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土生隐球酵母在铝胁迫下钙调磷酸酶信号调控基因的转录组分析

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基因组学与应用生物学 2020年第7期39卷 3052-3059页

作者：代梦瑶刘嘉孔蕾文增叶谭勇年洪娟昆明理工大学生命科学与技术学院昆明650500

钙调素-钙调磷酸酶信号通路是酵母细胞中重要的铝胁迫应答通路,在铝胁迫的条件下可激活钙调素和钙调磷酸酶的转录和翻译。之前的研究表明钙调磷酸酶能够参与铝胁迫下土生隐球酵母的生长,添加了铝的培养基上再添加FK506(钙调磷酸酶抑制剂... 详细信息

钙调素-钙调磷酸酶信号通路是酵母细胞中重要的铝胁迫应答通路,在铝胁迫的条件下可激活钙调素和钙调磷酸酶的转录和翻译。之前的研究表明钙调磷酸酶能够参与铝胁迫下土生隐球酵母的生长,添加了铝的培养基上再添加FK506(钙调磷酸酶抑制剂)时会对土生隐球酵母的生长产生明显抑制,而未添加FK506的培养基上土生隐球酵母可以正常生长,只是菌落较小。为了研究钙调磷酸酶在土生隐球酵母耐铝过程中的作用,本研究提取土生隐球酵母RNA后,反转录得到cDNA文库,并利用二代高通量测序平台Illumina HiSeqTM2000对土生隐球酵母转录组进行测序。本研究初步表明,土生隐球酵母通过激活钙调磷酸酶途径抵抗铝胁迫。通过土生隐球酵母转录组分析得到的调控基因、结构基因以及差异表达基因,为进一步研究微生物耐铝中关键酶基因的挖掘、克隆和功能的验证提供了宝贵数据,为微生物耐铝机制的研究提供科学依据。

关键词：土生隐球酵母钙调磷酸酶通路转录组分析差异表达

尖孢镰刀菌全基因组测序及其致病相关基因分析

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基因组学与应用生物学 2020年第3期39卷 1105-1112页

作者：文增叶李定华代梦瑶杨野杨启良崔秀明年洪娟昆明理工大学生命科学技术学院云南省三七资源可持续发展利用重点实验室国家中药管理局三七资源可持续发展利用研究室昆明市道地药材可持续发展利用重点实验室昆明650500 昆明理工大学农业与食品学院昆明650500

尖孢镰刀菌是导致三七根腐病的病原之一。本研究采用Illumina高通量测序技术对三七根腐病原菌(Fusarium oxysporum)的基因组扫描测序,并进行了基因组序列分析、基因功能注释和比较基因组学分析,从全基因组水平鉴定致病相关基因。扫描结... 详细信息

尖孢镰刀菌是导致三七根腐病的病原之一。本研究采用Illumina高通量测序技术对三七根腐病原菌(Fusarium oxysporum)的基因组扫描测序,并进行了基因组序列分析、基因功能注释和比较基因组学分析,从全基因组水平鉴定致病相关基因。扫描结果表明,基因组大小为48.12 Mb,G+C含量为51.5%,15 746个基因编码区(CDS),其中11 330个基因(71.95%)可以在COG数据库中得到其分类信息,编码有功能的蛋白6 022个。该序列已经提交GenBank数据库,登录号为SAMN09976373。进一步分析得到细胞壁降解相关基因45个,搜索数据库中F. oxysporum MAPK级联途径组分的基因序列,与酿酒酵母中MAPK级联途径进行比对并进行系统进化分析。研究结果对深入理解尖孢镰刀菌导致三七致病的分子机理,从而进一步有效控制病害的发生具有重要意义。

