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云南省HIV-1 B(B′)、C亚型毒株的耐药突变分析

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中国皮肤性病学杂志 2019年第5期33卷 547-552页

作者：舒远路杨翠先张米李健健刘家法杨壁珲邓雪媚董兴齐大理大学云南大理671000 云南省传染病专科医院/艾滋病关爱中心云南昆明650301

目的调查云南省艾滋病病毒1型B(B′)、C亚型毒株在ART失败后的耐药突变特征。方法对云南省15个地州定点医院2016年随访ART失败的HIV/AIDS患者的1 591份血浆样本,采用RT-PCR扩增HIV-1 pol区蛋白酶和反转录酶基因,通过BLAST、jpHMM at GOB... 详细信息

目的调查云南省艾滋病病毒1型B(B′)、C亚型毒株在ART失败后的耐药突变特征。方法对云南省15个地州定点医院2016年随访ART失败的HIV/AIDS患者的1 591份血浆样本,采用RT-PCR扩增HIV-1 pol区蛋白酶和反转录酶基因,通过BLAST、jpHMM at GOBICS和MEGA6.06软件确证亚型,进行耐药突变位点的分析。结果共获得B(B′)、C亚型毒株分别为27例和63例,其中B(B′)、C亚型检测出发生耐药突变分别为22例和37例,耐药突变率为81.48%和58.73%。病毒载量在B(B′)、C亚型耐药突变的毒株间差异有统计学意义(P0.05)。在所有检出耐药突变位点中,仅K103和A71突变率在两种亚型间差异有统计学意义(P<0.05)。在所有治疗方案中,仅TDF/3TC/EFV方案在两种亚型间的耐药突变率和病毒载量差异有统计学意义(P<0.05)。结论 B(B′)、C亚型毒株ART失败后的耐药突变特征有差异,应加强两种亚型的耐药监测。

关键词：艾滋病病毒1型亚型耐药突变

云南省HIV-1感染儿童一线抗病毒治疗病毒学反弹影响因素研究

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中国艾滋病性病 2021年第2期27卷 180-182页

作者：杨壁珲杨翠先刘家法李健健王佳丽张桂仙楼金成张米云南省传染病医院昆明650301

目的观察云南省艾滋病病毒(HIV-1)感染儿童抗病毒治疗(ART)的疗效,探讨ART过程中出现病毒学反弹的影响因素。方法通过"国家艾滋病抗病毒治疗信息系统"收集资料,并进行描述性分析,采用COX比例风险回归模型分析发生病毒学反弹的影响因素... 详细信息

目的观察云南省艾滋病病毒(HIV-1)感染儿童抗病毒治疗(ART)的疗效,探讨ART过程中出现病毒学反弹的影响因素。方法通过"国家艾滋病抗病毒治疗信息系统"收集资料,并进行描述性分析,采用COX比例风险回归模型分析发生病毒学反弹的影响因素。结果2005年1月1日至2015年12月31日,云南省随访治疗1年以上且在治疗过程中第一年病毒学得到抑制的548例儿童感染者,其中有85例在随后的治疗中出现病毒学反弹。不同疗程组中疗程在13~24个月组病毒学反弹比例(40.71%)高于25~36个月组(11.76%)和≥37个月组(4.84%)。最近7天有漏服药物病毒学反弹的风险高于未漏服者[风险比(HR)=4.111,95%可信区间(CI):2.679~6.310],发生药物不良反应者病毒学反弹的风险高于未发生者(HR=1.767,95%CI:0.994~3.141)。结论云南省HIV-1感染儿童病毒学反弹发生的时间段主要在治疗的13~24个月。最近7天漏服药物和发生药物不良反应是影响儿童抗病毒治疗发生病毒学反弹的主要因素,通过提高儿童的服药依从性可以降低抗病毒治疗中病毒学反弹的发生。

关键词：儿童艾滋病病毒感染者病毒学反弹一线抗病毒治疗

云南省2014-2016年抗病毒失败HIV/AIDS基因型耐药情况调查

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中华疾病控制杂志 2019年第9期23卷 1107-1113页

