hsa-miR-381-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析

作     者：唐乖 龙鼎新 TANG Guai;LONG Ding-xin

作者机构：南华大学公共卫生学院中国湖南衡阳421001 

出 版 物：《生命科学研究》 (Life Science Research)

年 卷 期：2018年第22卷第3期

页      面：222-228页

学科分类：0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 0711[理学-系统科学] 12[管理学] 1204[管理学-公共管理] 120402[管理学-社会医学与卫生事业管理(可授管理学、医学学位)] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 08[工学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(81673227 81172712) 

主　　题：miR-381-3p 靶基因 生物信息学 信号通路 

摘      要：应用生物信息学方法分析miR-381-3p序列,预测其靶基因,并对靶基因进行蛋白质互作分析、功能富集分析及信号转导通路富集分析。结果发现,已知的成熟miR-381-3p序列在不同物种间高度保守。蛋白质互作分析显示,mi R-381-3p预测靶基因所编码蛋白质间存在复杂的相互作用,尤其是靶基因BTBD1、NUP160、STX16等编码的蛋白质,在互作中起关键作用。GO分析发现其靶基因集合可能参与细胞过程、生物调节、细胞大分子代谢等生物学过程;KEGG通路分析发现其靶基因集合显著富集于mTOR、Wnt、p53、MAPK等信号通路中。分析结果初步提示miR-381-3p通过调控靶基因广泛参与多种重要的生物学过程,为后续的实验性研究提供了线索。