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作者：唐乖南华大学

学位级别：硕士

目的鉴定来源于三邻甲苯基磷酸酯(Tri-ortho-cresyl phosphate,TOCP)诱导人神经母细胞瘤细胞SK-N-SH细胞自噬中的micro RNA(mi RNA)表达谱,获得TOCP诱导神经细胞自噬差异表达的mi RNA信息;初步探讨mi RNA在TOCP诱导SK-N-SH细胞自噬中的... 详细信息

目的鉴定来源于三邻甲苯基磷酸酯(Tri-ortho-cresyl phosphate,TOCP)诱导人神经母细胞瘤细胞SK-N-SH细胞自噬中的micro RNA(mi RNA)表达谱,获得TOCP诱导神经细胞自噬差异表达的mi RNA信息;初步探讨mi RNA在TOCP诱导SK-N-SH细胞自噬中的作用与机制,进一步阐明mi RNA与细胞自噬的关系,为更深层研究TOCP诱导的细胞自噬提供实验及理论依据。方法1.体外培养人神经母细胞瘤细胞SK-N-SH细胞株,MTT法检测不同浓度TOCP(0、0.25、0.5、0.75、1.0 m M)对SK-N-SH细胞增殖的影响,确定自噬细胞模型中TOCP染毒剂量。2.用0、0.25、0.5 m M TOCP处理SK-N-SH细胞24 h收获细胞作为实验组,以HBSS处理细胞10 h为对照组,分别提取总RNA进行小RNA测序,获得TOCP诱导SK-N-SH细胞自噬的mi RNA表达谱。3.应用生物信息学软件筛选差异倍数较大(前20位)的mi RNA进行靶基因网络分析,预测与关键自噬基因相关的mi RNA,再用q RT-PCR实验验证小RNA测序结果。4.采用生物信息学方法预测mi R-381-3P的靶基因,采用PCR方法调取靶基因3?UTR片段,基因工程方法构建双荧光素酶表达载体。双荧光素酶实验验证目的hsa-mi R-381-3p与靶基因3?UTR之间的靶向关系。结果***法检测结果显示,TOCP染毒处理24 h,细胞增殖受到明显的抑制,并呈现一定的剂量依赖关系,其24 h半数抑制浓度(IC50)为0.65 m M。2.通过小RNA测序筛查发现,与0 m M组相比,TOCP和Hank’s液处理组细胞的mi RNA表达谱发生明显改变。其中0.25 m M组中表达上调超过2倍以上差异的mi RNA有10个,如hsa-mi R-1285-5p、hsa-mi R-192-3p、hsa-mi R-7976等;表达下调超过2倍以上差异的mi RNA有25个,如hsa-mi R-326、hsa-mi R-4448、hsa-mi R-31-3p等。0.5 m M组中表达上调超过2倍以上差异的mi RNA有19个,如hsa-mi R-2355-3p、hsa-mi R-127-3p、hsa-mi R-7978等;表达下调超过2倍以上差异的mi RNA有22个,如hsa-mi R-362-3p、hsa-mi R-153-5p、hsa-mi R-6866-5p等。HBSS组表达上调超过2倍以上差异的mi RNA有45个,如hsa-mi R-1468-5p、hsa-mi R-20a-3p、hsa-mi R-7978等。表达下调超过2倍以上差异的mi RNA有44个,如hsa-mi R-122-5p、hsa-mi R-3195、hsa-mi R-148a-3p等。3.经靶基因网络功能分析以及结合既往报道过的自噬相关的明确的关键靶基因,选取显著差异表达的mi R-1285-5p、mi R-20a-3p、mi R-210-5p、mi R-155-5p、mi R-6866-3p、mi R-381-3p进行q RT-PCR验证,证明测序结果基本可信,其中mi R-381-3p在0.25 m M和0.5m M TOCP处理后出现表达持续下调,可初步作为下一步研究的目标mi RNA。4.应用mi RNA生物信息学预测工具(Target Scan、mi RDB、mi Randa、CLIP-seq和mi RBase)初步预测,自噬相关基因RPS6KA33?UTR与mi R-381-3p的seed部位有着互补结合。应用PCR方法调取RPS6KA3基因3?UTR序列,构建到荧光素酶表达载体上。构建的载体经测序和比对分析确认位置和序列的正确性。分别将RPS6KA3的野生型、突变型以及PC-mi R-424 inhibit sponge克隆到载体pmir Glo中,与mi R-381-3p mimic或NC共同转染进入239T。结果发现,共转染后RPS6KA3的荧光值活性降低到54%(P?0.05)。而共转染mi R-381-3p mimic与突变体荧光素酶载体,荧光素酶的活性无改变。结论***可诱导SK-N-SH细胞mi RNA的表达谱发生显著改变。***6KA3是mi R-381-3p的靶基因之一,其可能作为一种自噬相关基因参与TOCP诱发的SK-N-SH细胞自噬的发生和发展过程。

