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DNA指纹图谱法在哺乳动物和鸟类遗传研究中的应用

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动物学杂志 1991年第4期26卷 53-55页

作者：刘德立华中师范大学生物系武昌430070

DNA指纹图谱法(DNA fingerprinting)是1980年中期发展起来的一种新的实验方法。短暂的几年,该方法得到迅速发展和完善,并在鸟类、人类和其它哺乳动物的遗传研究中得到广泛应用。在人类染色体中,含有许多分散的具有串联重复单位的微小... 详细信息

DNA指纹图谱法(DNA fingerprinting)是1980年中期发展起来的一种新的实验方法。短暂的几年,该方法得到迅速发展和完善,并在鸟类、人类和其它哺乳动物的遗传研究中得到广泛应用。在人类染色体中,含有许多分散的具有串联重复单位的微小卫星区(minisatellite)。在这些区域中,由于重复单位的数目和重复拷贝数的等位性不同,所以许多卫星区表现出高度多态性(high polymorphism)。1985年,Jeffreys等人发现,这些区域可通过一种10—15碱基对的核心序列来检测。他们从人肌红蛋白基因的卫星区分离出单一重复单位。

关键词：哺乳纲鸟纲 DNA指纹图谱遗传

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DNA指纹图谱法及其应用

生物化学与生物物理进展 1990年第6期17卷 421-424,436页

作者：刘德立华中师范大学生物系武昌430070

DNA指纹图谱法是利用卫星DNA作探针,探测不同生物的卫星区,产生相应的DNA指纹图谱的杂交方法。它是八十年代中期发展起来的最新技术。短暂几年,该法得到迅速发展和完善,并在法医学、人类遗传学以及鸟类和其它哺乳类的遗传研究中得到广... 详细信息

DNA指纹图谱法是利用卫星DNA作探针,探测不同生物的卫星区,产生相应的DNA指纹图谱的杂交方法。它是八十年代中期发展起来的最新技术。短暂几年,该法得到迅速发展和完善,并在法医学、人类遗传学以及鸟类和其它哺乳类的遗传研究中得到广泛应用。

关键词： DNA指纹图谱指纹技术 DNA探针

重组缣孢菌细胞色素P-450nor的性质研究

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生物化学与生物物理进展 1997年第2期24卷 147-150页

作者：刘德立祥云弘文华中师范大学生物系武汉430070 筑波大学应用生物化学系

纯化的重组缣孢菌细胞色素P 4 50nor(recombinantfusariumoxysporumcytochromeP 4 50nor ,rF·P 4 50nor)用于动力学研究 .测得米氏常数Km (NO)和Km (NADH)分别为 0 1 2 8mmol/L和0 2 0 8mmol/L .Vmax (N2 O)为 1 1 363min- 1.光谱吸收特性研究表明 :rF·P 4 50nor具有典型的血红素蛋白的特性 ,在 4 1 3nm有最大吸收峰 .加入还原剂Na2 S2 O4 时 ,最大吸收峰前移至 4 0 5nm .与CO结合后 ,再加入还原剂Na2 S2 O4 时 ,在 4 50nm处表现最大吸收 .与NO结合后 ,最大吸收峰移至4 30nm附近 .这些光谱特征的变化与天然的F·P 4

关键词：细胞色素 P-450nor 重组动力学研究镰孢菌

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1株高效BBP降解菌的分离与特性研究

环境科学 2013年第7期34卷 2882-2888页

作者：陈湖星杨雪张凯钟秋郭佳王攀熊丽刘德立华中师范大学生命科学学院湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室武汉430079

从湖北省荆沙河泥样中富集培养分离得到了1株能够以邻苯二甲酸丁基苄基酯为唯一碳源和能源生长的细菌并命名为HS-B1.采用形态学、生理生化和16S rDNA序列分析对其进行了鉴定,发现HS-B1是1株杆状、需氧、革兰氏阴性细菌,接触酶呈阳性反应... 详细信息

从湖北省荆沙河泥样中富集培养分离得到了1株能够以邻苯二甲酸丁基苄基酯为唯一碳源和能源生长的细菌并命名为HS-B1.采用形态学、生理生化和16S rDNA序列分析对其进行了鉴定,发现HS-B1是1株杆状、需氧、革兰氏阴性细菌,接触酶呈阳性反应,氧化酶呈阴性反应,不产硫化氢气体,且该菌的16S rDNA序列与琼氏不动杆菌(Acinetobacter junii)的相似性高达99%.因此初步鉴定该菌株为不动杆菌(Acinetobacter sp.).摇瓶实验表明,菌株HS-B1生长和BBP降解的最适培养条件为35℃,pH 8.0.采用0.10 mmol.L-1非离子型表面活性剂吐温-80提高了BBP在水溶液中的表观溶解度,发现在最适培养条件下,HS-B1能够在48 h内将浓度为1 000 mg.L-1BBP完全降解,证明是一株高效降解菌.底物广谱性实验中,菌株HS-B1也能够有效利用DMP、DEP、DBP等邻苯二甲酸酯类化合物,说明该菌株在处理邻苯二甲酸酯类化合物的污染治理中有独特的应用潜力.

