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细胞焦亡与溃疡性结肠炎及中医药调控的研究进展

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中国实验方剂学杂志 2020年第15期26卷 200-206页

作者：吴娜毛祥坤于男李华山江西中医药大学附属医院南昌330006 南昌市洪都中医院南昌330006 中国中医科学院广安门医院北京100053

细胞焦亡是不同于细胞坏死、凋亡、自噬的细胞程序性死亡的一种新形式,表现为细胞不断肿胀直至胞膜破裂,导致细胞内容物的释放进而激活强烈的炎症反应。细胞焦亡信号通路分为依赖于半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-1(Caspase-1)的经典途径和依... 详细信息

细胞焦亡是不同于细胞坏死、凋亡、自噬的细胞程序性死亡的一种新形式,表现为细胞不断肿胀直至胞膜破裂,导致细胞内容物的释放进而激活强烈的炎症反应。细胞焦亡信号通路分为依赖于半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-1(Caspase-1)的经典途径和依赖于半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-4,5,11(Caspase-4,5,11)的非经典途径,其中经典途径中Caspase-1的激活依赖于炎性小体发挥作用,非经典途径则是直接激活Caspase-4,5,11,最终导致gasdermin D(GSDMD)蛋白裂解,诱导膜孔隙的形成,白细胞介素-1β(IL-1β),IL-18成熟及释放,细胞膜破裂而发生焦亡。溃疡性结肠炎是一种消化系统常见的疑难病,具有病程长、易复发、难治愈等特点。目前其发病机制尚未完全清楚,但近年研究发现细胞焦亡对溃疡性结肠炎的发生发展有重要作用。中医药防治该病由来已久,临床疗效显著,研究发现中药防治该病的作用机制与炎症小体、焦亡产物IL-1β,IL-18等关系密切,中医药调控溃疡性结肠的分子机制与细胞焦亡存在一定相关性。故本文就细胞焦亡与溃疡性结肠炎之间关系及中医药的调控作用进行综述。

关键词：细胞焦亡溃疡性结肠炎 Nod样受体蛋白3(NLRP3) 中医药

溃疡性结肠炎活动期关键基因与治疗中药的生信分析及系统评价

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中国中药杂志 2020年第11期45卷 2677-2686页

作者：吴娜毛祥坤万治平于男李华山中国中医科学院广安门医院北京100053 南昌市洪都中医院江西南昌330006

在GEO数据库下载包含溃疡性结肠炎活动期基因芯片数据GSE75214,GSE48959。以调整P<0.05及|log2 FC|≥1.5为筛选差异基因的标准进行分析,得出溃疡性结肠炎(UC)活动期差异基因。STRING数据库进行PPI分析,DAVID数据库进行GO及KEGG pathway... 详细信息

在GEO数据库下载包含溃疡性结肠炎活动期基因芯片数据GSE75214,GSE48959。以调整P<0.05及|log2 FC|≥1.5为筛选差异基因的标准进行分析,得出溃疡性结肠炎(UC)活动期差异基因。STRING数据库进行PPI分析,DAVID数据库进行GO及KEGG pathway分析。Cytoscape软件对活动期差异基因进行可视化并计算出活动期关键基因。Coremine Medical分析治疗关键基因的中药并进行系统评价。最终筛选出符合条件的活动期139个差异基因(109个上调基因,30个下调基因)。DAVID分析这些差异基因的生物与通路主要富集在炎症反应、免疫反应、趋化因子活性、TNF通路、NF-κB通路、Toll样受体通路等方面。Cytoscape软件计算出IL-6,CXCL8,IL-1β,MMP9,CXCL1,ICAM1,CXCL10,TIMP1,PTGS2,CXCL9为UC活动期关键基因。Coremine Medical分析得出治疗UC活动期的中药有姜黄、黄芩、郁金,其中黄芩有清热祛湿、泻火解毒功效,符合UC活动期病机,且临床常用于治疗湿热泄泻,故选以黄芩为君药的方剂(黄芩汤)进行系统评价。经过评价可知黄芩在提高临床有效率、降低炎症因子及免疫球蛋白水平方面均优于单纯西医治疗,差异具有统计学意义,且不良反应少。该研究对UC活动期基因及其作用机制的分析为进一步深入研究UC活动期发病机制提供了新思路,对治疗UC活动期中药及系统评价为临床中医药防治UC提供了依据。