关键词： SK-N-SH细胞 TOCP miRNA 自噬 RPS6KA3

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Ryanodine受体蛋白的分子结构和理化性质分析

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生物学杂志 2019年第5期36卷 25-30页

作者：杨越朱家佳唐乖龙鼎新南华大学公共卫生学院

Ryanodine受体(Ryanodine receptor, RyR)是一种重要的配体门控的Ca 2+通道,分析RyR蛋白的结构及其理化性质对了解其调控机制具有重要意义。运用生物信息学方法,对RyR 3种亚型蛋白进行了分子结构和理化性质分析。结果显示RyR 3种亚型均... 详细信息

Ryanodine受体(Ryanodine receptor, RyR)是一种重要的配体门控的Ca 2+通道,分析RyR蛋白的结构及其理化性质对了解其调控机制具有重要意义。运用生物信息学方法,对RyR 3种亚型蛋白进行了分子结构和理化性质分析。结果显示RyR 3种亚型均具有跨膜结构,为亲水性蛋白,具有磷酸化位点,含有大量α-螺旋,无二硫键,有蛋白结合能力和离子通道活性等,参与离子转运等。对RyR蛋白进行分子结构和理化性质等生物信息学分析,为RyR的机制研究及生物学实验等提供重要的参考依据。

关键词： Ryanodine受体生物信息学蛋白结构氨基酸

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人RPS6KA3基因及蛋白质的生物信息学分析

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生物学杂志 2019年第6期36卷 30-35页

作者：唐乖杨越朱家佳龙鼎新南华大学公共卫生学院

核糖体蛋白S6激酶A3(ribosomal protein S6 kinase A3,RPS6KA3)具有丝氨酸/苏氨酸激酶活性,在机体的生理过程中发挥重要作用。为了研究RPS6KA3基因的性质和功能,利用一系列生物信息学分析软件对该基因序列及其编码蛋白的结构和特性进行... 详细信息

核糖体蛋白S6激酶A3(ribosomal protein S6 kinase A3,RPS6KA3)具有丝氨酸/苏氨酸激酶活性,在机体的生理过程中发挥重要作用。为了研究RPS6KA3基因的性质和功能,利用一系列生物信息学分析软件对该基因序列及其编码蛋白的结构和特性进行生物信息学分析。结果表明,人RPS6KA3基因共编码740个氨基酸组成的多肽,其在进化过程中高度保守,隶属于PKc_like超家族,是一种等电点为6.41的不稳定的水溶性蛋白,无信号肽序列和跨膜结构。该蛋白定位于细胞质的可能性最大,主要的二级结构为α-螺旋结构,具有多个磷酸化功能位点。与RPS6KA3相互作用的蛋白主要是MAPK信号途径相关蛋白、mTOR信号途径相关蛋白及蛋白合成相关蛋白等。分析结果为进一步研究RPS6KA3在生命过程中的作用提供重要信息。

