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6个不同品种荔枝果肉内生细菌群落多样性的高通量测序分析

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广东农业科学 2024年第2期51卷 29-38页

作者：史发超蔡长河严倩姜永华刘海伦文英杰欧良喜陈洁珍广东省农业科学院果树研究所/农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室/广东省热带亚热带果树研究重点实验室广东广州510640

【目的】内生菌在植物生长发育中发挥重要作用,分析不同品种荔枝果肉内生细菌群落结构及多样性,挖掘和利用潜在荔枝内生菌种资源,为进一步研究荔枝与内生菌互作关系提供参考依据。【方法】以6个不同品种荔枝的果肉组织为材料,PCR扩增16S... 详细信息

【目的】内生菌在植物生长发育中发挥重要作用,分析不同品种荔枝果肉内生细菌群落结构及多样性,挖掘和利用潜在荔枝内生菌种资源,为进一步研究荔枝与内生菌互作关系提供参考依据。【方法】以6个不同品种荔枝的果肉组织为材料,PCR扩增16SrDNA的V3~V4区,利用MiSeq高通量测序技术分析果肉组织内生细菌在门、科、属和种分类水平上的群落组成及优势菌群,结合Alpha多样性分析评估内生细菌群落多样性。【结果】对6个品种荔枝果肉内生细菌16S rDNA的V3~V4区进行扩增,共获得2139086条序列,其平均长度为376 bp。不同品种荔枝果肉内生细菌群落在相对丰度和多样性上无显著差异。在门分类水平,变形菌门为主要优势细菌门类,其次为放线菌门。在科、属和种分类水平上,不同品种荔枝内生菌群落结构相似,但相对丰度占比不同。差异菌群分析结果显示,假单胞菌属(Pseudomonas)、果胶杆菌属(Pectobacterium)、苍白杆菌属(Ochrobactrum)和迪基氏菌属(Dickeya)在优良品种‘鹅蛋荔’‘糯米糍’和‘观音绿’中显著富集,根瘤菌属(Bradyrhizobium)和变形菌属(Snodgrassella)只在‘鹅蛋荔’中富集。根据菌群相对丰度进行聚类分析,‘观音绿’‘糯米糍’和‘鹅蛋荔’的相似性更高。Alpha多样性分析结果表明,6种荔枝果肉内生菌群仅在丰度和多样性上存在差异,但未达到显著水平。【结论】该研究首次分析了6个不同品种荔枝果肉内生细菌的群落结构,并在优良荔枝品种中发现特有的微生物类群富集现象,可为后续提升荔枝品质、开发利用内生菌提供理论依据和重要参考。

关键词：荔枝果肉内生细菌群落结构微生物多样性优势菌群高通量测序

功能性三尖瓣反流与房颤消融术后复发的相关性研究

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功能性三尖瓣反流与房颤消融术后复发的相关性研究

作者：史发超皖南医学院

学位级别：硕士

目的:研究功能性三尖瓣反流(functional tricuspid regurgitation,FTR)与房颤(atrial fibrillation,AF)导管消融术后复发的相关性。方法:选取2020年01月01日至2021年12月01日于皖南医学院弋矶山医院心内科行导管消融AF患者261例。收集... 详细信息

目的:研究功能性三尖瓣反流(functional tricuspid regurgitation,FTR)与房颤(atrial fibrillation,AF)导管消融术后复发的相关性。方法:选取2020年01月01日至2021年12月01日于皖南医学院弋矶山医院心内科行导管消融AF患者261例。收集患者的性别、年龄、身体质量指数(body mass index,BMI)、相关合并症和超声心动图参数等一般临床资料。根据患者术前超声心动图检查结果将患者分为对照组(无和轻度三尖瓣反流,n=189)和实验组(中、重度三尖瓣反流,n=72)。对所有成功接受导管消融的入选者平均随访14月,并依据随访过程中有无复发将患者分为复发组(n=53)和未复发组(n=208)。比较各组间的一般临床资料,分析房颤消融患者中显著三尖瓣反流(中、重度三尖瓣反流)的患病率及相关临床因素;采用单因素及多因素cox回归分析显著三尖瓣反流对房颤患者导管消融术后复发的影响。结果:1、显著FTR的患病率为27.6%(72/261),其中持续性房颤患者合并显著FTR为40.3%(58/144),阵发性房颤患者合并显著FTR为12.0%(14/117),两者之间的差异有统计学意义(P发组和未复发组间在年龄、BMI、房颤类型、高血压病史、左房前后径、左室前后径、右房左右径、右室前后径、肺动脉压力、三尖瓣反流程度等方面均有显著差异(P0.05);5、多因素Cox的回归分析结果表明,显著的FTR、右房大小为AF导管消融术后复发的的独立危险因素。结论:中、重度FTR、右房大小为房颤消融术后复发的独立危险因素。