作者：李健健潘小满张米刘家法杨翠先杨壁珲李惠琴董兴齐云南省传染病专科医院艾滋病关爱中心昆明650301 昆明医科大学公共卫生学院昆明650000

目的调查云南省16个州市2014-2016年接受抗病毒治疗失败的感染人类免疫缺陷病毒/艾滋病免疫缺陷综合征(human immunodeficiency virus/acquired immune deficiency syndrome, HIV/AIDS)患者基因型耐药变异、耐药程度及突变位点分布情况... 详细信息

目的调查云南省16个州市2014-2016年接受抗病毒治疗失败的感染人类免疫缺陷病毒/艾滋病免疫缺陷综合征(human immunodeficiency virus/acquired immune deficiency syndrome, HIV/AIDS)患者基因型耐药变异、耐药程度及突变位点分布情况。方法采用横断面调查方法,收集患者耐药相关流行病学信息。通过In-house方法,运用逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增患者HIV-1 pol基因序列,测序后进行比对分析,阐明三类抗病毒药物耐药情况。结果 2014-2016年全省发生耐药突变1 368(58.8%)例。粗略估计HIV-1总体耐药率为1.6%(1 368/84 146)。16个地市均有耐药毒株出现,总体耐药率以昭通市最高为4.5%,治疗失败人群耐药率最高为德宏,达到72.9%(100/145)。核苷类抑制剂(nucleoside reverse transcriptase inhibitors, NRTIs)、非核苷类抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors, NNRTIs)以及蛋白酶抑制剂(protease inhibitor, PIs)的耐药率分别为51.1%(699/1 368)、91.2%(1 248/1 368)和9.6%(132/1 368);三类药物出现频率最高的突变位点依次为NRTIs-M184V(71.1%)、NNRTIs-K103N(43.7%)和PIs-K20I(24.2%)。结论目前云南省的HIV-1耐药呈现低流行水平,耐药率在各地市的分布存在一定差异,三类药物中以NNRTIs和NRTIs耐药为主,全省总体耐药情况与2008-2012年结果比较变化明显。我们应加强抗病毒治疗的管理和基因型耐药的检测,以降低耐药发生率,控制耐药毒株发生和传播。

关键词：人类免疫缺陷病毒- 1 高效联合抗逆转录病毒治疗基因型耐药突变位点

云南省德宏和昆明地区高效抗逆转录病毒治疗后HIV-1流行毒株pol区基因变异分析

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中华检验医学杂志 2011年第4期34卷 315-320页

作者：杨绍敏樊移山李惠琴杨壁珲李健健高丽钟敏雷素云周曾全云南省传染病专科医院艾滋病关爱中心检验科昆明650301

目的调查云南省德宏和昆明两个地区HIV-1流行毒株pol区基因在接受HAART后的变异情况.方法选择接受HAART 1年以上血浆HIV-1病毒载量＞1 000拷贝/ml的139例HIV/AIDS患者,提取血浆中HIV-1 RNA,采用RT-nested-PCR扩增HIV-1的pol区基因蛋... 详细信息

目的调查云南省德宏和昆明两个地区HIV-1流行毒株pol区基因在接受HAART后的变异情况.方法选择接受HAART 1年以上血浆HIV-1病毒载量＞1 000拷贝/ml的139例HIV/AIDS患者,提取血浆中HIV-1 RNA,采用RT-nested-PCR扩增HIV-1的pol区基因蛋白酶（PR）和逆转录酶（RT）基因片段,测定DNA序列.经拼接整理后与美国斯坦福大学网站提供的HIV耐药数据库（Stanford HIV Drug Resistance Database）进行比对,分析耐药突变位点,采用MEGA 4.1构建系统进化树以确定HIV的亚型,结合HIV/AIDS患者流行病学资料进行综合分析.结果昆明地区患者HIV以T215F/NY/I、M41L/M和T69G/N/I/S/A/D突变较多,突变率分别为39%（24/62）、27%（17/62）和27%（17/62）,高于德宏地区患者HIV的相应突变率[分别为16%（11/69）、13%（9/69）和9%（6/69）],差异有统计学意义（x2值分别为8.646、4.242和7.909,P均＜0.05）.德宏地区HIV-1流行毒株pol区基因亚型主要为CRF01_AE亚型为32%（22/69）、C亚型为25%（17/69）、B亚型19%（13/69）.而昆明地区主要是08_BC亚型60%（37/62）、CRF01_AE亚型21%（13/62）和07_BC亚型15%（9/62）.结论云南省德宏、昆明两地区HIV-1流行毒株pol区基因PR、RT基因突变频率存在部分差异,昆明地区T215F/N/Y/I、M41L/M和T69G/N/I/S/A/D突变率高于德宏地区.两地共检出HIV-1流行毒株pol区基因CRF01_AE、B、C、BC、08_BC和07_BC共6种基因亚型.