关键词：邻苯二甲酸丁基苄基酯 16S rDNA 生物降解吐温-80 表观溶解度底物广谱性

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粮草畜耦合系统模拟

粮草畜耦合系统模拟

第二十届中国作物学会学术年会

作者：王自奎刘德立王斌 Annette Cowie 兰州大学草业农业科技学院

粮草畜耦合系统包括作物、牧草和家畜的共同生产,相较于传统单一粮食作物种植系统其自给能力更强、环境成本较低。然而该耦合系统产量优势的形成机制尚不清楚,气候变化条件下系统资源利用规律和生产潜力也不清晰。本研究利用经过验证的A... 详细信息

粮草畜耦合系统包括作物、牧草和家畜的共同生产,相较于传统单一粮食作物种植系统其自给能力更强、环境成本较低。然而该耦合系统产量优势的形成机制尚不清楚,气候变化条件下系统资源利用规律和生产潜力也不清晰。本研究利用经过验证的APSIM模型,在两种共享社会经济路径（SSP245和SSP585）下,利用27个全球气候模型（GCMs）提供的气候数据,模拟了包含6种不同作物轮作的粮食-牧草-绵羊耦合生产系统（WCWC、WFWC、WFWO、WWB、WWC和WWO）,将纯作物轮作设定为参照,评估了历史时期（1985-2008）、近未来（NF,2033-2056）和远未来（FF,2057-2080）条件下耦合农业系统中牧草、作物和家畜放牧对土壤水分和氮平衡及系统生产力的影响。结果显示,与作物系统相比耦合生产系统将更多的氮（N）还原回土壤,作物生长阶段的氮还原量在历史时期为28.1～28.3 kg ha,在未来气候下为32.2～36.4 kg ha,牧草生长阶段的氮以有机物和尿素的形式返回土壤,SSP245情景下历史时期、NF和FF等不同时期返还量分别为66.3、80.4和83.8 kg ha,SSP585情景下NF和FF返还量分别为85.5和94.4 kg ha。耦合系统中存在时间上的氮素互补作用,不同的轮作和气候情景下作物每年从土壤中吸收25.4～58.2 kg ha的氮。在水分平衡方面,耦合系统显著减少了深层排水,降雨的收集效率比作物系统提高了11.0%-12.3%。耦合系统中更多的水分用于蒸腾作用,蒸腾与蒸散比（T/ET）相较于作物系统增加了38.1%～44.6%。SSP245情景下历史、NF和FF等不同时期常规系统中作物水分利用效率为9.81、10.71和11.03 kg ha mm,耦合系统中增加到10.67、11.60和11.99 kg ha mm,SSP585 NF和FF下进一步增加至为12.33和13.60 kg ha mm。耦合系统粗蛋白水分利用效率比作物系统分别提高了33.1%～61.6%。在未来气候条件下,紫花苜蓿后的第一年小麦作物的产量优势受到土壤水分含量的限制,而其他作物产量优势由于气候变暖而增加。WCWC轮作苜蓿的8年耦合生产系统经济效益最高,而WFWO轮作苜蓿系统的经济效益增加幅度最大。并且,耦合种植系统大幅度增加了土壤有机碳,历史条件下温室气体排放与传统农业系统相当,未来气候下需要通过秸秆还田增加土壤碳汇,以减少耦合农业系统的温室气体排放量。本研究表明,粮草畜耦合农业系统对氮输入的依赖较低,减少了水分渗漏和蒸发损失,提高了水分利用效率和系统产量。在未来的气候条件下,水氮互补利用和产量优势可以进一步增强。建议在旱作农区采用粮食作物-苜蓿轮作饲养家畜的耦合生产方式提高变化环境下农业系统的生产稳定性。

关键词： APSIM 农业系统建模耦合农业水氮互补利用资源利用效率

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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植物热激蛋白及其功能

植物学通报 1996年第1期13卷 14-19页

作者：刘德立华中师范大学生物系

植物热激蛋白及其功能＊刘德立（华中师范大学生物系，武汉４３００７０）ＨＥＡＴ－ＳＨＯＣＫＰＲＯＴＥＩＮＳＯＦＰＬＡＮＴＳＡＮＤＴＨＥＩＲＦＵＮＣＴＩＯＮＳＬｉｕＤｅ－ｌｉ（ＢｉｏｌｏｇｙＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＨｕａ... 详细信息

植物热激蛋白及其功能＊刘德立（华中师范大学生物系，武汉４３００７０）ＨＥＡＴ－ＳＨＯＣＫＰＲＯＴＥＩＮＳＯＦＰＬＡＮＴＳＡＮＤＴＨＥＩＲＦＵＮＣＴＩＯＮＳＬｉｕＤｅ－ｌｉ（ＢｉｏｌｏｇｙＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＨｕａｚｈｏｎｇＮｏｒｍａｌＵｎｉｕｅｒ...

