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宏基因组二代测序技术在单纯疱疹肺炎混合感染患者中的应用

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中国医师杂志 2022年第5期24卷 728-732页

作者：侯红玲孙国先刘微丽郑庆斌扬州大学附属医院神经内科扬州225001 扬州大学附属医院临床药学科扬州225001 扬州大学附属医院重症医学科扬州225001

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在单纯疱疹肺炎混合感染患者中的应用价值。方法回顾性分析扬州大学附属医院2018年6月至2021年1月行肺泡灌洗液传统病原检测和mNGS检测的肺炎患者的临床资料,包括患者一般资料、mNGS检测结果、细菌... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在单纯疱疹肺炎混合感染患者中的应用价值。方法回顾性分析扬州大学附属医院2018年6月至2021年1月行肺泡灌洗液传统病原检测和mNGS检测的肺炎患者的临床资料,包括患者一般资料、mNGS检测结果、细菌培养结果等信息,评价mNGS技术对单纯疱疹肺炎混合感染诊疗的价值。结果共纳入41例mNGS检测为单纯疱疹病毒-1型(HSV-1)阳性的患者,包括4例HSV-1病原携带者和37例HSV-1感染者(12例为HSV-1单一感染,25例为HSV-1混合感染)。男22例,女19例,年龄范围46~83岁,中位年龄67岁。采用mNGS技术检测的25例HSV-1混合感染患者占比较高的病原体分别为耶氏肺孢子虫(6例,24.0%)、鲍曼不动杆菌(4例,16.0%)、肺炎克雷伯菌(4例,16.0%)、烟曲霉(3例,12.0%)。HSV-1病原携带组、HSV-1单一感染组和HSV-1混合感染组辛普森菌群多样性指数比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。与12例HSV-1单一感染者比较,25例HSV-1混合感染者的体温恢复正常时间更长[(5.16±2.04)d vs(3.75±1.29)d],抗感染药疗程也更长[(10.60±2.18)d vs(8.92±1.98)d],差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论mNGS技术在识别HSV-1混合感染优势明显,有利于医师精准治疗。

关键词：肺炎疱疹病毒1型,人同时感染宏基因组高通量核苷酸序列分析

PCT与SDI比值对重症细菌性肺炎患者短期预后的预测价值

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中国感染控制杂志 2022年第9期21卷 885-890页

作者：孙国先刘微丽郑庆斌侯红玲林慧晶扬州大学附属医院临床药学科江苏扬州225001 扬州大学附属医院重症医学科江苏扬州225001 扬州大学附属医院神经内科江苏扬州225001

目的探讨血清降钙素原(PCT)与肺泡灌洗液辛普森菌群多样性指数(SDI)比值对重症监护病房(ICU)内细菌性肺炎患者短期预后的预测价值。方法回顾性调查扬州大学附属医院ICU 2019年10月—2021年7月选择肺泡灌洗液宏基因组二代测序(mNGS)技... 详细信息

目的探讨血清降钙素原(PCT)与肺泡灌洗液辛普森菌群多样性指数(SDI)比值对重症监护病房(ICU)内细菌性肺炎患者短期预后的预测价值。方法回顾性调查扬州大学附属医院ICU 2019年10月—2021年7月选择肺泡灌洗液宏基因组二代测序(mNGS)技术的56例细菌性肺炎患者病历资料,依据其入ICU 24 h内急性生理学与慢性健康状况评分Ⅱ(APACHE-Ⅱ)分为非危重症组21例和危重症组35例。以细菌性肺炎造成死亡为终点事件,记录28天转归,并将患者分为生存组38例和死亡组18例。对各组患者的SDI、PCT、C-反应蛋白(CRP)、PCT/SDI、CRP/SDI进行比较分析。结果与非危重症组比较,危重症组患者血清PCT/SDI、PCT水平均升高,且呼吸机辅助通气时间更长,28天病死率更高(均P<0.05);与存活组比较,死亡组患者SDI较低,PCT/SDI、PCT水平均较高(均P<0.05);SDI与呼吸机辅助通气时间呈负相关(r值为-0.655,P<0.001),PCT水平、PCT/SDI与呼吸机辅助通气时间呈正相关(r值分别为0.660、0.734,均P<0.001)。受试者工作特征曲线(ROC曲线)显示,PCT/SDI预测患者28天死亡的ROC曲线下面积(AUC)为0.851,其次为PCT+SDI(0.845)、PCT(0.808)、SDI(0.785)、CRP/SDI(0.731),PCT/SDI的最佳截断值为11.56时预判患者28天死亡的灵敏度为89.5%,特异度为66.7%。Cox回归分析显示,PCT/SDI值高(HR=1.562,95%CI:1.271~1.920,P=0.031)、PCT水平高(HR=1.106,95%CI:1.021~1.198,P=0.024)是ICU细菌性肺炎患者死亡的独立危险因素。结论 PCT/SDI、PCT、PCT+SDI、SDI、CRP/SDI均可作为ICU细菌性肺炎患者短期预后的评估指标。与其他指标相比,PCT/SDI预测患者短期预后更有价值。

