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分子动力学模拟中支持CIF蛋白质文件格式（英文）

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中国科学技术大学学报 2024年第3期 3-9页

作者：王恒越张志勇中国科学技术大学物理系

分子动力学(MD)模拟能够以非常精细的时间分辨率捕捉蛋白质的全原子动态行为，因此它已经成为蛋白质动力学研究的重要工具。当前有多种MD软件包被广泛使用。MD模拟需要从一个蛋白质初始结构开始，而初始结构一般来自蛋白质数据库(PDB)... 详细信息

分子动力学(MD)模拟能够以非常精细的时间分辨率捕捉蛋白质的全原子动态行为，因此它已经成为蛋白质动力学研究的重要工具。当前有多种MD软件包被广泛使用。MD模拟需要从一个蛋白质初始结构开始，而初始结构一般来自蛋白质数据库(PDB)。直到2014年，PDB文件格式一直是蛋白质结构的标准格式。然而，PDB格式存在一些内在缺陷，例如以固定宽度存储结构信息，这对于超大型蛋白质复合物来说存在问题。因此，CIF文件格式被提出来替代PDB格式，前者的特点是具有出色的扩展性。据我们所知，目前主流的MD软件包只支持PDB格式，而不直接支持CIF格式。在本研究中，我们修改了一个MD软件包GROMACS的源代码，使其能够支持输入CIF格式的蛋白质结构文件，并生成拓扑文件。这项工作将简化大型蛋白质复合物MD模拟中的预处理过程。

关键词：蛋白质数据库 PDB格式 CIF格式分子动力学模拟 GROMACS

高取向稳定性的苯并环丁烯基二阶非线性光学材料

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高取向稳定性的苯并环丁烯基二阶非线性光学材料

作者：尤星越长春工业大学

学位级别：硕士

随着信息时代的疾速推进,一幅幅令人瞩目的景象不断吸引着我们的目光。信息技术以多种形式如雨后春笋般涌现,互联网、多媒体和卫星通信等已深深融入人们的日常生活,成为不可或缺的一部分。其中,具有非线性光学性质的材料,即非线性光学（... 详细信息

随着信息时代的疾速推进,一幅幅令人瞩目的景象不断吸引着我们的目光。信息技术以多种形式如雨后春笋般涌现,互联网、多媒体和卫星通信等已深深融入人们的日常生活,成为不可或缺的一部分。其中,具有非线性光学性质的材料,即非线性光学（NLO）材料,在通信领域发挥着举足轻重的作用。特别是有机二阶NLO材料,它们凭借卓越的光电活性、出众的激光损伤阈值以及极短的响应时间,赢得了广泛的赞誉。有机NLO材料凭借其独特的光电活性,正引领着光学领域的一场革命。材料的核心是生色团,其排列（取向）的稳定性对材料的使用寿命具有至关重要的作用。苯并环丁烯（BCB）基树脂经交联反应后表现出优异的热稳定性,是一种良好的包封材料。然而由于BCB的交联温度较高,因此直接用于二阶非线性光学材料仍然是一个挑战。本文合成了一系列苯并环丁烯基二阶非线性光学材料,首先研究了热交联苯并环丁烯基二阶非线性光学材料对生色团取向稳定性的影响。接着在热交联基础上,对热交联存在的问题进行进一步改善,通过引入光交联,合成了一系列光热双交联苯并环丁烯基二阶非线性光学材料,首次利用光热双交联来提高生色团取向稳定性。首先,针对苯并环丁烯开环温度较高的问题,合成了一系列热交联苯并环丁烯基二阶非线性光学材料,并且通过核磁光谱表征了其结构。通过添加双马来酰亚胺（B MI）作为交联剂调节交联温度,并通过DSC研究了交联剂添加量对交联程度的影响以及通过TGA研究交联前后材料热稳定性。结果表明,双马来酰亚胺的添加可有效降低苯并环丁烯的交联温度（峰值温度从194℃降至160℃）,同时交联后,由于BMI和BCB之间形成三维交联网络,因此材料的热稳定性有明显提升,聚合物质量损失5 wt%的温度提升了100℃,生色团取向稳定性也得到明显提升,TSD峰值温度从84℃上升到110℃。第二,在前一工作中发现,虽然通过添加双马来酰亚胺可以有效降低苯并环丁烯的开环温度,但对于生色团仍具有较高的热稳定性要求,为了防止生色团在极化过程中产生不必要的分解,我们在此基础上又合成了一系列光热双交联苯并环丁烯基二阶非线性光学材料并且通过核磁光谱表征了其结构。紫外可见光谱表明,光热双交联可以对生色团提供一定程度的保护。电光系数(r)测量结果表明,光热双交联对电光系数值基本没有影响。光热双交联后,TSD测试结果显示,生色团取向稳定性显著提高,最大提高42℃,并且优于单热交联以及单光交联。