关键词：抗逆转录病毒治疗,高效 HIV-1 pol基因产物,人免疫缺陷病毒抗药性,细菌突变逆转录聚合酶链反应

初治使用含克立芝方案出现病毒学失败HIV/AIDS患者耐药情况分析

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现代预防医学 2018年第11期45卷 2073-2076+2093页

作者：刘家法杨壁珲张米杨翠先谢祺姚之莹李健健云南省传染病专科医院艾滋病关爱中心

目的分析初次使用含克立芝抗病毒治疗方案治疗艾滋病病毒感染者/艾滋病病人治疗失败基因型耐药情况。方法收集云南省2014-2015年接受高效抗逆转录病毒治疗的艾滋病病毒感染者/艾滋病病人的临床及实验室资料,对初次使用含克立芝抗病毒治... 详细信息

目的分析初次使用含克立芝抗病毒治疗方案治疗艾滋病病毒感染者/艾滋病病人治疗失败基因型耐药情况。方法收集云南省2014-2015年接受高效抗逆转录病毒治疗的艾滋病病毒感染者/艾滋病病人的临床及实验室资料,对初次使用含克立芝抗病毒治疗方案治疗且治疗持续6个月以上、病毒载量仍大于1 000Copies/ml的患者进行基因型耐药检测,分析耐药基因变异情况及耐药位点的变化情况。结果 2年共获得符合条件pol区序列150条,该人群中耐药发生率为27.3%(41/150)。在使用过的药物中,对3TC、TDF、D4T、AZT、ABC高度耐药的情况分别是16(10.7%)、2(1.3%)、1(0.7%)、0(0%)、3(2.0%),对蛋白酶抑制剂没有出现高度耐药的情况。结论初治使用含克立芝治疗方案治疗失败的病人耐药率仍处于较低水平,但是随着使用含克立芝方案治疗人数增加以及治疗时间延长,仍需加强耐药检测。

关键词： HIV-1 抗病毒治疗克立芝基因型耐药

云南省2012年人类免疫缺陷病毒感染者和艾滋病患者抗病毒治疗失败基因型耐药情况分析

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中华传染病杂志 2015年第1期33卷 30-33页

作者：钟敏李韩平李惠琴刘家法杨壁珲李健健楼金成李敬云杨绍敏云南省传染病专科医院艾滋病关爱中心实验室昆明650301 军事医学科学院微生物与流行病研究所

目的了解2012年云南省抗病毒治疗病毒学失败的HIV感染者和艾滋病患者（HIV/AIDS）中HIV-1耐药发生情况及特点.方法收集云南省2012年接受免费HAART的HIV/AIDS患者的临床及实验室资料,对抗病毒治疗持续6个月以上、病毒载量≥1 000拷贝/m... 详细信息

目的了解2012年云南省抗病毒治疗病毒学失败的HIV感染者和艾滋病患者（HIV/AIDS）中HIV-1耐药发生情况及特点.方法收集云南省2012年接受免费HAART的HIV/AIDS患者的临床及实验室资料,对抗病毒治疗持续6个月以上、病毒载量≥1 000拷贝/mL的患者进行基因型耐药检测,分析耐药发生情况及耐药毒株流行特点.分类资料用频数或百分数表示.结果 2012年接受HAART的患者共31 731例,其中1 315例患者发生病毒学失败.1 315例抗病毒治疗病毒学失败的患者中耐药基因突变者775例,占病毒学失败患者的58.9％（775/1 315）,占抗病毒治疗总体人群的2.4％（775/31 731）.耐药突变位点主要为M184V/I（29.1％）、K103N/S （23.7％）、G190A/S/E（13.5％）、Y181C/I/V（11.8％）和V179D/E/F（9.6％）.使用过的药物中,对奈韦拉平、依非韦仑高度耐药的构成比分别是46.5％（612/1 315）、32.6％（429/1 315）;对拉米夫定、齐多夫定、司他夫定、替诺福韦高度耐药的构成比分别是29.3％（385/1 315）、5.2％（68/1 315）、5.0％（66/1 315）、0.9％（12/1 315）;对洛匹那韦/利托那韦高度耐药的构成比为0.2％（2/1 315）.结论当前HIV耐药是导致抗病毒治疗失败的主要原因,在以后艾滋病防控中如何避免HIV-1耐药的发生与耐药毒株的传播显得尤为重要.