关键词：细菌性肺炎肺泡灌洗液降钙素原辛普森多样性指数预后价值

替加环素治疗多重耐药鲍曼不动杆菌肺炎失败的影响因素分析

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中国药房 2022年第22期33卷 2775-2778页

作者：孙国先徐媛刘微丽侯红玲尹文星扬州大学附属医院临床药学科江苏扬州225001 扬州大学附属医院重症医学科江苏扬州225001 扬州大学附属医院神经内科江苏扬州225001

目的探讨替加环素治疗多重耐药鲍曼不动杆菌(MDRAb)肺炎失败的影响因素,为合理使用替加环素提供依据。方法回顾性收集我院ICU 2020年8月至2022年6月选择替加环素治疗MDRAb肺炎患者的病例资料,依据疗效将患者分为治疗失败组和治疗成功组... 详细信息

目的探讨替加环素治疗多重耐药鲍曼不动杆菌(MDRAb)肺炎失败的影响因素,为合理使用替加环素提供依据。方法回顾性收集我院ICU 2020年8月至2022年6月选择替加环素治疗MDRAb肺炎患者的病例资料,依据疗效将患者分为治疗失败组和治疗成功组,记录并比较两组患者的基本信息、急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ(APACHE-Ⅱ)评分、实验室指标、用药相关信息。采用Logistic回归分析法对替加环素治疗MDRAb肺炎失败的影响因素进行分析。结果共有102例使用替加环素治疗MDRAb肺炎的患者,其中治疗成功组有71例,治疗失败组有31例。与治疗成功组比较,治疗失败组患者APACHE-Ⅱ评分更高(P<0.05),凝血功能异常和共病种类≥2种的例数更多(P<0.05)。替加环素治疗后,治疗失败组降钙素原显著高于治疗成功组(P<0.05)。Logistic回归分析显示,导致替加环素治疗MDRAb肺炎失败的独立危险因素为凝血功能异常、APACHE-Ⅱ评分≥20分(P<0.05),首剂负荷是保护性因素(P<0.05)。结论APACHE-Ⅱ评分≥20分和凝血功能异常的MDRAb肺炎患者,给予替加环素治疗失败的可能性大;替加环素首剂负荷给药治疗MDRAb肺炎,疗效更优。

关键词：替加环素多重耐药鲍曼不动杆菌肺炎治疗失败影响因素

辛普森菌群多样性指数与降钙素原对机械通气细菌性肺炎患者的预测价值研究

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中华危重症医学杂志（电子版） 2023年第1期16卷 28-32页

作者：孙国先徐媛刘微丽郑庆斌侯红玲扬州大学附属医院临床药学科江苏扬州225001 扬州大学附属医院重症医学科江苏扬州225001 扬州大学附属医院神经内科江苏扬州225001

目的探讨肺泡灌洗液辛普森菌群多样性指数(SDI)与血清降钙素原(PCT)对机械通气细菌性肺炎患者预后的预测价值.方法收集扬州大学附属医院ICU 2019年6月至2021年6月行机械通气并采用高通量测序技术辅助诊疗的64例细菌性肺炎患者的临床资料... 详细信息

