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QuantiFERON-TB Gold Plus与QuantiFERON-TB Gold In-Tube在骨关节结核辅助诊断中的比较研究

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中国防痨杂志 2024年第6期46卷 648-653页

作者：贾红彦范俊孙琦宋瑞雪杜博平董静王颖超邢爱英朱传智李自慧潘丽萍耐药结核病研究北京市重点实验室/首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所北京101149

目的:评价QuantiFERON-TB Gold Plus(简称“QFT-Plus”)和QuantiFERON-TB Gold In-Tube(简称“QFT-GIT”)检测辅助诊断骨关节结核的应用价值及其检测结果的一致性。方法:选取2023年4—9月于首都医科大学附属北京胸科医院就诊的骨关节结... 详细信息

目的:评价QuantiFERON-TB Gold Plus(简称“QFT-Plus”)和QuantiFERON-TB Gold In-Tube(简称“QFT-GIT”)检测辅助诊断骨关节结核的应用价值及其检测结果的一致性。方法:选取2023年4—9月于首都医科大学附属北京胸科医院就诊的骨关节结核患者88例作为观察组,非结核性骨关节疾病患者123例作为对照组。所有研究对象同时行外周血QFT-Plus和QFT-GIT检测。分析QFT-Plus和QFT-GIT辅助诊断骨关节结核的价值,评价两种方法检测结果的一致性。结果:211例研究对象中,剔除4例检测为不确定结果者,最终将207例研究对象检测结果纳入诊断性能评估(观察组86例,对照组121例)。QFT-Plus检测的敏感度为95.3%(95%CI:87.9%~98.5%),特异度为70.2%(95%CI:61.2%~78.0%),阳性预测值为65.5%(95%CI:60.2%~77.5%),阴性预测值为95.5%(95%CI:88.3%~98.6%);QFT-GIT检测的敏感度为91.9%(95%CI:83.4%~96.4%),特异度为66.9%(95%CI:57.7%~75.1%),阳性预测值为66.4%(95%CI:57.1%~74.6%),阴性预测值为92.0%(95%CI:83.8%~96.5%)。QFT-Plus和QFT-GIT检测结果的总一致率为91.8%(95%CI:88.1%~95.5%),阳性一致率为92.4%(95%CI:87.7%~97.2%),阴性一致率为90.9%(95%CI:84.9%~96.9%),一致性检验Kappa值为0.832(95%CI:0.756~0.908,P<0.001)。结论:QFT-Plus与QFT-GIT检测结果具有良好的一致性,在骨关节结核诊断中具有相似的辅助诊断效能。

关键词：结核,骨关节诊断,鉴别免疫学试验评价研究

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结核分枝杆菌潜伏感染者外周血单个核细胞转录组学研究

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中国防痨杂志 2024年第4期46卷 449-460页

作者：尚雪恬董静黄麦玲孙琦贾红彦张蓝月刘秋月姚明旭王颖超姬秀秀杜博平邢爱英潘丽萍首都医科大学附属北京胸科医院耐药结核病研究北京市重点实验室/北京市结核病胸部肿瘤研究所北京101149 首都医科大学附属北京胸科医院结核科/北京市结核病胸部肿瘤研究所北京101149 首都医科大学附属北京胸科医院重症医学科/北京市结核病胸部肿瘤研究所北京101149

目的:通过对比分析结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection,LTBI)者和健康人的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)经结核特异性抗原刺激后的转录组,寻找LTBI人群中结核抗原特异的免疫应答重要基... 详细信息