关键词：功能性三尖瓣反流心房颤动复发预测因素导管消融

文化生态保护区旅游发展水平评价及其发展模式

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经济地理 2024年第3期44卷 209-217页

作者：何琪敏史中超谈国新华中师范大学国家文化产业研究中心湖北武汉430079 东京都市大学环境学部日本东京158-8557

文化生态保护区发展旅游业,既为文化生态保护区内非物质文化遗产提供新的活态传播路径,也为文化与旅游融合发展提供新的案例。文章首先利用ROST CM6工具,通过政策文本分析构建出相关政策的三维分析框架,提出文化生态保护区旅游发展水平... 详细信息

文化生态保护区发展旅游业,既为文化生态保护区内非物质文化遗产提供新的活态传播路径,也为文化与旅游融合发展提供新的案例。文章首先利用ROST CM6工具,通过政策文本分析构建出相关政策的三维分析框架,提出文化生态保护区旅游发展水平的评价指标体系;然后基于16个国家级文化生态保护区的统计数据,综合评价各文化生态保护区旅游发展水平,根据各维度评价的差异情况,总结了文化生态保护区旅游发展的不同模式。研究发现:(1)从评价结果看,我国非遗保护指标权重高于主体获益与旅游市场,且各文化生态保护区旅游发展水平差异较大;(2)从发展模式看,各文化生态保护区旅游发展形成了上下贯通型、从上至下型、从周边到中心型、以大带小型4种模式。最后,为更好地保障文化生态保护区的非遗活态传播,提出了促进文化生态保护区与旅游业可持续融合发展的实践建议。

关键词：文化生态保护区非物质文化遗产旅游发展水平政策文本分析评价活态传播发展模式

TRV介导的溪荪VIGS转化体系的构建与鉴定

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植物研究 2024年第1期44卷 132-138页

作者：刘桂伶徐诺史恭发王玲东北林业大学园林学院哈尔滨150040

病毒诱导基因沉默(Virus-induced gene silencing,VIGS)技术为缺乏稳定遗传转化体系的植物进行基因功能分析提供了可能,为解决缺少稳定遗传转化体系的植物进行基因功能验证的需求,以单子叶植物溪荪(Iris sanguinea)为材料,克隆IsPDS基... 详细信息

病毒诱导基因沉默(Virus-induced gene silencing,VIGS)技术为缺乏稳定遗传转化体系的植物进行基因功能分析提供了可能,为解决缺少稳定遗传转化体系的植物进行基因功能验证的需求,以单子叶植物溪荪(Iris sanguinea)为材料,克隆IsPDS基因的特异性片段并构建其VIGS重组载体pTRV2-IsPDS,通过注射法侵染溪荪叶片,结果显示:pTRV1和pTRV2-IsPDS的菌液OD_(600)调至1.8~2.0后重悬,重悬液OD600调至0.8~1.0,通过注射器叶脉注射方式侵染溪荪叶片效果最佳。在室外温度为15~20℃的下午6~8时进行,用1 mL注射器针头扎伤溪荪叶片外表皮,沿着平行脉缓慢注射重悬液1mL至溪荪叶片维管束中,14 d左右会出现明显的白化表型。在出现表型变化的植株和空载组中均检测到TRV1和TRV2的病毒载体,白化植株的IsPDS表达量显著低于对照组。侵染液配制中通过提高携带病毒载体的农杆菌的浓度提高侵染效率,且接种后无需遮光。