目的探讨肺泡灌洗液辛普森菌群多样性指数(SDI)与血清降钙素原(PCT)对机械通气细菌性肺炎患者预后的预测价值.方法收集扬州大学附属医院ICU 2019年6月至2021年6月行机械通气并采用高通量测序技术辅助诊疗的64例细菌性肺炎患者的临床资料,根据患者28d转归分成存活组(44例)及死亡组(20例).收集患者入ICU 24h内急性病生理学和长期健康评价(APACHE)评分Ⅱ、SDI及PCT.采用Spearman相关分析法分析SDI与PCT的相关性,构建Logistic回归模型分析影响机械通气细菌性肺炎患者预后的危险因素,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线评价SDI及PCT对机械通气细菌性肺炎患者的预测价值.结果存活组患者的APACHEⅡ评分[(14.6±1.8)分vs.(18.4±1.9)分,t=7.716,P<0.001]及PCT水平[(4.6±2.1)μg/L vs.(9.0±2.1)μg/L,t=7.869,P<0.001]均明显低于死亡组,SDI水平明显高于死亡组[0.50(0.44,0.64)vs.0.29(0.25,0.32),Z=5.579,P<0.001].相关分析显示,SDI与PCT呈显著负相关(r=-0.810,P<0.001).二元Logistic回归分析显示,SDI为影响行机械通气细菌性肺炎患者死亡的保护因素,PCT则为危险因素(P均<0.05).ROC曲线显示,SDI预测行机械通气细菌性肺炎患者28 d预后的ROC曲线下面积(AUC)为0.937,PCT的AUC为0.931,SDI联合PCT的AUC为0.950,且联合指标的AUC显著高于PCT的AUC(Z=1.892,P=0.043).结论SDI和PCT对行机械通气细菌性肺炎患者的预后均有较高的诊断价值,且SDI联合PCT的预测价值更优.

关键词：辛普森菌群多样性指数降钙素原二代测序细菌性肺炎预后

初始30,mL/kg液体复苏完成时间对脓毒性休克患者预后的影响

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中华危重病急救医学 2021年第7期33卷 803-808页

作者：吴飞陈含冰陈齐红郑瑞强刘微丽扬州大学医学院江苏扬州225000 苏北人民医院重症医学科江苏扬州225000 扬州市江都人民医院重症医学科江苏扬州225000 扬州大学附属医院重症医学科江苏扬州225000

目的探讨初始30 mL/kg液体复苏完成时间对脓毒性休克患者预后的影响。方法采用观察性研究方法,纳入2018年10月1日至2020年9月30日江苏省苏北人民医院、扬州大学附属医院及扬州市江都人民医院重症医学科收治的脓毒性休克住院患者。收集... 详细信息

目的探讨初始30 mL/kg液体复苏完成时间对脓毒性休克患者预后的影响。方法采用观察性研究方法,纳入2018年10月1日至2020年9月30日江苏省苏北人民医院、扬州大学附属医院及扬州市江都人民医院重症医学科收治的脓毒性休克住院患者。收集患者的一般资料,包括性别、年龄、体质量指数(BMI)、患者来源、感染部位,入重症监护病房(ICU)时的急性生理学与慢性健康状况评分Ⅱ(APACHEⅡ)、序贯器官衰竭评分(SOFA)、动脉血乳酸(Lac),液体复苏量、初始30 mL/kg液体复苏完成时间,以及机械通气情况、急性肾损伤(AKI)发生率、连续性肾脏替代治疗(CRRT)情况、ICU住院时间和28 d病死率。分析初始30 mL/kg液体复苏完成时间与ΔSOFA评分(即液体复苏3 h SOFA评分与初始SOFA评分的差值)之间的关系。根据初始30 mL/kg液体复苏完成时间(T)将患者分为T≤1 h组、1 h3 h组,比较各组之间观察指标的差异。结果①共纳入131例患者,其中男性94例,女性37例;平均年龄(68.3±15.0)岁;初始APACHEⅡ评分为27(21,34)分,初始SOFA评分为12(10,14)分,初始Lac为5.0(3.4,7.1)mmol/L;感染来源以肺部感染为主(87例,占66.41%)。初始30 mL/kg液体复苏完成时间与ΔSOFA评分之间存在拟合曲线关系(Y=-1.0626X2+4.4079X+0.9618),提示过早或过晚完成初始液体复苏均会对脓毒性休克患者的预后产生不良影响。②不同时间完成初始30 mL/kg液体复苏各组患者的感染部位、初始APACHEⅡ评分、初始Lac及初始SOFA评分差异均无统计学意义。进一步分析显示,T≤1 h组患者呼吸支持率、AKI发生率和CRRT比例均明显高于1 h3 h组(呼吸支持率:78.57%比75.51%、42.86%、75.00%,AKI发生率:57.14%比20.41%、21.43%、50.00%,CRRT比例:35.71%比0%、7.14%、16.67%),各组间比较差异均有统计学意义(均P3 h组为33.33%,各组间比较差异具有统计学意义(P<0.01)。结论脓毒性休克发生后1~2 h完成初始30 mL/kg液体复苏可能会降低患者的28 d病死率,改善器官功能障碍;过早或过晚完成液体复苏有可能增加患者的28 d病死率,但需进一步临床研究验证。