关键词：三七根腐病尖孢镰刀菌基因组 MAPK途径

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江西省南昌市进贤县桂桥传统村落

城市规划 2024年第4期48卷 I0003-I0004页

作者：唐劼(图/文) 叶孝奇(图/文) 同济大学建筑与城市规划学院上海同济城市规划设计研究院有限公司

1.桂桥传统村落概况桂桥传统村落位于赣抚平原抚河沿岸,是江西省进贤县李渡镇下辖的一个自然村,肇基于明永乐六年(公元1408年),村民以桂姓为主,属李渡“沿河十八桂”中较为完整的一脉。村内历史格局完整、历史遗存丰富、文化价值突出,于... 详细信息

1.桂桥传统村落概况桂桥传统村落位于赣抚平原抚河沿岸,是江西省进贤县李渡镇下辖的一个自然村,肇基于明永乐六年(公元1408年),村民以桂姓为主,属李渡“沿河十八桂”中较为完整的一脉。村内历史格局完整、历史遗存丰富、文化价值突出,于2019年列入第五批中国传统村落名录。

关键词：传统村落历史遗存明永乐进贤县赣抚平原历史格局自然村江西省

三七根腐病病原菌尖孢镰刀菌的生物学特性分析

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中药材 2019年第9期42卷 1978-1984页

作者：文增叶李定华代梦瑶杨野崔秀明杨启良年洪娟昆明理工大学生命科学技术学院/云南省三七资源可持续发展利用重点实验室/国家中药管理局三七资源可持续发展利用研究室/昆明市道地药材可持续发展利用重点实验室云南昆明650500 昆明理工大学现代农业工程学院云南昆明650500

目的:旨在分离鉴定三七苗期根腐病病原菌,并对其生物学特性进行研究,从而了解该病原菌的发病条件,为该病原菌引起的三七病害的监测和防治提供理论参考。方法:采集三七根腐病幼苗,用PDA培养基对病原菌进行分离纯化,得到了2株真菌。通过... 详细信息

目的:旨在分离鉴定三七苗期根腐病病原菌,并对其生物学特性进行研究,从而了解该病原菌的发病条件,为该病原菌引起的三七病害的监测和防治提供理论参考。方法:采集三七根腐病幼苗,用PDA培养基对病原菌进行分离纯化,得到了2株真菌。通过对菌落、菌丝和孢子形态观察及ITS序列的比对,对其中1株病原菌进行了鉴定。并研究了温度、pH、光照、碳源及氮源等对菌丝生长和孢子萌发的影响。结果:该病原菌鉴定为尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)。将病原菌回接一年生三七植株,发现其有很强的致病性。该病原菌在30℃、pH 5的培养条件下生长最快,可有效利用多种碳和氮源,其中以淀粉、乳糖为最佳碳源,硝酸铵为最适氮源。孢子在30℃、pH 6~7的条件下萌发率最高,孢子的致死温度为50℃。结论:明确了三七苗期根腐病病原菌(尖孢镰刀菌)的生物学特性,确定了该病原菌生长和孢子萌发的最适培养条件。

关键词：三七根腐病病原菌尖孢镰刀菌生物学特性

文旅资源产业化的现状、困境与数字化路径——以甘肃省为例

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社会科学家 2024年第3期 76-82页

作者：叶紫青中国社会科学院大学商学院北京102488

党的二十大报告提出“高质量发展是全面建设社会主义现代化国家的首要任务”,扩大内需和实现产业转型升级是着力推进高质量发展的当务之急。数字化是当下突破文旅资源产业化的重要路径,推进文化和旅游资源产业化发展,要确立内容生产的... 详细信息

党的二十大报告提出“高质量发展是全面建设社会主义现代化国家的首要任务”,扩大内需和实现产业转型升级是着力推进高质量发展的当务之急。数字化是当下突破文旅资源产业化的重要路径,推进文化和旅游资源产业化发展,要确立内容生产的基础性地位,基于产业协同和价值链重构层面,推动文化资源和旅游资源融合视角的研究阐释、创意转化与开发利用,创新生产能够反映时代要求的文化产品,进而推动中华优秀传统文化创造性转化和创新性发展,为我国文旅融合实现内涵式、跨越式发展提供强大内生动力。文章以甘肃省为例,通过分析文旅资源产业化及其文旅产业融合发展现状与困境,提出数字化革新路径,进一步加强文旅资源与科技的深度融合,实现新时代数字文旅产业高质量发展。

