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基于转录组测序的巴马香猪和杜洛克猪骨骼肌差异lncRNA分析

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南方农业学报 2024年第3期55卷 650-659页

作者：胡梦灵范新浩姚一龙闫超谢炳坤兰干球梁晶唐中林广西大学动物科学技术学院/广西畜禽繁育与疾病防控重点实验室广西南宁530004 佛山鲲鹏现代农业研究院广东佛山528226 中国农业科学院深圳农业基因组研究所/岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心广东深圳518124 广西巴马香猪资源开发工程研究中心广西河池547599 广西农业职业技术大学畜牧研究院/广西家畜遗传改良重点实验室广西南宁530001 中国农业科学院深圳农业基因组研究所MARA畜禽多密克戎重点实验室广东深圳518124

【目的】通过对巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序鉴定差异表达lncRNA,筛选与骨骼肌发育形成相关的候选基因,为明确lncRNA对骨骼肌生长发育的调控机制提供理论基础。【方法】采集12月龄的巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进... 详细信息

【目的】通过对巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序鉴定差异表达lncRNA,筛选与骨骼肌发育形成相关的候选基因,为明确lncRNA对骨骼肌生长发育的调控机制提供理论基础。【方法】采集12月龄的巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序,以错误发现率(FDR)1为标准筛选差异表达基因(DEGs)和差异表达lncRNA,并进行实时荧光定量PCR验证,预测差异表达lncRNA靶基因并进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,选取表达差异最大的lncRNA构建其与靶基因互作网络。【结果】在巴马香猪和杜洛克猪背肌间共鉴定出6316个DEGs和675个差异表达lncRNA;GO功能注释分析结果表明,差异表达lncRNA靶基因主要涉及代谢过程、肌肉组织发育及骨骼肌细胞增殖和分化等生物过程;KEGG信号通路富集分析结果表明,差异表达lncRNA靶基因在Hippo和Wnt信号通路显著富集(P一致。lncRNA-MSTRG.16703与靶基因互作网络分析结果表明,上调靶基因包括QKI、MBNL1和YBX2,QKI和MBNL1在均与可变剪接相关。【结论】在巴马香猪和杜洛克猪间发现的差异表达lncRNA是调控骨骼肌发育的候选基因,其靶基因主要富集在Hippo和Wnt等骨骼肌发育相关信号通路。lncRNA-MSTRG.16703的表达差异最大且在巴马香猪中上调,其靶基因在骨骼肌细胞增殖分化和肌纤维形成中有重要调控作用。

关键词：巴马香猪杜洛克猪背最长肌转录组测序 lncRNA

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汽车结构的动力响应计算

应用力学学报 2001年第Z1期18卷 24-30页

作者：姚一龙李暹薛涛明上海飞机研究所上海200232

在时域内计算了汽车结构在不同类型路谱 (地面不平度函数 )激励下的位移、加速度和应力响应。汽车分割成包括车身、车架在内的悬挂部件和非悬挂部件 ,建立各部件的有限元动力结构模型 ,并计算其模态特性。通过子结构综合模态法 ,获得汽... 详细信息

在时域内计算了汽车结构在不同类型路谱 (地面不平度函数 )激励下的位移、加速度和应力响应。汽车分割成包括车身、车架在内的悬挂部件和非悬挂部件 ,建立各部件的有限元动力结构模型 ,并计算其模态特性。通过子结构综合模态法 ,获得汽车结构的模态特性 ,进而计算汽车结构的位移、加速度和动应力响应时间历程。严重应力部位的分析结果与汽车试验台试验结果符合良好。

关键词：有限元法动力响应汽车动力学

牦牛“海绵吸附”bta-miR-146a的lncRNA筛选及靶向验证

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中国畜牧兽医 2023年第3期50卷 859-869页

作者：王运路孟朝轶姚一龙郭敏牛家强索朗斯珠徐业芬西藏农牧学院动物科学学院林芝860000 西藏农牧学院西藏高原动物疫病研究自治区高校重点实验室林芝860000 中国农业科学院深圳农业基因组研究所深圳518000 中国农业大学动物科技学院北京100193

【目的】筛选牦牛卵泡发育过程中可能对靶向Smad家族成员4(Smad family member 4,Smad4)基因的bta-miR-146a具有“海绵吸附”作用的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。【方法】使用miRanda和RNAhybrid数据库对靶向牦牛bta-miR-146a的lncRNA进行预测;采集牦牛卵巢,分离健康、闭锁卵泡,用Trizol法提取RNA并反转录为cDNA,利用PCR检测所预测lncRNA的表达情况;利用实时荧光定量PCR法检测所筛选lncRNA和bta-miR-146a/Smad4在牦牛健康、闭锁卵泡中的表达情况;构建lncRNA-ENSBGRT00000000387.1的野生型和突变型双荧光素酶载体,将其与bta-miR-146a-mimics、mimics NC共转染至HEK293T细胞,检测双荧光素酶活性。【结果】试验共筛选出7个可能对靶向Smad 4基因的bta-miR-146a具有“海绵吸附”作用的lncRNAs,其中的lncRNA-ENSBGRT00000000387.1在牦牛卵泡中表达量极显著高于其他lncRNAs(P一步研究lncRNA-ENSBGRT00000000387.1在牦牛卵泡中的功能机制提供依据。