关键词：溪荪 IsPDS基因 VIGS体系

基于改进YOLOv5算法的钢材表面缺陷检测

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郑州大学学报(工学版) 2024年

作者：燕雨荆宇超史孟翔杨朵郑州大学电气与信息工程学院

为了解决钢铁缺陷检测效率低下和因误检造成的经济损失问题,提出了用于钢材缺陷检测的YOLOv5改进算法。在保持原YOLOv5检测层不变的情况下,新增加3条自适应权重的辅助分支,用于提取YOLOv5网络的浅层信息,同时辅助分支也可以增强整体网... 详细信息

为了解决钢铁缺陷检测效率低下和因误检造成的经济损失问题,提出了用于钢材缺陷检测的YOLOv5改进算法。在保持原YOLOv5检测层不变的情况下,新增加3条自适应权重的辅助分支,用于提取YOLOv5网络的浅层信息,同时辅助分支也可以增强整体网络的梯度流动,使得训练效果更好;在网络的主干部分加入EMA注意力机制,经过EMA模块加权后的特征信息可以帮助模型更好地关注和理解重要的目标特征;使用SIoU代替了CIoU损失函数,SIoU引入的角度损失和形状损失可以使锚框在回归过程更加快速准确,提高检测的稳定性和鲁棒性。通过对NEU-DET数据集的实验,所提的改进算法相比原YOLOv5s精确率提升了3.7百分点,相比其他主流算法也拥有更好的检测性能。

关键词： YOLOv5 自适应辅助分支注意力机制损失函数

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左心耳封堵术的临床研究进展

中文科技期刊数据库（引文版）医药卫生 2022年第5期 68-74页

作者：史发超汪祥海皖南医学院附属第一医院弋矶山医院心内科安徽芜湖241001

缺血性卒中为心房颤动患者严重且较为常见的并发症之一。长期以来,口服抗凝药为其主要治疗方法。尽管这一治疗策略有了较大的进步和发展,然而抗凝本身带来的出血风险和患者依从性差、难以耐受均限制了其临床应用。近年来,左心耳封堵术... 详细信息

缺血性卒中为心房颤动患者严重且较为常见的并发症之一。长期以来,口服抗凝药为其主要治疗方法。尽管这一治疗策略有了较大的进步和发展,然而抗凝本身带来的出血风险和患者依从性差、难以耐受均限制了其临床应用。近年来,左心耳封堵术发展迅速,为口服抗凝药禁忌和难以耐受抗凝治疗的患者提供了一种新的治疗手段。越来越多的研究表明,左心耳封堵术预防非瓣膜性房颤患者卒中是安全、有效的,本文就左心耳封堵术近年来的临床研究进展做一综述。

关键词：经皮左心耳封堵术房颤血栓栓塞

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不同运动强度与骨关节炎发病风险的效应分析

中国组织工程研究 2024年

作者：马浩宇乔鸿超郝茜茜史冬博太原理工大学体育学院

背景：越来越多的证据表明不同运动强度与骨关节炎风险之间存在关联，但这可能受到混杂和反向因果关系的影响，结论尚未统一。目的：应用孟德尔随机化探索不同运动强度与骨关节炎的因果关联。方法：选取与不同运动强度相关联的全基因组... 详细信息

背景：越来越多的证据表明不同运动强度与骨关节炎风险之间存在关联，但这可能受到混杂和反向因果关系的影响，结论尚未统一。目的：应用孟德尔随机化探索不同运动强度与骨关节炎的因果关联。方法：选取与不同运动强度相关联的全基因组关联研究数据，以阈值P 发现，骨关节炎与低强度运动呈负相关性，与电视观看呈正相关。(2)分析结果显示，不同运动强度与骨关节炎风险存在双向因果关系。

关键词：运动强度骨关节炎孟德尔随机化因果关联膝关节骨关节炎髋关节骨关节炎

荔枝CDPK基因家族鉴定及其在霜疫病胁迫下的表达分析

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果树学报 2023年第3期40卷 442-456页

作者：刘海伦严倩姜永华史发超陈洁珍蔡长河欧良喜广东省农业科学院果树研究所·农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室·广东省热带亚热带果树研究重点实验室广州510640