关键词：脓毒性休克初始液体复苏序贯器官衰竭评分

不同时机连续性肾脏替代治疗对急性呼吸窘迫综合征的影响

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中国急救医学 2018年第1期38卷 67-71页

作者：孟丽君刘微丽扬州大学附属医院重症医学科江苏扬州225001

目的观察不同时机连续性肾脏替代治疗（CRRT）对急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的影响，探讨ARDS患者应用CRRT的时机。方法48例中重度ARDS患者随机分为早期CRTT组（入ICU24h内行CRRT）和晚期CRRT组（入ICU24h后行CRRT），每组24例，分别在... 详细信息

目的观察不同时机连续性肾脏替代治疗（CRRT）对急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的影响，探讨ARDS患者应用CRRT的时机。方法48例中重度ARDS患者随机分为早期CRTT组（入ICU24h内行CRRT）和晚期CRRT组（入ICU24h后行CRRT），每组24例，分别在治疗前和治疗后第2天、第7天监测氧合指数（PaO2／FiO2）、呼气末正压（PEEP）、平台压（Pplat）以及中心静脉压（CVP）、平均动脉压（MAP）、血乳酸（Lac）和去甲肾上腺素使用剂量，并进行比较；对两组患者液体总负荷、机械通气时间、住ICU时间及28d病死率也进行比较。结果早期CRRT组患者PaO2／FiO2、PEEP、Pplat、CVP、MAP在治疗后第2天即出现明显改善，Lac在治疗后第2天出现明显下降；而晚期CRRT组患者上述指标的改善及Lac的下降均晚于早期CRRT组，且在治疗后第2天、第7天两组上述指标比较差异有统计学意义。两组机械通气时间分别为（8．5±3．1）d和（14．4±4．1）d（P〈0．05），住ICU时间分别为（12±2）d和（19±5）d（P〈0．05），28d病死率分别为20．83％和37．5％（P〈0．05）。结论CRRT可以改善ARDS患者临床预后，24h内行CRRT治疗能尽早地改善氧合，稳定血流动力学，缩短机械通气时间和住ICU时间，降低病死率。

关键词：急性呼吸窘迫综合征(ARDS) 连续性肾脏替代治疗(CRRT) 氧合指数(Pa02/Fi02) 机械通气

小鼠星状神经节阻滞模型的建立及其对脑皮质血流量的影响

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中华麻醉学杂志 2022年第4期42卷 430-434页

作者：王嘉华周炜王小洪严诗婷田顺平王莹于乐洋李虎张冬生张转刘微丽扬州大学附属医院麻醉科扬州225012 扬州大学医学院扬州225009 大连医科大学研究生院大连116000 扬州大学附属医院重症医学科扬州225012

目的建立小鼠星状神经节阻滞(SGB)模型,并探讨SGB对脑皮质血流量的影响。方法清洁级健康雄性C57BL/6小鼠30只,8~9周龄,体重23~27 g,采用随机数字表法分为5组(n=6):对照组(C组)、左侧SGB组(L组)、左侧生理盐水组(SL组)、右侧SGB组(R组)... 详细信息

目的建立小鼠星状神经节阻滞(SGB)模型,并探讨SGB对脑皮质血流量的影响。方法清洁级健康雄性C57BL/6小鼠30只,8~9周龄,体重23~27 g,采用随机数字表法分为5组(n=6):对照组(C组)、左侧SGB组(L组)、左侧生理盐水组(SL组)、右侧SGB组(R组)及右侧生理盐水组(SR组)。C组不予任何处理;L组和R组采用0.25%罗哌卡因0.08 ml行经皮后入路SGB;SL组和SR组注射等量生理盐水。于SGB前(T_(0))及SGB后10、30、60、90、120 min(T_(1~5))时,采用激光散斑血流成像系统检测脑皮质血流量。结果L组和R组小鼠均出现阻滞侧上睑下垂,提示小鼠SGB模型制备成功。C组、SL组和SR组各时点脑皮质血流量差异无统计学意义(P>0.05),L组和R组阻滞侧脑皮质血流量T_(1)时降低,T_(2)时开始升高,T_(3)时达峰值,T_(5)时降低,但仍高于T_(0)时(P0.05)。结论本研究成功建立了小鼠经皮后入路SGB模型。单侧SGB可对阻滞侧脑皮质血流量产生影响,表现为短暂降低之后持续性升高。