关键词：牦牛海绵吸附 lncRNA bta-miR-146a

应用PDCA循环法护理神经外科手术患者的效果

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中国医科大学学报 2020年第4期49卷 373-375页

作者：贾天姝姚一龙中国医科大学附属盛京医院第一神经外科沈阳117004

比较实施PDCA循环法护理方案前后神经外科手术患者的切口愈合率、院内感染率及术后满意度。实施PDCA循环法后,切口愈合率由84.7%提高至93.7%,院内感染率由14.7%下降至6.0%,患者术后对医护人员满意度由76.3%上升至90.0%,差异均有统计学意... 详细信息

比较实施PDCA循环法护理方案前后神经外科手术患者的切口愈合率、院内感染率及术后满意度。实施PDCA循环法后,切口愈合率由84.7%提高至93.7%,院内感染率由14.7%下降至6.0%,患者术后对医护人员满意度由76.3%上升至90.0%,差异均有统计学意义(均P<0.05)。因此,应用PDCA循环法护理神经外科手术患者,能够提高患者的切口愈合率,减少院内感染的发生,提高患者术后的满意度。

关键词： PDCA循环神经外科护理

牦牛FKBP6基因启动子区克隆、鉴定与分析

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畜牧兽医学报 2017年第1期48卷 52-59页

作者：姚一龙李伯江李齐发南京农业大学动物科技学院南京210095

本研究旨在了解牦牛FKBP6基因5′调控区和启动子区特征,为探讨牦牛和犏牛睾丸组织中FKBP6基因差异表达机制提供依据。利用克隆测序获得牦牛FKBP6基因5′调控区序列,采用生物信息学方法分析其序列特征;采用双荧光素酶报告基因系统鉴定牦... 详细信息

本研究旨在了解牦牛FKBP6基因5′调控区和启动子区特征,为探讨牦牛和犏牛睾丸组织中FKBP6基因差异表达机制提供依据。利用克隆测序获得牦牛FKBP6基因5′调控区序列,采用生物信息学方法分析其序列特征;采用双荧光素酶报告基因系统鉴定牦牛FKBP6基因核心启动子区,利用生物信息学软件预测与精子发生有关的转录因子结合位点。通过克隆测序和序列拼接获得了1 354bp的牦牛FKBP6基因5′调控区序列,与普通牛的一致性为99.71%;牦牛FKBP6基因5′调控区序列含有潜在的启动子区、典型的CAAT-Box和CpG岛,但未见TATA-Box;荧光素酶活性分析发现,牦牛FKBP6基因的核心启动子区位于5′调控区的-263^-167nt区域,含有CAAT-Box、E-Box、CTCF和CREB等与精子发生相关的转录因子结合位点。牦牛FKBP6基因核心启动子的鉴定和精子发生相关转录因子结合位点的发现为进一步研究牦牛睾丸组织中FKBP6基因的表达调控奠定了基础。

关键词：牦牛 FKBP6 5′调控区核心启动子

13例儿童脑积水脑室-腹腔分流术后颅内感染的诊治分析

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中国医科大学学报 2020年第11期49卷 1046-1048页

作者：姚一龙冯天达刘云会中国医科大学附属盛京医院第一神经外科沈阳110001

对中国医科大学附属盛京医院神经外科收治的脑室-腹腔分流术后继发颅内感染的13例患儿临床资料进行分析。其中,呼吸系统感染继发颅内感染6例,腹腔感染继发颅内感染4例,皮肤破溃以致分流装置外露继发颅内感染2例,重度鼻窦炎继发颅内感染... 详细信息

对中国医科大学附属盛京医院神经外科收治的脑室-腹腔分流术后继发颅内感染的13例患儿临床资料进行分析。其中,呼吸系统感染继发颅内感染6例,腹腔感染继发颅内感染4例,皮肤破溃以致分流装置外露继发颅内感染2例,重度鼻窦炎继发颅内感染1例。呼吸系统感染继发颅内感染患儿经抗菌药物治疗后痊愈,脑室-腹腔分流管保留。其他患儿部分保留脑室-腹腔分流管。1例皮肤破溃继发颅内感染患儿死亡,其他患儿经抗感染治疗后,接受再次手术后痊愈。因此,脑室-腹腔分流术后颅内感染患儿根据继发性感染的病因有效对症治疗,可减轻痛苦,最大程度保证生存质量。

关键词：儿童脑积水脑室-腹腔分流术颅内感染