【目的】鉴定荔枝(Litchi chinensis Sonn.)钙依赖蛋白激酶(CDPK)基因家族,并分析其在不同组织和荔枝霜疫病胁迫下的表达模式。【方法】基于荔枝基因组数据,利用生物信息学方法鉴定CDPK家族基因,并对其序列特征、基因结构、启动子顺式... 详细信息

【目的】鉴定荔枝(Litchi chinensis Sonn.)钙依赖蛋白激酶(CDPK)基因家族,并分析其在不同组织和荔枝霜疫病胁迫下的表达模式。【方法】基于荔枝基因组数据,利用生物信息学方法鉴定CDPK家族基因,并对其序列特征、基因结构、启动子顺式作用元件、染色体定位和进化关系等进行分析。依赖276份荔枝种质材料,筛选高抗霜疫病的优良荔枝品种。另外,通过RNA-Seq和qRT-PCR方法检测高抗病荔枝品种中LcCDPK基因家族成员在荔枝霜疫病胁迫处理下的表达模式。【结果】从276份荔枝自然群体材料中鉴定到荔枝高抗霜疫病品种裕荣1号(YR1)。从荔枝基因组中共鉴定出19个LcCDPK基因家族成员,分布于11条染色体上。根据保守结构域和系统发育分析将其分为4个亚家族。基因结构分析表明,LcCDPKs外显子数量为7~19。蛋白结构分析发现,所有LcCDPK蛋白均具有1~4个EF-hand结构域。顺式作用元件分析表明,LcCDPKs成员拥有大量的生物和非生物胁迫响应元件。组织表达分析发现,LcCDPK基因在荔枝不同组织存在组织特异性。另外,表达分析发现在高抗霜疫病荔枝裕荣1号(YR1)中,LcCDPK5、LcCDPK17和LcCDPK19在霜疫病胁迫后急剧上调表达,LcCDPK3和LcCDPK8急剧下调表达。【结论】裕荣1号(YR1)是一种高抗霜疫病的荔枝品种。荔枝基因组中共鉴定出19个CDPK基因家族成员,具有明显的组织特异性,LcCDPK5、LcCDPK17、LcCDPK19、LcCDPK3和LcCDPK8可能在荔枝抗霜疫病过程中发挥重要作用。研究结果为进一步探究荔枝CDPK基因家族提供了参考。

关键词：荔枝钙依赖蛋白激酶(CDPK) 荔枝霜疫病表达分析

含丙二醇的复合有机抑制剂应用于TSV镀铜工艺的研究

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电镀与涂饰 2024年第1期43卷 43-49页

作者：史筱超于仙仙王溯上海市集成电路关键工艺材料重点实验室上海201616 上海新阳半导体材料股份有限公司上海201616

[目的]硅通孔(TSV)电镀铜填充一般采用PEG(聚乙二醇)类有机化合物抑制剂,但往往存在电镀时间长、易产生空洞、面铜较厚、退火后晶界间缺陷多等问题。[方法]开发了一种新型含丙二醇的复合有机抑制剂,研究了采用它时的TSV填充模式,退火后... 详细信息

[目的]硅通孔(TSV)电镀铜填充一般采用PEG(聚乙二醇)类有机化合物抑制剂,但往往存在电镀时间长、易产生空洞、面铜较厚、退火后晶界间缺陷多等问题。[方法]开发了一种新型含丙二醇的复合有机抑制剂,研究了采用它时的TSV填充模式,退火后孔内镀层的结晶状态,以及镀层的杂质含量。[结果]该抑制剂对TSV的填充效果明显优于传统抑制剂,与小分子含硫化合物加速剂复配使用时可实现“自下而上”的均匀填充,且面铜平整,无微孔、气泡等缺陷存在。[结论]该复合有机抑制剂具有很好的工业化应用潜力。

关键词：硅通孔电镀铜丙二醇有机抑制剂自下而上填充