关键词：文旅资源产业化文旅融合数字化路径

南羌塘依桑日剖面中侏罗统布曲组沉积相与氧化还原条件

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沉积与特提斯地质 2024年

作者：文跃韦恒叶邹怡付修根西南石油大学羌塘盆地研究院西南石油大学地球科学学院

羌塘盆地中侏罗统布曲组为海相碳酸盐岩沉积，可作为良好的储集层，但目前对于布曲组早期沉积环境以及古海水氧化还原条件还有争议。本文针对南羌塘盆地依桑日剖面布曲组下部地层开展岩相、沉积相以及古水体氧化还原条件分析，研究结果... 详细信息

羌塘盆地中侏罗统布曲组为海相碳酸盐岩沉积，可作为良好的储集层，但目前对于布曲组早期沉积环境以及古海水氧化还原条件还有争议。本文针对南羌塘盆地依桑日剖面布曲组下部地层开展岩相、沉积相以及古水体氧化还原条件分析，研究结果表明：1）南羌塘盆地毕洛错地区依桑日剖面布曲组下部地层中识别出远端变陡的碳酸盐缓坡沉积体系，划分为内缓坡、中缓坡以及外缓坡沉积亚相。2）划分出5个岩相组合分别为风暴岩岩相、核形石石灰岩岩相、滑塌透镜体灰岩岩相、瘤状灰岩岩相、钙质泥岩岩相；11种微相类型分别为钙质泥岩（MF1）、泥晶灰岩（MF2）、似球粒灰泥石灰岩（MF3）、含鲕粒粒泥灰岩（MF4）、粪球粒粒泥灰岩（MF5）、核形石粒泥灰岩（MF6）、含内碎屑、似球粒泥粒石灰岩（MF7）、生物碎屑泥粒灰岩（MF8）、内碎屑颗粒灰岩（MF9）、内碎屑角砾灰岩（MF10）、内碎屑灰砾灰岩（MF11）。3）依桑日剖面布曲组整体古水体处于贫氧-氧化环境，并且有机碳TOC含量较低，可能跟氧化还原条件有关，但其关键控制因素可能是水体营养水平以及初级生产力水平。布曲组下部较深水相泥岩TOC值较低说明布曲组晚期沉积的白云岩古油藏的油气来源并不是同时期沉积的深水烃源岩产生的，可能是更深部古老的烃源岩地层。

关键词：布曲组沉积相碳酸盐缓坡风暴沉积草莓状黄铁矿羌塘盆地

柴达木盆地英雄岭构造带小断层和碳酸盐岩缝洞体识别地震勘探关键技术

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石油地球物理勘探 2024年第2期59卷 290-298页

作者：陈敬国邓志文王飞李景叶王恺吴迪中国石油大学(北京)地球物理学院北京102249 东方地球物理公司河北涿州072751

针对柴达木盆地英雄岭构造带深层小断层和碳酸盐岩缝洞体识别,提出配套的地震勘探关键技术。首先,从资料采集方面,扩大观测方位,采用小组合激发和接收,炮、检点均匀布设,可提高小断层成像精度;在地震资料数据处理方面,采用OVT域多维保... 详细信息

针对柴达木盆地英雄岭构造带深层小断层和碳酸盐岩缝洞体识别,提出配套的地震勘探关键技术。首先,从资料采集方面,扩大观测方位,采用小组合激发和接收,炮、检点均匀布设,可提高小断层成像精度;在地震资料数据处理方面,采用OVT域多维保真压噪技术和巨厚表层Q补偿处理技术,可以提高地震资料信噪比、保真度,有效拓宽频带,提高分辨率;在地震资料解释方面,利用分方位数据体和人工智能断层识别技术,可有效提高小断层识别精度,利用各向异性强度属性可有效识别缝洞体。该技术可为其他类似地区提供参考。