目的:通过对比分析结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection,LTBI)者和健康人的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)经结核特异性抗原刺激后的转录组,寻找LTBI人群中结核抗原特异的免疫应答重要基因及可能发挥功能的信号通路,绘制LTBI基因表达谱。方法:应用微阵列芯片检测2009年12月在首都医科大学附属北京胸科医院招募的4例LTBI者(LTBI组)和4名健康人(健康对照组)经结核抗原刺激后的PBMC转录组,并对部分差异基因进行qPCR检测以验证芯片数据。应用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选与LTBI最相关模块,并对模块中的基因分别进行基因本体论(geneontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encylopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析。通过基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)从全转录组水平筛选信号通路。通过免疫浸润分析寻找与LTBI相关的免疫细胞。通过STRING数据库蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析绘制两模块中差异基因相互作用网络图。结果:LTBI组与健康对照组间共发现393个差异表达基因(差异倍数>2或<0.5,P<0.05),LTBI中112个表达下调,281个表达上调。针对10个差异基因的实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测证实基因表达趋势与芯片数据一致,即CAMK1G、IL2、SPINK1、SUCNR1、HCAR3、IL18BP、CHI3L1、TNF均上调;RASGRP2、TPM2均下调。通过WGCNA分析确定与LTBI最相关的正相关蓝色模块(cor=0.88,P=0.004)和负相关蓝绿色模块(cor=―0.93,P=0.001)。对上述模块内基因进行KEGG富集分析,并行基于全转录组的GSEA分析,发现趋化因子信号通路(P<0.001)和凋亡信号通路(P=0.003)在两种分析中均明显富集。对两模块中的差异基因通过STRING数据库构建PPI网络图,通过内置插件计算得到每个模块中的前10个关键基因,即蓝色模块中的PTPRC、CD40、IL10、IRF8、CCR1、CD80、TLR8、CLEC7A、CD83和CD274;蓝绿色模块中的TNF、ICAM1、TNFRSF4、HAVCR2、CD276、CCL4、CD33、IL1RN、NCF1和FGR。免疫浸润分析发现,M1型巨噬细胞(P=0.029)和M2型巨噬细胞(P=0.001)等固有免疫细胞的比例在LTBI组和健康对照组间存在明显差异。结论:经结核特异性抗原刺激后的PBMC转录组在LTBI人群和健康人群间存在明显差异,这些差异基因主要聚集于凋亡信号通路和趋化因子信号通路,其中巨噬细胞介导的免疫应答在其中发挥了重要作用,揭示了固有免疫应答在LTBI中的重要作用。

关键词：分枝杆菌,结核分枝杆菌感染转录因子生物学标记免疫

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液态芯片技术筛选胸腔积液细胞因子对结核性胸膜炎的诊断价值

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天津医药 2024年第3期52卷 319-323页

作者：杜凤娇杜博平贾红彦邢爱英李自慧朱传智李华耐药结核病研究北京市重点实验室 101149 首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所结核二科

目的应用液态芯片技术筛选结核性胸膜炎(plTB)胸腔积液结核特异性细胞因子建立诊断模型,并探讨其应用价值。方法纳入plTB患者(plTB组)86例,其中确诊plTB组41例,临床诊断plTB组45例;其他胸腔积液患者(对照组)42例。采用液相芯片技术分析... 详细信息

目的应用液态芯片技术筛选结核性胸膜炎(plTB)胸腔积液结核特异性细胞因子建立诊断模型,并探讨其应用价值。方法纳入plTB患者(plTB组)86例,其中确诊plTB组41例,临床诊断plTB组45例;其他胸腔积液患者(对照组)42例。采用液相芯片技术分析胸腔积液17个细胞因子,包括白细胞介素(IL)-1β、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、γ-干扰素诱导蛋白10(IP-10)、IL-15、IL-17F、IL-27、肿瘤坏死因子(TNF)-α、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)、巨噬细胞炎症蛋白-3a(MIP-3α)、巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)、β-干扰素(IFN-β)的表达量。筛选确诊plTB组和对照组组间差异因子,并在确诊plTB患者中绘制受试者工作特征(ROC)曲线,将AUC>0.850、特异度>80%的IP-10、IL-27和MCP-1联合诊断plTB,并同胸腔积液腺苷酸脱氨酶(ADA)检测和结核感染T细胞斑点试验(***)比较,评估诊断效能。结果确诊plTB组IL-2、IP-10、IL-27、TNF-α和MCP-1水平均高于对照组(P0.05)。plTB组中,TIP-10、IL-27和MCP-1三因子联合检测的敏感度为87.2%,高于***单独检测(81.4%)和ADA单独检测(54.7%)。结论应用液态芯片技术对胸腔积液IP-10、IL-27和MCP-1联合检测,可为plTB诊断提供帮助。

关键词：结核胸腔积液胸膜炎白细胞介素-27 液态芯片技术 γ-干扰素诱导蛋白10 单核细胞趋化蛋白-1

液态芯片技术筛选胸腔积液细胞因子诊断结核性胸膜炎的价值研究

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天津医药 2023年

作者：杜凤娇杜博平贾红彦邢爱英李自慧朱传智李华首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所结核二科耐药结核病研究北京市重点实验室

目的应用液态芯片技术筛选结核性胸膜炎（plTB）胸腔积液结核特异性细胞因子建立诊断模型，并探讨其应用价值。方法纳入plTB患者（plTB组）86例，其中确诊plTB组41例，临床诊断plTB组45例；其他胸腔积液患者（对照组）42例。采用液相... 详细信息