关键词： RPS6KA3基因生物信息学信号通路

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2015—2022年江西省疟疾疫情特征分析

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2023年第5期41卷 586-592页

作者：龚艳凤李紫芬唐乖黄美琴周炳华胡强江西省疾病预防控制中心南昌330029

目的对2015—2022年江西省疟疾疫情特征进行分析,为制定防治对策提供科学依据。方法从国家传染病报告信息管理系统和寄生虫病防治信息管理系统收集报告地为江西省、终审日期为2015年1月1日至2022年12月31日的疟疾病例,统计病例资料。按... 详细信息

目的对2015—2022年江西省疟疾疫情特征进行分析,为制定防治对策提供科学依据。方法从国家传染病报告信息管理系统和寄生虫病防治信息管理系统收集报告地为江西省、终审日期为2015年1月1日至2022年12月31日的疟疾病例,统计病例资料。按确诊病例(省级疟疾诊断参比实验室镜检和/或PCR疟原虫检测结果为阳性)、临床诊断病例(医疗机构血检结果为阳性但省级参比实验室镜检和PCR均为阴性)、重症病例(存在并发症)进行分类整理。采用SPSS 26.0软件,以LSD⁃t法和mann-whitney Test法进行统计学分析。结果2015—2022年江西省共报告疟疾病例241例,均为境外输入性疟疾,无死亡病例报告。各年报告病例分别为53、52、30、41、46、12、3和4例。其中确诊病例240例,临床诊断病例1例(2015年报告)。在确诊病例中,恶性疟153例(占63.75%)、间日疟50例(占20.83%)、卵形疟31例(占12.91%)、三日疟5例(占2.08%),恶性疟和间日疟混合感染1例(占0.41%)。感染来源分布于非洲、亚洲和大洋洲等34个国家,其中非洲(共27个国家)占92.53%(223/241)。各月份均有病例报告,各月累计以1月、6月和9月病例较多,10月、11月和12月病例较少。2015—2019年[新型冠状病毒感染(简称新冠)疫情发生前]和2020—2022年(新冠疫情期间),月平均报告病例数分别为3.7例和0.53例(t=6.369,P0.05)。初诊到确诊时间间隔中位数为2 d;新冠疫情发生前平均数为(3.36±3.30)d,新冠疫情期间平均数为(2.74±2.90)d,差异无统计学意义(Z=-0.103,P>0.05)。重症病例28例(11.62%),非重症病例213例(88.38%)。重症病例发病到确诊间隔时间(中位数6 d)与非重症病例(中位数4 d)相比,差异无统计学意义(Z=-1.242,P>0.05)。结论疟疾消除后阶段,江西省输入性疟疾引起输入再传播风险仍然存在,应当继续加强监测,防止重症疟疾和死亡的发生。

关键词：疟疾疫情特征江西

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has-miR-155-5p靶基因预测及其生物信息学分析

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中南医学科学杂志 2018年第2期46卷 113-118页

作者：唐乖龙鼎新南华大学公共卫生学院湖南衡阳421001

深入了解miR-155-5p参与的生命过程和疾病类型,为后续的功能研究提供理论依据。对miR-155-5p进行生物信息学分析发现,已知的其成熟序列在不同物种间高度保守;基因本体论(GO)分析发现其分子功能显著富集于杂环化合物结合、核酸结合等,生... 详细信息

深入了解miR-155-5p参与的生命过程和疾病类型,为后续的功能研究提供理论依据。对miR-155-5p进行生物信息学分析发现,已知的其成熟序列在不同物种间高度保守;基因本体论(GO)分析发现其分子功能显著富集于杂环化合物结合、核酸结合等,生物学过程主要富集于细胞大分子代谢、生物调节和有机物代谢等;京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析发现其显著富集于癌症通路、MAPK和Fox O信号通路等。分析结果表明miR-155-5p通过调控靶基因在人类生命活动和疾病发生发展过程中起重要作用,尤其是作为癌症早期诊断和预后的生物标志值得进一步研究。

关键词： miR-155-5p 靶基因生物信息学信号通路

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hsa-miR-381-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析