关键词：溃疡性结肠炎活动期生信分析系统评价关键基因治疗中药

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哮喘的病因及中医治疗的近况

中医临床研究 2010年第10期2卷 34-35页

作者：韩玲毛祥坤吴小庆江西中医学院科技学院江西南昌330025

哮喘的病因涉及广泛，以中医治疗为主要切入点，综合了各种治疗方案和药物，对哮喘中医治疗的发展前景进行了展望。

关键词：哮喘病因诊断中医治疗

基于网络药理学及分子对接研究健脾化浊调脂颗粒治疗非酒精性脂肪肝的分子作用机制

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中华中医药学刊 2020年第1期38卷 57-60页

作者：吴娜毛祥坤徐驲于男刘中勇江西中医药大学附属医院江西南昌330006 南昌市洪都中医院江西南昌330006

目的通过网络药理学及分子对接技术探讨健脾化浊调脂颗粒(国家专利号ZL 201510430075.8)治疗非酒精性脂肪肝的具体分子机制。方法通过中国知网、TCMSP、BATMAN-TCM 3个数据库对健脾化浊调脂颗粒主要成分及潜在作用靶点进行收集。从DisGe... 详细信息

目的通过网络药理学及分子对接技术探讨健脾化浊调脂颗粒(国家专利号ZL 201510430075.8)治疗非酒精性脂肪肝的具体分子机制。方法通过中国知网、TCMSP、BATMAN-TCM 3个数据库对健脾化浊调脂颗粒主要成分及潜在作用靶点进行收集。从DisGeNET数据库中寻找与非酒精性脂肪肝相关的疾病基因与潜在靶点进行映射,得出健脾化浊调脂颗粒治疗非酒精性脂肪肝最终作用靶标。将最终靶标输入STRING数据库得出"蛋白-蛋白"相互作用关系,并用Cytoscape软件进行可视化。输入DAVID数据库进行KEGG PATHWAY富集,得出其可能作用的分子机制并构建"活性成分-靶标-作用通路"网络图。将"蛋白-蛋白"互作图中排名前5位靶标蛋白与君药进行分子对接,以验证其治疗作用。结果通过网络药理学预测后发现,健脾化浊调脂颗粒中有117个有效成分可用于治疗NAFLD,其中涉及113个靶基因及包括AMPK、PPAR、FOXO、胰岛素抵抗等18个信号通路。通过分子对接发现,5个靶标蛋白与君药结合性较好。结论从分子对接技术揭示了健脾化浊调脂颗粒有直接治疗非酒精性脂肪肝的作用,从网络药理学角度初步揭示了其治疗非酒精性脂肪的分子机制,为后续的研究提供了基础。

关键词：网络药理学分子对接健脾化浊调脂颗粒分子机制

基于生物信息学分析肝癌组织中关键基因及MicroRNA

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中华中医药学刊 2019年第12期37卷 2874-2879,I0035,I0036页

作者：吴娜毛祥坤万治平李瀚旻江西中医药大学附属医院江西南昌330006 南昌市洪都中医院江西南昌330006 湖北省中医院湖北中医药大学附属医院湖北省中医药研究院湖北武汉430061

目的:探讨肝细胞癌中关键基因、miRNA及相关的信号通路。方法:在美国国立生物技术信息中心数据库GEO(Gene Expression Omnibus)中下载4个芯片数据(GSE62232、GSE84598及GSE452673个基因数据及GSE98269miRNA数据)进行分析。将筛选出的差... 详细信息

目的:探讨肝细胞癌中关键基因、miRNA及相关的信号通路。方法:在美国国立生物技术信息中心数据库GEO(Gene Expression Omnibus)中下载4个芯片数据(GSE62232、GSE84598及GSE452673个基因数据及GSE98269miRNA数据)进行分析。将筛选出的差异基因(differentially expressed genes,DEGs)输入DAVID数据库进行Gene ontology(GO)及Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析,用Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作分析图。将筛选出的差异miRNA(differentially expressed miRNAs,DEMs)用在线软件miRDB进行靶基因预测。结果:通过筛选后发现152个DEGs(103个下调基因及49个上调基因)及34个DEMs(26个DEMs高表达,8个DEMs低表达)。经过DAVID分析后发现P53信号通路、卵母细胞减数分裂等生物过程参与肝癌的发生发展。结论:在152个DEGs中TOP2A、AURKA、HMMR、ANLN、CCNB1、CCNB2、CDK1、CDK3、CENPF、NDC80等10个过表达靶基因可作为肝癌的潜在生物学标记物,miR-424-5p为肝癌的重要miRNA,P53信号通路可能是肝癌的关键作用分子机制。