目的应用液态芯片技术筛选结核性胸膜炎（plTB）胸腔积液结核特异性细胞因子建立诊断模型，并探讨其应用价值。方法纳入plTB患者（plTB组）86例，其中确诊plTB组41例，临床诊断plTB组45例；其他胸腔积液患者（对照组）42例。采用液相芯片技术分析胸腔积液17个细胞因子：白细胞介素（IL）-1β、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、γ-干扰素诱导蛋白10(IP-10)、IL-15、IL-17F、IL-27、肿瘤坏死因子（TNF）-α、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)、巨噬细胞炎症蛋白-3a(MIP-3α)、巨噬细胞集落刺激因子（M-CSF）、β-干扰素（IFN-β）的表达量。筛选确诊plTB组和对照组组间差异因子，并在确诊plTB患者中绘制受试者工作特征（ROC）曲线，将AUC>0.850且特异度>80%的IP-10、IL-27和MCP-1联合诊断plTB，并同胸腔积液腺苷酸脱氨酶（ADA）检测、***比较，评估诊断效能。结果确诊plTB组IL-2、IL-6、IP-10、IL-27、TNF-α和MCP-1水平均高于对照组（P0.05），三因子联合诊断plTB的敏感度为87.2%，特异度为81.0%。plTB组中，***的敏感度为81.4%,IP-10、IL-27和MCP-1三因子联合检测和***的敏感度均高于ADA检测的敏感度54.7%(P<0.01)，且三因子联合检测的敏感度高于***(P<0.01)。结论应用液态芯片技术对胸腔积液IP-10、IL-27和MCP-1联合检测，可为plTB诊断提供帮助。

关键词：结核胸腔积液胸膜炎白细胞介素-27 液态芯片技术 γ-干扰素诱导蛋白10 单核细胞趋化蛋白-1

应用于结核性胸膜炎分子生物学检测的胸腔积液核酸提取方法初步比较分析

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中国人兽共患病学报 2022年第8期38卷 678-684页

作者：杜博平李自慧潘丽萍孙琦吕翎娜朱传智邢爱英贾红彦张宗德首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病研究北京市重点实验室北京101149

目的筛选鉴定有助于结核性胸膜炎分子生物学检测的胸腔积液核酸提取方法。方法收集18例结核性胸膜炎患者胸腔积液样本,分别采用6种方法提取核酸,应用微滴数字PCR技术分析样本中结核分枝杆菌特异性核酸IS6110和IS1081数量,以此评估不同... 详细信息

目的筛选鉴定有助于结核性胸膜炎分子生物学检测的胸腔积液核酸提取方法。方法收集18例结核性胸膜炎患者胸腔积液样本,分别采用6种方法提取核酸,应用微滴数字PCR技术分析样本中结核分枝杆菌特异性核酸IS6110和IS1081数量,以此评估不同胸腔积液核酸提取方法的优劣。结果对于胸腔积液原液或胸腔积液离心上清,采用柱法和磁珠法提取的核酸样本中靶标数量无明显差别。对于胸腔积液离心沉渣,采用物理破碎法提取的核酸样本中IS6110和IS1081数量显著高于化学破碎法(IS6110,Z=-3.408,P=0.001;IS1081,Z=-3.297,P=0.001)。相比于小体积(0.7 mL)胸腔积液原液直接提取,大体积(4 mL)胸腔积液离心的上清和沉渣(物理破碎)中提取的核酸样本含有更多的靶标数量(分别IS6110,Z=-3.237,P=0.001,IS1081,Z=-2.667,P=0.008;IS6110,Z=-3.157,P=0.002,IS1081,Z=-2.250,P=0.024)。结论大体积胸腔积液离心上清游离核酸提取法和离心沉渣物理破碎核酸提取法能够富集更多的结核分枝杆菌核酸,是较好的用于结核性胸膜炎分子生物学检测的核酸制备方法。

关键词：结核性胸膜炎结核病结核分枝杆菌胸腔积液核酸聚合酶链式反应检测

复苏因子薄层琼脂快速培养法诊断结核性胸膜炎的应用研究

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中国人兽共患病学报 2022年第9期38卷 802-806页

作者：邢爱英杜凤娇李自慧杜博平孙琦贾红彦魏荣荣潘丽萍刘忠泉首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病研究北京市重点实验室北京101149

目的建立胸腔积液结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,***)复苏因子薄层琼脂(Rpfs-TLA)快速培养法并评估其临床应用价值。方法收集2016年7月至2018年11月北京胸科医院103例结核性胸膜炎和34例其他胸膜疾病患者的胸腔积液,经过离... 详细信息

目的建立胸腔积液结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,***)复苏因子薄层琼脂(Rpfs-TLA)快速培养法并评估其临床应用价值。方法收集2016年7月至2018年11月北京胸科医院103例结核性胸膜炎和34例其他胸膜疾病患者的胸腔积液,经过离心、消化处理后进行***复苏因子薄层琼脂和普通薄层琼脂培养,比较Rpfs-TLA与普通TLA培养***的阳性率、平均报阳时间、菌落形成单位数的组间差异。结果胸腔积液Rpfs-TLA培养组和普通TLA对照组***的阳性率分别为43.7%和29.1%,差异有统计学意义(χ^ (2)=54.56,P平均报告时间为11.87 d和18.13 d,差异有统计学意义(t=31.82,P平均报告时间为11.87 d和20.60 d,差异有统计学意义(t=16.62,P<0.001)。Rpfs-TLA诊断结核性胸膜炎的灵敏度为43.7%,特异度为100%,准确度为57.7%。结论Rpfs-TLA是一种准确、快速、廉价且易于培养的方法,可为结核性胸膜炎诊断提供帮助。