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生命科学研究 2018年第3期22卷 222-228页

作者：唐乖龙鼎新南华大学公共卫生学院中国湖南衡阳421001

应用生物信息学方法分析miR-381-3p序列,预测其靶基因,并对靶基因进行蛋白质互作分析、功能富集分析及信号转导通路富集分析。结果发现,已知的成熟miR-381-3p序列在不同物种间高度保守。蛋白质互作分析显示,mi R-381-3p预测靶基因所编... 详细信息

应用生物信息学方法分析miR-381-3p序列,预测其靶基因,并对靶基因进行蛋白质互作分析、功能富集分析及信号转导通路富集分析。结果发现,已知的成熟miR-381-3p序列在不同物种间高度保守。蛋白质互作分析显示,mi R-381-3p预测靶基因所编码蛋白质间存在复杂的相互作用,尤其是靶基因BTBD1、NUP160、STX16等编码的蛋白质,在互作中起关键作用。GO分析发现其靶基因集合可能参与细胞过程、生物调节、细胞大分子代谢等生物学过程;KEGG通路分析发现其靶基因集合显著富集于mTOR、Wnt、p53、MAPK等信号通路中。分析结果初步提示miR-381-3p通过调控靶基因广泛参与多种重要的生物学过程,为后续的实验性研究提供了线索。

关键词： miR-381-3p 靶基因生物信息学信号通路

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2022年江西省8 ～ 10岁儿童尿碘特征分析

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中华地方病学杂志 2024年第10期43卷 823-825页

作者：上官俊周炳华胡强黄美琴唐乖龚艳凤李紫芬彭文芳江西省疾病预防控制中心地方病防治所南昌江西省疾病预防控制中心营养与食品安全所南昌

目的了解江西省儿童尿碘水平, 为碘缺乏病防治工作和科学补碘提供依据。方法 2022年3 - 7月采用系统抽样方法在江西省99个县(市、区, 简称县), 每个县按东、西、南、北、中5个方位各抽取1个乡镇(街道), 每个乡镇(街道)抽取1所小学, 每... 详细信息

目的了解江西省儿童尿碘水平, 为碘缺乏病防治工作和科学补碘提供依据。方法 2022年3 - 7月采用系统抽样方法在江西省99个县(市、区, 简称县), 每个县按东、西、南、北、中5个方位各抽取1个乡镇(街道), 每个乡镇(街道)抽取1所小学, 每所小学抽取8 ～ 10岁非寄宿儿童40人(男女各半), 采集随意1次尿样检测尿碘, 比较不同地区、性别和年龄儿童尿碘分布情况。结果共采集儿童尿样19 842份, 尿碘中位数为181.90 μg/L。不同设区(市, H = 1 014.05, P < 0.001)、不同性别(Z = 6.44, P < 0.001)、不同年龄组儿童(H = 29.82, P < 0.001)尿碘水平比较, 差异均有统计学意义。结论江西省儿童尿碘处于适宜水平, 但不同地区、性别、年龄儿童尿碘分布不均, 提示碘缺乏病防治工作需侧重科学、精准补碘。

关键词：碘儿童尿

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敌敌畏对人神经母细胞瘤细胞SK-N-SH的氧化损伤作用

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实用预防医学 2017年第6期24卷 646-649页

作者：杨裔朱家佳唐乖龙鼎新南华大学公共卫生学院湖南衡阳421001

目的研究敌敌畏(O,O-dimethyl-O-2,2-dichlorovinylphosphate,DDVP)对人神经母细胞瘤细胞(SK-N-SH)的氧化损伤作用。方法 MEM培养基培养SK-N-SH细胞,细胞计数测定SK-N-SH细胞群体倍增时间;不同浓度(0~120μmol/L)DDVP作用SK细胞48 h后,MTT法测定SK-N-SH细胞48 h半数抑制浓度(IC50);巴氏染色后观察细胞形态变化;同时分别检测细胞内超氧化物歧化酶(SOD)活性、过氧化氢酶(CAT)活性、丙二醛(MDA)含量的变化。结果SK-N-SH细胞群体倍增时间(36.28±1.46)h;48 h半数抑制浓度(IC50)为(105.22±5.80)μmol/L;随着DDVP染毒浓度的增高,细胞内MDA的含量逐渐增高,SOD、CAT活性逐渐降低,呈现明显的剂量—效应关系(P<0.05)。结论 DDVP对SK-N-SH细胞有明显的氧化损伤作用。