关键词：植物热激蛋白功能

柱孢菌细胞色素P－450nor2cDNA克隆与表达

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Acta Biochimica et Biophysica Sinica 1996年第5期28卷 27-34页

作者：刘德立华中师范大学生物系筑波大学应用生物化学系

在真菌的反硝化作用中，一种独特的细胞色素Ｐ－４５０起着一氧化氮还原酶（Ｐ－４５０ｎｏｒ）的作用。用ｇｔｌｌ构建了柱孢菌（Ｃｙｌｉｎｄｒｏｃａｒｐｏｎｔｏｎｌｅｉｎｅｎｓｅ）ｃＤＮＡ文库。纯化的柱孢菌Ｃ。Ｐ－４５０ｎｏ... 详细信息

在真菌的反硝化作用中，一种独特的细胞色素Ｐ－４５０起着一氧化氮还原酶（Ｐ－４５０ｎｏｒ）的作用。用ｇｔｌｌ构建了柱孢菌（Ｃｙｌｉｎｄｒｏｃａｒｐｏｎｔｏｎｌｅｉｎｅｎｓｅ）ｃＤＮＡ文库。纯化的柱孢菌Ｃ。Ｐ－４５０ｎｏｒ２免疫兔，制备抗体。并用抗体筛选出阳性克隆。回收插入片段（Ｐ－４５０ｎｏｒ２ｃＤＮＡ）克隆到表达载体ｐＹＥＳ２中，并在酵母系统中表达。经Ｗｅｓｔｅｍ－ｂｌｏｔ分析验证，表达产物能与抗体反应产生特异性杂交带。酶分析结果表明：表达产物具有一氧化氮还原酶细胞包素Ｐ－４５０ｎｏｒ２的活性，能以ＮＡＤＨ或ＮＡＤＰＨ为供体，使ＮＯ还原先成Ｎ２Ｏ。

关键词：细胞色素P－450nor cDNA克隆表达

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同方期刊数据库

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RNA催化剂的研究进展

生命的化学 1990年第1期10卷 13-15页

作者：刘德立华中师范大学生物系

RNA催化剂(Rlbozyme)最初由Cech(1989年诺贝尔化学奖金获得者)发现井命名,意指具有催化能力的RNA。发现的七、八年间,已相继发现了几十种RNA催化剂,1988年9月,在美国纽约州州府Albany召开了关于RNA催化。

关键词： RNA RNA催化剂

日本血吸虫乙醛脱氢酶全长基因编码序列的预测、验证与分析

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2008年第1期26卷 30-34页

作者：王玮刘德立胡薇冯正杨忠中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所世界卫生组织疟疾、血吸虫病和丝虫病合作中心卫生部寄生虫病原与媒介生物学重点实验室上海200025 华中师范大学生命科学学院武汉430079 上海生物信息技术研究中心上海200235 华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室上海200237

目的利用生物信息学和实验相结合的方法,补平已知拼接序列中的缺失片段,获得日本血吸虫乙醛脱氢酶全长基因编码序列。方法通过生物信息学方法从已公开发布的日本血吸虫转录组数据库中提取乙醛脱氢酶表达序列标签(EST)序列数据,与其他物... 详细信息

目的利用生物信息学和实验相结合的方法,补平已知拼接序列中的缺失片段,获得日本血吸虫乙醛脱氢酶全长基因编码序列。方法通过生物信息学方法从已公开发布的日本血吸虫转录组数据库中提取乙醛脱氢酶表达序列标签(EST)序列数据,与其他物种的同源基因进行多序列联配,寻找分别与同一蛋白氨基酸序列的N端和C端配对的序列;设计引物,用RT-PCR扩增得到全长基因中间的缺失片段并测序。最终获得全长基因序列,并分析该蛋白的理化性质。结果找到日本血吸虫乙醛脱氢酶基因的可能EST序列片段8条,对其中的1对EST序列(AAW27891和AAW27047对应的氨基酸序列,中间缺少约80个氨基酸)进行blastn比对结果,预测为同一基因的2条片段。根据这两对EST序列设计正、反向引物,通过PCR扩增、对扩增产物进行测序及序列的生物信息学鉴定,找回了缺少的核酸序列,并与预测序列大小大致吻合(430bp)。组合成1条完整的日本血吸虫乙醛脱氢酶基因的编码序列(提交GenBank,其登录号为EF503564)。ORF全长为1596bp,编码531个氨基酸,编码的蛋白相对分子质量理论值为Mr57330.7,pI值为7.94,此序列的290～297位氨基酸与乙醛脱氢酶的模式序列[LIVMFGA]-E-[LIMSTAC]-[GS]-G-[KNLM]-[SADN]-[TAPFV]相匹配。结论利用生物信息学和实验相结合的方法,可以补平已知拼接序列中的缺失片段,获得日本血吸虫乙醛脱氢酶的全长基因编码序列。

关键词：日本血吸虫乙醛脱氢酶生物信息学序列拼接