关键词： HIV感染获得性免疫缺陷综合征抗反转录病毒治疗,高效抗药性,病毒

抗结核治疗对HIV/AIDS-TB病人抗病毒治疗效果的影响

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中国艾滋病性病 2020年第3期26卷 234-238,242页

作者：舒远路杨翠先董兴齐张米李健健杨壁珲刘家法邓雪媚张玮严妍云南省传染病医院昆明650301 大理大学云南大理671000 怀化市第一人民医院循证医学与临床研究中心湖南怀化418000

目的分析艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人合并肺结核(TB)(简称HIV/AIDS-TB病人)抗结核治疗(ATT)对抗病毒治疗(ART)效果的影响因素和HIV-1基因型耐药情况。方法回顾性收集2014年1月至2017年12月云南省传染病医院确诊的HIV/AIDS-T... 详细信息

目的分析艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人合并肺结核(TB)(简称HIV/AIDS-TB病人)抗结核治疗(ATT)对抗病毒治疗(ART)效果的影响因素和HIV-1基因型耐药情况。方法回顾性收集2014年1月至2017年12月云南省传染病医院确诊的HIV/AIDS-TB病人和HIV/AIDS病人的人口学、临床资料、HIV-1病毒载量和基因型耐药,分析影响HIV/AIDS-TB病人HIV-1复制的因素。结果 197例HIV/AIDS-TB病人在联合治疗24周后HIV核糖核酸(RNA)检测阳性率为23.86%(47例),抗病毒治疗失败率为11.17%(22例),抗病毒失败病人的耐药率为9/22,均高于ART的HIV/AIDS病人,但二者间的差异均无统计学意义。HIV/AIDS-TB病人主要核苷类反转录酶抑制剂相关的突变为M184V(26.67%),主要非核苷类反转录酶抑制剂相关的突变为V179D(26.67%)和V106M(20.00%),未产生蛋白酶抑制剂主要突变。二分类多因素Logistic回归分析发现,入组时的白蛋白(ALB)、抗酸杆菌涂片、CD4^+T淋巴细胞、CD8^+T淋巴细胞、CD4/CD8^+T淋巴细胞比值、ART和ATT方案与HIV-1复制无关,而ATT 8周内接受ART是抑制HIV/AIDS-TB病人HIV-1复制的保护因素。结论联合治疗能有效抑制HIV/AIDS-TB病人的HIV-1病毒载量,且未加速病人HIV-1基因型耐药的产生。对于尚未接受ART的双重感染病人在启动抗结核治疗8周内开始ART有利于抑制HIV-1病毒载量。

关键词：抗结核治疗抗病毒治疗影响因素基因型耐药

2011-2018年临沧市抗HIV-1治疗失败患者基因突变位点分析

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中华疾病控制杂志 2019年第12期23卷 1429-1435,1465页