关键词：交联二阶非线性光学材料生色团取向稳定性

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基于具身认知的我国传统节日IP设计研究

包装工程 2024年第2期45卷 444-451,471页

作者：刘鑫周欣越辽宁科技大学辽宁鞍山114051

目的以我国传统节日文化内容为核心,提取、构建传统节日IP设计因子,并转化为形象设计应用的新路径,以探索传统节日文化创新发展新思路,从而助力中国传统节日文化创新发展。方法分析用户在节日活动时的具身认知发展特征,构建具身认知... 详细信息

目的以我国传统节日文化内容为核心,提取、构建传统节日IP设计因子,并转化为形象设计应用的新路径,以探索传统节日文化创新发展新思路,从而助力中国传统节日文化创新发展。方法分析用户在节日活动时的具身认知发展特征,构建具身认知与我国传统节日IP设计关联的感知层、行为层和情境层,转化为节日文化设计因子。以春节为例,利用春节的文化内容为设计来源,将具身认知理论应用到春节IP设计及IP文创设计中。结果围绕传统节日文化具身认知设计方法研究,开展我国传统节日IP形象设计与IP文创设计实践。结论基于具身认知视角下我国传统节日IP的设计研究,是建立在我国人民对传统节日文化独有的情感认知下进行的,有助于探索传统节日文化的创新发展新路径,实现传统节日文化的传承与创新。

关键词：传统节日IP 具身认知 IP设计

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基于增材制造的钛合金构件低温疲劳行为与机理研究

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基于增材制造的钛合金构件低温疲劳行为与机理研究

作者：吴自越北方工业大学

学位级别：硕士

增材制造中的选择性激光熔化(Selective Laser Melting,SLM)作为一种先进的制造技术,能够高效制造复杂的金属构件。与传统工艺制造的构件相比,SLM构件通常表现出较高的强度和硬度,并伴随着较低的塑性。SLM构件中不可避免的会产生孔隙等... 详细信息

增材制造中的选择性激光熔化(Selective Laser Melting,SLM)作为一种先进的制造技术,能够高效制造复杂的金属构件。与传统工艺制造的构件相比,SLM构件通常表现出较高的强度和硬度,并伴随着较低的塑性。SLM构件中不可避免的会产生孔隙等缺陷,会影响构件的力学与疲劳性能,而在低温环境下可能会对构件疲劳性能造成更严重的影响。本文通过SLM制备了Ti-6Al-4V拉伸试样,开展了室温和低温(77K)拉伸试验。结果表明,SLM Ti-6Al-4V试样在室温下展现出了与传统轧制Ti-6Al-4V试样相近的力学性能,且具有良好的加工硬化性能,在低温下屈服强度和抗拉强度进一步提升,但塑性有所降低。基于ABAQUS疲劳分析模块,建立了孔隙缺陷不同形状、位置、大小、相互距离、数量及孔隙率的模型,研究了不同孔隙缺陷对SLM Ti-6Al-4V试样疲劳寿命的影响规律。结果表明,含有孔隙缺陷的试样比无缺陷试样疲劳寿命降低了一个数量级,试样含有非球型孔隙缺陷比含有球型孔隙缺陷对疲劳寿命影响更为显著。半径在10-30μm时,内部孔隙缺陷比表面孔隙缺陷对疲劳寿命影响更为显著;半径在40-70μm时则相反;孔隙缺陷距自由表面越近对疲劳寿命的影响越显著。孔隙率小于1%时孔隙缺陷半径越大,试样疲劳寿命变化幅度越大;孔隙率在1%-5%之间时混合孔隙缺陷的试样疲劳寿命最低,含有不同排列的混合孔隙缺陷的试样疲劳寿命会在一个范围内波动。将损伤本构模型编写进USDFLD子程序并耦合到ABAQUS,使用非线性随动硬化和各向同性硬化的混合硬化模型来描述弹塑性行为,模拟了不同应变幅下的低周疲劳损伤演化以及材料的疲劳寿命,分析了SLM Ti-6Al-4V材料中孔隙缺陷的大小对试样疲劳寿命的影响。结果表明,损伤模型预测寿命与试验寿命吻合较好,预测寿命平均误差为5.392%。对Ti-6Al-4V和SLM Ti-6Al-4V材料进行疲劳寿命模拟,模拟数据与文献数据吻合较好。SLM Ti-6Al-4V材料中孔隙缺陷在高应力时,半径在0.025mm和0.03mm时,疲劳寿命的变化趋势出现拐点;在低应力时,半径在0.02mm、0.03mm和0.05mm时,疲劳寿命的变化趋势出现拐点。建立了叶轮构件的有限元模型,分析了叶轮构件的应力与损伤分布特点,探究了温度对叶轮构件疲劳寿命的影响规律。结果表明,使用应力应变曲线替代循环应力应变曲线进行简化计算,得到低温下疲劳寿命的变化趋势与文献结果相近。在叶根位置存在明显的应力集中现象,同时也是构件产生疲劳损伤的位置。低温条件下构件的疲劳寿命显著低于室温条件下的疲劳寿命。在低应力区,20K与77K条件下构件的疲劳寿命相差不大;在高应力区,20K条件下构件的疲劳寿命显著低于77K条件下的疲劳寿命;随着应力的增高,低温疲劳寿命受温度变化的影响进一步增大。