关键词： SK-N-SH细胞敌敌畏丙二醛超氧化物歧化酶过氧化氢酶氧化损伤

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2019年江西省孕妇碘营养水平监测分析

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中华地方病学杂志 2021年第7期40卷 551-553页

作者：上官俊朱名群周炳华毛战球李紫芬唐乖江西省疾病预防控制中心地方病防治所南昌330029 江西省肿瘤医院呼吸内科南昌330029

目的分析江西省孕妇碘营养状况,为孕妇科学补碘提供依据。方法2019年,采用系统抽样方法,在江西省11个设区市的100个县(市、区,简称县),每个县按东、南、西、北、中5个方位各抽取1个乡镇(街道),每个乡镇(街道)抽取20名孕妇(早、中、晚孕... 详细信息

目的分析江西省孕妇碘营养状况,为孕妇科学补碘提供依据。方法2019年,采用系统抽样方法,在江西省11个设区市的100个县(市、区,简称县),每个县按东、南、西、北、中5个方位各抽取1个乡镇(街道),每个乡镇(街道)抽取20名孕妇(早、中、晚孕期均衡),进行家庭食用盐盐样和尿样的碘含量测定。分析比较各设区市孕妇盐碘、尿碘水平以及不同孕期尿碘分布。结果共采集孕妇家庭食用盐盐样10000份,盐碘中位数为24.53 mg/kg,合格碘盐食用率为97.05%(9705/10000),碘盐覆盖率为99.80%(9980/10000);各设区市孕妇家庭食用盐碘含量比较,差异无统计学意义(H=3.42,P>0.05)。共检测孕妇尿样10000份,尿碘中位数为175.58μg/L,各设区市孕妇尿碘含量比较,差异有统计学意义(H=28.80,P0.05)。结论江西省孕妇碘营养处于适宜状态,但各地孕妇碘营养状况分布不均,需关注重点地区孕妇的碘营养状况。

关键词：孕妇碘盐类尿

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2014-2018年江西省燃煤污染型地方性氟中毒病区监测结果分析

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中华地方病学杂志 2021年第11期40卷 898-901页

作者：上官俊周炳华毛战球唐乖李紫芬龚艳凤雷蕾江西省疾病预防控制中心地方病防治所南昌330029

目的了解江西省燃煤污染型地方性氟中毒病区防治措施落实后病情现状和变化趋势。方法按照国家《燃煤污染型地方性氟中毒监测方案》的要求,2014-2018年,每年在江西省芦溪、上栗县分别抽取3个固定监测村和5个非固定监测村,采用单纯随机抽... 详细信息

目的了解江西省燃煤污染型地方性氟中毒病区防治措施落实后病情现状和变化趋势。方法按照国家《燃煤污染型地方性氟中毒监测方案》的要求,2014-2018年,每年在江西省芦溪、上栗县分别抽取3个固定监测村和5个非固定监测村,采用单纯随机抽样方法每个村抽取10户家庭,监测灶使用情况和食用辣椒相关行为方式,并在固定监测村开展8~12岁儿童氟斑牙和尿氟监测。结果固定监测村各年度改良灶使用率、电炊具等清洁能源使用率、改良灶合格率比较,差异均有统计学意义(χ^(2)=111.70、83.96、36.64,P均0.05)。非固定监测村各年度改良灶使用率、电炊具等清洁能源使用率、改良灶合格率、改良灶正确使用率比较,差异均有统计学意义(χ^(2)=132.32、42.63、50.03、15.29,P均0.05),食用辣椒正确保管率和加工前淘洗率均达到或接近100%。2014-2018年8~12岁儿童氟斑牙检出率从17.04%(106/622)下降至6.68%(90/1347),且呈逐年下降趋势(χ^(2)趋势=72.60,P0.05)。结论江西省燃煤污染型地方性氟中毒病区防治工作取得明显成效。

关键词：氟监测改炉改灶

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