随机分为对照组、模型组和Sco干预组。采用腹腔注射APAP(800 mg/kg)建立急性药物性肝损伤模型;Sco干预组给予Sco(500μmol)灌胃,连续干预5 d后取材;对照组和模型组给予等量橄榄油。给药结束后,收集血清测定生化指标;采用lncRNA基因芯片技术筛选组间肝组织差异表达lncRNAs,并采用实时荧光定量PCR法对lncRNA靶基因表达进行验证。结果表明:大鼠血清ALT、AST和T-BIL含量相对于对照组,模型组显著升高(均P<0.0001)。但Sco干预后,含量均显著下降(均P<0.0001)。筛选组间表达差异倍数大于2且显著的lncRNA,9个lncRNA在模型组显著上调,但Sco干预后显著下调;6个lncRNA在模型组显著下调,但Sco干预后显著上调。相对于对照组,差异表达lncRNA NONRATG 022224.2的靶基因Vdr表达水平显著下降(P<0.001),但Sco干预后,Vdr表达水平显著提高(P<0.01)。Sco对大鼠急性药物性肝损伤具有一定的保护作用,lncRNA NONRATG 022224.2靶向调控Vdr基因可能在Sco保护大鼠急性药物性肝损伤中发挥重要作用。

关键词：急性药物性肝损伤长链非编码RNA 6,7-二甲氧基香豆素

hsa-miR-423-5p激活IL1R1基因在冠心病中的作用机制

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广西医科大学学报 2023年第6期40卷 997-1004页

作者：王癸丁陈晶杨英潘尚领彭均华广西医科大学基础医学院南宁530021

目的:通过人群表达水平及转录组测序分析hsa-miR-423-5p靶向目标基因在冠心病(CHD)中的作用机制。方法:选取广西医科大学第一附属医院收治的151例CHD患者(CHD组),同期选择健康体检者作为健康对照组。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测... 详细信息

目的:通过人群表达水平及转录组测序分析hsa-miR-423-5p靶向目标基因在冠心病(CHD)中的作用机制。方法:选取广西医科大学第一附属医院收治的151例CHD患者(CHD组),同期选择健康体检者作为健康对照组。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测外周血白细胞中hsa-miR-423-5p表达水平,通过Spearman相关分析对hsa-miR-423-5p与各临床指标的相关关系进行分析。在*** 926细胞中过表达hsa-miR-423-5p后进行hsa-miR-423-5p的亚细胞定位实验及转录组测序。针对测序结果预测hsa-miR-423-5p的潜在靶基因,对其进行RT-qPCR实验验证并分析目标基因与hsa-miR-423-5p表达水平及各临床指标之间的相关关系。结果:CHD组外周血白细胞中hsa-miR-423-5p的表达水平显著低于健康对照组(P<0.05)。hsamiR-423-5p的表达量与总胆固醇(TC)呈负相关关系,与高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)呈正相关关系(P<0.05)。在***926细胞中过表达hsa-miR-423-5p,亚细胞定位实验显示hsa-miR-423-5p主要存在于细胞核内。转录组测序结果经过分析验证后,发现过表达hsa-miR-423-5p后可上调IL1R1表达。CHD组中IL1R1的表达水平低于健康对照组(P<0.01),IL1R1表达水平与hsa-miR-423-5p表达水平、HDL-C均呈正相关关系(P<0.01)。结论:hsa-miR-423-5p及IL1R1在CHD患者中呈低表达且与TC和HDL-C相关;hsa-miR-423-5p在内皮细胞上调IL1R1的表达进而影响血脂水平,提示hsa-miR-423-5p可能通过调控IL1R1基因影响脂质代谢及内皮细胞功能从而参与CHD的进展。

关键词： hsa-miR-423-5p 冠心病 IL1R1 血脂水平