关键词：增材制造 Ti-6Al-4V合金孔隙缺陷有限元疲劳

中文体育类核心期刊元分析的选题和方法学问题

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体育科学 2024年第1期44卷 88-96,F0003页

作者：徐恺殷明越王然上海体育大学竞技运动学院上海200438

目的:探讨中文体育类核心期刊中元分析的选题和方法学问题,进行评价和举例分析,提出相应建议。方法:以中国知网数据库中16本中文体育类核心期刊发表的元分析研究为对象,依据Cochrane手册和经典元分析文献探讨体育科学领域元分析存在的... 详细信息

目的:探讨中文体育类核心期刊中元分析的选题和方法学问题,进行评价和举例分析,提出相应建议。方法:以中国知网数据库中16本中文体育类核心期刊发表的元分析研究为对象,依据Cochrane手册和经典元分析文献探讨体育科学领域元分析存在的选题问题,并评估所选元分析研究的方法学问题。方法学问题的主要评估指标为:1)是否存在异常值(效应量>3);2)是否将标准误换算成标准差;3)是否忽略了研究内的相关性;4)是否忽略了研究内的方差;5)是否关注研究内而非研究间;6)报告多个效应量的研究是否仅提取某一个效应量。结果:在选题方面,71.1%的中文元分析的研究主题与既有英文元分析相似,其中27.3%的中文元分析题目名称与英文元分析几乎相同。在方法学方面,82.2%的元分析至少存在1个方法学问题,这些问题可能导致43.8%的元分析结果发生变化。结论:元分析应以解决具有实际意义的研究问题为出发点。在进行元分析时,研究者应仔细检查原始数据的报告形式,并采用多种效应模型、分析方法、合并策略、元分析软件及展示方式,通过团队合作确保元分析结果的稳定性。更重要的是,需在方法部分详细介绍和解释分析过程,以提高研究的透明度和可重复性。

关键词：元分析选题方法学效应量体育

全部真相：一位宇宙学家对追求客观现实的反思（节选）英译汉翻译实践报告

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全部真相：一位宇宙学家对追求客观现实的反思（节选）英译汉翻译...

作者：冯德越齐鲁工业大学

学位级别：硕士

本翻译实践材料选自詹姆斯·皮布尔斯(*** Peebles)所著的《全部真相:一个宇宙学家对追求客观现实的深度思考》(The Whole Truth:A Cosmologist’s Reflections on the Search for Objective Reality)一书的第三章和第四章。本书是一部... 详细信息

本翻译实践材料选自詹姆斯·皮布尔斯(*** Peebles)所著的《全部真相:一个宇宙学家对追求客观现实的深度思考》(The Whole Truth:A Cosmologist’s Reflections on the Search for Objective Reality)一书的第三章和第四章。本书是一部以宇宙学为例,深度探讨关于科学与现实本质等重大问题的著作。本书是世界上最受尊敬的宇宙学家之一詹姆斯·皮布尔斯在探索真相的志业中所汇集的个人思考。这些反思包括物理学的核心,客观现实的概念是否有意义,以及现有的物理理论在解释现实方面是否足够有效。因此,译者一方面需要确保科学知识能够准确传递,另一方面也需要确保翻译的语言易于理解,避免晦涩难懂。本文运用尤金·奈达(Eugene Nida)的功能对等理论进行翻译实践,旨在提供可读性强的译本,以期为关注宇宙学领域的读者提供借鉴与参考价值。本报告共包括六个部分。第一章介绍选题的背景,以及翻译实践的目的和意义。第二章主要分析原文本并介绍了本次实践的具体内容。第三章对译前准备、译中遇到的问题和译后反馈做出阐述。第四章简述奈达的功能对等理论及其对哲学科学文本翻译的指导作用。第五章为案例分析,主要从奈达功能对等的词汇对等、句法对等、篇章对等和文体对等这四个方面,探究科学文本具体的翻译策略和翻译方法。最后一章译者对本次翻译实践进行总结,并指出如何在功能对等理论的指导下有效提高科学哲学文本的翻译质量。