关键词：英雄岭碳酸盐岩缝洞体小断层地震勘探关键技术

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穿堤建筑物与分散土界面渗透稳定性研究

岩土工程学报 2024年

作者：文纪翔樊恒辉贾琼瑜刘宇芊孙增春西北农林科技大学水利与建筑工程学院西北农林科技大学岩土工程研究所/特殊岩土博物馆

分散土具有遇水分散流失的特性，位于分散土体中的建筑物在土-水-建筑物耦合作用下往往会出现界面处的渗透变形而发生破坏，常导致水利工程出现险情。采用人工配制的不同程度的分散土，开展分散性试验与抗渗试验，同时考虑穿堤建筑物因... 详细信息

分散土具有遇水分散流失的特性，位于分散土体中的建筑物在土-水-建筑物耦合作用下往往会出现界面处的渗透变形而发生破坏，常导致水利工程出现险情。采用人工配制的不同程度的分散土，开展分散性试验与抗渗试验，同时考虑穿堤建筑物因不均匀沉降和振动等因素导致的与接触位置填土的分离脱空，对非分散土与分散土开展脱空区在管道上侧和下侧两种位置的裂缝冲刷试验。结果表明：（1）随着碳酸钠掺量的增加，土样逐渐从非分散向分散转化，临界坡降从120.0降低到12.9和14.7，抗渗性能显著下降。（2）分散土与非分散土的自身裂缝（无建筑物）均可在反滤料的保护下逐渐愈合，裂缝段试验末分别能承担大于59.0和51.2的坡降，抗渗性能显著提高。（3）在相同干密度的条件下，与非分散土相比，分散土中的裂缝愈合更快，在较低速的流动水的条件下即可迅速填充堵塞渗流通道。（4）建筑物-土界面存在裂缝，当裂缝位于建筑物上部时，裂缝可以在反滤料的保护下逐渐愈合，非分散土和分散土分别能承担大于87.4和63.1的坡降，具有一定的抗渗性能；当裂缝位于建筑物下部时，裂缝段基本不承担坡降，在反滤料的保护下裂缝也难以愈合且在高水头下易发生反滤料的管涌破坏。

关键词：分散土土-结构接触面裂缝渗透稳定性

中药活性成分中新型冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂的消息传递机制神经网络虚拟筛选

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中草药 2024年第3期55卷 895-906页

作者：张智强朱增文陈俊利绪连彩郑州轻工业大学材料与化学工程学院河南郑州450000

目的在新型冠状病毒感染尚无特效药的情况下,根据潜在的治疗靶点,从中药活性成分中筛选出先导化合物为药物研发、中药组方等提供理论线索。方法构建消息传递机制神经网络(message passing neural networks,MPNN)模型,以化合物描述符SMI... 详细信息

目的在新型冠状病毒感染尚无特效药的情况下,根据潜在的治疗靶点,从中药活性成分中筛选出先导化合物为药物研发、中药组方等提供理论线索。方法构建消息传递机制神经网络(message passing neural networks,MPNN)模型,以化合物描述符SMILES码为输入,以化合物对新型冠状病毒3CL蛋白酶抑制活性为输出,利用开源数据对模型进行训练和优化。结果用优化后的模型从186味清热解毒中药所含的3863个活性成分中筛选出101个潜在的抑制剂。其中龙胆素、桑辛素C、5-羟基-4-氧代戊酸甲酯等化合物预测活性较高,黄芩、苍耳子、昆布、芫荽、紫苏等中药含有的潜在抑制剂数量较多。结论使用MPNN模型虚拟筛选出的抑制剂中约1/5已被其他的研究报道验证有效,证明了MPNN模型虚拟筛选结果的可靠性。此外,优化的神经网络模型微调后可用于分子其他属性的预测,在药物虚拟筛选领域有着广泛的应用前景。

关键词：严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2) 3CL蛋白酶抑制剂药物虚拟筛选消息传递机制神经网络龙胆素、桑辛素C、5-羟基-4-氧代戊酸甲酯