关键词：星状神经节神经传导阻滞模型动物脑血管循环大脑皮质

基于星载激光雷达与多光谱影像结合的土地覆盖分类方法

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中国激光 2024年第8期51卷 214-222页

作者：黄兴胡旭嫣刘微微赵宏丽水市国土空间规划测绘研究院浙江丽水323000 浙南综合工程勘察测绘院有限公司浙江杭州310030 浙江省测绘科学技术研究院浙江杭州311121 南京航空航天大学航天学院江苏南京210016

针对全波形激光雷达和多光谱数据下土地覆盖误分类问题,提出了融合陆地卫星(Landsat)多光谱遥感影像数据和星载全波形激光雷达全球生态系统动态调查(GEDI)数据进行土地覆盖分类的方法。首先,根据实地调查数据建立数据集;然后,采用支持... 详细信息

针对全波形激光雷达和多光谱数据下土地覆盖误分类问题,提出了融合陆地卫星(Landsat)多光谱遥感影像数据和星载全波形激光雷达全球生态系统动态调查(GEDI)数据进行土地覆盖分类的方法。首先,根据实地调查数据建立数据集;然后,采用支持向量机(SVM)方法来实现激光雷达足迹的土地覆盖分类;最后,对土地覆盖的分类结果进行评价。结果表明,在SVM方法下联合使用光谱特征和波形特征的总体准确率可以达到90.68%,相比仅使用光谱特征或波形特征时总体准确率可以提升8个百分点以上。融合光谱特征和波形特征的方法可以提高土地覆盖分类的准确性。

关键词：测量全球生态系统动力学调查支持向量机土地覆盖分类 Landsat

宏基因组二代测序在鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗中的应用

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中华实验和临床感染病杂志（电子版） 2022年第2期16卷 115-121页

作者：孙国先蔡萍刘微丽孟丽君侯红玲扬州大学附属医院临床药学科扬州市225001 扬州大学附属医院重症医学科扬州市225001 扬州大学附属医院神经内科扬州市225001

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术对重症监护病房鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗的应用价值。方法回顾性收集扬州大学附属医院2019年1月至2021年5月同时行肺泡灌洗液mNGS技术和传统病原检测的84例肺炎患者的基本资料、细菌培养以及m... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术对重症监护病房鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗的应用价值。方法回顾性收集扬州大学附属医院2019年1月至2021年5月同时行肺泡灌洗液mNGS技术和传统病原检测的84例肺炎患者的基本资料、细菌培养以及mNGS检测结果、抗菌药物应用等。根据鲍曼不动杆菌感染的诊断标准和mNGS检测结果,将入组患者分为定植菌组(25例)、单一感染组(29例)和混合感染组(30例)。炎性指标、辛普森菌群多样性指数(SDI)、抗菌药物使用时间、使用强度、费用和总药费为正态分布的计量资料,采用t检验或ANOVA检验分析;患者年龄分布、基础疾病、发热时间分布、不同临床疗效和治疗转归占比均采用[例(%)]表示,组间比较采用卡方检验。结果入组的84例患者传统病原和mNGS检测鲍曼不动杆菌均为阳性,其中25例鲍曼不动杆菌定植和59例鲍曼不动杆菌肺炎患者;男性44例、女性40例,年龄[65.4(62,68)]岁。mNGS检测中,30例[50.85%(30/59)]检出混合感染;传统病原检测中,3例[5.08%(3/59)]检出混合感染,显著低于mNGS检测,差异有统计学意义(χ^(2)=30.667、P<0.001)。mNGS检出混合感染居前3位的病原体分别为人疱疹病毒(7例)、肺炎链球菌(5例)和耶氏肺孢子虫(5例)。定植菌组、单一感染组和混合感染组患者SDI分别为(0.77±0.11)、(0.38±0.16)和(0.34±0.17),差异具有统计学意义(F=65.411、P<0.001)。单一感染组与混合感染组患者白细胞计数(t=2.211、P=0.031)、中性粒细胞比率(t=2.068、P=0.043)、C-反应蛋白(t=2.024、P=0.048)、抗菌药物费用(t=2.279、P=0.026)、抗菌药物使用强度(t=2.161、P=0.035)、住院天数(t=2.664、P=0.010)、总药费(t=2.397、P=0.020)和体温降至正常时间(t=-2.178、P=0.034)差异均有统计学意义。单一感染组患者治疗显效率高于混合感染组(82.76%vs.56.67%,χ^(2)=4.735、P=0.047)。结论肺泡灌洗液mNGS技术在检测鲍曼不动杆菌肺炎混合感染方面优势明显,能够辅助临床优选抗菌药物,促进患者康复。

关键词：宏基因组二代测序肺炎支气管肺泡灌洗液鲍曼不动杆菌混合感染