关键词：宇宙学奈达功能对等理论翻译实践

产脂肪酶木糖葡萄球菌YCC3全基因组测序及序列分析

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食品科学技术学报 2024年第3期42卷 126-138页

作者：刘莹蒙志明席越阳朱迎春山西农业大学食品科学与工程学院山西太谷030800

木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus,***)YCC3是从发酵肉制品中分离筛选到的1株产脂肪酶活性高的菌株,为研究该菌株在香肠发酵过程中的代谢机理和功能,采用PromethION和Illumina HiSeq测序平台对*** YCC3进行完成图测序分析。结果表明... 详细信息

木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus,***)YCC3是从发酵肉制品中分离筛选到的1株产脂肪酶活性高的菌株,为研究该菌株在香肠发酵过程中的代谢机理和功能,采用PromethION和Illumina HiSeq测序平台对*** YCC3进行完成图测序分析。结果表明,*** YCC3基因组为1套含有3个质粒的环状分子,基因组序列总长度为2773035 bp,GC含量(鸟嘌呤和胞嘧啶占基因组序列的比率)为32.88%。基因组中预测到2540个编码基因,编码基因总长度为2742136 bp,平均长度为1079.58 bp,占基因组的83.24%。*** YCC3的编码基因通过GO(Gene Ontology)数据库注释,预测到与抗氧化活性相关的基因3个;COG(Cluster of Orthologous Groups of Proteins)数据库注释到与脂质运输和代谢相关的基因中有8个含有脂肪酸合成基因、4个含有脂肪水解酶基因;KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库注释到与脂肪酸合成相关的基因16个,与脂肪酸降解相关的基因10个,与不饱和脂肪酸合成相关的基因3个。***菌株的基因组基本功能注释和代谢通路基因信息注释旨在为菌株作为发酵剂在香肠发酵中的应用提供一定的理论依据。

关键词：木糖葡萄球菌脂肪酶全基因组测序基因功能注释发酵香肠

干冷空气活动对热带气旋强度变化影响的研究进展与展望

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气象 2024年第2期50卷 133-143页

作者：于玉斌彭思越赵大军中国气象局气象干部培训学院北京100081 中国气象局上海台风研究所上海200030 成都信息工程大学成都610225 中国气象科学研究院灾害天气国家重点实验室北京100081

热带气旋的强度变化一直是热带气旋研究中的重要内容之一,干冷空气活动与热带气旋强度变化之间有密切的关系,如快速增强和快速减弱过程。文章对国内外干冷空气影响热带气旋强度变化的研究成果进行了回顾和总结,主要包括干冷空气的强度... 详细信息

热带气旋的强度变化一直是热带气旋研究中的重要内容之一,干冷空气活动与热带气旋强度变化之间有密切的关系,如快速增强和快速减弱过程。文章对国内外干冷空气影响热带气旋强度变化的研究成果进行了回顾和总结,主要包括干冷空气的强度、侵入位置,以及高空冷性天气系统对热带气旋强度变化的影响三个方面,并对未来的研究进行展望,以期为干冷空气影响热带气旋强度的研究提供参考。

关键词：热带气旋干冷空气强度变化研究进展

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高分子活性剂改良盐渍土力学特性及机理研究

建筑材料学报 2024年第5期27卷 446-453页

作者：车文越刘瑾郝社锋卜凡任静华河海大学地球科学与工程学院江苏南京211100 自然资源部国土(耕地)生态监测与修复工程技术创新中心江苏省地质调查研究院江苏南京210018

基于三轴剪切试验与可溶盐含量测试,探究高分子活性剂掺量与养护时间对硫酸型盐渍土力学性能与可溶盐含量的影响,揭示土体微观特性及其改良机理.结果表明:CLI型高分子活性剂的掺入能有效提升硫酸型盐渍土的力学强度和抗变形能力,其最佳... 详细信息

基于三轴剪切试验与可溶盐含量测试,探究高分子活性剂掺量与养护时间对硫酸型盐渍土力学性能与可溶盐含量的影响,揭示土体微观特性及其改良机理.结果表明:CLI型高分子活性剂的掺入能有效提升硫酸型盐渍土的力学强度和抗变形能力,其最佳掺量为8%;活性剂与盐渍土发生置换反应,从而增强盐渍土的保水性能,有效降低盐渍土的可溶盐含量,CLI型高分子活性剂掺量越大,改良效果越好;养护时间达到7 d时,盐渍土的可溶盐含量趋于稳定.

关键词：硫酸型盐渍土高分子活性剂力学性能可溶盐含量机理分析