关键词：结核分枝杆菌复苏促进因子薄层琼脂胸膜积液培养

结核分枝杆菌复苏因子基因克隆及其蛋白质的表达

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中华结核和呼吸杂志 2007年第3期30卷 236-237页

作者：刘忠泉张宗德邢爱英陈曦李自慧古淑香贾红艳杜博平马玙北京市结核病胸部肿瘤研究所内科实验室 101149

结核病仍然是严重危害人类健康的重大公共卫生问题。如何提高临床标本结核杆菌培养阳性率、缩短培养时间是提高结核病诊疗和控制水平的关键。

关键词：结核分枝杆菌基因克隆蛋白质因子复苏公共卫生问题结核杆菌培养人类健康

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基于实例与目标相关性的多目标稀疏回归算法

控制与决策 2024年第5期39卷 1478-1486页

作者：何杜博孙胜祥海军工程大学管理工程与装备经济系武汉430033

针对传统多目标回归算法无法处理输入与多输出间的非线性关系,且忽视了数据点在输入与输出之间的结构信息,导致算法泛化性能受限、缺乏稳健性等问题,提出一种基于实例与目标相关性的多目标稀疏回归(multitarget sparse regression with ... 详细信息

针对传统多目标回归算法无法处理输入与多输出间的非线性关系,且忽视了数据点在输入与输出之间的结构信息,导致算法泛化性能受限、缺乏稳健性等问题,提出一种基于实例与目标相关性的多目标稀疏回归(multitarget sparse regression with instances and targets correlations, MTR-ITC)算法.首先,通过嵌入潜变量空间来对复杂的输入与输出以及输出间的关联结构解耦,并利用核技巧和稀疏回归学习输入输出间的非线性关系和输出间的相关结构;然后,引入流形正则化项探索不同实例在输入与输出变量间的相关性,确保模型输出与真实结果在局部和全局结构的一致性,以提升模型泛化性能;最后,提出一种交替优化算法来对目标函数进行求解,使其能快速收敛至全局最优.在基准测试数据集上的实验表明,所提算法在不同MTR数据集上均具有较好的测试性能.

关键词：多目标回归稀疏学习流形学习交替优化算法核方法实例相关性

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结合空间—光谱信息的快速自训练高光谱遥感影像分类

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遥感学报 2024年第1期28卷 219-230页

作者：金垚董燕妮杜博中国地质大学(武汉)地球物理与空间信息学院武汉430074 湖北珞珈实验室武汉430079 武汉大学测绘遥感信息工程国家重点实验室武汉430079 武汉大学资源与环境科学学院武汉430079 武汉大学计算机学院武汉430072

自训练方法被广泛应用于高光谱影像分类任务中以解决标记样本获取困难的问题。传统的自训练方法不仅忽略了高光谱影像所能提供的空间信息,导致最终分类精度受到影响;同时在每次迭代过程中都需要完成一次对未标记数据的分类任务,导致需... 详细信息

自训练方法被广泛应用于高光谱影像分类任务中以解决标记样本获取困难的问题。传统的自训练方法不仅忽略了高光谱影像所能提供的空间信息,导致最终分类精度受到影响;同时在每次迭代过程中都需要完成一次对未标记数据的分类任务,导致需要大量的时间成本。因此,针对上述问题,本文提出了一种基于空间—光谱信息的快速自训练方法用于高光谱影像分类。与传统的自训练方法不同,该方法在迭代过程中使用空间—光谱信息对未标记数据进行筛选完成标记样本的扩充,而不是使用分类器对未标记样本进行分类。首先针对初始标记样本使用空间邻域块选择空间近邻点,然后使用自适应阈值对空间近邻点进行二次筛选得到空谱近邻点赋予标记,最后根据扩充后的标记样本对分类器进行训练完成分类任务。结果表明,在Washington DC Mall Subimage高光谱数据集中每类分别选择2个和10个训练样本时,整体分类精度分别达到了93.17%和95.43%;而在Indian Pines数据集中整体分类精度分别达到了59.75%和86.13%。我们提出的结合空间—光谱信息的快速自训练方法和对比方法相比,我们的方法有明显的提升。

关键词：高光谱遥感半监督分类小样本问题空间—光谱信息自训练方法