宏基因组二代测序技术在单纯疱疹肺炎混合感染患者中的应用

作     者：侯红玲 孙国先 刘微丽 郑庆斌 Hou Hongling;Sun Guoxian;Liu Weili;Zheng Qingbin

作者机构：扬州大学附属医院神经内科扬州225001 扬州大学附属医院临床药学科扬州225001 扬州大学附属医院重症医学科扬州225001 

出 版 物：《中国医师杂志》 (Journal of Chinese Physician)

年 卷 期：2022年第24卷第5期

页      面：728-732页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 100206[医学-皮肤病与性病学] 10[医学] 

基　　金：江苏省药学会-天晴医院药学基金项目(Q202050) 江苏省药学会-恒瑞药学基金项目(H202129) 

主　　题：肺炎 疱疹病毒1型,人 同时感染 宏基因组 高通量核苷酸序列分析 

摘      要：目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在单纯疱疹肺炎混合感染患者中的应用价值。方法回顾性分析扬州大学附属医院2018年6月至2021年1月行肺泡灌洗液传统病原检测和mNGS检测的肺炎患者的临床资料,包括患者一般资料、mNGS检测结果、细菌培养结果等信息,评价mNGS技术对单纯疱疹肺炎混合感染诊疗的价值。结果共纳入41例mNGS检测为单纯疱疹病毒-1型(HSV-1)阳性的患者,包括4例HSV-1病原携带者和37例HSV-1感染者(12例为HSV-1单一感染,25例为HSV-1混合感染)。男22例,女19例,年龄范围46~83岁,中位年龄67岁。采用mNGS技术检测的25例HSV-1混合感染患者占比较高的病原体分别为耶氏肺孢子虫(6例,24.0%)、鲍曼不动杆菌(4例,16.0%)、肺炎克雷伯菌(4例,16.0%)、烟曲霉(3例,12.0%)。HSV-1病原携带组、HSV-1单一感染组和HSV-1混合感染组辛普森菌群多样性指数比较,差异具有统计学意义(P0.05)。与12例HSV-1单一感染者比较,25例HSV-1混合感染者的体温恢复正常时间更长[(5.16±2.04)d vs(3.75±1.29)d],抗感染药疗程也更长[(10.60±2.18)d vs(8.92±1.98)d],差异均有统计学意义(均P0.05)。结论mNGS技术在识别HSV-1混合感染优势明显,有利于医师精准治疗。