作者：邓雪媚刘家法张米李健健杨壁珲孙艾丝舒远路董兴齐云南省传染病医院云南省艾滋病关爱中心

目的了解云南省临沧市抗病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)失败的人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染者/艾滋病(aquired immunodeficiency syndrom,AIDS)患者的主要基因耐药突变位点及变化趋势。方法采用In-House方法,对2011-2018年临沧市ART失败的HIV/AIDS患者血浆样本进行Pol基因区扩增,目标序列经拼接整理提交至HIV耐药数据库,确定并分析HIV-1毒株亚型和耐药突变位点。结果 950例ART失败的HIV/AIDS患者样本株以CRF08_BC为主占75.5%(717/950),总基因突变率为67.1%(637/950),以非核苷类反转录酶抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTIs)为主,占62.4%(593/950);其次是核苷类反转录酶抑制剂(nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NRTIs)为34.7%(330/950);蛋白酶抑制剂(protease inhibitors,PIs)为7.5%(71/950)。累计检出耐药相关突变位点NRTIs类15种,主要为M184V(29.3%),在AZT/D4T+3TC+NVP方案中检出最多;NNRTIs类17种,主要为K103N/S(25.1%),在AZT/TDF+3TC+EFV方案中检出最多;PIs类22种,主要为次要位点L10F/V/I(2.2%),L33F(2.1%)。该地NRTIs类居前三位的突变位点由T69D/N/G,M184I/V和D67N/G/S变为M184I/V,K70R/Q/E/T和T215Y/F/V/I/N/A/D;NNRTIs类由V179D/T/E/F,E138A/K/G/R和Y181C/F/G/V变为K103N/S,E138A/K/G/R和V179D/T/E/F;PIs类突变位点变化不大。结论以PIs类为主的二线方案是目前免费ART较好的选择,掌握不同基因突变位点的耐药规律有利于一线药物间的换药配伍,从而延迟二线药物的使用。

关键词： HIV/AIDS 抗病毒失败突变位点变化趋势

云南省HIV-1主要流行亚型毒株的耐药突变分析

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中国艾滋病性病 2018年第11期24卷 1080-1084,1114页

作者：舒远路杨翠先张米李健健刘家法杨壁珲邓雪媚董兴齐大理大学云南大理671000 云南省传染病专科医院/艾滋病关爱中心昆明650301

目的调查云南省Ⅰ型艾滋病病毒(HIV-1)的主要流行毒株CRF01_AE、CRF07_BC及CRF08_BC在HIV感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人)抗病毒治疗失败者间耐药突变的差异。方法以2012-2016年云南省接受抗病毒治疗6个月以上、治疗病毒学... 详细信息

目的调查云南省Ⅰ型艾滋病病毒(HIV-1)的主要流行毒株CRF01_AE、CRF07_BC及CRF08_BC在HIV感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人)抗病毒治疗失败者间耐药突变的差异。方法以2012-2016年云南省接受抗病毒治疗6个月以上、治疗病毒学失败的HIV/AIDS病人为对象。对HIV-1 pol基因进行检测,收集CRF01_AE、CRF07_BC及CRF08_BC亚型序列,提交至Stanford HIV Drug Resistance Database进行耐药突变位点的分析。结果 2012-2016年共收集的CRF01_AE、CRF07_BC及CRF08_BC亚型序列分别为730条、663条、2 877条。其中CRF01_AE、CRF07_BC及CRF08_BC亚型的耐药突变率分别为79.2%(578/730)、64.9%(430/663)、65.1%(1 874/2 877)。CRF01_AE、CRF07_BC及CRF08_BC亚型在核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)和蛋白酶抑制剂(PIs)耐药突变率差异有统计学意义(P<0.05)。在反转录酶区,M41、E44、A62、K65、D67、T69、K70、L74、V75、Y115、Q151、M184、L210、T215、K219、V90、A98、K101、V106、V108、E138、Y181、G190、H221、F227和M230在三种亚型间突变率差异有统计学意义(P<0.05),其他位点差异均无统计学意义(P≥0.05)。V106(16.5%)、Y115(3.26%)和F227(5.58%)位点突变以CRF07-BC亚型最高,A62(7.79%)、T69(22.6%)、V90(10.5%)、E138(19.6%)和H221(4.86%)位点突变以CRF08-BC亚型最高,其他均以CRF01-AE亚型最高(P<0.05)。在蛋白酶区,仅M46在三种亚型间突变率差异有统计学意义(P<0.05)。结论云南省三种亚型在抗病毒治疗后具有不同的耐药突变特性。在接受NRTIs和NNRTIs治疗下,CRF01_AE较CRF07_BC、CRF08_BC亚型更易产生耐药突变,应加强HIV-1耐药毒株的动态监测和研究。

关键词：艾滋病病毒Ⅰ型亚型耐药突变突变位点