关键词：肝癌生信分析 DEGs DEMs 信号通路

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肛周及会阴部急性坏死性筋膜炎1例

中国肛肠病杂志 2015年第1期35卷 66-67页

作者：毛祥坤潘琦虹魏武江西中医药大学江西南昌330006 江西中医药大学科技学院江西南昌330025 贵阳中医学院贵州贵阳550001

患者男，47岁。因“腰骶部疼痛1周，多饮、多尿3d”，于2014年4月14日入我院内分泌科治疗。查体：T37．7℃，HR84次／min，R20次／min，BP130／71mmHg。急性病容，查心肺腹部无明显异常。

关键词：急性坏死性筋膜炎会阴部肛周腰骶部疼痛内分泌科急性病

基于网络药理学和分子对接的理肠四方治疗溃疡性结肠炎分子机制的比较研究

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中药材 2020年第1期43卷 186-192页

作者：吴娜毛祥坤魏武于男饶智颖李华山中国中医科学院广安门医院北京100053 南昌市洪都中医院江西南昌330006 江西中医药大学江西南昌330006

目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨理肠四方(白头翁汤、参苓白术散、痛泻要方、乌梅丸)治疗溃疡性结肠炎的分子机制及比较作用。方法:从TCMSP、BATMAN-TCM、DisGeNET数据库中得出理肠四方治疗溃疡性结肠炎的作用靶标,对共有基因构... 详细信息

目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨理肠四方(白头翁汤、参苓白术散、痛泻要方、乌梅丸)治疗溃疡性结肠炎的分子机制及比较作用。方法:从TCMSP、BATMAN-TCM、DisGeNET数据库中得出理肠四方治疗溃疡性结肠炎的作用靶标,对共有基因构建PPI网络。利用DAVID数据库进行KEGG Pathway富集并构建"活性成分-靶标-作用通路"图。将PPI中排名前5的靶标与君药进行分子对接。结果:网络药理学发现白头翁汤作用该病的靶基因147个,有效成分75个,通路4个。参苓白术散靶基因230个,有效成分306个,通路8个。痛泻要方靶基因193个,有效成分134个,通路28个。乌梅丸靶基因202个,有效成分331个,通路30个,且其作用Toll样受体、NF-κB信号通路最明显。分子对接表明靶标蛋白与君药结合性较好。结论:四方均有治疗溃疡性结肠炎的作用,从分子生物学层面比较乌梅丸效果更好。本研究为后续的研究提供了基础。

关键词：网络药理学分子对接理肠四方溃疡性结肠炎比较研究

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刘中勇教授临床常用药对拾萃

中西医结合心血管病电子杂志 2016年第27期4卷 153-154页

作者：毛祥坤吴娜潘琦虹刘中勇江西中医药大学湖北中医药大学江西中医药大学科技学院江西中医药大学附属医院心血管科

药对又叫对药,是指处方配伍中成对出现的药物,它是医家长期临床实践的总结,用药经验的升华,亦体现了中医遣方用药的特色及优势。刘中勇教授为江西省名中医,现任江西中医药大学附属医院副院长,从事中医内科临床、教学、科研30余载,在中... 详细信息

药对又叫对药,是指处方配伍中成对出现的药物,它是医家长期临床实践的总结,用药经验的升华,亦体现了中医遣方用药的特色及优势。刘中勇教授为江西省名中医,现任江西中医药大学附属医院副院长,从事中医内科临床、教学、科研30余载,在中医内科疾病以及疑难杂症诊疗方面经验丰富。刘师在临证过程中常用药对,多获良效。

关键词：中药对药临床运用刘中勇名医经验

基于GEO数据库分析非酒精性脂肪肝关键分子机制

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江西中医药大学学报 2019年第5期31卷 30-34页

作者：吴娜毛祥坤许嵩江西中医药大学附属医院南昌330006 南昌市洪都中医院南昌330006

目的:探讨非酒精性脂肪肝中关键分子机制。方法:在GEO数据库下载数据GSE89632进行分析。将筛选出的差异基因(DEGs)输入DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,用Cytoscape软件构建PPI互作分析图,用Cytohubba软件求得10个靶基因。结果:通过筛... 详细信息

目的:探讨非酒精性脂肪肝中关键分子机制。方法:在GEO数据库下载数据GSE89632进行分析。将筛选出的差异基因(DEGs)输入DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,用Cytoscape软件构建PPI互作分析图,用Cytohubba软件求得10个靶基因。结果:通过筛选后发现124个DEGs(103个上调基因及21个下调基因)。经过DAVID分析后发现TNF信号通路、JAK/STAT信号通路等参与NAFLD的发生发展。结论:JUN、IL6、FOS、MYC、CCL2、IL8、IL1B、ATF3、EGR1、SERPINE1等10个过表达靶基因可作为脂肪肝的潜在生物学标记物,TNF信号通路可能是其关键作用分子机制。

关键词：非酒精性脂肪肝差异基因信号通路